<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 5491 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

  AC119415.13	1	CTTTCCTTTTTCCAATTTCAATTCAACTGCAACAGATCTCACTCTCACTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	5491	CTTTCCTTTTTCCAATTTCAATTCAACTGCAACAGATCTCACTCTCACTC	5442

  AC119415.13	51	TCATCAACTATAACAATTCTGAGTTCTATTTATTCTCCAATTTCCCCCTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	5441	TCATCAACTATAACAATTCTGAGTTCTATTTATTCTCCAATTTCCCCCTT	5392

  AC119415.13	101	AAATATTCTGAGTATTTTCACAACAGAGATGAGCATCTTCTTCATAAATA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	5391	AAATATTCTGAGTATTTTCACAACAGAGATGAGCATCTTCTTCATAAATA	5342

  AC119415.13	151	TGAAATAAACTATGTACTGACATTAAGCCAGTAAGATTACGAAACGTGTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	5341	TGAAATAAACTATGTACTGACATTAAGCCAGTAAGATTACGAAACGTGTC	5292

  AC119415.13	201	TATTAGTAGTCAATGTAAAATAACGTTGACTCATGTGTACCTCTCTCATA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	5291	TATTAGTAGTCAATGTAAAATAACGTTGACTCATGTGTACCTCTCTCATA	5242

  AC119415.13	251	AAAATTGATTAAAATAATATATAATTGCTCATTTTTTTACCGGTTTGGTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	5241	AAAATTGATTAAAATAATATATAATTGCTCATTTTTTTACCGGTTTGGTC	5192

  AC119415.13	301	CAGACATCATTGAACATTAATGTGAATATTCTCATATAAAATTTAAATTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	5191	CAGACATCATTGAACATTAATGTGAATATTCTCATATAAAATTTAAATTT	5142

  AC119415.13	351	TGATTTATCACTTGTAATAGTTCAATCTCTTCTTATGGACCGACTGGAGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	5141	TGATTTATCACTTGTAATAGTTCAATCTCTTCTTATGGACCGACTGGAGT	5092

  AC119415.13	401	ATCAATTATTGATTTGATTAACTGTTTATTTATTTATTATTTAGAAGTAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	5091	ATCAATTATTGATTTGATTAACTGTTTATTTATTTATTATTTAGAAGTAA	5042

  AC119415.13	451	GTACACCTTTTAAAGAGAAAACACCTGAATCATTCACCTCACAGATAGTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	5041	GTACACCTTTTAAAGAGAAAACACCTGAATCATTCACCTCACAGATAGTG	4992

  AC119415.13	501	GTTGATAACATTAATGATATTAATGTTTTTACATGAAAAAGAATGATGAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4991	GTTGATAACATTAATGATATTAATGTTTTTACATGAAAAAGAATGATGAA	4942

  AC119415.13	551	TGAATAATTAAAATAAATTATTTAGACGAAAGAAAATAATTAACTAAAAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4941	TGAATAATTAAAATAAATTATTTAGACGAAAGAAAATAATTAACTAAAAG	4892

  AC119415.13	601	AGATATCTAAATAATGTCATCAAAATACAAGTTGCTCGTTCCAATGAACT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4891	AGATATCTAAATAATGTCATCAAAATACAAGTTGCTCGTTCCAATGAACT	4842

  AC119415.13	651	TAATTCAGTTGGCAAGGACCTTGCATCCGAGATTTAATCCCCAGAAAAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4841	TAATTCAGTTGGCAAGGACCTTGCATCCGAGATTTAATCCCCAGAAAAAA	4792

  AC119415.13	701	AGAAAGAAAAAAAAAAGTACAAGTTTCTCACCCAATCAAGTCCCTTACAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4791	AGAAAGAAAAAAAAAAGTACAAGTTTCTCACCCAATCAAGTCCCTTACAC	4742

  AC119415.13	751	AATATTTTTTAGTGTATATATACAAATGCATGCTATGTCACATTTAAGCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4741	AATATTTTTTAGTGTATATATACAAATGCATGCTATGTCACATTTAAGCT	4692

