<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759786.5	1	GGCCGTGGGACTGCTGACCTGGGCGACCTTGGGGCTTCTGGTGGCTGGAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	48563	GGCCGTGGGACTGCTGACCTGGGCGACCTTGGGGCTTCTGGTGGCTGGAC	48612

CR759786.5	51	TCGGGGGTCATGACGACCTGCACGACGATCTGCAAGAGGACTTCCATGGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	48613	TCGGGGGTCATGACGACCTGCACGACGATCTGCAAGAGGACTTCCATGGC	48662

CR759786.5	101	CACAGCCACAGGCACTCACATGAAGATTTCCACCATGGCCACAGCCATGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	48663	CACAGCCACAGGCACTCACATGAAGATTTCCACCATGGCCACAGCCATGC	48712

CR759786.5	151	CCATGGCCATGGCCACACTCACGAGAGCATCTGGCATGGACATACCCACG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	48713	CCATGGCCATGGCCACACTCACGAGAGCATCTGGCATGGACATACCCACG	48762

CR759786.5	201	ATCACGACCATGGACATTCACATGAGGATTTACACCATGGCCATAGCCAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	48763	ATCACGACCATGGACATTCACATGAGGATTTACACCATGGCCATAGCCAT	48812

CR759786.5	251	GGCTACTCCCATGAGAGCCTCTACCACAGAGGACATGGACATGACCATGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	48813	GGCTACTCCCATGAGAGCCTCTACCACAGAGGACATGGACATGACCATGA	48862

CR759786.5	301	GCATAGCCATGGAGGCTATGGGGAGTCTGGGGCTCCAGGCATCAAGCAGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	48863	GCATAGCCATGGAGGCTATGGGGAGTCTGGGGCTCCAGGCATCAAGCAGG	48912

CR759786.5	351	ACCTGGATGCTGTCACTCTCTGGGCTTATGTGAGTCTCCAGGGGATGGGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	48913	ACCTGGATGCTGTCACTCTCTGGGCTTATGTGAGTCTCCAGGGGATGGGA	48962

CR759786.5	401	GAGAGAAGGGCTGGTTCTGGATTGTTGGGAAACTCCACAGTACTTGACCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	48963	GAGAGAAGGGCTGGTTCTGGATTGTTGGGAAACTCCACAGTACTTGACCT	49012

CR759786.5	451	TGACTCTCCCTCACCAGGCACTGGGGGCCACAGTGCTGATCTCAGCAGCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49013	TGACTCTCCCTCACCAGGCACTGGGGGCCACAGTGCTGATCTCAGCAGCT	49062

CR759786.5	501	CCATTTTTTGTCCTCTTCCTTATCCCCGTGGAGTCGAACTCTCCCCGGCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49063	CCATTTTTTGTCCTCTTCCTTATCCCCGTGGAGTCGAACTCTCCCCGGCA	49112

CR759786.5	551	TCGCTCTCTACTTCAGATCTTGCTCAGTTTTGCTTCCGGTGGGCTCCTGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49113	TCGCTCTCTACTTCAGATCTTGCTCAGTTTTGCTTCCGGTGGGCTCCTGG	49162

CR759786.5	601	GAGATGCTTTCCTGCACCTCATTCCTCATGCTCTTGGTAAGTAACCTCTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49163	GAGATGCTTTCCTGCACCTCATTCCTCATGCTCTTGGTAAGTAACCTCTG	49212

CR759786.5	651	ACTTCTACCTCAAATCTAACCTATTTCGTTCTTTGGAGGAAAAGGGTTCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49213	ACTTCTACCTCAAATCTAACCTATTTCGTTCTTTGGAGGAAAAGGGTTCT	49262

CR759786.5	701	TTCTCCTTTATGATCCCTGACCTTTCGATATTCCCCCAAATACACACTCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49263	TTCTCCTTTATGATCCCTGACCTTTCGATATTCCCCCAAATACACACTCA	49312

CR759786.5	751	TTGTGTCAGATATTCCCTCATCTGGTTTTCCCCCCTTCTTCCAGAACCTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49313	TTGTGTCAGATATTCCCTCATCTGGTTTTCCCCCCTTCTTCCAGAACCTC	49362

CR759786.5	801	ATTCTCACCACACTCTGGAGCAACCCGGACATGGACACTCCCACAGTGGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49363	ATTCTCACCACACTCTGGAGCAACCCGGACATGGACACTCCCACAGTGGT	49412

CR759786.5	851	GAGGAAGAGACAGATGGGGATGGGAGTTGGGGTGCTGGGGAAGGTCCGTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49413	GAGGAAGAGACAGATGGGGATGGGAGTTGGGGTGCTGGGGAAGGTCCGTC	49462

CR759786.5	901	TCTCCCTATTCCTCACCTCCCGCACTTGAGGAGGAGGAGTCTGGAATGCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49463	TCTCCCTATTCCTCACCTCCCGCACTTGAGGAGGAGGAGTCTGGAATGCA	49512

CR759786.5	951	CATCTCCCTTAATGTCTCAATGCCTCCATTCCCAGGCCAGGGCCCCATTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49513	CATCTCCCTTAATGTCTCAATGCCTCCATTCCCAGGCCAGGGCCCCATTC	49562

