<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759828.5	1	GGCCATTGATTTAATTAATCTTGCCTACACAATGAAACTTCCATAGAAAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	25770	GGCCATTGATTTAATTAATCTTGCCTACACAATGAAACTTCCATAGAAAC	25819

CR759828.5	51	CTCTAGAGATTGGGTTTTGGAGAGCTTCCCAATTGCTGAGCACATCCGTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	25820	CTCTAGAGATTGGGTTTTGGAGAGCTTCCCAATTGCTGAGCACATCCGTG	25869

CR759828.5	101	TGTCCATGTGCTGGGAGGATGGTGAACCTCATCTCCATGGGGACAGAGGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	25870	TGTCCATGTGCTGGGAGGATGGTGAACCTCATCTCCATGGGGACAGAGGC	25919

CR759828.5	151	TCCTGTGCTCAGAGCCCTCCCAGACCACACCCTGTGCACCTCTTCATCTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	25920	TCCTGTGCTCAGAGCCCTCCCAGACCACACCCTGTGCACCTCTTCATCTG	25969

CR759828.5	201	GTTGCTCATTTGTACCCTTTATAACTGCTATGGCTTGAATGTTTCCCTAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	25970	GTTGCTCATTTGTACCCTTTATAACTGCTATGGCTTGAATGTTTCCCTAG	26019

CR759828.5	251	AAAAGCATCTCTTGGATAATTTATCCTGAATGCAACATTTTTAAGAGGCG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26020	AAAAGCATCTCTTGGATAATTTATCCTGAATGCAACATTTTTAAGAGGCG	26069

CR759828.5	301	GGACCTTTGAGAGGTGATTGGACCATCAGAGCTCTGCCTCCATTAATGAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26070	GGACCTTTGAGAGGTGATTGGACCATCAGAGCTCTGCCTCCATTAATGAA	26119

CR759828.5	351	TTAAGTCTGATCATAAAAGGACCTGAGGCTGTGAGTTTGACCTCTTATTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26120	TTAAGTCTGATCATAAAAGGACCTGAGGCTGTGAGTTTGACCTCTTATTC	26169

CR759828.5	401	CCCCTACCTCTCACCCTCTCTTGCCCTTTTGCTTTCTACCAGGTACAGTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26170	CCCCTACCTCTCACCCTCTCTTGCCCTTTTGCTTTCTACCAGGTACAGTC	26219

CR759828.5	451	CTTGGTCTTGGAATTCCCATCCTCAACAACCATGAACCAAATAAATTTCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26220	CTTGGTCTTGGAATTCCCATCCTCAACAACCATGAACCAAATAAATTTCT	26269

CR759828.5	501	GTTCGTTTTAAGTTATCCAGTCTCAGGTGTTCTACTATAGTGGCATAATT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26270	GTTCGTTTTAAGTTATCCAGTCTCAGGTGTTCTACTATAGTGGCATAATT	26319

CR759828.5	551	TAAACCAAGAGTCCGTAACCCCTGGCTGTGGACTGGTACAGGTTCTTGGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26320	TAAACCAAGAGTCCGTAACCCCTGGCTGTGGACTGGTACAGGTTCTTGGC	26369

CR759828.5	601	TTGGCAGGAACCAGACCACACAGCAGGAGGTCACTGGTGGGTGATAGAGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26370	TTGGCAGGAACCAGACCACACAGCAGGAGGTCACTGGTGGGTGATAGAGC	26419

CR759828.5	651	ATGAGCATGACCACCTGAGCTCTGCCTCCTGTTAGATCAGTGGCGGAATT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26420	ATGAGCATGACCACCTGAGCTCTGCCTCCTGTTAGATCAGTGGCGGAATT	26469

CR759828.5	701	AGATTCTCATAAGAGCATGAACCCTATTGTGAACTCTGCATGTGAGGGAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26470	AGATTCTCATAAGAGCATGAACCCTATTGTGAACTCTGCATGTGAGGGAT	26519

CR759828.5	751	CTACGTTGCATTCTCCATATGAAACAGTAATGCCTGATCATCTGAGGTGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26520	CTACGTTGCATTCTCCATATGAAACAGTAATGCCTGATCATCTGAGGTGG	26569

CR759828.5	801	AACAGTTTCATCCTCAATCCATTCCCCTCTATTCCCTGCCACCTCTGCTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26570	AACAGTTTCATCCTCAATCCATTCCCCTCTATTCCCTGCCACCTCTGCTG	26619

CR759828.5	851	GTCCATGGAAAAACTGTCTTCCATGAAATTGGTCCCTGGTGCCAAAAAGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26620	GTCCATGGAAAAACTGTCTTCCATGAAATTGGTCCCTGGTGCCAAAAAGT	26669

CR759828.5	901	TGGGACCACTGATTTAAGCTATAACAATAATAAACTACAATACTGAGTGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26670	TGGGACCACTGATTTAAGCTATAACAATAATAAACTACAATACTGAGTGT	26719

CR759828.5	951	GAAAGAAAAATAAAATTTAGGGACGCCAAATTCACTATACCAAAGGGACA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26720	GAAAGAAAAATAAAATTTAGGGACGCCAAATTCACTATACCAAAGGGACA	26769

