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Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

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CR936924.2	40132	AGAGTGGGATGGAGGCAAAGGGGCCACGGAGCTTCCTGGGCTGCTATGGC	40181

CR936882.4	51	TCTGTGAGCCGGTCCCAGGAACGGGAGGGTGACTGGGCCAGGAGTAGGAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	40182	TCTGTGAGCCGGTCCCAGGAACGGGAGGGTGACTGGGCCAGGAGTAGGAA	40231

CR936882.4	101	TAAAAGAGGAGCCAGACAAGAAAGCAAGTGTCCCCTGGGGTGCAGGGAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	40232	TAAAAGAGGAGCCAGACAAGAAAGCAAGTGTCCCCTGGGGTGCAGGGAAA	40281

CR936882.4	151	GTAGGGAGAGGGATGAGTGTGAGTGGGAGAGGAGAGCTCAGGGCCTGGGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	40282	GTAGGGAGAGGGATGAGTGTGAGTGGGAGAGGAGAGCTCAGGGCCTGGGT	40331

CR936882.4	201	TTTCCTGGACCCAATAAATCAGTGGGTGCTGAGGACTGGAGTGTGGGGCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	40332	TTTCCTGGACCCAATAAATCAGTGGGTGCTGAGGACTGGAGTGTGGGGCA	40381

CR936882.4	251	CAGAACGTGAAATTCCAACAGGTGCCACAAGGGGGCGAAGGCTCTGGCCG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	40382	CAGAACGTGAAATTCCAACAGGTGCCACAAGGGGGCGAAGGCTCTGGCCG	40431

CR936882.4	301	CGGGAGGCCTCCAGCCCTCACTCACCGGTCCTGGCCTCCACAGGGACTGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	40432	CGGGAGGCCTCCAGCCCTCACTCACCGGTCCTGGCCTCCACAGGGACTGG	40481

CR936882.4	351	GCCGTGGCGTTTCCCATTCTGGAGTCCAAAGAGCAGGAACTTGTACTTGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	40482	GCCGTGGCGTTTCCCATTCTGGAGTCCAAAGAGCAGGAACTTGTACTTGC	40531

CR936882.4	401	GGGCCGGGTCCAGCCCCGAGACGGCGACCGCTCGGAGGTCTCCGCTCACA	450
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CR936882.4	451	GGCACTGCCTGGGGCTGCCCCTGCGCGTCCCTGTACTGTACCAGGAAGGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	40582	GGCACTGCCTGGGGCTGCCCCTGCGCGTCCCTGTACTGTACCAGGAAGGA	40631

CR936882.4	501	GTCAAAGGGGCCCTGGGCCACCGTCCATGAGAGGCCCACTGAGTCCGAGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CR936882.4	551	TCACGGCCGCCACCGCCAGCTCCCCCAGGCGGGGCTCCACCGGCAGTGGT	600
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CR936882.4	601	GTGGGCAGGGGCGCTGAAAAGAGCAGAGCAGGCCCATGGGTCAGGAGGCA	650
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CR936924.2	40732	GTGGGCAGGGGCGCTGAAAAGAGCAGAGCAGGCCCATGGGTCAGGAGGCA	40781

CR936882.4	651	GGACCCTGCGCAAGGGAGGCAGTGCTCTCCCAGGACTGGAGTGAGCATTT	700
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CR936924.2	40782	GGACCCTGCGCAAGGGAGGCAGTGCTCTCCCAGGACTGGAGTGAGCATTT	40831

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CR936924.2	40832	CTTAGCGGCCTCCTCTAAAACGCTTGTTTTAGAATCTGTGCCCTGCATTG	40881

CR936882.4	751	CTGTAAGCAGCTCACAAACAGTGGTGCATTTAACCCTCGCACAACATATG	800
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CR936924.2	40882	CTGTAAGCAGCTCACAAACAGTGGTGCATTTAACCCTCGCACAACATATG	40931

CR936882.4	801	AAGTGGGTGCCATTATTATCATCACCCCAACTTTGCAGGAATCTGAAGCA	850
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CR936924.2	40932	AAGTGGGTGCCATTATTATCATCACCCCAACTTTGCAGGAATCTGAAGCA	40981

CR936882.4	851	CAAGGTTAGGAAACGCCTGCAAAGTCGCACAATCACTACATTCGAAGGCA	900
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CR936924.2	40982	CAAGGTTAGGAAACGCCTGCAAAGTCGCACAATCACTACATTCGAAGGCA	41031

CR936882.4	901	CATGCAGATCTGGGCAGCTGGATCTGAAGCACTTTCTGAGCCACTAAAAT	950
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CR936924.2	41032	CATGCAGATCTGGGCAGCTGGATCTGAAGCACTTTCTGAGCCACTAAAAT	41081

CR936882.4	951	ACTCCTTAAGGGAGCCTGAAGACTAACAAATGAGCACACGAGCAACATGG	1000
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CR936924.2	41082	ACTCCTTAAGGGAGCCTGAAGACTAACAAATGAGCACACGAGCAACATGG	41131

CR936882.4	1001	AGGTTCCAGATCACAATGGGAGAAGGAAGCTACAACAAACAGGGCATGGA	1050
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CR936924.2	41132	AGGTTCCAGATCACAATGGGAGAAGGAAGCTACAACAAACAGGGCATGGA	41181