  AC119415.13	801	CATCTTCCTCGAAACTACTCGTTCTTCACTTCCTTAATCCCAAATAACTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4691	CATCTTCCTCGAAACTACTCGTTCTTCACTTCCTTAATCCCAAATAACTC	4642

  AC119415.13	851	TATATTGTGTGGTTGTCATTTTCCTTGGTTCTTTCTTTGTATTTTCCCCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4641	TATATTGTGTGGTTGTCATTTTCCTTGGTTCTTTCTTTGTATTTTCCCCC	4592

  AC119415.13	901	AAAGATTATATATAATGGACACCAAAGTGCTTTCTTCCGGAATCCATTAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4591	AAAGATTATATATAATGGACACCAAAGTGCTTTCTTCCGGAATCCATTAT	4542

  AC119415.13	951	TCAAAATTACCCGAAAGCTACATCAGACCCGAATCTGATAGACCATGTCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4541	TCAAAATTACCCGAAAGCTACATCAGACCCGAATCTGATAGACCATGTCT	4492

  AC119415.13	1001	TTCTCAAGTCTCTGAGTTCGAAAATGTTCCTATCATTGATTTGGGTTCTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4491	TTCTCAAGTCTCTGAGTTCGAAAATGTTCCTATCATTGATTTGGGTTCTC	4442

  AC119415.13	1051	ACAACAGAACACAGATTGTGCAGCAAATTGGTGAAGCATGCAGCTCCTAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4441	ACAACAGAACACAGATTGTGCAGCAAATTGGTGAAGCATGCAGCTCCTAT	4392

  AC119415.13	1101	GGTTTTTTCCAGGTCTAGCCCCATATTTCAATTTTTTTGTTTATTCATTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4391	GGTTTTTTCCAGGTCTAGCCCCATATTTCAATTTTTTTGTTTATTCATTA	4342

  AC119415.13	1151	TTCAATAACCATAGATGAACAATGAAGATTTTTTTAGATAAGCATAACTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4341	TTCAATAACCATAGATGAACAATGAAGATTTTTTTAGATAAGCATAACTT	4292

  AC119415.13	1201	TTGCTACTCGTCATAATTAGGATTAATTCCTCATTTCTGCTAAATACAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4291	TTGCTACTCGTCATAATTAGGATTAATTCCTCATTTCTGCTAAATACAAT	4242

  AC119415.13	1251	TTGATTTGTCACATGCAAGCCAGATGCCACTAGTTCTAACGTAAGTGGTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4241	TTGATTTGTCACATGCAAGCCAGATGCCACTAGTTCTAACGTAAGTGGTT	4192

  AC119415.13	1301	GATGCGCAATGTGTATGATTTGTAACTTTAGAGAACCTAGTTCAATTCTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4191	GATGCGCAATGTGTATGATTTGTAACTTTAGAGAACCTAGTTCAATTCTT	4142

  AC119415.13	1351	AATGATGAAATAAAATGTCATTTTGGTAATTAAGTGACATTGTGAAAACA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4141	AATGATGAAATAAAATGTCATTTTGGTAATTAAGTGACATTGTGAAAACA	4092

  AC119415.13	1401	ATGCTAATTGAATGATTGTGTAATGCACAGTCACTGAATTAATTTTATAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4091	ATGCTAATTGAATGATTGTGTAATGCACAGTCACTGAATTAATTTTATAT	4042

  AC119415.13	1451	TAAACACCGTAAGTTTTGGGAGGCTAATTAATAATATATTGACAATTAAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	4041	TAAACACCGTAAGTTTTGGGAGGCTAATTAATAATATATTGACAATTAAT	3992

  AC119415.13	1501	TGGACAGGTAGTTAATCATGGGGTGCCACTAGAAGAATTGAAAAAAACAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3991	TGGACAGGTAGTTAATCATGGGGTGCCACTAGAAGAATTGAAAAAAACAG	3942

  AC119415.13	1551	CAGAAGTGGCATATGATTTTTTCAAGTTGCCAGTGGAGGAGAAAATGAAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3941	CAGAAGTGGCATATGATTTTTTCAAGTTGCCAGTGGAGGAGAAAATGAAG	3892

