<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR936838.15	1	GGCCATCTGTGCTGCTTGAGATAATACTGCATATGGTTGTTTAGGGCTAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151084	GGCCATCTGTGCTGCTTGAGATAATACTGCATATGGTTGTTTAGGGCTAG	151133

CR936838.15	51	GGAAATTGTTCAGTAAATGCTTGATGTGCAAGCATTATAACTTGAATTTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151134	GGAAATTGTTCAGTAAATGCTTGATGTGCAAGCATTATAACTTGAATTTG	151183

CR936838.15	101	AAACCACAGGACCCATGTAAAAGCCAGGCAGAATGTAACCGCAGTACTGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151184	AAACCACAGGACCCATGTAAAAGCCAGGCAGAATGTAACCGCAGTACTGG	151233

CR936838.15	151	AGTTGGCGGGCAGTTGGGGGCCAGGCAGAGAGAGAGAGAGACAGGTAGAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151234	AGTTGGCGGGCAGTTGGGGGCCAGGCAGAGAGAGAGAGAGACAGGTAGAT	151283

CR936838.15	201	CATAGGGACTTGTTGACTGGTCAATCTGTCCATGAGAACGAGCTACAGGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151284	CATAGGGACTTGTTGACTGGTCAATCTGTCCATGAGAACGAGCTACAGGT	151333

CR936838.15	251	ACAACGAGAGGTGCAGTTTTACAATTATTTAACTTATGTATTTTATCAGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151334	ACAACGAGAGGTGCAGTTTTACAATTATTTAACTTATGTATTTTATCAGT	151383

CR936838.15	301	TGATTTATCGGCTGTTACTTTCATATGTGGCAGCTATTGTCCAATGAAAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151384	TGATTTATCGGCTGTTACTTTCATATGTGGCAGCTATTGTCCAATGAAAC	151433

CR936838.15	351	CCACAAACTACCCTCTATCTGGAGTTGGAACATTTATCTGCATTTATAAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151434	CCACAAACTACCCTCTATCTGGAGTTGGAACATTTATCTGCATTTATAAG	151483

CR936838.15	401	CCGGCTGGCTGCATTTATAAGCCCTGAGCTCCCCTGTCCTCTGAGCTTCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151484	CCGGCTGGCTGCATTTATAAGCCCTGAGCTCCCCTGTCCTCTGAGCTTCA	151533

CR936838.15	451	GTTTATGATTACCAGCATGAGCATCCCATTACAGTGCAGAAAAGACGTAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151534	GTTTATGATTACCAGCATGAGCATCCCATTACAGTGCAGAAAAGACGTAA	151583

CR936838.15	501	CACTTGTATTCAGTGTTTGGCTTGACTGCTGACAAGCACCGTGATAAAGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151584	CACTTGTATTCAGTGTTTGGCTTGACTGCTGACAAGCACCGTGATAAAGA	151633

CR936838.15	551	GTAGGTTCCCTCTCTTCTCTCTTTCCTCCAGCTTTGTCTCAAGGACAGCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151634	GTAGGTTCCCTCTCTTCTCTCTTTCCTCCAGCTTTGTCTCAAGGACAGCT	151683

CR936838.15	601	GCTCCTAAGACCATTGTGAGGAGGAGATAATGCACCTCAGGTGACTTGCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151684	GCTCCTAAGACCATTGTGAGGAGGAGATAATGCACCTCAGGTGACTTGCT	151733

CR936838.15	651	CAGAGCCTTCTATCGGCAAGTTTTCATGTAGTTGGAAAAGACAGTCATCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151734	CAGAGCCTTCTATCGGCAAGTTTTCATGTAGTTGGAAAAGACAGTCATCC	151783

CR936838.15	701	CGCCTCTAAGAACTAGGGTGCTTAGGATTGTCCCGGCCTCCTCTCCTAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151784	CGCCTCTAAGAACTAGGGTGCTTAGGATTGTCCCGGCCTCCTCTCCTAGG	151833

CR936838.15	751	TTGTGGAGAGACGGTGGAAGAACATATATTGCTCCACTCAGTGATTTTTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151834	TTGTGGAGAGACGGTGGAAGAACATATATTGCTCCACTCAGTGATTTTTT	151883

CR936838.15	801	CTCAAAGCCACATGGGAAATGATCATAAAGTAGTATGTGGATGGGCAAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151884	CTCAAAGCCACATGGGAAATGATCATAAAGTAGTATGTGGATGGGCAAAA	151933

CR936838.15	851	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTCTCCACCTTATTAATATGCTTTCCAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151934	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTCTCCACCTTATTAATATGCTTTCCAC	151983

CR936838.15	901	GTTTGGAACCAGCCGCTCAGGGTACTTCCGGTTTTTCTCTTGTAGGCATC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	151984	GTTTGGAACCAGCCGCTCAGGGTACTTCCGGTTTTTCTCTTGTAGGCATC	152033

CR936838.15	951	ATGACTCACCATGTCCCTGAGAGATGACTTCTTGCATTGGGTTATTTTCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152034	ATGACTCACCATGTCCCTGAGAGATGACTTCTTGCATTGGGTTATTTTCT	152083

CR936838.15	1001	AAAGCTTTATTACCCAAGATGTAATTTCTAGGCCAAAGGTTAACATTTTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152084	AAAGCTTTATTACCCAAGATGTAATTTCTAGGCCAAAGGTTAACATTTTC	152133

