<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CR762476.2 1 GGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAGTACAAAAAAAAAAAAT 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 56404 GGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAGTACAAAAAAAAAAAAT 56453 CR762476.2 51 TAGCCAGGCATGGTGGCAGATGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCTG 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 56454 TAGCCAGGCATGGTGGCAGATGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCTG 56503 CR762476.2 101 AGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAG 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 56504 AGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAG 56553 CR762476.2 151 ATCGCGCCACTGCACTCCAGCCAGCATGACAAAGCGAGACTCCGTCTCAA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 56554 ATCGCGCCACTGCACTCCAGCCAGCATGACAAAGCGAGACTCCGTCTCAA 56603 CR762476.2 201 AAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGATATGCATTTGTGTCTTCTGGGCAG 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 56604 AAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGATATGCATTTGTGTCTTCTGGGCAG 56653 CR762476.2 251 GGGCGTGACTACACCTGTAAAGATAAGCTACCAATTTACATTGCCATGGT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 56654 GGGCGTGACTACACCTGTAAAGATAAGCTACCAATTTACATTGCCATGGT 56703 CR762476.2 301 AAAATTTTAACAGAAACACCTTAGAGTAAAGATCTTGCAGCTCACAAGGA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 56704 AAAATTTTAACAGAAACACCTTAGAGTAAAGATCTTGCAGCTCACAAGGA 56753 CR762476.2 351 CTTTCCTTGTGGACAAAATATGAGGGAGGCATGTAGCTTTTCATTTTGTA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 56754 CTTTCCTTGTGGACAAAATATGAGGGAGGCATGTAGCTTTTCATTTTGTA 56803 CR762476.2 401 GCCATCTTATTTAGGAACCAAAAAGGGGGAGGCGGGTTTTCGCAACCCCG 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 56804 GCCATCTTATTTAGGAACCAAAAAGGGGGAGGCGGGTTTTCGCAACCCCG 56853 CR762476.2 451 TTCCCAGATTAACTTTTCCCTTAGGCTTAATGAGTTGGAGTCCCAAGATT 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 56854 TTCCCAGATTAACTTTTCCCTTAGGCTTAATGAGTTGGAGTCCCAAGATT 56903 CR762476.2 501 TAATTTCCTTTCATAGTTCTAAAACTATGACCAAGTGTTCATTTCTTCCT 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 56904 TAATTTCCTTTCATAGTTCTAAAACTATGACCAAGTGTTCATTTCTTCCT 56953 CR762476.2 551 GATAGGCACTTAGCACACTGACCATGTGCCTTAAATTGTCCATATGATGC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 56954 GATAGGCACTTAGCACACTGACCATGTGCCTTAAATTGTCCATATGATGC 57003 CR762476.2 601 GAAGAGCTATAAATCCATGGAGTCGTAAGTTTGGGGATACCAACCACAAT 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57004 GAAGAGCTATAAATCCATGGAGTCGTAAGTTTGGGGATACCAACCACAAT 57053 CR762476.2 651 CCATCTGCAGCAGAAGTGGTTCCTTTGGAACCAAGCTTGAACAGGTCTAA 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57054 CCATCTGCAGCAGAAGTGGTTCCTTTGGAACCAAGCTTGAACAGGTCTAA 57103 CR762476.2 701 AAACTAGGTTGTTCTTCTGGTTTAGTGACAGAGACTACTATCCCAGATGA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57104 AAACTAGGTTGTTCTTCTGGTTTAGTGACAGAGACTACTATCCCAGATGA 57153 CR762476.2 751 AAATACAATAGTCTTTTAGTGCTTCTATGCATGGTCATGTCTGTCAGTAG 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57154 AAATACAATAGTCTTTTAGTGCTTCTATGCATGGTCATGTCTGTCAGTAG 57203 CR762476.2 801 ACACTAAAACAATCATAATTCAAGAACAGAGTAAATAGTAACATAGACCC 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57204 ACACTAAAACAATCATAATTCAAGAACAGAGTAAATAGTAACATAGACCC 57253 CR762476.2 851 TTCTGGAATAGTTGTCTCTGTCACCAAAACAGAAAAACAAACTAGACTAA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57254 TTCTGGAATAGTTGTCTCTGTCACCAAAACAGAAAAACAAACTAGACTAA 57303 CR762476.2 901 ATTCAGAGGATGAGGGGAATCAAGAATGGCTTGTGAAGGAGGGAAACAAA 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57304 ATTCAGAGGATGAGGGGAATCAAGAATGGCTTGTGAAGGAGGGAAACAAA 57353 CR762476.2 951 TATTAGTTACAGTCATAATGACAACTATAATAGTAGACACTGTAGCAAAT 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57354 