  AC119415.13	1601	TTGTATTCAGACGATCCAACAAAGACAATGAGACTATCTACAAGTTTTAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3891	TTGTATTCAGACGATCCAACAAAGACAATGAGACTATCTACAAGTTTTAA	3842

  AC119415.13	1651	TGTGAACAAAGAGGAGGTGCATAATTGGAGGGACTACCTTAGACTTCATT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3841	TGTGAACAAAGAGGAGGTGCATAATTGGAGGGACTACCTTAGACTTCATT	3792

  AC119415.13	1701	GCTATCCTTTGGATAATTATGTGCCAGAATGGCCTTCTAATCCTCCTTCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3791	GCTATCCTTTGGATAATTATGTGCCAGAATGGCCTTCTAATCCTCCTTCA	3742

  AC119415.13	1751	TTCAAGTAAGTCCACTCTCTTCATTTTTCTCTGTCTCTCTAATTTCAGCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3741	TTCAAGTAAGTCCACTCTCTTCATTTTTCTCTGTCTCTCTAATTTCAGCC	3692

  AC119415.13	1801	ACGTATCTATCATCGGACAAGTGTTACTGACTAGGTCTAGGCCTCACCTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3691	ACGTATCTATCATCGGACAAGTGTTACTGACTAGGTCTAGGCCTCACCTT	3642

  AC119415.13	1851	GTAGACATGTGGTGAGGTATAGTTTTTAGGTGAATGACATGTGATGATGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3641	GTAGACATGTGGTGAGGTATAGTTTTTAGGTGAATGACATGTGATGATGT	3592

  AC119415.13	1901	ATTCACCATGAGGTCATTCTCTTGTCTATAAAAAAAATAAAATTGATGTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3591	ATTCACCATGAGGTCATTCTCTTGTCTATAAAAAAAATAAAATTGATGTA	3542

  AC119415.13	1951	ATATATATGATGCATTTTCTTACTTTATGAATATGATAAAAAAATGTTAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3541	ATATATATGATGCATTTTCTTACTTTATGAATATGATAAAAAAATGTTAA	3492

  AC119415.13	2001	CGAAGTCATAGGAGCTTAAGATCTTTAAATAGTCAACTTTTAAGAAGGTT	2050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3491	CGAAGTCATAGGAGCTTAAGATCTTTAAATAGTCAACTTTTAAGAAGGTT	3442

  AC119415.13	2051	TGTATACTAATTATGTTAAAAATTAAAATATTTGACTTTGTTGTAGAATA	2100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3441	TGTATACTAATTATGTTAAAAATTAAAATATTTGACTTTGTTGTAGAATA	3392

  AC119415.13	2101	GATTTTTATTTAAAATTCTTTAAGAGTATTATGTTAGAAACACAAGTTAG	2150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3391	GATTTTTATTTAAAATTCTTTAAGAGTATTATGTTAGAAACACAAGTTAG	3342

  AC119415.13	2151	CAATATATATATATATATAAAAGATTGTCATGTTAAGTAGTGTTTTAAAT	2200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3341	CAATATATATATATATATAAAAGATTGTCATGTTAAGTAGTGTTTTAAAT	3292

  AC119415.13	2201	GTATTTTTTAAAGAATCTTAAAAAAAATTGTTTAAAATCTAAATCAAAGT	2250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3291	GTATTTTTTAAAGAATCTTAAAAAAAATTGTTTAAAATCTAAATCAAAGT	3242

  AC119415.13	2251	ACTTGTCAAATCATAAAAAATCCCATGTCCCCAAAAAGAAGTTACATGAT	2300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3241	ACTTGTCAAATCATAAAAAATCCCATGTCCCCAAAAAGAAGTTACATGAT	3192

  AC119415.13	2301	TTGTCATGTTACCATTTTGCTATAAAAACCACATTATATTTTTGTTCTCT	2350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3191	TTGTCATGTTACCATTTTGCTATAAAAACCACATTATATTTTTGTTCTCT	3142

  AC119415.13	2351	TCACGATTTTTTAGAAAAATGTGAGTAGTTTTATGATTGGAAATTAAATA	2400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3141	TCACGATTTTTTAGAAAAATGTGAGTAGTTTTATGATTGGAAATTAAATA	3092

