<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759848.2	1	GGCCAGGCCAGATGTTATTAGGAGAGCCGAGAGAGCTCCTGTTAGTGGTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	81683	GGCCAGGCCAGATGTTATTAGGAGAGCCGAGAGAGCTCCTGTTAGTGGTC	81732

CR759848.2	51	AAGGGCTAGGTACAGCTATATGGTAGGCATGAGTTTGGCGGGTCATTATG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	81733	AAGGGCTAGGTACAGCTATATGGTAGGCATGAGTTTGGCGGGTCATTATG	81782

CR759848.2	101	TATTATCATGCAAATAAAGACTTACTAATAGTGTGAAGACATAAGCTTGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	81783	TATTATCATGCAAATAAAGACTTACTAATAGTGTGAAGACATAAGCTTGA	81832

CR759848.2	151	ATAAGAGCGACAGCGAACTCGAGAATAGTTAGTAGAATTAGAATAATAAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	81833	ATAAGAGCGACAGCGAACTCGAGAATAGTTAGTAGAATTAGAATAATAAG	81882

CR759848.2	201	AGATACTGAAGTTGCAGAGACACTAATAATTGATAATATTAGCACTGCAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	81883	AGATACTGAAGTTGCAGAGACACTAATAATTGATAATATTAGCACTGCAC	81932

CR759848.2	251	TGCGACTGTGGTCGGCGATTATCCCACTTCCAGGGCCAATCAGGCTAACA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	81933	TGCGACTGTGGTCGGCGATTATCCCACTTCCAGGGCCAATCAGGCTAACA	81982

CR759848.2	301	AATTATTTCAAACCTATTACAACTCCCTACAATGCTTCAAGCCCCAAGGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	81983	AATTATTTCAAACCTATTACAACTCCCTACAATGCTTCAAGCCCCAAGGC	82032

CR759848.2	351	ACCCCCGTTGGAGGGCCTATAACTAAACACTCCCTCCTTTTACAATAAGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82033	ACCCCCGTTGGAGGGCCTATAACTAAACACTCCCTCCTTTTACAATAAGC	82082

CR759848.2	401	CTCACTTTGCTTTTCAGCCTCTGAAGGAAATTTCCCTGTAGGATCCTTCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82083	CTCACTTTGCTTTTCAGCCTCTGAAGGAAATTTCCCTGTAGGATCCTTCA	82132

CR759848.2	451	CACCTAACCAATGCAACCGCACTATCATTATTAAACACCCCTCTAACCAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82133	CACCTAACCAATGCAACCGCACTATCATTATTAAACACCCCTCTAACCAT	82182

CR759848.2	501	CAGACTAACCAAGCTGACTACCAAGTATCACCTGAAGCAAATGGAATGTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82183	CAGACTAACCAAGCTGACTACCAAGTATCACCTGAAGCAAATGGAATGTT	82232

CR759848.2	551	TCTGCATCTGGCTTGTTTTACAGCCTATCCCCTAACCAATGCCTCTGAAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82233	TCTGCATCTGGCTTGTTTTACAGCCTATCCCCTAACCAATGCCTCTGAAC	82282

CR759848.2	601	TAACTTGTGCTGTCCCTGGTTCCCACCTTTTTCCATGGCTCAATGTCAAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82283	TAACTTGTGCTGTCCCTGGTTCCCACCTTTTTCCATGGCTCAATGTCAAT	82332

CR759848.2	651	GATGCAACATCTGATCACATTAAACGTGTAAAAAATAACTCTTGCTATAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82333	GATGCAACATCTGATCACATTAAACGTGTAAAAAATAACTCTTGCTATAT	82382

CR759848.2	701	CTCTACTATAGTGGATGTCTCTCTGGCCTCCTCCTTGTCCATCTGGAGTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82383	CTCTACTATAGTGGATGTCTCTCTGGCCTCCTCCTTGTCCATCTGGAGTA	82432

CR759848.2	751	ATGAACCGCAGGAAAGAAACAACATCCAATTTTTAACACACTTATTCTCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82433	ATGAACCGCAGGAAAGAAACAACATCCAATTTTTAACACACTTATTCTCT	82482

CR759848.2	801	TTCCATATCTCTGCCTGTATTTACGACAAAGGCTTGTTCTTTTTGTGTGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82483	TTCCATATCTCTGCCTGTATTTACGACAAAGGCTTGTTCTTTTTGTGTGG	82532

CR759848.2	851	CACCAACACATATCTTTGTCTCCCCACCAACCGGACCGGAACCTGTTCTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82533	CACCAACACATATCTTTGTCTCCCCACCAACCGGACCGGAACCTGTTCTC	82582

CR759848.2	901	TAGTTTATCTTTCCCCTTCCATTGGACTAGTTCCTCCTCATCAACCTTTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82583	TAGTTTATCTTTCCCCTTCCATTGGACTAGTTCCTCCTCATCAACCTTTG	82632

CR759848.2	951	TCTATCCCATCCACCCAATATGTTAGGAAAAGGAGAGCCATCCACATCAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82633	TCTATCCCATCCACCCAATATGTTAGGAAAAGGAGAGCCATCCACATCAT	82682

CR759848.2	1001	TCCTTAATGGCCGCCTTGGGTATAAGCTCTGGACTTAGAGAGGGAGCAGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82683	TCCTTAATGGCCGCCTTGGGTATAAGCTCTGGACTTAGAGAGGGAGCAGG	82732

CR759848.2	1051	TGGATTAGCCACATACTTTAAGGTTCTTTCAACAGAACTACAGGGATCTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82733	TGGATTAGCCACATACTTTAAGGTTCTTTCAACAGAACTACAGGGATCTC	82782

CR759848.2	1101	TAGAAGATATAGCCTGAAGCCTTGTAAGAGTCCAAGACCAACTAGACTCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82783	TAGAAGATATAGCCTGAAGCCTTGTAAGAGTCCAAGACCAACTAGACTCC	82832

CR759848.2	1151	TTAGCTGGTACAGTCCTCCAGAACAGACAGAGACTAGATCTTATAATGGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82833	TTAGCTGGTACAGTCCTCCAGAACAGACAGAGACTAGATCTTATAATGGT	82882

CR759848.2	1201	TGAAAAAGAGGGCATCTGCCTCTCACTGGGTGAGGAAAGTTGTTTCTGTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82883	TGAAAAAGAGGGCATCTGCCTCTCACTGGGTGAGGAAAGTTGTTTCTGTC	82932

CR759848.2	1251	TCAACCAGTCGGGCCCAGTAAGAGGTGCTGCCGAAAAACTTAAAGAAAGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82933	TCAACCAGTCGGGCCCAGTAAGAGGTGCTGCCGAAAAACTTAAAGAAAGG	82982

CR759848.2	1301	GCTAAAAAGCTAAGGGAATACCAACACAGTCAAATAGATTCTTGGTTTGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	82983	GCTAAAAAGCTAAGGGAATACCAACACAGTCAAATAGATTCTTGGTTTGG	83032

CR759848.2	1351	GAACAAAATCATAGCATGAGTCACCCCATTCCTGGGCCCTCTCCTAATGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	83033	GAACAAAATCATAGCATGAGTCACCCCATTCCTGGGCCCTCTCCTAATGA	83082

CR759848.2	1401	TATGCCTAGGACTAGTGTTCTTACCCTGCCTAATTAATCTTTTTCAAAGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	83083	TATGCCTAGGACTAGTGTTCTTACCCTGCCTAATTAATCTTTTTCAAAGA	83132

CR759848.2	1451	TTTTTAACCAACAGGATCATGGCCATTTCACAGACAACTACCCAAAAACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	83133	TTTTTAACCAACAGGATCATGGCCATTTCACAGACAACTACCCAAAAACA	83182

CR759848.2	1501	TCTACAGATGGCATTACTCCTACAGTCAATCCGAGACCAGAAAACTCTCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	83183	TCTACAGATGGCATTACTCCTACAGTCAATCCGAGACCAGAAAACTCTCC	83232

CR759848.2	1551	ACACTCCTCTCAGCAGGAATTAGCCAGAAAGAACACACCGTCCTCATCCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	83233	ACACTCCTCTCAGCAGGAATTAGCCAGAAAGAACACACCGTCCTCATCCT	83282

CR759848.2	1601	TTTATAACTATAGGATCTGGATTGACAGAGCAGGAGCATTGCCATCTTGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	83283	TTTATAACTATAGGATCTGGATTGACAGAGCAGGAGCATTGCCATCTTGG	83332

CR759848.2	1651	ACAAGCACCACCATTTTAAAGTTCCCCTTGATCAAAAGCCACCTAAATCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	83333	ACAAGCACCACCATTTTAAAGTTCCCCTTGATCAAAAGCCACCTAAATCC	83382

CR759848.2	1701	AACCCAAAGGGCATCAGCCTAATGGCTAATGGCAGCATGACCTTAAACCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	83383	AACCCAAAGGGCATCAGCCTAATGGCTAATGGCAGCATGACCTTAAACCA	83432

CR759848.2	1751	CAAATGATACCTCTGACCAGAAACATTCCAACCCTGAGATAAACCCCTCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	83433	CAAATGATACCTCTGACCAGAAACATTCCAACCCTGAGATAAACCCCTCT	83482

CR759848.2	1801	CCAACCAGAGACACACCAGCCCCAAGATAACCTCCCCTCTGACCGGAGAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	83483	CCAACCAGAGACACACCAGCCCCAAGATAACCTCCCCTCTGACCGGAGAG	83532

CR759848.2	1851	ATGCCAACCCCAAGATAACCTCCCCTCCAACCAGAGACATTCCAACCCCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	83533	ATGCCAACCCCAAGATAACCTCCCCTCCAACCAGAGACATTCCAACCCCA	83582

CR759848.2	1901	CAATAAAGTTCTCCTCCACACAGAAACATTCAAGCCTTTTGCCCCAAACC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	83583	CAATAAAGTTCTCCTCCACACAGAAACATTCAAGCCTTTTGCCCCAAACC	83632

CR759848.2	1951	CTTAAATACTCTTAGTCTGTAAGAGAGAGGGCTCCTGACTGAAATCAGAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933859.5	83633	CTTAAATACTCTTAGTCTGTAAGAGAGAGGGCTCCTGACTGAAATCAGAC	83682

Overview

Query
CR759848.2 - 104881 bps
Hit
CR933859.5 - 83682 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link