<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR933735.5	1	ATCTTGGGAATGAGTGAGAGGGGGCGGTGCGTCTTAAAGGGAAGGACGAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	192231	ATCTTGGGAATGAGTGAGAGGGGGCGGTGCGTCTTAAAGGGAAGGACGAA	192280

CR933735.5	51	ATGCCTTTAAGGCCGGAAACACGTCGGAAGCGAAAAACCGCGCTGCTCCG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	192281	ATGCCTTTAAGGCCGGAAACACGTCGGAAGCGAAAAACCGCGCTGCTCCG	192330

CR933735.5	101	CCCCGCTTAAGGCAGCGAGATGAGGCCGGCGACTTGCGTGGCGACCTTCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	192331	CCCCGCTTAAGGCAGCGAGATGAGGCCGGCGACTTGCGTGGCGACCTTCC	192380

CR933735.5	151	TACCCCGCCCCCAGCAGAGAGAGGCCGGAGGCTAGCTGGTGCAGAGACGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	192381	TACCCCGCCCCCAGCAGAGAGAGGCCGGAGGCTAGCTGGTGCAGAGACGT	192430

CR933735.5	201	TTAATGGCAATTCGTATAAACCAAGCCCATGCACAAGTAGAAAGTGCTCG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	192431	TTAATGGCAATTCGTATAAACCAAGCCCATGCACAAGTAGAAAGTGCTCG	192480

CR933735.5	251	TGGAGCCAGCCGGGGGCTCCCGCCGCGCCAGGGAATCAGACGCCCGGCCG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	192481	TGGAGCCAGCCGGGGGCTCCCGCCGCGCCAGGGAATCAGACGCCCGGCCG	192530

CR933735.5	301	CGCAGCGCCTTAAATAGATTCTTCACTATACTCTGTATGTTACAGTTATG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	192531	CGCAGCGCCTTAAATAGATTCTTCACTATACTCTGTATGTTACAGTTATG	192580

CR933735.5	351	TACACACCCCTCCCCACGGGAGCGGGACTCCGCCTCGCGATCCTATGTAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	192581	TACACACCCCTCCCCACGGGAGCGGGACTCCGCCTCGCGATCCTATGTAC	192630

CR933735.5	401	ACCCCCTCCTCTTTGGCCCCTACGTGGGCGACCAGAGAGTCAGGGTGATG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	192631	ACCCCCTCCTCTTTGGCCCCTACGTGGGCGACCAGAGAGTCAGGGTGATG	192680

CR933735.5	451	GGGAAGACAGGGCCAGGAAAGGAGGAAACAGACGCAAACATGCGGAGTCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	192681	GGGAAGACAGGGCCAGGAAAGGAGGAAACAGACGCAAACATGCGGAGTCA	192730

CR933735.5	501	AGGTGGGGGCAGTCACCCCTGAAACACGAGGGCGCGCGCAGCGAAGGCAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	192731	AGGTGGGGGCAGTCACCCCTGAAACACGAGGGCGCGCGCAGCGAAGGCAG	192780

CR933735.5	551	CGGTGGGGACCGAGGCGGATACATTCATCAGAGACTCTCGAACAAATAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	192781	CGGTGGGGACCGAGGCGGATACATTCATCAGAGACTCTCGAACAAATAAA	192830

CR933735.5	601	TAAGGCAAGTCAGGAAGGTCCGAGTCAGGTGCAGGCAGGAACGGGGATAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	192831	TAAGGCAAGTCAGGAAGGTCCGAGTCAGGTGCAGGCAGGAACGGGGATAT	192880

CR933735.5	651	GGAGAAGGTGCAGGCAGGGCTCCGGAGGTCACAGCTGAAGATGCAGATAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	192881	GGAGAAGGTGCAGGCAGGGCTCCGGAGGTCACAGCTGAAGATGCAGATAT	192930

CR933735.5	701	GTGGGGCGTGGGTCTTCTGGAGCCGGAGACCAAAAGAGGAGGCACAACCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	192931	GTGGGGCGTGGGTCTTCTGGAGCCGGAGACCAAAAGAGGAGGCACAACCA	192980

CR933735.5	751	GAAGGGAGGAAACGTGTAAGGCCTGGGGGCGGGGGTTCTACGAAGGGCTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	192981	GAAGGGAGGAAACGTGTAAGGCCTGGGGGCGGGGGTTCTACGAAGGGCTC	193030