  AC119415.13	2401	CTGACTGACCTACTAAAAGGAATTTTATAGCGCTTTTTTTTTATTTTTAT	2450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3091	CTGACTGACCTACTAAAAGGAATTTTATAGCGCTTTTTTTTTATTTTTAT	3042

  AC119415.13	2451	TACAAGAGTGAGACTTTTTTAGATTAATTTTTTTTAAAACTTTTTTAGAT	2500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	3041	TACAAGAGTGAGACTTTTTTAGATTAATTTTTTTTAAAACTTTTTTAGAT	2992

  AC119415.13	2501	TAATGTATATTATTAAAATTGATTTAAAATTTAACAAACTTTTACATACT	2550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2991	TAATGTATATTATTAAAATTGATTTAAAATTTAACAAACTTTTACATACT	2942

  AC119415.13	2551	CAAGGTGCTATCTCATTGATAAGAGGATTCATTAGAATTATTTTTGTAAA	2600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2941	CAAGGTGCTATCTCATTGATAAGAGGATTCATTAGAATTATTTTTGTAAA	2892

  AC119415.13	2601	AGTCATGTGAACTTGGTTCAGATGTGAACTTGATTCAGTTGATAGGGATA	2650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2891	AGTCATGTGAACTTGGTTCAGATGTGAACTTGATTCAGTTGATAGGGATA	2842

  AC119415.13	2651	ATGCATAAATGTTGATGTTTAAACTTTGAATACCCGCTTATTCATTTTAA	2700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2841	ATGCATAAATGTTGATGTTTAAACTTTGAATACCCGCTTATTCATTTTAA	2792

  AC119415.13	2701	AAATGAATTTCTATTCATTAAACTACTTAAAAAAAAAAAGACAGTAACAA	2750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2791	AAATGAATTTCTATTCATTAAACTACTTAAAAAAAAAAAGACAGTAACAA	2742

  AC119415.13	2751	TAACAATAATTTGAACAAAAACGTTATCTCGATAAGTTAAACTTTTGAGT	2800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2741	TAACAATAATTTGAACAAAAACGTTATCTCGATAAGTTAAACTTTTGAGT	2692

  AC119415.13	2801	GCAATTTATTGTCTAATTAAAATTGGTTTTATGTTGAAAGTTAGGATCGA	2850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2691	GCAATTTATTGTCTAATTAAAATTGGTTTTATGTTGAAAGTTAGGATCGA	2642

  AC119415.13	2851	ACTATCGATCTCCTTAGCACTCCGCTACTTACCATATGTTTGGAGTCGCT	2900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2641	ACTATCGATCTCCTTAGCACTCCGCTACTTACCATATGTTTGGAGTCGCT	2592

  AC119415.13	2901	TTTGGAAGCAAATTTTTGTGTACCATGAACTCTAATGTCTATAGCTTCTG	2950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2591	TTTGGAAGCAAATTTTTGTGTACCATGAACTCTAATGTCTATAGCTTCTG	2542

  AC119415.13	2951	CATTGCGGTAATTTTTATTGCTACATTGGAGAAATTGAATGCGAATTCGA	3000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2541	CATTGCGGTAATTTTTATTGCTACATTGGAGAAATTGAATGCGAATTCGA	2492

  AC119415.13	3001	ACAAACAAACACTTAGCCCCATTTTACAGTTGTGCGCGATTTAAAAAAAA	3050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2491	ACAAACAAACACTTAGCCCCATTTTACAGTTGTGCGCGATTTAAAAAAAA	2442

  AC119415.13	3051	AAAGCATGTTGCAGTCAACTACTTCACTCTTGTCAATGCACAACTTTGTA	3100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2441	AAAGCATGTTGCAGTCAACTACTTCACTCTTGTCAATGCACAACTTTGTA	2392

  AC119415.13	3101	GATTAATGTATTTAACTATTTAAGGTAAAAAATTATAAAAAATTTAATAT	3150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2391	GATTAATGTATTTAACTATTTAAGGTAAAAAATTATAAAAAATTTAATAT	2342

  AC119415.13	3151	TTTGAAAATATTTATCGATACAAATCGAACAACATCTTATATGTTAAGTT	3200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2341	TTTGAAAATATTTATCGATACAAATCGAACAACATCTTATATGTTAAGTT	2292

