<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759766.5	1	GGCCATCTACACCTACCTGCAGCCCGCGCAGCGCTACAACCAGGCACGGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	17629	GGCCATCTACACCTACCTGCAGCCCGCGCAGCGCTACAACCAGGCACGGG	17678

CR759766.5	51	GCAAGTTCGTATCGCTCTTCTACACCGTGGTCACACCTGCTCTCAACCCG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	17679	GCAAGTTCGTATCGCTCTTCTACACCGTGGTCACACCTGCTCTCAACCCG	17728

CR759766.5	101	CTCATCTACACCCTCAGGAATAAGAAAGTGAAGGGGGCAGCGAGGAGGCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	17729	CTCATCTACACCCTCAGGAATAAGAAAGTGAAGGGGGCAGCGAGGAGGCT	17778

CR759766.5	151	GCTGCGGAGTCTGGGGAGAGGCCAGGCTGGGCAGTGAGTAGTTGGGGAGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	17779	GCTGCGGAGTCTGGGGAGAGGCCAGGCTGGGCAGTGAGTAGTTGGGGAGG	17828

CR759766.5	201	GGAGAAAGTATTAAGCCAGAACCCAAGGATGGAAATACCCCTTAGTGAGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	17829	GGAGAAAGTATTAAGCCAGAACCCAAGGATGGAAATACCCCTTAGTGAGT	17878

CR759766.5	251	CAGTTTAGACTTCAGGCTGTTCATTTTTGTATGATAATCTGCAAGATTTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	17879	CAGTTTAGACTTCAGGCTGTTCATTTTTGTATGATAATCTGCAAGATTTG	17928

CR759766.5	301	TCCTAAGGAGTCCAATGGGGGATATGTTTTCCTCCCGTGAGGAAATGTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	17929	TCCTAAGGAGTCCAATGGGGGATATGTTTTCCTCCCGTGAGGAAATGTTT	17978

CR759766.5	351	AGTTCTTGAGGGAAAATCCCTAAATCCTCTATATACTCAGGTTTAGGGAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	17979	AGTTCTTGAGGGAAAATCCCTAAATCCTCTATATACTCAGGTTTAGGGAA	18028

CR759766.5	401	GGAAAACCTACCCCTCACAACTCCACGCGCAGGGAAAATGATGGACGTGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18029	GGAAAACCTACCCCTCACAACTCCACGCGCAGGGAAAATGATGGACGTGA	18078

CR759766.5	451	CGCTCGCCTTTAGCTTCCTCCCTATCTGATGGAAGACCATGGAAGACCTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18079	CGCTCGCCTTTAGCTTCCTCCCTATCTGATGGAAGACCATGGAAGACCTC	18128

CR759766.5	501	TTGGTCTCTGCAATCAGAAGTCTCAAGTTGACAAGAAAATCATAGTCCCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18129	TTGGTCTCTGCAATCAGAAGTCTCAAGTTGACAAGAAAATCATAGTCCCT	18178

CR759766.5	551	ACCCTGCAGGAGAGGGTACATCCAGAAAAAGCGACCATGGACTCTATTCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18179	ACCCTGCAGGAGAGGGTACATCCAGAAAAAGCGACCATGGACTCTATTCT	18228

CR759766.5	601	CAGAAATCAGTCCAACTTAGTGCAGACCTGGCCAGATGACCAGTGCCCTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18229	CAGAAATCAGTCCAACTTAGTGCAGACCTGGCCAGATGACCAGTGCCCTC	18278

CR759766.5	651	CCCGGGGCATTTCACCCATAAATGTGATGAGGAAAGCCCATAAATGGTGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18279	CCCGGGGCATTTCACCCATAAATGTGATGAGGAAAGCCCATAAATGGTGG	18328

CR759766.5	701	TGAATTTTGCTGAGTGGGGTTAAGACTGGAAACCCCCCTGCAGGAGTTGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18329	TGAATTTTGCTGAGTGGGGTTAAGACTGGAAACCCCCCTGCAGGAGTTGG	18378

CR759766.5	751	TTCTTGAGCAAGTTTTAAAGAAACAAGGAACTAGGATGAGTGTGGAAGAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18379	TTCTTGAGCAAGTTTTAAAGAAACAAGGAACTAGGATGAGTGTGGAAGAA	18428

CR759766.5	801	GGCGGGCACGTCTCAGCCCGTGAAAAAAACTCACAGGTGATCAGTAGTGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18429	GGCGGGCACGTCTCAGCCCGTGAAAAAAACTCACAGGTGATCAGTAGTGA	18478

CR759766.5	851	GTCATGAGAGAGAGAGCAAGAGAGAGAGTCAGAGAGAGGAGTAAATGGAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18479	GTCATGAGAGAGAGAGCAAGAGAGAGAGTCAGAGAGAGGAGTAAATGGAG	18528

CR759766.5	901	GGAGGAAGATGGAGGAAGGGACTCAAGTTCTCAAGACAGGAACAGGGATC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18529	GGAGGAAGATGGAGGAAGGGACTCAAGTTCTCAAGACAGGAACAGGGATC	18578

CR759766.5	951	TCCTCATGAAAAAAAGAAGAGAGGAAAATGCTCAATCAGCAGAACCTGAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18579	TCCTCATGAAAAAAAGAAGAGAGGAAAATGCTCAATCAGCAGAACCTGAG	18628