CR936838.15	1051	AACATTTTCACAGCTTTTGTTTATATACAGCCAGATAGCTAACAGACAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152134	AACATTTTCACAGCTTTTGTTTATATACAGCCAGATAGCTAACAGACAAA	152183

CR936838.15	1101	TAAAAGCCAACCAAACAGTCCCCGTGAGCCGGGAAGAGCAGATTTCCCTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152184	TAAAAGCCAACCAAACAGTCCCCGTGAGCCGGGAAGAGCAGATTTCCCTA	152233

CR936838.15	1151	GCCTTGGTTAGAAGTCTTTGGTGTTATTTTGACTGGATTCCTGTCTTAGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152234	GCCTTGGTTAGAAGTCTTTGGTGTTATTTTGACTGGATTCCTGTCTTAGC	152283

CR936838.15	1201	TATCCATTTGCTGAGCTGGCTATCCTCTCTGATTCTCCCTTCTGTCAGCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152284	TATCCATTTGCTGAGCTGGCTATCCTCTCTGATTCTCCCTTCTGTCAGCT	152333

CR936838.15	1251	GTAAAGTGGGATACAATTATACAGTTTACCTGTCAAGCACTCTCTTGGCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152334	GTAAAGTGGGATACAATTATACAGTTTACCTGTCAAGCACTCTCTTGGCA	152383

CR936838.15	1301	CAAGGTATTCAGTGGTCAGTCTTTGCAATCTGCCATTATTCTCCTGCACT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152384	CAAGGTATTCAGTGGTCAGTCTTTGCAATCTGCCATTATTCTCCTGCACT	152433

CR936838.15	1351	CTCTGGCTTTCTCTTAGACCACTGCCCACTAGTTATTTCCCCCCTGTATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152434	CTCTGGCTTTCTCTTAGACCACTGCCCACTAGTTATTTCCCCCCTGTATG	152483

CR936838.15	1401	TGAGAATTTTAAAAAAGGATTATTGAATTTTTATCTTATTTTATGTGCAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152484	TGAGAATTTTAAAAAAGGATTATTGAATTTTTATCTTATTTTATGTGCAT	152533

CR936838.15	1451	TGGTGCAAGAGTGTCAGATCTCCTGGAACTGGATTATAGACAGTCGTGAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152534	TGGTGCAAGAGTGTCAGATCTCCTGGAACTGGATTATAGACAGTCGTGAG	152583

CR936838.15	1501	CTGCCATGTGGGGGGAATTGAATCCTGGTCCTCTGGAAGAACAAGCCTGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152584	CTGCCATGTGGGGGGAATTGAATCCTGGTCCTCTGGAAGAACAAGCCTGT	152633

CR936838.15	1551	GCTCTTAATCACTGAGCTGTCTCTCTCCAGCCTTGTATGTAAGATTTTAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152634	GCTCTTAATCACTGAGCTGTCTCTCTCCAGCCTTGTATGTAAGATTTTAA	152683

CR936838.15	1601	TATAGTTCCATTCTCTCAAAGGAATCACCATTGATTTTAAAATAGGAAAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152684	TATAGTTCCATTCTCTCAAAGGAATCACCATTGATTTTAAAATAGGAAAA	152733

CR936838.15	1651	AGCCCTCTGCAAAGATCCCTGTGATGGACGGATGCTTTTGTAACTATGGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152734	AGCCCTCTGCAAAGATCCCTGTGATGGACGGATGCTTTTGTAACTATGGG	152783

CR936838.15	1701	GAGTGGTGCTGTGAAGAAGCCCTAGGGTGAGGTCCCCAATCTCTATGTGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152784	GAGTGGTGCTGTGAAGAAGCCCTAGGGTGAGGTCCCCAATCTCTATGTGA	152833

CR936838.15	1751	TGCCTTCCCTGGTCTGTGTGATGCCTTCCCTGGTCTGTGTGATGCCTTCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152834	TGCCTTCCCTGGTCTGTGTGATGCCTTCCCTGGTCTGTGTGATGCCTTCC	152883

CR936838.15	1801	CTGGTCTGTGTGATGCCTTCCCTGGTCTGTGTGATGCCTTCCCTGGTCTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152884	CTGGTCTGTGTGATGCCTTCCCTGGTCTGTGTGATGCCTTCCCTGGTCTG	152933

CR936838.15	1851	TGTGATGCCTTCCCTGGTCTGTGTGATGCCTTCCCTGGTCTGTGTGATGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152934	TGTGATGCCTTCCCTGGTCTGTGTGATGCCTTCCCTGGTCTGTGTGATGC	152983

CR936838.15	1901	CTTCCCTGGTCTATGTGATGCCTTCCCTGGTCTGTGTGATGCCTTCCCTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	152984	CTTCCCTGGTCTATGTGATGCCTTCCCTGGTCTGTGTGATGCCTTCCCTG	153033

CR936838.15	1951	GTCTGGCCTCGTCATCCTCTGCCTTCTGCTCTTACAGCTATTTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR936849.22	153034	GTCTGGCCTCGTCATCCTCTGCCTTCTGCTCTTACAGCTATTTGGAATTC	153083

Overview

Query
CR936838.15 - 174972 bps
Hit
CR936849.22 - 153083 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link