<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759808.2	1	GGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCATCTCACAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	11215	GGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCATCTCACAC	11264

CR759808.2	51	CAGTTAGAATGGCAATCATTAAAAAGTCAGGAAATAACAGGTGCTGGAGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	11265	CAGTTAGAATGGCAATCATTAAAAAGTCAGGAAATAACAGGTGCTGGAGA	11314

CR759808.2	101	GGATATGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAACT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	11315	GGATATGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAACT	11364

CR759808.2	151	AGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCAACTCCTCAGGGATCTAGAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	11365	AGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCAACTCCTCAGGGATCTAGAAC	11414

CR759808.2	201	TAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	11415	TAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAG	11464

CR759808.2	251	GATTATAAATCATGCTGCTAGAAAGACACATGCACACATATGTTTATTGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	11465	GATTATAAATCATGCTGCTAGAAAGACACATGCACACATATGTTTATTGT	11514

CR759808.2	301	GGCGCTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCAACAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	11515	GGCGCTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCAACAA	11564

CR759808.2	351	TGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	11565	TGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTAT	11614

CR759808.2	401	GCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	11615	GCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAA	11664

CR759808.2	451	GCTGGAAACCATCATTCTCAGCAAACTATCACAAAGGACAAAAACCCAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	11665	GCTGGAAACCATCATTCTCAGCAAACTATCACAAAGGACAAAAACCCAAA	11714

CR759808.2	501	CATCGCATGTTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGAGATCACATGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	11715	CATCGCATGTTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGAGATCACATGG	11764

CR759808.2	551	ACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGCCTGTTGTGGGGTGGGGGGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	11765	ACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGCCTGTTGTGGGGTGGGGGGA	11814

CR759808.2	601	GTGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGCTAAATGACTAGTTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	11815	GTGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGCTAAATGACTAGTTA	11864

CR759808.2	651	ATGGGTGCAGCACACCAACATGGCACATGTATACATATGTAACAAACCTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	11865	ATGGGTGCAGCACACCAACATGGCACATGTATACATATGTAACAAACCTG	11914

CR759808.2	701	CACGTTGTGCACATGTATCCTAAAATTTAAAGTATAATTTAAAAAAATGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	11915	CACGTTGTGCACATGTATCCTAAAATTTAAAGTATAATTTAAAAAAATGC	11964

CR759808.2	751	CTTTTCCATAATCACACATATTTAAGAATGGAATTCATTCACTTTTGAGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	11965	CTTTTCCATAATCACACATATTTAAGAATGGAATTCATTCACTTTTGAGT	12014

CR759808.2	801	AAAAATTATTCATCTGGGGGATTGTTAAAATGAGGGCTGGATTATCAGTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12015	AAAAATTATTCATCTGGGGGATTGTTAAAATGAGGGCTGGATTATCAGTT	12064

CR759808.2	851	TCAGAGTAATTTTAGAAAAGACACCATGTTTGAAGAAAGTTTAGCTCTCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12065	TCAGAGTAATTTTAGAAAAGACACCATGTTTGAAGAAAGTTTAGCTCTCT	12114

CR759808.2	901	AAGTCATGGTTTTATTCTGAGATTCTTTGATTCTACTATTATGTATGGGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12115	AAGTCATGGTTTTATTCTGAGATTCTTTGATTCTACTATTATGTATGGGT	12164

CR759808.2	951	TTATGTAAATAATTACTAAGTATTCCTTTTTTTTTTTACATAAGGCCAGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12165	TTATGTAAATAATTACTAAGTATTCCTTTTTTTTTTTACATAAGGCCAGT	12214

CR759808.2	1001	GCAATCATGCGTGATTTTATTGGTGACCAGTTAAAATGAAACTGTTAATT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12215	GCAATCATGCGTGATTTTATTGGTGACCAGTTAAAATGAAACTGTTAATT	12264

CR759808.2	1051	AATGAAAAAAATCCTTTTTACTAGAAAAACCTGTGAATCTGTGTTACAGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12265	AATGAAAAAAATCCTTTTTACTAGAAAAACCTGTGAATCTGTGTTACAGA	12314

CR759808.2	1101	AAACGAGTTATGTATAATATTCATTTTTTTAACCTGAAATGCATCGACTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12315	AAACGAGTTATGTATAATATTCATTTTTTTAACCTGAAATGCATCGACTA	12364

