<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR933783.5	1	GGCCAGAACTTCCAATACTATGTTGAGTGGGCGTGGTGAGAAAGGGCATC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	49232	GGCCAGAACTTCCAATACTATGTTGAGTGGGCGTGGTGAGAAAGGGCATC	49281

CR933783.5	51	TTTGTCTTGTCCTGGTTTTCCAAGAAAATGCTTCCAGCTCTTGCCTATTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	49282	TTTGTCTTGTCCTGGTTTTCCAAGAAAATGCTTCCAGCTCTTGCCTATTC	49331

CR933783.5	101	AGAATGATACTGGCTGTGGGTTTGTCATAAACAGCTCTTATTATTTTGAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	49332	AGAATGATACTGGCTGTGGGTTTGTCATAAACAGCTCTTATTATTTTGAA	49381

CR933783.5	151	ATATGTTCCATCAATACCTAGTTTATTGAGTGTTTGTAGCATGAAGGGGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	49382	ATATGTTCCATCAATACCTAGTTTATTGAGTGTTTGTAGCATGAAGGGGT	49431

CR933783.5	201	GTTCAATTTTATTGAAGGCCTTTTCTGCATTTATTGAGATAATCATGTGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	49432	GTTCAATTTTATTGAAGGCCTTTTCTGCATTTATTGAGATAATCATGTGG	49481

CR933783.5	251	TTTTTGTCGTTGGTTCTGTTTATCTGATGGATTACGTTTATTGATTTGTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	49482	TTTTTGTCGTTGGTTCTGTTTATCTGATGGATTACGTTTATTGATTTGTG	49531

CR933783.5	301	TATGTTGAACCAGCCTTACATCCCAGGGATGAAGCTGACTAGCTCATGGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	49532	TATGTTGAACCAGCCTTACATCCCAGGGATGAAGCTGACTAGCTCATGGT	49581

CR933783.5	351	GAATAAGCTTTTTGATGTGCTGTTGAATTGTTTGCTAGTATTTTATTGAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	49582	GAATAAGCTTTTTGATGTGCTGTTGAATTGTTTGCTAGTATTTTATTGAA	49631

CR933783.5	401	GATTTTCACATCAATGTCCATCAGGGATATTGGCCTGAAATTTTCTTTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	49632	GATTTTCACATCAATGTCCATCAGGGATATTGGCCTGAAATTTTCTTTTT	49681

CR933783.5	451	TGTTGTTGTTGTGTCTCTGCCCTGTTTTGGTATCAAGATGATGCTGACTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	49682	TGTTGTTGTTGTGTCTCTGCCCTGTTTTGGTATCAAGATGATGCTGACTT	49731

CR933783.5	501	CATAAAATGAGTTAGGGAGGAGTCCCTCTTTTTCTATAGTTTGGAATAGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	49732	CATAAAATGAGTTAGGGAGGAGTCCCTCTTTTTCTATAGTTTGGAATAGT	49781

CR933783.5	551	TTCAGAAGGAATGATACCAGGTCATCTTAGTACCTCTGGTAGAATTTGGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	49782	TTCAGAAGGAATGATACCAGGTCATCTTAGTACCTCTGGTAGAATTTGGC	49831

CR933783.5	601	TGTGAATCTGTGTGGTCCTGGAATTTTTTTGGTTGGTAAGCTGCTAATTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	49832	TGTGAATCTGTGTGGTCCTGGAATTTTTTTGGTTGGTAAGCTGCTAATTA	49881

CR933783.5	651	TTGCCTCAATTTCAGAGCCTGTTATTGGTCTATTCAGAGATTCAACTTCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	49882	TTGCCTCAATTTCAGAGCCTGTTATTGGTCTATTCAGAGATTCAACTTCT	49931

CR933783.5	701	TCCTGGTTTAGTCTTGGGAGGGTGTATGTGTCCAGAAGTTTATCAATTTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	49932	TCCTGGTTTAGTCTTGGGAGGGTGTATGTGTCCAGAAGTTTATCAATTTC	49981

CR933783.5	751	TTCTAGATTTTCTGGTTTATTTGCGTAGTGGTGTTTATAATATTCTCTGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	49982	TTCTAGATTTTCTGGTTTATTTGCGTAGTGGTGTTTATAATATTCTCTGA	50031

CR933783.5	801	TGGTAGTTTGTATTTCTGTGAGATCAGTGGTGATATCTCTTTATCGTTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50032	TGGTAGTTTGTATTTCTGTGAGATCAGTGGTGATATCTCTTTATCGTTTT	50081

CR933783.5	851	TTGTTGTGTCTGATTCTTCTCTCTTTTCTCCCTTTTCATAAAGCATTTCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50082	TTGTTGTGTCTGATTCTTCTCTCTTTTCTCCCTTTTCATAAAGCATTTCA	50131

CR933783.5	901	TGGATTCATTGACTTTTTGAAGGGTTTTTTGTGTCTGTATCTCCTTCAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50132	TGGATTCATTGACTTTTTGAAGGGTTTTTTGTGTCTGTATCTCCTTCAAT	50181

CR933783.5	951	TTTGCTCTGATTTTAGTTATTTCTTGTCTTCTGCTAGCTTTTGAATTTGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50182	TTTGCTCTGATTTTAGTTATTTCTTGTCTTCTGCTAGCTTTTGAATTTGT	50231