CR759766.5	1001	CAGAATATTGAGGTCAACCCAGAAGCCAGCTCCTCACCCACCCTCACCCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18629	CAGAATATTGAGGTCAACCCAGAAGCCAGCTCCTCACCCACCCTCACCCA	18678

CR759766.5	1051	GACTGGCGCCCTCATCCTGGAGAAGACCTGCTAGACCCTAAGGCAGGTAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18679	GACTGGCGCCCTCATCCTGGAGAAGACCTGCTAGACCCTAAGGCAGGTAG	18728

CR759766.5	1101	GAGAGAGGGTGGTCCACAGTCCCCCAGCTTTAGAAAGTTTGTTCGCTCCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18729	GAGAGAGGGTGGTCCACAGTCCCCCAGCTTTAGAAAGTTTGTTCGCTCCC	18778

CR759766.5	1151	AATGTCCATCTACCCCTAGGAATCCCCACTAGTTAAACAGAATTGCTAGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18779	AATGTCCATCTACCCCTAGGAATCCCCACTAGTTAAACAGAATTGCTAGA	18828

CR759766.5	1201	TCCCTGTGGAAAATACCTTTCCTTGCCCACCATCATCCCCAGAAATAATA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18829	TCCCTGTGGAAAATACCTTTCCTTGCCCACCATCATCCCCAGAAATAATA	18878

CR759766.5	1251	ACTATTTTAGTTGGGTGTGAGACATAGAGAATAAAAGGGGGCATGGTGCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18879	ACTATTTTAGTTGGGTGTGAGACATAGAGAATAAAAGGGGGCATGGTGCC	18928

CR759766.5	1301	AGACTTCATTTCATACAAATAGCTTTAAAGGAGAAGAGGGGGGAAGGAGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18929	AGACTTCATTTCATACAAATAGCTTTAAAGGAGAAGAGGGGGGAAGGAGT	18978

CR759766.5	1351	TTAATTTAGTTTCTAAAATGTTTAGTAATTTGATTGTGATCATGTCAGAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	18979	TTAATTTAGTTTCTAAAATGTTTAGTAATTTGATTGTGATCATGTCAGAG	19028

CR759766.5	1401	CAACTAATTCATTTTATAAAATATCATTTCACTATGCTCTATAAGTAGAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	19029	CAACTAATTCATTTTATAAAATATCATTTCACTATGCTCTATAAGTAGAA	19078

CR759766.5	1451	ATTCAATTTGGTTCAACCATTATTGAGTGATATAAATAAAGCACTGGACT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	19079	ATTCAATTTGGTTCAACCATTATTGAGTGATATAAATAAAGCACTGGACT	19128

CR759766.5	1501	TAACAAAGACAGAAATACAGAAATCAGTAGAACATGGATCCCAACCTAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	19129	TAACAAAGACAGAAATACAGAAATCAGTAGAACATGGATCCCAACCTAAA	19178

CR759766.5	1551	ACTTACTCTCTTGTCATAAAGGAAAGGAGATAGGAGTTTTTGCATAAATA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	19179	ACTTACTCTCTTGTCATAAAGGAAAGGAGATAGGAGTTTTTGCATAAATA	19228

CR759766.5	1601	ACAAGGTATCAAGACAGAATTAAATTCCAAGCTGGCTTTGAATGCTCTAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	19229	ACAAGGTATCAAGACAGAATTAAATTCCAAGCTGGCTTTGAATGCTCTAT	19278

CR759766.5	1651	TTTGCCTTAAAAATTTATTTACTAGTCTCAGTAATACATTAGTAAAAATC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	19279	TTTGCCTTAAAAATTTATTTACTAGTCTCAGTAATACATTAGTAAAAATC	19328

CR759766.5	1701	ATGTCACTTAATTAATTGTGTTAGAATCAAAGAAACATAGAGTTGGGCAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	19329	ATGTCACTTAATTAATTGTGTTAGAATCAAAGAAACATAGAGTTGGGCAA	19378

CR759766.5	1751	TATACTTCATCCTACCCATCCCACCCAAATCTTACTCTACTCATCTCATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	19379	TATACTTCATCCTACCCATCCCACCCAAATCTTACTCTACTCATCTCATT	19428

CR759766.5	1801	CTCATTAATTTTGGGAAATCATCAGAAGATGTGTTCGTTGAGTAAGAGAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	19429	CTCATTAATTTTGGGAAATCATCAGAAGATGTGTTCGTTGAGTAAGAGAT	19478

CR759766.5	1851	TAAAAGAAATAAGCTTTTTGACCCCTGCCAACACCCCATCCCCAGGGTGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	19479	TAAAAGAAATAAGCTTTTTGACCCCTGCCAACACCCCATCCCCAGGGTGG	19528

CR759766.5	1901	TCACCCTCCAATACAATAAGATGCCAGGAAGAGTAAGTTGCCCTTTCTGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	19529	TCACCCTCCAATACAATAAGATGCCAGGAAGAGTAAGTTGCCCTTTCTGA	19578

CR759766.5	1951	TGCCGTAATCTGCCATCATCTTCCCATCTTCCAGTCTCTTTCCATTGCAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR942274.1	19579	TGCCGTAATCTGCCATCATCTTCCCATCTTCCAGTCTCTTTCCATTGCAA	19628

Overview

Query
CR759766.5 - 127280 bps
Hit
CR942274.1 - 19628 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link