  AC119415.13	3201	TGTATTTACATATTAATTAAAAAATACGGTTAAATTAAGTCACGTGAATA	3250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2291	TGTATTTACATATTAATTAAAAAATACGGTTAAATTAAGTCACGTGAATA	2242

  AC119415.13	3251	ATGCGCATTGAAAAAATGCGACATGTATTTTAAACGGATGAAGTATAATT	3300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2241	ATGCGCATTGAAAAAATGCGACATGTATTTTAAACGGATGAAGTATAATT	2192

  AC119415.13	3301	TACTAAAATACTCTTATTAACTCTAGTTAGTTGAGTATTTAGGTGGATTA	3350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2191	TACTAAAATACTCTTATTAACTCTAGTTAGTTGAGTATTTAGGTGGATTA	2142

  AC119415.13	3351	TAATTCAATAAATAAGAGTATATTAATTAAAAATAAGTAAATGTTACATT	3400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2141	TAATTCAATAAATAAGAGTATATTAATTAAAAATAAGTAAATGTTACATT	2092

  AC119415.13	3401	AATATTTTAAAGTGACAATTATTTTGAGACAAAAAATACTAAAGAGACGA	3450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2091	AATATTTTAAAGTGACAATTATTTTGAGACAAAAAATACTAAAGAGACGA	2042

  AC119415.13	3451	GTAAAAATGTTACATTGATATTTTAAAGGACAAGTAAAATGAGACGAAAG	3500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	2041	GTAAAAATGTTACATTGATATTTTAAAGGACAAGTAAAATGAGACGAAAG	1992

  AC119415.13	3501	GAATATATTAACAGCTGTGCGATTAGTCTTTTAAAATTTAAGTTTTGTAT	3550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1991	GAATATATTAACAGCTGTGCGATTAGTCTTTTAAAATTTAAGTTTTGTAT	1942

  AC119415.13	3551	TTTTTGATGAACAATTACTAGATTTAAACTCTTTATTCATATTATAGACC	3600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1941	TTTTTGATGAACAATTACTAGATTTAAACTCTTTATTCATATTATAGACC	1892

  AC119415.13	3601	ATATATATAATTTATTTAATAAATCTAAAAAAGTGAAAAGTTATTTATAA	3650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1891	ATATATATAATTTATTTAATAAATCTAAAAAAGTGAAAAGTTATTTATAA	1842

  AC119415.13	3651	TTTAAACAGAGAGAGTATAAGTTAACAATGTCATAATTGATTTAAAAAAA	3700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1841	TTTAAACAGAGAGAGTATAAGTTAACAATGTCATAATTGATTTAAAAAAA	1792

  AC119415.13	3701	AAAAAATGTCATAAATTTAAGCAAGTCGCATTAGTTTAATGAATACTATG	3750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1791	AAAAAATGTCATAAATTTAAGCAAGTCGCATTAGTTTAATGAATACTATG	1742

  AC119415.13	3751	TCAAGAAAAAGATGGGTCCTGACATCACTAGATATTTCCGTGTTGACGTA	3800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1741	TCAAGAAAAAGATGGGTCCTGACATCACTAGATATTTCCGTGTTGACGTA	1692

  AC119415.13	3801	AGCTCTTCACTGTATATTTGTGTTAATATTGTCTAGATCTTCTTGTCCTG	3850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1691	AGCTCTTCACTGTATATTTGTGTTAATATTGTCTAGATCTTCTTGTCCTG	1642

  AC119415.13	3851	AAAAACTTGGGCCCCGGGATCTGTTTCCCTTTACGATTTAAATAGTCTCG	3900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1641	AAAAACTTGGGCCCCGGGATCTGTTTCCCTTTACGATTTAAATAGTCTCG	1592

  AC119415.13	3901	TCAAATCAAATGTGTACACCCTCTCCATTCACTAATATAAACAAAAATTA	3950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1591	TCAAATCAAATGTGTACACCCTCTCCATTCACTAATATAAACAAAAATTA	1542

