<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 1999 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CR774181.3 1 GGCCAACACGGTGAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCG 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 39337 GGCCAACACGGTGAAACCCCATCTTTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCG 39386 CR774181.3 51 GGCTTGGGGGTGTGTTCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGTGAGGCAGG 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 39387 GGCTTGGGGGTGTGTTCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGTGAGGCAGG 39436 CR774181.3 101 AGAATCGCTTGAACTTGGAGGCAGAAGTTGCAGTGAGCCGAGATAGTGCA 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 39437 AGAATCGCTTGAACTTGGAGGCAGAAGTTGCAGTGAGCCGAGATAGTGCA 39486 CR774181.3 151 ATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTTTGCCTCTTGAAAAAA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 39487 ATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTTTGCCTCTTGAAAAAA 39536 CR774181.3 201 AAAAAAAAGTGTATGAAAAGGTAAATTATTTTTCATGGAGTCCTGCCCTG 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 39537 AAAAAAAAGTGTATGAAAAGGTAAATTATTTTTCATGGAGTCCTGCCCTG 39586 CR774181.3 251 AGAACAAGGCATCAAATCCTCTAAGTGTATAGGAAATTTGAGTTCAAAAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 39587 AGAACAAGGCATCAAATCCTCTAAGTGTATAGGAAATTTGAGTTCAAAAT 39636 CR774181.3 301 AGATGCTTTGAAAAAAATAAAGAAAATGTTTTTGAAAAATGCAAATTTTA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 39637 AGATGCTTTGAAAAAAATAAAGAAAATGTTTTTGAAAAATGCAAATTTTA 39686 CR774181.3 351 ACAGATTTAGGGTATAGAAGTGCAGTTGTGTTCCATGGATATATTTACAT 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 39687 ACAGATTTAGGGTATAGAAGTGCAGTTGTGTTCCATGGATATATTTACAT 39736 CR774181.3 401 AGTGAAGTCTGAGATTTCAGTGTATCCATCATCCAAATAGGATACATTGT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 39737 AGTGAAGTCTGAGATTTCAGTGTATCCATCATCCAAATAGGATACATTGT 39786 CR774181.3 451 CCTCAATAGGTAGTCTTTCATCCCTCAACCCTTTCCCAACTTCCCACCTT 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 39787 CCTCAATAGGTAGTCTTTCATCCCTCAACCCTTTCCCAACTTCCCACCTT 39836 CR774181.3 501 TTGGAGTCTCCAATGTCATTATTTCATTCTGTATCCACATGTACCCATTG 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 39837 TTGGAGTCTCCAATGTCATTATTTCATTCTGTATCCACATGTACCCATTG 39886 CR774181.3 551 TTTAGCTCCCACTTATAATTGATAATATCTAGCATTTGGCTTTCTGTTTT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 39887 TTTAGCTCCCACTTATAATTGATAATATCTAGCATTTGGCTTTCTGTTTT 39936 CR774181.3 601 TGAGTTATTTCACTTAAGCCAATGGCCTCCAGTTCCATCCAAGTTGTTAT 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 39937 TGAGTTATTTCACTTAAGCCAATGGCCTCCAGTTCCATCCAAGTTGTTAT 39986 CR774181.3 651 AAAAGACATGACTTCAGTCTTTTTATGGGGAAGTAGTATCACATTTTAGA 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 39987 AAAAGACATGACTTCAGTCTTTTTATGGGGAAGTAGTATCACATTTTAGA 40036 CR774181.3 701 AATCCAATAGTCCATTGATGGACACTCAGGTTGATTCTATTACTTTGCTA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40037 AATCCAATAGTCCATTGATGGACACTCAGGTTGATTCTATTACTTTGCTA 40086 CR774181.3 751 TTGTGAATAGTGCTGCGATATACATAGACATGCAGGTTTCTTTCTGATAT 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40087 TTGTGAATAGTGCTGCGATATACATAGACATGCAGGTTTCTTTCTGATAT 40136 CR774181.3 801 AATGATTTACCTTTAGGTTGATATCCAATAATGGGATTGCTGGGTCAAAT 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40137 AATGATTTACCTTTAGGTTGATATCCAATAATGGGATTGCTGGGTCAAAT 40186 CR774181.3 851 GGTAGTTCCATTTTTAGTTCTTTGAAAAGTCTCCATACTGTTTTCCACAG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40187 GGTAGTTCCATTTTTAGTTCTTTGAAAAGTCTCCATACTGTTTTCCACAG 40236 CR774181.3 901 GGCTTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTATGTATTCTTTTTTTC 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40237 GGCTTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTATGTATTCTTTTTTTC 40286 CR774181.3 951 TCTATACCCTTGGCAAAATTTGTTTTTTTTTTTTTTGTCTTGATTTTTTT 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40287 TCTATACCCTTGGCAAAATTTGTTTTTTTTTTTTTTGTCTTGATTTTTTT 40336 CR774181.3 1001 AATCATGGCCATTTTGAATGGCATAAGGTAATATCTCATTGTGGTTTTAA 