<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927167.6	1	GGCCAGGATGGTCTCGCTCTCTTGCCCTCGTGATCCCCGCACCTTGGCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	24599	GGCCAGGATGGTCTCGCTCTCTTGCCCTCGTGATCCCCGCACCTTGGCCT	24648

BX927167.6	51	CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACGCGGCCTATTTTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	24649	CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACGCGGCCTATTTTT	24698

BX927167.6	101	TGTATTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGGTCTTA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	24699	TGTATTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTGGTCTTA	24748

BX927167.6	151	AACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	24749	AACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG	24798

BX927167.6	201	ATTACAAGTGTGAGCCACCACACAAGGCCTACTTGTTCTTTTTAACTAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	24799	ATTACAAGTGTGAGCCACCACACAAGGCCTACTTGTTCTTTTTAACTAAT	24848

BX927167.6	251	TATAACATTTACAGCAACTCATATGTTGAAGCGGTTTTAACAGCTTTAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	24849	TATAACATTTACAGCAACTCATATGTTGAAGCGGTTTTAACAGCTTTAAA	24898

BX927167.6	301	AGGTTTCTGTGGGATTATCATTGACCTGTTTTTACTTTGTCTTAGTGATA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	24899	AGGTTTCTGTGGGATTATCATTGACCTGTTTTTACTTTGTCTTAGTGATA	24948

BX927167.6	351	GCTTTGTAGGAAAGATTAATTTTTCCTTAGCCCAGCAGAGAGAGGTGAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	24949	GCTTTGTAGGAAAGATTAATTTTTCCTTAGCCCAGCAGAGAGAGGTGAGA	24998

BX927167.6	401	CTGATGGACATAAAAAGAAAATACTCAAGAAAATATATTAATCAATAGTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	24999	CTGATGGACATAAAAAGAAAATACTCAAGAAAATATATTAATCAATAGTG	25048

BX927167.6	451	TATTTTATTATTAGAATACATCCATAAGAATCCTTTATATTTATGCCTAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25049	TATTTTATTATTAGAATACATCCATAAGAATCCTTTATATTTATGCCTAC	25098

BX927167.6	501	ACTCTTCATGAATCTCTTCTTGTGGACATATTTATTTACTTATACATTTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25099	ACTCTTCATGAATCTCTTCTTGTGGACATATTTATTTACTTATACATTTC	25148

BX927167.6	551	TTAATTCAACATATATTTATTGAATACATTTTTGAATATGGCAATATACA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25149	TTAATTCAACATATATTTATTGAATACATTTTTGAATATGGCAATATACA	25198

BX927167.6	601	TTCATATTTGTTATTATTATTATTATTACGAGATGGAGTTTCACTCTGTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25199	TTCATATTTGTTATTATTATTATTATTACGAGATGGAGTTTCACTCTGTT	25248

BX927167.6	651	GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25249	GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCC	25298

BX927167.6	701	TCACAGGTTCAAGGGATTCTCGCGCCTCAGCTTGGGAATACAGGGGTCCG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25299	TCACAGGTTCAAGGGATTCTCGCGCCTCAGCTTGGGAATACAGGGGTCCG	25348

BX927167.6	751	CCACCACGCCCATCTATTTTTTTGTATTTTTAATAGAGACAGGGTTTCAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25349	CCACCACGCCCATCTATTTTTTTGTATTTTTAATAGAGACAGGGTTTCAC	25398

BX927167.6	801	CATGTTGGCCAGGGTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCAATCCGCCTGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25399	CATGTTGGCCAGGGTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCAATCCGCCTGC	25448

BX927167.6	851	CTCGGCGTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25449	CTCGGCGTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGC	25498

BX927167.6	901	CTCATATGTATAATTTTTAGTTAAATTAATAAATTAATATTTATGGTTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25499	CTCATATGTATAATTTTTAGTTAAATTAATAAATTAATATTTATGGTTTT	25548

BX927167.6	951	CATCATTATGACTTTGTAATATTTTTCACAGCTGAGCTCCATGGTATACC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25549	CATCATTATGACTTTGTAATATTTTTCACAGCTGAGCTCCATGGTATACC	25598

BX927167.6	1001	ATAATTACCTTCTTTGACAACCTTTTGTTCTTCCTGGGATTAATAATTGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25599	ATAATTACCTTCTTTGACAACCTTTTGTTCTTCCTGGGATTAATAATTGC	25648

BX927167.6	1051	CTCCTGTTCTTTGCTTACTTTTCTAAATATTTATTCCTAATTCAAAACCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25649	CTCCTGTTCTTTGCTTACTTTTCTAAATATTTATTCCTAATTCAAAACCA	25698