  AC119415.13	3951	TATTTTAGGTTCATTCATTTAATAATTTCATTTAATAATGTATGTGGTCT	4000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1541	TATTTTAGGTTCATTCATTTAATAATTTCATTTAATAATGTATGTGGTCT	1492

  AC119415.13	4001	ATAATAAAAATCATGTGTTCTTTAAAAAAAATAAAAACCATGTGCATCAT	4050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1491	ATAATAAAAATCATGTGTTCTTTAAAAAAAATAAAAACCATGTGCATCAT	1442

  AC119415.13	4051	TAAATGAAAGAATCTAAAATATAAACTTTTATTCATAATAGTGACCAAAG	4100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1441	TAAATGAAAGAATCTAAAATATAAACTTTTATTCATAATAGTGACCAAAG	1392

  AC119415.13	4101	GATGTATGCTACATTTTACTGCTATGCTAACTAGCAAAATCACTAAAAAT	4150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1391	GATGTATGCTACATTTTACTGCTATGCTAACTAGCAAAATCACTAAAAAT	1342

  AC119415.13	4151	AAGGAAGTACTATTGACTGGAAAACCCTAGAGAGACATTATTTAAGGGGT	4200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1341	AAGGAAGTACTATTGACTGGAAAACCCTAGAGAGACATTATTTAAGGGGT	1292

  AC119415.13	4201	CAAAATTAAAAAAGGGTTTTGCCAATGATTGTCACCTAACACTTTAAGCA	4250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1291	CAAAATTAAAAAAGGGTTTTGCCAATGATTGTCACCTAACACTTTAAGCA	1242

  AC119415.13	4251	TTCAAAATCACGATATTATTGTTTAAAAAATCACTTGTTATAACTTTCAA	4300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1241	TTCAAAATCACGATATTATTGTTTAAAAAATCACTTGTTATAACTTTCAA	1192

  AC119415.13	4301	TACATTGAATCACACATTTCATATAAACTTGCTATTTATGACGTTTAAAG	4350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1191	TACATTGAATCACACATTTCATATAAACTTGCTATTTATGACGTTTAAAG	1142

  AC119415.13	4351	AGAGTGTGGAGCAACTCAGCAACTCGTTAATATTTTCGATACTTTTTTTA	4400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1141	AGAGTGTGGAGCAACTCAGCAACTCGTTAATATTTTCGATACTTTTTTTA	1092

  AC119415.13	4401	CTTAACTTGACTATTCATAATGGTTGATGCTTCATGTATTTAACACCGTA	4450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1091	CTTAACTTGACTATTCATAATGGTTGATGCTTCATGTATTTAACACCGTA	1042

  AC119415.13	4451	TTAAAAATGCACCCTCATGTGGAGTATGATACATGGGTGCCTGCCTCTAT	4500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	1041	TTAAAAATGCACCCTCATGTGGAGTATGATACATGGGTGCCTGCCTCTAT	992

  AC119415.13	4501	GGAAAAGGTGACTAAGGAAGCACTCTTTCTCTCTTCATTTTTCACAAGCC	4550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	991	GGAAAAGGTGACTAAGGAAGCACTCTTTCTCTCTTCATTTTTCACAAGCC	942

  AC119415.13	4551	TCATTTAATAAATCTTAATAAAATAAACATTTTTTGTTGAAATGTAATGA	4600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	941	TCATTTAATAAATCTTAATAAAATAAACATTTTTTGTTGAAATGTAATGA	892

  AC119415.13	4601	TATATAATTATATATGAAAACTATTTAATAATTTCTTTTAAGCTCGATTG	4650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	891	TATATAATTATATATGAAAACTATTTAATAATTTCTTTTAAGCTCGATTG	842

  AC119415.13	4651	AAAAAAAATTGGTGTTCATTAACTATTATCGTAAAATAAGTGATGTTAGG	4700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	841	AAAAAAAATTGGTGTTCATTAACTATTATCGTAAAATAAGTGATGTTAGG	792

  AC119415.13	4701	AGACTCATTTGAGCACCCAATTTGGGGTGCTCTCTTGTGGATGTTCTAAG	4750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	791	AGACTCATTTGAGCACCCAATTTGGGGTGCTCTCTTGTGGATGTTCTAAG	742