CR759828.5	1001	AGTTAAGTTTGGTAACTGAGTGATGGAAAAACCGCCTTTCTTTTGTTCCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26770	AGTTAAGTTTGGTAACTGAGTGATGGAAAAACCGCCTTTCTTTTGTTCCT	26819

CR759828.5	1051	AAACAAATAACTGCAAAGATAGAGGAACATATATCTCCCCAGGTGGCCTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26820	AAACAAATAACTGCAAAGATAGAGGAACATATATCTCCCCAGGTGGCCTC	26869

CR759828.5	1101	CCTCACAAATTGCTCACAAGATAATTCCTTGTGGGCCCCAACATCTTTAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26870	CCTCACAAATTGCTCACAAGATAATTCCTTGTGGGCCCCAACATCTTTAC	26919

CR759828.5	1151	TCTAAAACAGAGTTTTGTTGAGTTTCACCCTAACAATGTAAATTAACAGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26920	TCTAAAACAGAGTTTTGTTGAGTTTCACCCTAACAATGTAAATTAACAGC	26969

CR759828.5	1201	TTATCTTCACAGGTGAAGGACAAAGACAAGACCAGAAATCATCCCTCCAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	26970	TTATCTTCACAGGTGAAGGACAAAGACAAGACCAGAAATCATCCCTCCAC	27019

CR759828.5	1251	TCACCTGGAGACAAATGTGTATTTGACTTCTCTACCCAACATTTACTTTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	27020	TCACCTGGAGACAAATGTGTATTTGACTTCTCTACCCAACATTTACTTTG	27069

CR759828.5	1301	TCTTATGTAAAATGCAGATTTACTGAGCACTCGACGAAAGCATAGTTGAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	27070	TCTTATGTAAAATGCAGATTTACTGAGCACTCGACGAAAGCATAGTTGAC	27119

CR759828.5	1351	TGTTCCTTTTTCCTCTCCTGCCTGCTCTTTCTCCTGTAAATATTAAAGTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	27120	TGTTCCTTTTTCCTCTCCTGCCTGCTCTTTCTCCTGTAAATATTAAAGTC	27169

CR759828.5	1401	CTCAAAACCCTCTTAGTAAAAAGCATGGGCCACAGATGCTACAATAATTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	27170	CTCAAAACCCTCTTAGTAAAAAGCATGGGCCACAGATGCTACAATAATTT	27219

CR759828.5	1451	GTGTCTCTGTTTCCAAGGTACATCTTCAGCTTGGCAAAATAAACTTCTAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	27220	GTGTCTCTGTTTCCAAGGTACATCTTCAGCTTGGCAAAATAAACTTCTAA	27269

CR759828.5	1501	ATTGATTGATACCTGTCTCAGATGTTTTTTGGTTTACATGGTTATAGCAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	27270	ATTGATTGATACCTGTCTCAGATGTTTTTTGGTTTACATGGTTATAGCAA	27319

CR759828.5	1551	CTTCCTGAGTTCTTTGAGTTAGTTTAAGAATTCCCAAACCTTGGGAGGTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	27320	CTTCCTGAGTTCTTTGAGTTAGTTTAAGAATTCCCAAACCTTGGGAGGTG	27369

CR759828.5	1601	AGAAACCCCTGACATTGCAGCCATGATAGACAGAAGTGCAGGTAACCTGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	27370	AGAAACCCCTGACATTGCAGCCATGATAGACAGAAGTGCAGGTAACCTGG	27419

CR759828.5	1651	AACCCGATAACTTGTGACTTGCATCTGAAGTGAGGACAGACTTGTGGGAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	27420	AACCCGATAACTTGTGACTTGCATCTGAAGTGAGGACAGACTTGTGGGAC	27469

CR759828.5	1701	TGAGTCCTTAAACCTGTGGAGTCTGAGGCTAACTCCAGGTAGTTAGTGTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	27470	TGAGTCCTTAAACCTGTGGAGTCTGAGGCTAACTCCAGGTAGTTAGTGTC	27519

CR759828.5	1751	AGAATTGAGTCAAATTCTAGGACTCCCAATTGCTGTTGGAGAATCAGAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	27520	AGAATTGAGTCAAATTCTAGGACTCCCAATTGCTGTTGGAGAATCAGAAA	27569

CR759828.5	1801	ATTATTTGGCTGGAGGAAAACCCCATCACCATCCCACAGAGAGAAACTTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	27570	ATTATTTGGCTGGAGGAAAACCCCATCACCATCCCACAGAGAGAAACTTA	27619

CR759828.5	1851	CAGTATATTGGGGGAACCCACCCCCAATATTTCAACATAGGTTCTTTCTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	27620	CAGTATATTGGGGGAACCCACCCCCAATATTTCAACATAGGTTCTTTCTA	27669

CR759828.5	1901	TTTTCCATAAGTGTCGGCCAGCTGAGAAATAAAGAAAGACAGTACAAAGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	27670	TTTTCCATAAGTGTCGGCCAGCTGAGAAATAAAGAAAGACAGTACAAAGA	27719

CR759828.5	1951	GAGGAATTTTACAGCTGGGCCACCAGGGGTGACATCACATATCGGTAGGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933862.6	27720	GAGGAATTTTACAGCTGGGCCACCAGGGGTGACATCACATATCGGTAGGA	27769

Overview

Query
CR759828.5 - 102821 bps
Hit
CR933862.6 - 27769 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link