<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR938720.8	1	AGATCGTGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	100908	AGATCGTGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTC	100957

CR938720.8	51	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACTGAGAGGTCAATAAGAGATGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	100958	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACTGAGAGGTCAATAAGAGATGG	101007

CR938720.8	101	CACCTGTAGTTTCAAAAATAAGTACCAAATTAAACTGCTCATCACCACAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101008	CACCTGTAGTTTCAAAAATAAGTACCAAATTAAACTGCTCATCACCACAC	101057

CR938720.8	151	CCCTACCATCTCTAATTAGGAGTATTGTGATAGTATCCTACCTGGCTCCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101058	CCCTACCATCTCTAATTAGGAGTATTGTGATAGTATCCTACCTGGCTCCC	101107

CR938720.8	201	TTGCTTCCAACTTGCCCCCAACTGTTGGCCCAGGCCATTCTCGATGTGGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101108	TTGCTTCCAACTTGCCCCCAACTGTTGGCCCAGGCCATTCTCGATGTGGT	101157

CR938720.8	251	GACCAGTGAGAGATGATTGGGGCATGGTGAGTCTGATTTGGAATATATTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101158	GACCAGTGAGAGATGATTGGGGCATGGTGAGTCTGATTTGGAATATATTT	101207

CR938720.8	301	TAAAACTAGAGTGGGTATAGTTTGACTGAATAAGGGGTACACAGGTTGGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101208	TAAAACTAGAGTGGGTATAGTTTGACTGAATAAGGGGTACACAGGTTGGG	101257

CR938720.8	351	TCTCCAGGAAGTGGACTTTGAGATTTAACCCGGAGCTGGGATGGCCCTTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101258	TCTCCAGGAAGTGGACTTTGAGATTTAACCCGGAGCTGGGATGGCCCTTC	101307

CR938720.8	401	AGAGCCATCCCCAACTGGGGCAAGGGAGCTGGGTTTTTGCCCCCCACATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101308	AGAGCCATCCCCAACTGGGGCAAGGGAGCTGGGTTTTTGCCCCCCACATT	101357

CR938720.8	451	AATCAGTCACGGAAGGTGGGTTGCCCCTAGAAAGAGTGTGACCTTGGGGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101358	AATCAGTCACGGAAGGTGGGTTGCCCCTAGAAAGAGTGTGACCTTGGGGA	101407

CR938720.8	501	AGCAATTATCTTCAGTCCACAAAGAGGGCTGAGAGGTGAGGGCTGTCCTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101408	AGCAATTATCTTCAGTCCACAAAGAGGGCTGAGAGGTGAGGGCTGTCCTT	101457

CR938720.8	551	GAGCAGAAGACTTGGGTAACACTGTCAACTAACTAAGCCTAACGGACATC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101458	GAGCAGAAGACTTGGGTAACACTGTCAACTAACTAAGCCTAACGGACATC	101507

CR938720.8	601	TATAAAACACTCTGCTAAACAATAGCAGGATATACCATTTTTCTCAAGTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101508	TATAAAACACTCTGCTAAACAATAGCAGGATATACCATTTTTCTCAAGTG	101557

CR938720.8	651	TACATGGAACGTTCTCCAGGATAGGCCATATGCTAGGCCATAAAACACGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101558	TACATGGAACGTTCTCCAGGATAGGCCATATGCTAGGCCATAAAACACGT	101607

CR938720.8	701	CTCAATAATTTTAAAAGGACTGAAATAATACAAAGATGTTCTCTGATCAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101608	CTCAATAATTTTAAAAGGACTGAAATAATACAAAGATGTTCTCTGATCAC	101657

CR938720.8	751	AATAGAATTAAATTAGAAATCAACAACAACAGGAAATTTGAGAAAATTAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101658	AATAGAATTAAATTAGAAATCAACAACAACAGGAAATTTGAGAAAATTAC	101707

CR938720.8	801	AAGTGTGTGAAAATTAAACAGCATGCTTCTAAACAACCAATGGGTGGAAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101708	AAGTGTGTGAAAATTAAACAGCATGCTTCTAAACAACCAATGGGTGGAAG	101757

CR938720.8	851	AAGAAATCACAAGGAAAACCAGAAAATATTTCAAGCTGAATGAAAATTGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101758	AAGAAATCACAAGGAAAACCAGAAAATATTTCAAGCTGAATGAAAATTGA	101807

CR938720.8	901	AACAGAACATATCAGAATTAATTTTTGACATGTAGCTAAAGCTATGCTTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101808	AACAGAACATATCAGAATTAATTTTTGACATGTAGCTAAAGCTATGCTTA	101857

CR938720.8	951	GAGGGGATTTATAGCTTGTAATTCCTATATTACCTCATACCATACACAAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101858	GAGGGGATTTATAGCTTGTAATTCCTATATTACCTCATACCATACACAAA	101907