CR936882.4	1051	CTACCTGCCCATCTGACTCCACACAGTCTCCATGAATCCAAGGATGAGGC	1100
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CR936924.2	41182	CTACCTGCCCATCTGACTCCACACAGTCTCCATGAATCCAAGGATGAGGC	41231

CR936882.4	1101	AGGATCATTAGCAACATGGGAGAAAAGACAGAAACCTAGAGGCCCAGTCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	41232	AGGATCATTAGCAACATGGGAGAAAAGACAGAAACCTAGAGGCCCAGTCA	41281

CR936882.4	1151	AAAGAGGTGCCAAGATCCAAAGGAGAAACACAAGGGGGCTGCAGAGGTAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	41282	AAAGAGGTGCCAAGATCCAAAGGAGAAACACAAGGGGGCTGCAGAGGTAA	41331

CR936882.4	1201	ACCTGGGGACGAGGGCCTGTCCCCCCACTCACCCGTGATGCCCACGGTGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	41332	ACCTGGGGACGAGGGCCTGTCCCCCCACTCACCCGTGATGCCCACGGTGG	41381

CR936882.4	1251	ACACTGGGCCCACGCGCTGCCCCTCGTGGAGGCCGTACAGATGCATCTTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	41382	ACACTGGGCCCACGCGCTGCCCCTCGTGGAGGCCGTACAGATGCATCTTG	41431

CR936882.4	1301	TATTTGCGCCCGGGCTCCAGGCCCCCCACGGTGACCTCGCTCTCCTCGCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	41432	TATTTGCGCCCGGGCTCCAGGCCCCCCACGGTGACCTCGCTCTCCTCGCC	41481

CR936882.4	1351	CCTGACACGCACCACCTGGGGCTGCCCGTCCCTGTCCTTGTACTGCACGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	41482	CCTGACACGCACCACCTGGGGCTGCCCGTCCCTGTCCTTGTACTGCACGG	41531

CR936882.4	1401	TGAAGGAGTCGAAGCGGCCCTGGGGGACGGTCCAGGAGAGGCTCAGCGAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	41532	TGAAGGAGTCGAAGCGGCCCTGGGGGACGGTCCAGGAGAGGCTCAGCGAG	41581

CR936882.4	1451	TCAGGGGAGGATCCTGTCACTGTCAACTCCCCCAGGAGCGGCTCCTCAGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	41582	TCAGGGGAGGATCCTGTCACTGTCAACTCCCCCAGGAGCGGCTCCTCAGG	41631

CR936882.4	1501	GGCCTCCGGGGCCTCAGTGCTGGGTTCTGTGGGGCTGGGGGTCTCTTCCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	41632	GGCCTCCGGGGCCTCAGTGCTGGGTTCTGTGGGGCTGGGGGTCTCTTCCT	41681

CR936882.4	1551	CTGCAGTGGAGAAGGAGGGAGAGAGAGTGAGGGGGATGTCCTTGGGTCCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	41682	CTGCAGTGGAGAAGGAGGGAGAGAGAGTGAGGGGGATGTCCTTGGGTCCT	41731

CR936882.4	1601	GGGGAAAAGGAGGGAGAAGCCAAGGCTATGACTGGGGGACCTGAGGTCAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	41732	GGGGAAAAGGAGGGAGAAGCCAAGGCTATGACTGGGGGACCTGAGGTCAT	41781

CR936882.4	1651	TTCAGAGAAGTCCATTCTTGGGGCTGGGTGGTCCTGCTCAGCTGACAGCT	1700
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CR936882.4	1701	AACACACGTAACAAGTTCCAGGGTCAGCTGTGGGGGACCTGGCACAGCCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	41832	AACACACGTAACAAGTTCCAGGGTCAGCTGTGGGGGACCTGGCACAGCCA	41881

CR936882.4	1751	CCAGCACAGCAAAACTCCTGATGGCCCCTCCCTGCTCAGGGGGAGCCAGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	41882	CCAGCACAGCAAAACTCCTGATGGCCCCTCCCTGCTCAGGGGGAGCCAGG	41931

CR936882.4	1801	GGTCAACCACATAGGAAGGCCCAAGGGGAGTCCCAGCCCCAGCCACAAGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	41932	GGTCAACCACATAGGAAGGCCCAAGGGGAGTCCCAGCCCCAGCCACAAGC	41981

CR936882.4	1851	AGTTCTGTGGTGCTGACCAGACCCCTGTCCCATTCCCCACCAGTCATCAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936924.2	41982	AGTTCTGTGGTGCTGACCAGACCCCTGTCCCATTCCCCACCAGTCATCAC	42031

CR936882.4	1901	CAAAGAGCAAGAGGTGGCCCTCCCACAGCTCCCACCCTGGGGCTCCCATC	1950
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CR936924.2	42032	CAAAGAGCAAGAGGTGGCCCTCCCACAGCTCCCACCCTGGGGCTCCCATC	42081

CR936882.4	1951	ATTCACTCACCCGTCACCCCAATGGCAGACACAGGGCCTACGCGCTGGCC	2000
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CR936924.2	42082	ATTCACTCACCCGTCACCCCAATGGCAGACACAGGGCCTACGCGCTGGCC	42131

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CR936882.4 - 5584 bps
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CR936924.2 - 42131 bps
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