  AC119415.13	4751	TGTTGCTGCTTCATTAATTTTTGTCGTAGAAAATAAACAAAAATAAGGAA	4800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	741	TGTTGCTGCTTCATTAATTTTTGTCGTAGAAAATAAACAAAAATAAGGAA	692

  AC119415.13	4801	GATAAAAATTCATATACTCATCAGTCTCCTTGATTAAGCCCAGCTACGAC	4850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	691	GATAAAAATTCATATACTCATCAGTCTCCTTGATTAAGCCCAGCTACGAC	642

  AC119415.13	4851	AAGGCTCTTCATGACAAATGATAAACAAGCCCCCATCAATAATTTGTGTT	4900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	641	AAGGCTCTTCATGACAAATGATAAACAAGCCCCCATCAATAATTTGTGTT	592

  AC119415.13	4901	TCGGTAGATGATGAATTAACAAGCAAATTAAAGTCCAACATAATTGACAA	4950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	591	TCGGTAGATGATGAATTAACAAGCAAATTAAAGTCCAACATAATTGACAA	542

  AC119415.13	4951	CTGTTGCATGATAATTTGTATGTGGCAGGGAAACTGTGGCAAATTACTGC	5000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	541	CTGTTGCATGATAATTTGTATGTGGCAGGGAAACTGTGGCAAATTACTGC	492

  AC119415.13	5001	AAAGAAGTTAGGGAATTGGGGTTGAGAATAGAAGAATACATATCAGAGAG	5050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	491	AAAGAAGTTAGGGAATTGGGGTTGAGAATAGAAGAATACATATCAGAGAG	442

  AC119415.13	5051	CTTGGGCCTAGAAAAAGATTACTTAAGGAATGCTTTAGGTGAACAAGGGC	5100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	441	CTTGGGCCTAGAAAAAGATTACTTAAGGAATGCTTTAGGTGAACAAGGGC	392

  AC119415.13	5101	AGCACATGGCAGTGAATTACTATCCACCATGCCCACAACCAGAACTTACT	5150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	391	AGCACATGGCAGTGAATTACTATCCACCATGCCCACAACCAGAACTTACT	342

  AC119415.13	5151	TATGGATTGCCAGGGCATACAGACCCAAATGCACTTACAATTCTACTCCA	5200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	341	TATGGATTGCCAGGGCATACAGACCCAAATGCACTTACAATTCTACTCCA	292

  AC119415.13	5201	AGATCTTCATGTTGCTGGCCTACAAGTCCTCAAAGATGGCAAGTGGCTTG	5250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	291	AGATCTTCATGTTGCTGGCCTACAAGTCCTCAAAGATGGCAAGTGGCTTG	242

  AC119415.13	5251	CTATTAACCCAATTCCTGATGCCTTTGTTATTAACATAGGTGATCAACTG	5300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	241	CTATTAACCCAATTCCTGATGCCTTTGTTATTAACATAGGTGATCAACTG	192

  AC119415.13	5301	CAGGTATGTAATAAGCTACTCATTTACGACAAATATACGCTACATTAACA	5350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	191	CAGGTATGTAATAAGCTACTCATTTACGACAAATATACGCTACATTAACA	142

  AC119415.13	5351	TTGTAACTAAATTTGAGCCAGTTATTTGCGTAGTCATGATCACCTTAAGA	5400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	141	TTGTAACTAAATTTGAGCCAGTTATTTGCGTAGTCATGATCACCTTAAGA	92

  AC119415.13	5401	CACACTTGATGGACTAGTTAGTATCAACAAACAGTTTATCAATCCATGAA	5450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	91	CACACTTGATGGACTAGTTAGTATCAACAAACAGTTTATCAATCCATGAA	42

  AC119415.13	5451	CACGCGTAACTGTTGGTGGCGTGCTCTTCACCTCCAAGCTT	5491
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR940305.16	41	CACGCGTAACTGTTGGTGGCGTGCTCTTCACCTCCAAGCTT	1

Overview

Query
AC119415.13 - 139330 bps
Hit
CR940305.16 - 134589 bps
Total alignments
2
Best alignment
alignment #1 (HSP: 5491 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11005155549115491115491-1
286.0725966830703313701779384631
Short-link