<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR762476.2	1	GGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAGTACAAAAAAAAAAAAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	56404	GGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAGTACAAAAAAAAAAAAT	56453

CR762476.2	51	TAGCCAGGCATGGTGGCAGATGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	56454	TAGCCAGGCATGGTGGCAGATGCCTGTAATCTCAGCTACTTGGGAGGCTG	56503

CR762476.2	101	AGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	56504	AGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAG	56553

CR762476.2	151	ATCGCGCCACTGCACTCCAGCCAGCATGACAAAGCGAGACTCCGTCTCAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	56554	ATCGCGCCACTGCACTCCAGCCAGCATGACAAAGCGAGACTCCGTCTCAA	56603

CR762476.2	201	AAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGATATGCATTTGTGTCTTCTGGGCAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	56604	AAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGATATGCATTTGTGTCTTCTGGGCAG	56653

CR762476.2	251	GGGCGTGACTACACCTGTAAAGATAAGCTACCAATTTACATTGCCATGGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	56654	GGGCGTGACTACACCTGTAAAGATAAGCTACCAATTTACATTGCCATGGT	56703

CR762476.2	301	AAAATTTTAACAGAAACACCTTAGAGTAAAGATCTTGCAGCTCACAAGGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	56704	AAAATTTTAACAGAAACACCTTAGAGTAAAGATCTTGCAGCTCACAAGGA	56753

CR762476.2	351	CTTTCCTTGTGGACAAAATATGAGGGAGGCATGTAGCTTTTCATTTTGTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	56754	CTTTCCTTGTGGACAAAATATGAGGGAGGCATGTAGCTTTTCATTTTGTA	56803

CR762476.2	401	GCCATCTTATTTAGGAACCAAAAAGGGGGAGGCGGGTTTTCGCAACCCCG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	56804	GCCATCTTATTTAGGAACCAAAAAGGGGGAGGCGGGTTTTCGCAACCCCG	56853

CR762476.2	451	TTCCCAGATTAACTTTTCCCTTAGGCTTAATGAGTTGGAGTCCCAAGATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	56854	TTCCCAGATTAACTTTTCCCTTAGGCTTAATGAGTTGGAGTCCCAAGATT	56903

CR762476.2	501	TAATTTCCTTTCATAGTTCTAAAACTATGACCAAGTGTTCATTTCTTCCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	56904	TAATTTCCTTTCATAGTTCTAAAACTATGACCAAGTGTTCATTTCTTCCT	56953

CR762476.2	551	GATAGGCACTTAGCACACTGACCATGTGCCTTAAATTGTCCATATGATGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	56954	GATAGGCACTTAGCACACTGACCATGTGCCTTAAATTGTCCATATGATGC	57003

CR762476.2	601	GAAGAGCTATAAATCCATGGAGTCGTAAGTTTGGGGATACCAACCACAAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57004	GAAGAGCTATAAATCCATGGAGTCGTAAGTTTGGGGATACCAACCACAAT	57053

CR762476.2	651	CCATCTGCAGCAGAAGTGGTTCCTTTGGAACCAAGCTTGAACAGGTCTAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57054	CCATCTGCAGCAGAAGTGGTTCCTTTGGAACCAAGCTTGAACAGGTCTAA	57103

CR762476.2	701	AAACTAGGTTGTTCTTCTGGTTTAGTGACAGAGACTACTATCCCAGATGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57104	AAACTAGGTTGTTCTTCTGGTTTAGTGACAGAGACTACTATCCCAGATGA	57153

CR762476.2	751	AAATACAATAGTCTTTTAGTGCTTCTATGCATGGTCATGTCTGTCAGTAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57154	AAATACAATAGTCTTTTAGTGCTTCTATGCATGGTCATGTCTGTCAGTAG	57203

CR762476.2	801	ACACTAAAACAATCATAATTCAAGAACAGAGTAAATAGTAACATAGACCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57204	ACACTAAAACAATCATAATTCAAGAACAGAGTAAATAGTAACATAGACCC	57253

CR762476.2	851	TTCTGGAATAGTTGTCTCTGTCACCAAAACAGAAAAACAAACTAGACTAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57254	TTCTGGAATAGTTGTCTCTGTCACCAAAACAGAAAAACAAACTAGACTAA	57303

CR762476.2	901	ATTCAGAGGATGAGGGGAATCAAGAATGGCTTGTGAAGGAGGGAAACAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57304	ATTCAGAGGATGAGGGGAATCAAGAATGGCTTGTGAAGGAGGGAAACAAA	57353

CR762476.2	951	TATTAGTTACAGTCATAATGACAACTATAATAGTAGACACTGTAGCAAAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57354	TATTAGTTACAGTCATAATGACAACTATAATAGTAGACACTGTAGCAAAT	57403

CR762476.2	1001	TTCACTAACTTTCTTGCCTTAATCTTCTAGATCACAATTGATCACTCTTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57404	TTCACTAACTTTCTTGCCTTAATCTTCTAGATCACAATTGATCACTCTTG	57453