BX927167.6	1101	GCTTTCTGACACTATTTTCTCGTCAAATGCATGAGGCAGTATGTCAGTTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25699	GCTTTCTGACACTATTTTCTCGTCAAATGCATGAGGCAGTATGTCAGTTC	25748

BX927167.6	1151	CATTTTCCCCCATTGGAAACAACCCTCGTTTAGCCCTCTTTTTTCTATTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25749	CATTTTCCCCCATTGGAAACAACCCTCGTTTAGCCCTCTTTTTTCTATTC	25798

BX927167.6	1201	CACCGTAGACTGATTGCCTTCTAGCCTGGTAGCTCAGCAGTTGCCCCGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25799	CACCGTAGACTGATTGCCTTCTAGCCTGGTAGCTCAGCAGTTGCCCCGGA	25848

BX927167.6	1251	GTTTTTTCCTTTACCTTTCTTCTGTGTTAGGTCCCCAGTCACCGGATTTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25849	GTTTTTTCCTTTACCTTTCTTCTGTGTTAGGTCCCCAGTCACCGGATTTC	25898

BX927167.6	1301	ATATTTCCTTTTTCTTAGTTTAATTCCCTAGTTAGTGGACAATTCTCCAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25899	ATATTTCCTTTTTCTTAGTTTAATTCCCTAGTTAGTGGACAATTCTCCAG	25948

BX927167.6	1351	AAGCTTTCTGAGAAAAGGTACTTGGGAGATAATGTTCTGCAAATGTCCAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25949	AAGCTTTCTGAGAAAAGGTACTTGGGAGATAATGTTCTGCAAATGTCCAT	25998

BX927167.6	1401	TCACATTTGATTGATAGTTTGGCTGGGTTCAGAAATCTAGTTGTGGAAAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	25999	TCACATTTGATTGATAGTTTGGCTGGGTTCAGAAATCTAGTTGTGGAAAC	26048

BX927167.6	1451	TATTTTCCTTTATTGAAATGATTTAGAAGGCATTGCCTCATTGTCTTTCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	26049	TATTTTCCTTTATTGAAATGATTTAGAAGGCATTGCCTCATTGTCTTTCA	26098

BX927167.6	1501	GCTTTTGGTGTTGGTGCTGCTGTGGAGAAAAAAAGATGACATTCTAATTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	26099	GCTTTTGGTGTTGGTGCTGCTGTGGAGAAAAAAAGATGACATTCTAATTC	26148

BX927167.6	1551	ATAATCCTTTCTGTGCAATCTTTTAGTTTTGTTTTCCTTCTGGAAACATT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	26149	ATAATCCTTTCTGTGCAATCTTTTAGTTTTGTTTTCCTTCTGGAAACATT	26198

BX927167.6	1601	TAGGATATTCACTTTATTCATCTGATATTTCACAATGACAAGCTTTATTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	26199	TAGGATATTCACTTTATTCATCTGATATTTCACAATGACAAGCTTTATTG	26248

BX927167.6	1651	TGGGGCTTTGCCACACCCTATGCAGGGTAGTTGGTGGGCCTTTTAAATCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	26249	TGGGGCTTTGCCACACCCTATGCAGGGTAGTTGGTGGGCCTTTTAAATCT	26298

BX927167.6	1701	GGAGACTTAAGGTCTTTGGTTCTGAAAAATAATCTTATATTACATCTTTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	26299	GGAGACTTAAGGTCTTTGGTTCTGAAAAATAATCTTATATTACATCTTTA	26348

BX927167.6	1751	TCTCCTTTATTCCACTTTCTCCTCTTTTCCTAGAATCCCTGTTAGTTTGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	26349	TCTCCTTTATTCCACTTTCTCCTCTTTTCCTAGAATCCCTGTTAGTTTGT	26398

BX927167.6	1801	TGGCATATCTTCTATTATACACCATTTTATTTTCTTATCAATTCTTTGCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	26399	TGGCATATCTTCTATTATACACCATTTTATTTTCTTATCAATTCTTTGCT	26448

BX927167.6	1851	ATTTTCCATCATTCACCCCAAACTTTCCAGATTTCTACAACCTTATTTTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	26449	ATTTTCCATCATTCACCCCAAACTTTCCAGATTTCTACAACCTTATTTTG	26498

BX927167.6	1901	AAATTTTAGGCCAGGCGCAGTGGCTCACAACTGTAATCCCAGCACTTTGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	26499	AAATTTTAGGCCAGGCGCAGTGGCTCACAACTGTAATCCCAGCACTTTGG	26548

BX927167.6	1951	GAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCGAGACCAGTCAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936965.7	26549	GAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCGAGACCAGTCAG	26598

Overview

Query
BX927167.6 - 124344 bps
Hit
CR936965.7 - 26598 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link