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40337 AATCATGGCCATTTTGAATGGCATAAGGTAATATCTCATTGTGGTTTTAA 40386 CR774181.3 1051 CTTGCAATTCTCTTATGATTAACATTTGTTCATATGTTTATTGGCCATTT 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40387 CTTGCAATTCTCTTATGATTAACATTTGTTCATATGTTTATTGGCCATTT 40436 CR774181.3 1101 ATATGTGATCTTTGGAAAAAAAAAGAACATCTTAAAGTTCAGAATGGGGC 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40437 ATATGTGATCTTTGGAAAAAAAAAGAACATCTTAAAGTTCAGAATGGGGC 40486 CR774181.3 1151 CAGGTGCAGTGGCTCATGTTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGAC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40487 CAGGTGCAGTGGCTCATGTTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGAC 40536 CR774181.3 1201 AGGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40537 AGGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGA 40586 CR774181.3 1251 AACCCCGTCTCTACTAAAAATAGAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGGGGG 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40587 AACCCCGTCTCTACTAAAAATAGAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGGGGG 40636 CR774181.3 1301 TGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGCAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAA 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40637 TGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGCAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAA 40686 CR774181.3 1351 CCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCATCACTGCACTCCAG 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40687 CCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCATCACTGCACTCCAG 40736 CR774181.3 1401 CCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTAAGAAAACAAAACAAAACAAAAC 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40737 CCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTAAGAAAACAAAACAAAACAAAAC 40786 CR774181.3 1451 AAAACAAAAAACTTCAGAATGTATTACATTCATGGCTAGGTTTAGAATAT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40787 AAAACAAAAAACTTCAGAATGTATTACATTCATGGCTAGGTTTAGAATAT 40836 CR774181.3 1501 GGGTTGAGTCACTGGAAGATGTGTTGAATGAAGTCTTTTAAATAGTGAGA 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40837 GGGTTGAGTCACTGGAAGATGTGTTGAATGAAGTCTTTTAAATAGTGAGA 40886 CR774181.3 1551 ACCTGATGCCAAAATGACCTTAAAACTATGTCAAAAGAGAAAAACCCCAC 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40887 ACCTGATGCCAAAATGACCTTAAAACTATGTCAAAAGAGAAAAACCCCAC 40936 CR774181.3 1601 TTAAGACAGCAATAAAATAGGGTTTGGATGAGCATTTCAATCTTGAGGAA 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40937 TTAAGACAGCAATAAAATAGGGTTTGGATGAGCATTTCAATCTTGAGGAA 40986 CR774181.3 1651 AACCTAACCTGTTTGCAAAATAAGCCTAAGGATTGGATGACAAGTTTACC 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 40987 AACCTAACCTGTTTGCAAAATAAGCCTAAGGATTGGATGACAAGTTTACC 41036 CR774181.3 1701 ACTGGGCAAAAAGATATTTATATCCTTGGATTAAGTGCTAAATGATAAGA 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 41037 ACTGGGCAAAAAGATATTTATATCCTTGGATTAAGTGCTAAATGATAAGA 41086 CR774181.3 1751 AATCAAACCAAATATTTGAGTGAACAATTGATGAATATTCACTACTATAC 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 41087 AATCAAACCAAATATTTGAGTGAACAATTGATGAATATTCACTACTATAC 41136 CR774181.3 1801 TTGGAGAAGATAAAATGGATGTTGGGACTTAGAACTAGATCAAATCAGAA 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 41137 TTGGAGAAGATAAAATGGATGTTGGGACTTAGAACTAGATCAAATCAGAA 41186 CR774181.3 1851 TGAGTATCGATCAATGTTCAGTCAAAGGGGGTTGGAGGAAATTTGTTTAT 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 41187 TGAGTATCGATCAATGTTCAGTCAAAGGGGGTTGGAGGAAATTTGTTTAT 41236 CR774181.3 1901 GCTTCTTAAAACGCTTTTTTTTTTCTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTG 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 41237 GCTTCTTAAAACGCTTTTTTTTTTCTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTG 41286 CR774181.3 1951 TTGCCCAGGATGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCGACTACTGCAACCCCCA 1999 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR942175.3 41287 TTGCCCAGGATGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCGACTACTGCAACCCCCA 41335