<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1334 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR388180.5	1	GGCCAGATGACGTCCCTCCTGAAGGCTGGAACCGCACCCGCCATGTCATC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	32290	GGCCAGATGACGTCCCTCCTGAAGGCTGGAACCGCACCCGCCATGTCATC	32339

CR388180.5	51	ATCCTCATGACTGATGGTCAGAAGGGACCTCTCTCCTGTCCCAGCCTCCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	32340	ATCCTCATGACTGATGGTCAGAAGGGACCTCTCTCCTGTCCCAGCCTCCC	32389

CR388180.5	101	CACCTTCTCAGACCAGCATGTGGCCCTTAAGTCCACTTGTAACACTATAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	32390	CACCTTCTCAGACCAGCATGTGGCCCTTAAGTCCACTTGTAACACTATAC	32439

CR388180.5	151	CCATGGTTGGGGCCCTGAATGTGACTCATAGCTGGCTGTTCATCTCTCCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	32440	CCATGGTTGGGGCCCTGAATGTGACTCATAGCTGGCTGTTCATCTCTCCT	32489

CR388180.5	201	GTGACCCTTCATAAGGAATTCTTCCTAAGCCCTGTGATCAACTATCTCTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	32490	GTGACCCTTCATAAGGAATTCTTCCTAAGCCCTGTGATCAACTATCTCTA	32539

CR388180.5	251	ACCCTTCCTCAACTTGCTCACCCTGCCACGTGTATCCCTGCCTTTAGCCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	32540	ACCCTTCCTCAACTTGCTCACCCTGCCACGTGTATCCCTGCCTTTAGCCA	32589

CR388180.5	301	GTTTATCTTCCTTATCTCCTACCCTCATGGTCCTGTCTCTTCTGCAGGAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	32590	GTTTATCTTCCTTATCTCCTACCCTCATGGTCCTGTCTCTTCTGCAGGAT	32639

CR388180.5	351	TGCACAACATGGGCGGGGACCCAATTACTGTCATTGATGAGATCCGGGAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	32640	TGCACAACATGGGCGGGGACCCAATTACTGTCATTGATGAGATCCGGGAC	32689

CR388180.5	401	TTGCTATACATTGGCAAGGATCGCAAAAACCCAAGGGAGGATTATCTGGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	32690	TTGCTATACATTGGCAAGGATCGCAAAAACCCAAGGGAGGATTATCTGGG	32739

CR388180.5	451	TGAGTAACCTGCCTAGGACCCAGCACCCCACTTCCTCAGGGCTTGGACCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	32740	TGAGTAACCTGCCTAGGACCCAGCACCCCACTTCCTCAGGGCTTGGACCC	32789

CR388180.5	501	TCATCCTTCCTTTTTATCCCTCAGATGTCTATGTGTTTGGGGTCGGGCCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	32790	TCATCCTTCCTTTTTATCCCTCAGATGTCTATGTGTTTGGGGTCGGGCCT	32839

CR388180.5	551	TTGGTGAACCAAGTGAACATCAATGCTTTGGCTTCCAAGAAAGACAATGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	32840	TTGGTGAACCAAGTGAACATCAATGCTTTGGCTTCCAAGAAAGACAATGA	32889

CR388180.5	601	GCAACATGTGTTCAAAGTCAAGGATATGGAAAACCTGGAAGATGTTTTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	32890	GCAACATGTGTTCAAAGTCAAGGATATGGAAAACCTGGAAGATGTTTTCT	32939

CR388180.5	651	ACCAAATGATCGGTAGGGAGATACAAGGGAATAAAGAACACAACTCTCCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	32940	ACCAAATGATCGGTAGGGAGATACAAGGGAATAAAGAACACAACTCTCCT	32989

CR388180.5	701	CAGGTTCCCCTGAAGTAATTCATTCTTCCTCTACACCTGAAGCTCTAGTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	32990	CAGGTTCCCCTGAAGTAATTCATTCTTCCTCTACACCTGAAGCTCTAGTT	33039

CR388180.5	751	GCCTGGAAAGCCTTCTTCATTCCTCCTTCTCTACCTCAGTGTCACTATTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	33040	GCCTGGAAAGCCTTCTTCATTCCTCCTTCTCTACCTCAGTGTCACTATTC	33089

CR388180.5	801	TTGTTTCCTGGCACTGTTCACTTAACCTTAGAATCACAGAGCTCTGAGCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	33090	TTGTTTCCTGGCACTGTTCACTTAACCTTAGAATCACAGAGCTCTGAGCA	33139

CR388180.5	851	CTTCAGAGATCTTTCTATAGTCCTACATTTGACACATGTGGAAACAGAAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	33140	CTTCAGAGATCTTTCTATAGTCCTACATTTGACACATGTGGAAACAGAAG	33189

CR388180.5	901	CCAAAGGAGGTCAAGGGACAGCAAGTTAGCAACAAGGGTGGGCTTGAAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	33190	CCAAAGGAGGTCAAGGGACAGCAAGTTAGCAACAAGGGTGGGCTTGAAAA	33239

CR388180.5	951	CAGCCAGGCCTCTGACAGCTTGATCCCAAGTTCTTTCCCTTTTCAGTCCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	33240	CAGCCAGGCCTCTGACAGCTTGATCCCAAGTTCTTTCCCTTTTCAGTCCA	33289

CR388180.5	1001	CCATAGCAGTTTTCTCCTAACACGAGGAAACAAATACCCGTGGTCTTTCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	33290	CCATAGCAGTTTTCTCCTAACACGAGGAAACAAATACCCGTGGTCTTTCC	33339

CR388180.5	1051	CTTTCTCCTTTTGGGCCTTTGCTCCCCATAGACTCCTACCCAAAAGGCTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	33340	CTTTCTCCTTTTGGGCCTTTGCTCCCCATAGACTCCTACCCAAAAGGCTG	33389

CR388180.5	1101	CTGCCATTTGGGAATGAAGTGTTCCGAGTTTTCAGCACATTCTCCTTCTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	33390	CTGCCATTTGGGAATGAAGTGTTCCGAGTTTTCAGCACATTCTCCTTCTC	33439

CR388180.5	1151	TGCCAGATGAAAGCCAGTCTCTGAGTCTCTGTGGCATGGTTTGGGAACAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	33440	TGCCAGATGAAAGCCAGTCTCTGAGTCTCTGTGGCATGGTTTGGGAACAC	33489

CR388180.5	1201	AGGAAGGGTACCGATTACCACAAGCAACCATGGCAGGCCAAGATCTCAGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	33490	AGGAAGGGTACCGATTACCACAAGCAACCATGGCAGGCCAAGATCTCAGT	33539

CR388180.5	1251	CATTGTAAGCACAGAATCCCAGTAGTGGGGACTTGGGGGAGGTGAGGTCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	33540	CATTGTAAGCACAGAATCCCAGTAGTGGGGACTTGGGGGAGGTGAGGTCA	33589

CR388180.5	1301	AGGTGAAATGGGAGTAGGGGAAGGAAAAAATGGC	1334
			||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933857.3	33590	AGGTGAAATGGGAGTAGGGGAAGGAAAAAATGGC	33623

Overview

Query
CR388180.5 - 1869 bps
Hit
CR933857.3 - 33623 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1334 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link