CR759786.5	1001	TGTCTGTGGGACTGTGGGTTCTCAGTGGAATTGTTGCCTTTCTTGTCGTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49563	TGTCTGTGGGACTGTGGGTTCTCAGTGGAATTGTTGCCTTTCTTGTCGTG	49612

CR759786.5	1051	GAGAAATTTGTGAGACATGTGAAAGGAGGACATGGTCACAGTCATGGACA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49613	GAGAAATTTGTGAGACATGTGAAAGGAGGACATGGTCACAGTCATGGACA	49662

CR759786.5	1101	TGGACACGCTCACAGTCATACACGTGGAAGTCATGGACATGGAAGACAAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49663	TGGACACGCTCACAGTCATACACGTGGAAGTCATGGACATGGAAGACAAG	49712

CR759786.5	1151	GTGAGCCCAGGAACAACTTTCCTGAAAGCTGACTTGCCTGCCTCAGAATC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49713	GTGAGCCCAGGAACAACTTTCCTGAAAGCTGACTTGCCTGCCTCAGAATC	49762

CR759786.5	1201	TCCTCATCTTATGGCCCTCAGGAGGGAGAGGACATGTTGGAAGATCTGTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49763	TCCTCATCTTATGGCCCTCAGGAGGGAGAGGACATGTTGGAAGATCTGTT	49812

CR759786.5	1251	CTCCACTCTGACCAACTCTTTTCTTCCCTCAGAGCGTTCTACCAAGGAGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49813	CTCCACTCTGACCAACTCTTTTCTTCCCTCAGAGCGTTCTACCAAGGAGA	49862

CR759786.5	1301	AGCAGAGCTCAGAGGAAGAAGAAAAGGAAACAAGAGGGGTTCAGAAGAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49863	AGCAGAGCTCAGAGGAAGAAGAAAAGGAAACAAGAGGGGTTCAGAAGAGG	49912

CR759786.5	1351	CGAGGAGGGAGCACAGTACCCAAAGATGGGCCAGTGAGACCTCAGAACGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49913	CGAGGAGGGAGCACAGTACCCAAAGATGGGCCAGTGAGACCTCAGAACGC	49962

CR759786.5	1401	TGAAGAAGAAAAAAGAGGCTTAGGTAAGGGCCAGAGTTGGTGATAAATTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	49963	TGAAGAAGAAAAAAGAGGCTTAGGTAAGGGCCAGAGTTGGTGATAAATTT	50012

CR759786.5	1451	GGGCAAGGGACATCATCACAAATCACATGGAATATGTGCTGTGGGTAATG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	50013	GGGCAAGGGACATCATCACAAATCACATGGAATATGTGCTGTGGGTAATG	50062

CR759786.5	1501	GCAGGTATCTGAGAAACACTAAAGGACTGGGTGTAAAGTGGTCTCTGAGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	50063	GCAGGTATCTGAGAAACACTAAAGGACTGGGTGTAAAGTGGTCTCTGAGG	50112

CR759786.5	1551	GGAGGTGTGAGAATAGCTGACCAAGACTGGAACAAGTGGTGATGGAAGCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	50113	GGAGGTGTGAGAATAGCTGACCAAGACTGGAACAAGTGGTGATGGAAGCC	50162

CR759786.5	1601	TCTGATCATTTTCTCTTCTTGTCCTGTACAAGACCTGCGTGTGTCGGGGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	50163	TCTGATCATTTTCTCTTCTTGTCCTGTACAAGACCTGCGTGTGTCGGGGT	50212

CR759786.5	1651	ACCTGAATCTGGCTGCTGACTTGGCACACAACTTCACTGATGGTCTGGCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	50213	ACCTGAATCTGGCTGCTGACTTGGCACACAACTTCACTGATGGTCTGGCC	50262

CR759786.5	1701	ATTGGGGCTTCCTTTCGAGGGGGCCGGGGACTAGGGATCCTGACCACAAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	50263	ATTGGGGCTTCCTTTCGAGGGGGCCGGGGACTAGGGATCCTGACCACAAT	50312

CR759786.5	1751	GACTGTCCTGCTACATGAAGTGCCCCACGAGGTCGGAGACTTTGCCATCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	50313	GACTGTCCTGCTACATGAAGTGCCCCACGAGGTCGGAGACTTTGCCATCT	50362

CR759786.5	1801	TGGTCCAGTCTGGCTGCAGCAAAAAGCAGGTTGGTGATGTCTGCCAAACA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	50363	TGGTCCAGTCTGGCTGCAGCAAAAAGCAGGTTGGTGATGTCTGCCAAACA	50412

CR759786.5	1851	CAGCTGCCTCAAACCCTTTATCTCTCCTCACTCACCCTAAACCCAAACAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	50413	CAGCTGCCTCAAACCCTTTATCTCTCCTCACTCACCCTAAACCCAAACAG	50462

CR759786.5	1901	CCTCTTATTAGTTCCAAACAATTCATACTGTCATTGACAAGTCCTCTAGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	50463	CCTCTTATTAGTTCCAAACAATTCATACTGTCATTGACAAGTCCTCTAGA	50512

CR759786.5	1951	AATGAGGGGGAAGAAGTTCTGGTTACTTTGTCCTTTAGCTCAGTATTTCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936877.4	50513	AATGAGGGGGAAGAAGTTCTGGTTACTTTGTCCTTTAGCTCAGTATTTCT	50562

Overview

Query
CR759786.5 - 123399 bps
Hit
CR936877.4 - 50562 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link