<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759815.3	1	GGCCATTCCAGACATAGGGAACAGCACACACGAAGGCTGATGCACATACG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	8603	GGCCATTCCAGACATAGGGAACAGCACACACGAAGGCTGATGCACATACG	8652

CR759815.3	51	CGCAAGGGCTGGTCCCTAGAGCTGGTGGTTCTGGCCACGAGAGCTCATCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	8653	CGCAAGGGCTGGTCCCTAGAGCTGGTGGTTCTGGCCACGAGAGCTCATCA	8702

CR759815.3	101	CCTGGGGGCAGCTTCTGTACCTGCACCCTGTATGAGGCTCCGGGTCTGCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	8703	CCTGGGGGCAGCTTCTGTACCTGCACCCTGTATGAGGCTCCGGGTCTGCC	8752

CR759815.3	151	CTTCCTGGTCCATCCTCCAGACACACTGCCTGTTCTTCTCTCAGGTCCCG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	8753	CTTCCTGGTCCATCCTCCAGACACACTGCCTGTTCTTCTCTCAGGTCCCG	8802

CR759815.3	201	CTCCGGGCCCTCCTCCCAGAAGCCTCCCCTGACTAGTCCAGCTCACCGTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	8803	CTCCGGGCCCTCCTCCCAGAAGCCTCCCCTGACTAGTCCAGCTCACCGTG	8852

CR759815.3	251	ACTCTTCTGAACTCACGGCGTTTACTGCCAAGGCTATTACATTGGCGCTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	8853	ACTCTTCTGAACTCACGGCGTTTACTGCCAAGGCTATTACATTGGCGCTC	8902

CR759815.3	301	GCTCATGTCATTATTAGGAAATATGCATTTTTACTGTCTTTGATGTTATT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	8903	GCTCATGTCATTATTAGGAAATATGCATTTTTACTGTCTTTGATGTTATT	8952

CR759815.3	351	TAAACTTGCCTGTAAATTCTGTCTCTCTCAATTTTAAGTTCTGAGTAGAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	8953	TAAACTTGCCTGTAAATTCTGTCTCTCTCAATTTTAAGTTCTGAGTAGAA	9002

CR759815.3	401	ACTACATATTTTTATTATTTATATTCTTATATTCTCCCATGGCACCCGGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9003	ACTACATATTTTTATTATTTATATTCTTATATTCTCCCATGGCACCCGGC	9052

CR759815.3	451	ATTCGTGGACACATTGAGGAAGTAAGATAATGAATGAATGAATGGGTGAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9053	ATTCGTGGACACATTGAGGAAGTAAGATAATGAATGAATGAATGGGTGAA	9102

CR759815.3	501	TCCAGTCCAGCTTGGGGCCTATTTAATTCTACTAGGCTCAACCTACAATT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9103	TCCAGTCCAGCTTGGGGCCTATTTAATTCTACTAGGCTCAACCTACAATT	9152

CR759815.3	551	CTTATGTGTTCTCAGATTATTCCTAAACCCTAAGCTTAGTTTTGTTTCAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9153	CTTATGTGTTCTCAGATTATTCCTAAACCCTAAGCTTAGTTTTGTTTCAT	9202

CR759815.3	601	TCGGACCACATGTAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTCTGAGACGGGGTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9203	TCGGACCACATGTAGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTCTGAGACGGGGTCT	9252

CR759815.3	651	TGCTCTGTCGCCCAGGCTGCAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACCGCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9253	TGCTCTGTCGCCCAGGCTGCAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACCGCA	9302

CR759815.3	701	ACCTCTGCCTCCCAGGTTCAATGGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9303	ACCTCTGCCTCCCAGGTTCAATGGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGAA	9352

CR759815.3	751	GCTGGGATTACAGGCGCCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9353	GCTGGGATTACAGGCGCCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTT	9402

CR759815.3	801	TTAGTAGAGACAGGGATTCACCATGTTGGTGAGGCTGGTCTCGAACTCCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9403	TTAGTAGAGACAGGGATTCACCATGTTGGTGAGGCTGGTCTCGAACTCCT	9452

CR759815.3	851	GACCTCAGGTAATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9453	GACCTCAGGTAATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAG	9502

CR759815.3	901	GTGTGAGCCACCACGCCTGATCTCATGTGTAGTTTTTTGGTTTTTTATTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9503	GTGTGAGCCACCACGCCTGATCTCATGTGTAGTTTTTTGGTTTTTTATTT	9552