CR938720.8	1001	AAACCAACTTAAAATTGATCATAGACCTAAATGTAAGTGCAAAACTATAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101908	AAACCAACTTAAAATTGATCATAGACCTAAATGTAAGTGCAAAACTATAA	101957

CR938720.8	1051	AACTATTAGAAAAAGGCCTAAAAGTAGATATTCATGATGTTGGGCTAGGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	101958	AACTATTAGAAAAAGGCCTAAAAGTAGATATTCATGATGTTGGGCTAGGC	102007

CR938720.8	1101	AATGATTTCTTACATATGATACTTTCTTACATCTACACAAGCAATAAAAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102008	AATGATTTCTTACATATGATACTTTCTTACATCTACACAAGCAATAAAAT	102057

CR938720.8	1151	AGTATTTTGTTTTTGGAGACAGGGTCCTGGTATGTCACCCAGTCTGGAGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102058	AGTATTTTGTTTTTGGAGACAGGGTCCTGGTATGTCACCCAGTCTGGAGT	102107

CR938720.8	1201	GCCATGGTGCAATCATAGTTCACTGCAGCCTCAACTCCCGGGCTCAAGTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102108	GCCATGGTGCAATCATAGTTCACTGCAGCCTCAACTCCCGGGCTCAAGTG	102157

CR938720.8	1251	ATCCTCCTGCCTCAGCTTCCTGGATAGCTGGGACTACAGGTGCATACAAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102158	ATCCTCCTGCCTCAGCTTCCTGGATAGCTGGGACTACAGGTGCATACAAC	102207

CR938720.8	1301	CACGCTTGGTTAATTGTTAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTGTGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102208	CACGCTTGGTTAATTGTTAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTGTGG	102257

CR938720.8	1351	AGACAGGGTCTCACTATATTGCCCATGCTTCACATAAAATATTGATAATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102258	AGACAGGGTCTCACTATATTGCCCATGCTTCACATAAAATATTGATAATT	102307

CR938720.8	1401	GGATTTCATCAAAATTGAAAACTTTTGTACTCCAAAAGGCACCATCAAGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102308	GGATTTCATCAAAATTGAAAACTTTTGTACTCCAAAAGGCACCATCAAGA	102357

CR938720.8	1451	AAGTGAAGGCTGGGTGTGGTGGCTTACACCTGTAATCCTAGCACTTTGAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102358	AAGTGAAGGCTGGGTGTGGTGGCTTACACCTGTAATCCTAGCACTTTGAG	102407

CR938720.8	1501	AGGCCGAGGCAGGTGGATCACTTGGGGCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102408	AGGCCGAGGCAGGTGGATCACTTGGGGCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGG	102457

CR938720.8	1551	CCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTAAAAAATGCAAAAATTAGCCGGGCAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102458	CCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTAAAAAATGCAAAAATTAGCCGGGCAT	102507

CR938720.8	1601	GGTGGTGCATGCATGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGATAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102508	GGTGGTGCATGCATGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGATAA	102557

CR938720.8	1651	TTTCTTAAACCTGGGAGTTGGAAGTTGTGGTGAGCCGAAATCATGCCACT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102558	TTTCTTAAACCTGGGAGTTGGAAGTTGTGGTGAGCCGAAATCATGCCACT	102607

CR938720.8	1701	GCACTCCCGCCTGGGTGATAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102608	GCACTCCCGCCTGGGTGATAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAA	102657

CR938720.8	1751	AAAAAAAAAAAAAAAGAAAGTGGAAATTGCCTTCATTAAGGAAAAAAACA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102658	AAAAAAAAAAAAAAAGAAAGTGGAAATTGCCTTCATTAAGGAAAAAAACA	102707

CR938720.8	1801	AACATAAAAATAACAGCAACCATAAGAAAGTGAAAAGATAAACAAAAGCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102708	AACATAAAAATAACAGCAACCATAAGAAAGTGAAAAGATAAACAAAAGCA	102757

CR938720.8	1851	ATAGAATGAGATCAAGTATTTGCAAATCATTTATCAGATAAGGGACTTGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102758	ATAGAATGAGATCAAGTATTTGCAAATCATTTATCAGATAAGGGACTTGT	102807

CR938720.8	1901	ATCTAAAATATAAAAAGAACTTTTATAACTCAATAATAACAATAAAAAAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102808	ATCTAAAATATAAAAAGAACTTTTATAACTCAATAATAACAATAAAAAAT	102857

CR938720.8	1951	GGGCAAGAGATTTGAATAGACATTTCACCAAAGAAGATACATAAATGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933878.7	102858	GGGCAAGAGATTTGAATAGACATTTCACCAAAGAAGATACATAAATGGCC	102907

Overview

Query
CR938720.8 - 24329 bps
Hit
CR933878.7 - 102907 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link