<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759792.3	1	GGCCAGGTGCAGTGGCTCTTGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	3585	GGCCAGGTGCAGTGGCTCTTGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAA	3634

CR759792.3	51	GGTGGGAGACTCGCTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	3635	GGTGGGAGACTCGCTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT	3684

CR759792.3	101	ACCGAGACCCCCATTGCCACAGAAAATAAAATAAAAAGGAAATTCTGACT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	3685	ACCGAGACCCCCATTGCCACAGAAAATAAAATAAAAAGGAAATTCTGACT	3734

CR759792.3	151	GATGCTACGACATAGATGAACCTTAAAGACATTGTATTTAATGAAATGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	3735	GATGCTACGACATAGATGAACCTTAAAGACATTGTATTTAATGAAATGAA	3784

CR759792.3	201	CCATTCAAAAAAGACAAATATTGTATGATTGCACTTATATGAGGTACCTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	3785	CCATTCAAAAAAGACAAATATTGTATGATTGCACTTATATGAGGTACCTA	3834

CR759792.3	251	GAGTCAAATTCATAGAGACAGAGAGTAGAATGGTGTTGCCAGGGGCTGGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	3835	GAGTCAAATTCATAGAGACAGAGAGTAGAATGGTGTTGCCAGGGGCTGGG	3884

CR759792.3	301	GCAAGGGGAGAATGGGAGTTCGTGTCTAGTGGGTAGGAAGTTTCAGTCTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	3885	GCAAGGGGAGAATGGGAGTTCGTGTCTAGTGGGTAGGAAGTTTCAGTCTG	3934

CR759792.3	351	GGAAGAGGAGTTCTGGAAGTGGAGGGTGACAGTCCACAGCAATGTGAGTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	3935	GGAAGAGGAGTTCTGGAAGTGGAGGGTGACAGTCCACAGCAATGTGAGTG	3984

CR759792.3	401	GACTTCATGCTGGACTGCAAACTAGAAAGCGATTAGAATGGCGAATTATG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	3985	GACTTCATGCTGGACTGCAAACTAGAAAGCGATTAGAATGGCGAATTATG	4034

CR759792.3	451	TCAAGTGTACTTTACTACAATAAAAAACAACAAAAAAAGTGTGTTCCTTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4035	TCAAGTGTACTTTACTACAATAAAAAACAACAAAAAAAGTGTGTTCCTTG	4084

CR759792.3	501	GACCAGTGGCATCAAGATAGATGAGAATCTTGTTAGAAATGGATGGTCGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4085	GACCAGTGGCATCAAGATAGATGAGAATCTTGTTAGAAATGGATGGTCGG	4134

CR759792.3	551	CTGGGCGCCGTGGCTCACGCCTATGATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4135	CTGGGCGCCGTGGCTCACGCCTATGATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG	4184

CR759792.3	601	AGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4185	AGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTG	4234

CR759792.3	651	AAACCCATCTCTACTAAAAATATGAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4235	AAACCCATCTCTACTAAAAATATGAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGC	4284

CR759792.3	701	ACGCCTGTAGTCCCAGTTACTCAGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4285	ACGCCTGTAGTCCCAGTTACTCAGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGA	4334

CR759792.3	751	ACCCAGGAGGCGGAGGTTCCAGTGAGCCGAGATTGAGCCACTGTACTCCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4335	ACCCAGGAGGCGGAGGTTCCAGTGAGCCGAGATTGAGCCACTGTACTCCA	4384

CR759792.3	801	GCCTGGGTGACAAAGCGAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4385	GCCTGGGTGACAAAGCGAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAA	4434

CR759792.3	851	AGAAAAAGAAAGAAATGCATGGTCTCTTGCCCTAGGCCAAGCCTGCTGAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4435	AGAAAAAGAAAGAAATGCATGGTCTCTTGCCCTAGGCCAAGCCTGCTGAA	4484

CR759792.3	901	TCCAAATCTGCTTTTTAACAAAAATCTCCAGGCATTTGGATACACAAAGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4485	TCCAAATCTGCTTTTTAACAAAAATCTCCAGGCATTTGGATACACAAAGG	4534

CR759792.3	951	AAGGAATACTCTTCAGAGTATGTTTTCACGAAGACTGGAGAGACAGCAGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4535	AAGGAATACTCTTCAGAGTATGTTTTCACGAAGACTGGAGAGACAGCAGT	4584

CR759792.3	1001	GTCTTCCAGGGCCATCTTCCCCACCTCGCCTCACTCACACTTACTCACCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4585	GTCTTCCAGGGCCATCTTCCCCACCTCGCCTCACTCACACTTACTCACCT	4634

CR759792.3	1051	GTCACACCCACAGCGGACACTGGGCCCACGCGCTGCCCCTCGTGGAGGCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4635	GTCACACCCACAGCGGACACTGGGCCCACGCGCTGCCCCTCGTGGAGGCC	4684