CR759815.3	951	GTTTGTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9553	GTTTGTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCA	9602

CR759815.3	1001	GTGGCACAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCCAGGTTCACGCCAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9603	GTGGCACAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCCAGGTTCACGCCAT	9652

CR759815.3	1051	TCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCGGCCACCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9653	TCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCGGCCACCA	9702

CR759815.3	1101	TGCCCAGCTAATTTTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACTGGGTTTCACCAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9703	TGCCCAGCTAATTTTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACTGGGTTTCACCAT	9752

CR759815.3	1151	GTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATTCGCCCGCCTTGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9753	GTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATTCGCCCGCCTTGG	9802

CR759815.3	1201	CCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTCTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9803	CCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTCTC	9852

CR759815.3	1251	ATATGTAGTTTTTAATGAGAGTTACCACATAAGCAAACTGGGTTCTAAGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9853	ATATGTAGTTTTTAATGAGAGTTACCACATAAGCAAACTGGGTTCTAAGT	9902

CR759815.3	1301	GGTGAAATTTAAGGTTATGCAACCTCAGTTTCTTTTAACCCCTCTTCATC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9903	GGTGAAATTTAAGGTTATGCAACCTCAGTTTCTTTTAACCCCTCTTCATC	9952

CR759815.3	1351	CCTAACCCTGGTCGGATACTTGATTGACAGTAGACCATTGGGATCTCTGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	9953	CCTAACCCTGGTCGGATACTTGATTGACAGTAGACCATTGGGATCTCTGA	10002

CR759815.3	1401	GCTCCTGTCCTTCTAACCTGATTGCCTCTTTAAAGGATTTTGAAAAACTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	10003	GCTCCTGTCCTTCTAACCTGATTGCCTCTTTAAAGGATTTTGAAAAACTA	10052

CR759815.3	1451	TGTCCCTTGCACATTTGTATTGTTTTGAGACACGGTCTCACTCTGTTGCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	10053	TGTCCCTTGCACATTTGTATTGTTTTGAGACACGGTCTCACTCTGTTGCC	10102

CR759815.3	1501	CAGACTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTACAGCCTCAACCTCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	10103	CAGACTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTTGGCTCACTACAGCCTCAACCTCC	10152

CR759815.3	1551	CAGGGTCAAGCAATCTTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	10153	CAGGGTCAAGCAATCTTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACA	10202

CR759815.3	1601	GGTGCGGGCCACCACATCTGGCTAATTTCTTAAATTTTCTGTAGAGACAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	10203	GGTGCGGGCCACCACATCTGGCTAATTTCTTAAATTTTCTGTAGAGACAG	10252

CR759815.3	1651	TTTTGCCATGTTGCCTAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCACAAGCAATCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	10253	TTTTGCCATGTTGCCTAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCACAAGCAATCC	10302

CR759815.3	1701	ACCCGATTCGGCCTCCCGAAGTGCTGGTATTACAGGCATGAGCCACCTCG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	10303	ACCCGATTCGGCCTCCCGAAGTGCTGGTATTACAGGCATGAGCCACCTCG	10352

CR759815.3	1751	CCCAGCCCCTTGCACATTTTTAAGTCAACATTTAACATTTGTAATAATTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	10353	CCCAGCCCCTTGCACATTTTTAAGTCAACATTTAACATTTGTAATAATTT	10402

CR759815.3	1801	AATAGCATTCCAAAGGGTAGGCTTTTCAGGGAATTGCAAATACATGTTAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	10403	AATAGCATTCCAAAGGGTAGGCTTTTCAGGGAATTGCAAATACATGTTAA	10452

CR759815.3	1851	AAATCACATCACTATTTATGTATTTATTTATTTATTTATTATTTTTGAGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	10453	AAATCACATCACTATTTATGTATTTATTTATTTATTTATTATTTTTGAGA	10502

CR759815.3	1901	TGGAGTCTCACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	10503	TGGAGTCTCACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGC	10552

CR759815.3	1951	TCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATCCTCATGCCCTAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR938714.3	10553	TCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATCCTCATGCCCTAGCTT	10602

Overview

Query
CR759815.3 - 102782 bps
Hit
CR938714.3 - 10602 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link