TATTAGTTACAGTCATAATGACAACTATAATAGTAGACACTGTAGCAAAT 57403 CR762476.2 1001 TTCACTAACTTTCTTGCCTTAATCTTCTAGATCACAATTGATCACTCTTG 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57404 TTCACTAACTTTCTTGCCTTAATCTTCTAGATCACAATTGATCACTCTTG 57453 CR762476.2 1051 TACCTCCCTTCTTGAGGAAAAATTAAAATGTGTTAATTTTCTCAGGAAAA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57454 TACCTCCCTTCTTGAGGAAAAATTAAAATGTGTTAATTTTCTCAGGAAAA 57503 CR762476.2 1101 AAAATGAAAGGCACCATATTGGACTATGGGAGCTTGGAATTCTGAATCAC 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57504 AAAATGAAAGGCACCATATTGGACTATGGGAGCTTGGAATTCTGAATCAC 57553 CR762476.2 1151 CACCTGGAGAAAAGCGACTCACAAATCTTCAATATCCTCCTTCTGCTACA 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57554 CACCTGGAGAAAAGCGACTCACAAATCTTCAATATCCTCCTTCTGCTACA 57603 CR762476.2 1201 TTAGTGAGTTATAAACTTCTACTATATTTCAGCCACAATACACTTTTTAG 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57604 TTAGTGAGTTATAAACTTCTACTATATTTCAGCCACAATACACTTTTTAG 57653 CR762476.2 1251 TCTATTTGTTGCAGCAGTTTGGCCTATTCTAATTAGTATAAAAAGAAGAA 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57654 TCTATTTGTTGCAGCAGTTTGGCCTATTCTAATTAGTATAAAAAGAAGAA 57703 CR762476.2 1301 AAAATAATCATAGAAAAAAATTAAATGAAGAATATAACAATTTTAATAGT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57704 AAAATAATCATAGAAAAAAATTAAATGAAGAATATAACAATTTTAATAGT 57753 CR762476.2 1351 TTCTCCTGACTTAGACTCACCTGAAATGATCCTCATTCTTTGTTTTAGGA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57754 TTCTCCTGACTTAGACTCACCTGAAATGATCCTCATTCTTTGTTTTAGGA 57803 CR762476.2 1401 TTAGCAGAGATGTAAGACAGAATTTCATGAAAATATTCAACCTGGTGGAT 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57804 TTAGCAGAGATGTAAGACAGAATTTCATGAAAATATTCAACCTGGTGGAT 57853 CR762476.2 1451 GATGCCAAATTAGCAGTTAGCGTGTGTGCCTGGAATTCAAACCATACAAA 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57854 GATGCCAAATTAGCAGTTAGCGTGTGTGCCTGGAATTCAAACCATACAAA 57903 CR762476.2 1501 TCCTCCCTGCCCACCTCTCATCCTATCCTTTAGAGCAGAGCCTGTTTCTC 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57904 TCCTCCCTGCCCACCTCTCATCCTATCCTTTAGAGCAGAGCCTGTTTCTC 57953 CR762476.2 1551 ATATATTGCCCCCAAGTCTATATCAATCAAATTAATTTTTATTATCCTGA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 57954 ATATATTGCCCCCAAGTCTATATCAATCAAATTAATTTTTATTATCCTGA 58003 CR762476.2 1601 AAACACCTATAGAAAGACTAACATGTTGAAAGTTATATTTAAATATGGGC 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 58004 AAACACCTATAGAAAGACTAACATGTTGAAAGTTATATTTAAATATGGGC 58053 CR762476.2 1651 ACTCTGCTTCATACTCTTTTGCCAATATTACTTCAAAGCTGTACAAACCT 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 58054 ACTCTGCTTCATACTCTTTTGCCAATATTACTTCAAAGCTGTACAAACCT 58103 CR762476.2 1701 ATATTCTTTGCATTTGTGGGAAATTATTATATTGTAGATAAGGCTAAAAT 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 58104 ATATTCTTTGCATTTGTGGGAAATTATTATATTGTAGATAAGGCTAAAAT 58153 CR762476.2 1751 ATTTTGTGAATCAAAACATACTATAAAAAGTTGGAAAGAAAGACTTCATT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 58154 ATTTTGTGAATCAAAACATACTATAAAAAGTTGGAAAGAAAGACTTCATT 58203 CR762476.2 1801 TGGATGTAAATACATGAAAATAGCAGCCCAGACACTCAAGACAAGAGGAA 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 58204 TGGATGTAAATACATGAAAATAGCAGCCCAGACACTCAAGACAAGAGGAA 58253 CR762476.2 1851 TAATAACTAAGTGACCACAAAGGAAATTTTTTATCACATGCCTGGCTGTT 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 58254 TAATAACTAAGTGACCACAAAGGAAATTTTTTATCACATGCCTGGCTGTT 58303 CR762476.2 1901 CCAGACAGGGAAGCTTGCTTTACCTGAAGGAAGTGGTCACTAGACCACAA 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 58304 CCAGACAGGGAAGCTTGCTTTACCTGAAGGAAGTGGTCACTAGACCACAA 58353 CR762476.2 1951 TGTAACCAAATACAGGATTCTGCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAGATTCACA 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR936921.7 58354 TGTAACCAAATACAGGATTCTGCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAGATTCACA 58403