CR759792.3	1101	GTACAGGTGCATCTTGTATTTGCACCCGGGCTCCAGGCCCCCCACGGTGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4685	GTACAGGTGCATCTTGTATTTGCACCCGGGCTCCAGGCCCCCCACGGTGA	4734

CR759792.3	1151	CCTCGCTCTCCTCGCCCCTGACACGCACCACCTGGGGCCGCCCGTCCCTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4735	CCTCGCTCTCCTCGCCCCTGACACGCACCACCTGGGGCCGCCCGTCCCTG	4784

CR759792.3	1201	TCCTTGTACTGCACAGTGAAGGAGTCGAAGCGGCCCTGGGGGATGGTCCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4785	TCCTTGTACTGCACAGTGAAGGAGTCGAAGCGGCCCTGGGGGATGGTCCA	4834

CR759792.3	1251	GGAGAGGCTCAGCGAGTCAGGGGAGGATCCTGTCACTGTCAGCTCCCCCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4835	GGAGAGGCTCAGCGAGTCAGGGGAGGATCCTGTCACTGTCAGCTCCCCCA	4884

CR759792.3	1301	GGAGCGGCTCCTCAGGGGGCTCCGGGGCCTCCGTGCTGGGTTCTGTGGGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4885	GGAGCGGCTCCTCAGGGGGCTCCGGGGCCTCCGTGCTGGGTTCTGTGGGG	4934

CR759792.3	1351	GCGGGAGTTTCTTCCTCTGCAGCTGAGAAGAGGGGACAGAGAAGGTGAGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4935	GCGGGAGTTTCTTCCTCTGCAGCTGAGAAGAGGGGACAGAGAAGGTGAGG	4984

CR759792.3	1401	CAGCTTCCCTGGGGGATGTCCTTGGGTCTTGTGAGGAAGGAGAGCGAAGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	4985	CAGCTTCCCTGGGGGATGTCCTTGGGTCTTGTGAGGAAGGAGAGCGAAGC	5034

CR759792.3	1451	TGTGGCCATGAGTGGGGGTCCTGGGGTCAGCTTGGAGAGGCCCATCTTTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	5035	TGTGGCCATGAGTGGGGGTCCTGGGGTCAGCTTGGAGAGGCCCATCTTTG	5084

CR759792.3	1501	GAGCTGGGTGGTCTTGCTCAGTTTACAGTCAACACACATGACAAGCTCTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	5085	GAGCTGGGTGGTCTTGCTCAGTTTACAGTCAACACACATGACAAGCTCTG	5134

CR759792.3	1551	AGGTCAGTGCTGCGGAACTTGGGACAGCCACCAACAGAGCTCACAGGGCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	5135	AGGTCAGTGCTGCGGAACTTGGGACAGCCACCAACAGAGCTCACAGGGCC	5184

CR759792.3	1601	CTTCTCCACCCAGGAAGATCTGTCAGTCCTCAGGGAAGTGGGGAAAGACA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	5185	CTTCTCCACCCAGGAAGATCTGTCAGTCCTCAGGGAAGTGGGGAAAGACA	5234

CR759792.3	1651	AAAAAGTACCATGGCTCAGCCAAGAGCAGAGGGGCTTCCTGGGCCAGTTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	5235	AAAAAGTACCATGGCTCAGCCAAGAGCAGAGGGGCTTCCTGGGCCAGTTC	5284

CR759792.3	1701	ACCCATCACCAGAGAAAGGGAGACCCTCCCACAGGCCCCACTCTGGGGCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	5285	ACCCATCACCAGAGAAAGGGAGACCCTCCCACAGGCCCCACTCTGGGGCT	5334

CR759792.3	1751	CCCATCGTACACTCACCTGTCACCCCAATGACAGAGATGGGGCCCACGCG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	5335	CCCATCGTACACTCACCTGTCACCCCAATGACAGAGATGGGGCCCACGCG	5384

CR759792.3	1801	CTGGCCACCGTGGAAGCCGTACAGGTTCATCTTGTACTTGTGGTCTGGCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	5385	CTGGCCACCGTGGAAGCCGTACAGGTTCATCTTGTACTTGTGGTCTGGCT	5434

CR759792.3	1851	CCAGGCCTGAGATGGTGACCCCGTCCTCGTGCCCCGGCACCCGCACCACC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	5435	CCAGGCCTGAGATGGTGACCCCGTCCTCGTGCCCCGGCACCCGCACCACC	5484

CR759792.3	1901	TTGGGCTGCCCATCCCCATTCCTGTACTGGACCAGGAAGTGGTCAAACTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	5485	TTGGGCTGCCCATCCCCATTCCTGTACTGGACCAGGAAGTGGTCAAACTG	5534

CR759792.3	1951	GCCCTCGGGGACCATCCAGGACAGGCTGAGGGAGTCAGGGGTGGCATCTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936882.4	5535	GCCCTCGGGGACCATCCAGGACAGGCTGAGGGAGTCAGGGGTGGCATCTG	5584

Overview

Query
CR759792.3 - 45162 bps
Hit
CR936882.4 - 5584 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link