CR759808.2	1151	CAAGAGTTAGCTAAACCAAGATAATAATTAACTACTTCCCACTGAGGCAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12365	CAAGAGTTAGCTAAACCAAGATAATAATTAACTACTTCCCACTGAGGCAA	12414

CR759808.2	1201	TTCCCTGAGGGAGAGGTCCATGAAATCCCCTGCTTTGAACTCATAGTTTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12415	TTCCCTGAGGGAGAGGTCCATGAAATCCCCTGCTTTGAACTCATAGTTTT	12464

CR759808.2	1251	TATCTGAAACACCAACTTTCCTGCACAGGATTTTTGTCCCCAGTGCCTGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12465	TATCTGAAACACCAACTTTCCTGCACAGGATTTTTGTCCCCAGTGCCTGG	12514

CR759808.2	1301	ACAGCACTGGCTTCATTTCAAATACCCCTTAGTTAATAGGAAATTTAAAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12515	ACAGCACTGGCTTCATTTCAAATACCCCTTAGTTAATAGGAAATTTAAAT	12564

CR759808.2	1351	GTCCCTGGGCAGTTACATCCTGTTTGGTCCTATATAAAAGCGTTTCAGTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12565	GTCCCTGGGCAGTTACATCCTGTTTGGTCCTATATAAAAGCGTTTCAGTC	12614

CR759808.2	1401	CTTTCCTTACATGGAAATTTCACTGACTGAAACACCAGCTTGATTCTAGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12615	CTTTCCTTACATGGAAATTTCACTGACTGAAACACCAGCTTGATTCTAGA	12664

CR759808.2	1451	ACAAAGATGCTCAGTCTCAGGATCAATTGAGATTTGTTTCTACCGAGAGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12665	ACAAAGATGCTCAGTCTCAGGATCAATTGAGATTTGTTTCTACCGAGAGA	12714

CR759808.2	1501	TCCACTCTGGTGAGTAAAACTTCTTCAAATTTTATGGAATTTATCCAACA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12715	TCCACTCTGGTGAGTAAAACTTCTTCAAATTTTATGGAATTTATCCAACA	12764

CR759808.2	1551	TTTATGTAGCACCTGCTTAGTGCCAGCGACTATGCGAGTCTTCAAAGTTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12765	TTTATGTAGCACCTGCTTAGTGCCAGCGACTATGCGAGTCTTCAAAGTTA	12814

CR759808.2	1601	TAACTCTAAATAAGATACATAATTTCTCACTCCTTAACTAAGAACAGTTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12815	TAACTCTAAATAAGATACATAATTTCTCACTCCTTAACTAAGAACAGTTT	12864

CR759808.2	1651	AAATAAGCTGCGATATCTATGCAAATAAGGTAGTATAAATTATAAAAAAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12865	AAATAAGCTGCGATATCTATGCAAATAAGGTAGTATAAATTATAAAAAAG	12914

CR759808.2	1701	TATATAAAGCATAAAAAAGTTAGTAAAAATTATAAGGAATCTTAAATGAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12915	TATATAAAGCATAAAAAAGTTAGTAAAAATTATAAGGAATCTTAAATGAA	12964

CR759808.2	1751	TGCAATCTGGGCTCCAAAGAGTGACAATTCTTCTTGGGTCGACAGTTAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	12965	TGCAATCTGGGCTCCAAAGAGTGACAATTCTTCTTGGGTCGACAGTTAAA	13014

CR759808.2	1801	CTCAGGTGAATTATAAATGGAAAGAGACAATGTAGCTGTGTTAAAAGATA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	13015	CTCAGGTGAATTATAAATGGAAAGAGACAATGTAGCTGTGTTAAAAGATA	13064

CR759808.2	1851	GTTAAGTATTTGCCAAACAAATGAGGGGAGATTTTTTTTCTTTTTTTTTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	13065	GTTAAGTATTTGCCAAACAAATGAGGGGAGATTTTTTTTCTTTTTTTTTC	13114

CR759808.2	1901	TTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGAGTCTCGCTCTGTCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	13115	TTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGAGTCTCGCTCTGTCA	13164

CR759808.2	1951	CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGTAACTTCCGCCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933842.5	13165	CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGACCTTGGCTCACTGTAACTTCCGCCT	13214

Overview

Query
CR759808.2 - 104964 bps
Hit
CR933842.5 - 13214 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link