CR933783.5	1001	TTGCTCTTGCTTCTCTAGTTCTTCTAATTGTGATGTTAAGGTGTCAGTTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50232	TTGCTCTTGCTTCTCTAGTTCTTCTAATTGTGATGTTAAGGTGTCAGTTT	50281

CR933783.5	1051	TAGATCTTTTCCTCTTTCTGATGTTGGCATTCAGTGCTATAAATTTTCCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50282	TAGATCTTTTCCTCTTTCTGATGTTGGCATTCAGTGCTATAAATTTTCCT	50331

CR933783.5	1101	CTAAACACTGCTCTAGCTGTGTCCCAGAGATTCTAGTACATTGTGTCTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50332	CTAAACACTGCTCTAGCTGTGTCCCAGAGATTCTAGTACATTGTGTCTTT	50381

CR933783.5	1151	GTTCTCATTGGTTTCAAAGAACTTCTTTATTTCTGCCTTAATTTTGTTAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50382	GTTCTCATTGGTTTCAAAGAACTTCTTTATTTCTGCCTTAATTTTGTTAT	50431

CR933783.5	1201	TTACCCAGTAGTCATTCAGGAGCAGGTTGTTCAGTTTCCATGTAGTTGTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50432	TTACCCAGTAGTCATTCAGGAGCAGGTTGTTCAGTTTCCATGTAGTTGTG	50481

CR933783.5	1251	TAGTTTTGAGTGAGTTTCTTAATCTTGAGTTCTAATTTGATTGCACTGTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50482	TAGTTTTGAGTGAGTTTCTTAATCTTGAGTTCTAATTTGATTGCACTGTG	50531

CR933783.5	1301	GTCTGAGAGACTGTTTTTTATGATTTCTCTTTTGCATTTGCTGAGGAGTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50532	GTCTGAGAGACTGTTTTTTATGATTTCTCTTTTGCATTTGCTGAGGAGTG	50581

CR933783.5	1351	TCTTACTCCCAATTATGTGGCCAATTTTAGATTAAGTGTAATGTGGTTCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50582	TCTTACTCCCAATTATGTGGCCAATTTTAGATTAAGTGTAATGTGGTTCT	50631

CR933783.5	1401	GAGAAGAATGCATATTCTGCTGATTAGGGGTGAAGAGTTCTGTAGATGTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50632	GAGAAGAATGCATATTCTGCTGATTAGGGGTGAAGAGTTCTGTAGATGTC	50681

CR933783.5	1451	TATTAGGTCTGCTTGGTCCAGAGCTGAGTTCAAGTTCTGAATATCCTTAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50682	TATTAGGTCTGCTTGGTCCAGAGCTGAGTTCAAGTTCTGAATATCCTTAT	50731

CR933783.5	1501	TAATTTTCTGTCTCACTGATCTGTCTAATATTGACAGTGGGGTGTTAAAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50732	TAATTTTCTGTCTCACTGATCTGTCTAATATTGACAGTGGGGTGTTAAAG	50781

CR933783.5	1551	TCTCCCACTATTATTGTGCAGGAGTCTGAGTCTCTTTGTAGGTCTCTAAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50782	TCTCCCACTATTATTGTGCAGGAGTCTGAGTCTCTTTGTAGGTCTCTAAG	50831

CR933783.5	1601	AACTTGCTTTATGAAACTGGGTGCACTTGTATTGGGTGCGTATATATTTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50832	AACTTGCTTTATGAAACTGGGTGCACTTGTATTGGGTGCGTATATATTTA	50881

CR933783.5	1651	GGATAGTTAGCTCTTCTCGTTGCACTGATCCCTTTACCGTTATGTAATTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50882	GGATAGTTAGCTCTTCTCGTTGCACTGATCCCTTTACCGTTATGTAATTC	50931

CR933783.5	1701	CCTTCTTTGTCTTTTTTGATTTAAAGTCTGTTTTATCAGAGACTAGGATT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50932	CCTTCTTTGTCTTTTTTGATTTAAAGTCTGTTTTATCAGAGACTAGGATT	50981

CR933783.5	1751	GCTACTGCTGCTTTTTTTTTTTTTTGGCTTTCCATTTGCTTGGTAAATAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	50982	GCTACTGCTGCTTTTTTTTTTTTTTGGCTTTCCATTTGCTTGGTAAATAT	51031

CR933783.5	1801	TCCTCCATCCCTTTATTTTGAGCCTGTGTGTGTCTTTGCACATGAGATGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	51032	TCCTCCATCCCTTTATTTTGAGCCTGTGTGTGTCTTTGCACATGAGATGG	51081

CR933783.5	1851	GTCTCCTGAATACAGCACACTGATGGGTCTTGACTCTTTATCCAATTTAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	51082	GTCTCCTGAATACAGCACACTGATGGGTCTTGACTCTTTATCCAATTTAT	51131

CR933783.5	1901	CAGTATGTGTCTTTTAATTGGAGCATTTAGCCCATTTATATTTAAGGTTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	51132	CAGTATGTGTCTTTTAATTGGAGCATTTAGCCCATTTATATTTAAGGTTA	51181

CR933783.5	1951	ATATTGTTATGTGTGAATTTGATCATGTCATTATGATGCTAGCTGGTTAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936923.5	51182	ATATTGTTATGTGTGAATTTGATCATGTCATTATGATGCTAGCTGGTTAT	51231

Overview

Query
CR933783.5 - 52025 bps
Hit
CR936923.5 - 51231 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link