CR762476.2	1051	TACCTCCCTTCTTGAGGAAAAATTAAAATGTGTTAATTTTCTCAGGAAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57454	TACCTCCCTTCTTGAGGAAAAATTAAAATGTGTTAATTTTCTCAGGAAAA	57503

CR762476.2	1101	AAAATGAAAGGCACCATATTGGACTATGGGAGCTTGGAATTCTGAATCAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57504	AAAATGAAAGGCACCATATTGGACTATGGGAGCTTGGAATTCTGAATCAC	57553

CR762476.2	1151	CACCTGGAGAAAAGCGACTCACAAATCTTCAATATCCTCCTTCTGCTACA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57554	CACCTGGAGAAAAGCGACTCACAAATCTTCAATATCCTCCTTCTGCTACA	57603

CR762476.2	1201	TTAGTGAGTTATAAACTTCTACTATATTTCAGCCACAATACACTTTTTAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57604	TTAGTGAGTTATAAACTTCTACTATATTTCAGCCACAATACACTTTTTAG	57653

CR762476.2	1251	TCTATTTGTTGCAGCAGTTTGGCCTATTCTAATTAGTATAAAAAGAAGAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57654	TCTATTTGTTGCAGCAGTTTGGCCTATTCTAATTAGTATAAAAAGAAGAA	57703

CR762476.2	1301	AAAATAATCATAGAAAAAAATTAAATGAAGAATATAACAATTTTAATAGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57704	AAAATAATCATAGAAAAAAATTAAATGAAGAATATAACAATTTTAATAGT	57753

CR762476.2	1351	TTCTCCTGACTTAGACTCACCTGAAATGATCCTCATTCTTTGTTTTAGGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57754	TTCTCCTGACTTAGACTCACCTGAAATGATCCTCATTCTTTGTTTTAGGA	57803

CR762476.2	1401	TTAGCAGAGATGTAAGACAGAATTTCATGAAAATATTCAACCTGGTGGAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57804	TTAGCAGAGATGTAAGACAGAATTTCATGAAAATATTCAACCTGGTGGAT	57853

CR762476.2	1451	GATGCCAAATTAGCAGTTAGCGTGTGTGCCTGGAATTCAAACCATACAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57854	GATGCCAAATTAGCAGTTAGCGTGTGTGCCTGGAATTCAAACCATACAAA	57903

CR762476.2	1501	TCCTCCCTGCCCACCTCTCATCCTATCCTTTAGAGCAGAGCCTGTTTCTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57904	TCCTCCCTGCCCACCTCTCATCCTATCCTTTAGAGCAGAGCCTGTTTCTC	57953

CR762476.2	1551	ATATATTGCCCCCAAGTCTATATCAATCAAATTAATTTTTATTATCCTGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	57954	ATATATTGCCCCCAAGTCTATATCAATCAAATTAATTTTTATTATCCTGA	58003

CR762476.2	1601	AAACACCTATAGAAAGACTAACATGTTGAAAGTTATATTTAAATATGGGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	58004	AAACACCTATAGAAAGACTAACATGTTGAAAGTTATATTTAAATATGGGC	58053

CR762476.2	1651	ACTCTGCTTCATACTCTTTTGCCAATATTACTTCAAAGCTGTACAAACCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	58054	ACTCTGCTTCATACTCTTTTGCCAATATTACTTCAAAGCTGTACAAACCT	58103

CR762476.2	1701	ATATTCTTTGCATTTGTGGGAAATTATTATATTGTAGATAAGGCTAAAAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	58104	ATATTCTTTGCATTTGTGGGAAATTATTATATTGTAGATAAGGCTAAAAT	58153

CR762476.2	1751	ATTTTGTGAATCAAAACATACTATAAAAAGTTGGAAAGAAAGACTTCATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	58154	ATTTTGTGAATCAAAACATACTATAAAAAGTTGGAAAGAAAGACTTCATT	58203

CR762476.2	1801	TGGATGTAAATACATGAAAATAGCAGCCCAGACACTCAAGACAAGAGGAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	58204	TGGATGTAAATACATGAAAATAGCAGCCCAGACACTCAAGACAAGAGGAA	58253

CR762476.2	1851	TAATAACTAAGTGACCACAAAGGAAATTTTTTATCACATGCCTGGCTGTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	58254	TAATAACTAAGTGACCACAAAGGAAATTTTTTATCACATGCCTGGCTGTT	58303

CR762476.2	1901	CCAGACAGGGAAGCTTGCTTTACCTGAAGGAAGTGGTCACTAGACCACAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	58304	CCAGACAGGGAAGCTTGCTTTACCTGAAGGAAGTGGTCACTAGACCACAA	58353

CR762476.2	1951	TGTAACCAAATACAGGATTCTGCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAGATTCACA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936921.7	58354	TGTAACCAAATACAGGATTCTGCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAGATTCACA	58403

Overview

Query
CR762476.2 - 95554 bps
Hit
CR936921.7 - 58403 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link