CR933735.5	801	CCAAAAAGGTGAAGGGGTGAAGAGCTGCCGACAGGGGGCTCCCCTAGTCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193031	CCAAAAAGGTGAAGGGGTGAAGAGCTGCCGACAGGGGGCTCCCCTAGTCC	193080

CR933735.5	851	CGAAAGCCCTCTCCTTGTTTAGACAGCCAGAAGGGGCTCCCAGGGTTTTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193081	CGAAAGCCCTCTCCTTGTTTAGACAGCCAGAAGGGGCTCCCAGGGTTTTG	193130

CR933735.5	901	AAGAAAGGCGTTGGAGAGGTCAGGTGGCCAGTCCTGGCTGGGGCAGCCCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193131	AAGAAAGGCGTTGGAGAGGTCAGGTGGCCAGTCCTGGCTGGGGCAGCCCC	193180

CR933735.5	951	TCCAGCTCCTGGTTCTGCTTCAGTTCCCTCATTCTGCGGAGAGACAGAGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193181	TCCAGCTCCTGGTTCTGCTTCAGTTCCCTCATTCTGCGGAGAGACAGAGC	193230

CR933735.5	1001	CAAGTCAGAGGAGACTGATGGATCAGAAAAGGTGTCAGGGCAGAGAGGTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193231	CAAGTCAGAGGAGACTGATGGATCAGAAAAGGTGTCAGGGCAGAGAGGTA	193280

CR933735.5	1051	AGGATGGGGTTAGAACCTGTGTCGGCAGCGCCGCAGGAACCTCATTATTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193281	AGGATGGGGTTAGAACCTGTGTCGGCAGCGCCGCAGGAACCTCATTATTT	193330

CR933735.5	1101	TCCGGGCTGCCTGGTCTTGCTTCTTGGTGAGAAAGGTGCCCCTGGTGGGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193331	TCCGGGCTGCCTGGTCTTGCTTCTTGGTGAGAAAGGTGCCCCTGGTGGGA	193380

CR933735.5	1151	AAGAAGAGTCCCCACTTTAAGACCATTGTAGGGAAAGGCTGGAGGGCCGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193381	AAGAAGAGTCCCCACTTTAAGACCATTGTAGGGAAAGGCTGGAGGGCCGA	193430

CR933735.5	1201	TAGAGGTAGTGGGCATTAACAAAGAGGTAAACTGAGGGCTGTATAGGGGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193431	TAGAGGTAGTGGGCATTAACAAAGAGGTAAACTGAGGGCTGTATAGGGGC	193480

CR933735.5	1251	AGGAAGGGGTGGTCCCTACTTGTTTCGAGCAGGAAGGGGGCCTGAGGGCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193481	AGGAAGGGGTGGTCCCTACTTGTTTCGAGCAGGAAGGGGGCCTGAGGGCC	193530

CR933735.5	1301	GGTGAGGAGGCCCCGGCCTGCGGCGGTAGGAGCGGTAGTGCTGCTGGATA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193531	GGTGAGGAGGCCCCGGCCTGCGGCGGTAGGAGCGGTAGTGCTGCTGGATA	193580

CR933735.5	1351	AGCACCGCTGCTCGGCGGCTCTGCTGAAACCGCTTCTGTTCATAGTAGCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193581	AGCACCGCTGCTCGGCGGCTCTGCTGAAACCGCTTCTGTTCATAGTAGCT	193630

CR933735.5	1401	TCGGAACTTGCTCTGAATCAGGATGGCCGCCTGAGTCATTTTCTTATAGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193631	TCGGAACTTGCTCTGAATCAGGATGGCCGCCTGAGTCATTTTCTTATAGA	193680

CR933735.5	1451	GTGCAAACTGCAGGGAAGGAGAGGGGGGACAGGAGCTGAAATGGAGAGAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193681	GTGCAAACTGCAGGGAAGGAGAGGGGGGACAGGAGCTGAAATGGAGAGAC	193730

CR933735.5	1501	AGAAATCCAAACCTCTGAAGGTCACCCTTCAATTAGGCTGATGTAGAGCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193731	AGAAATCCAAACCTCTGAAGGTCACCCTTCAATTAGGCTGATGTAGAGCC	193780

CR933735.5	1551	CGTTCTCTGACCCACCCACGGCTGAATCAGACTACTCACACCCAGATCTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193781	CGTTCTCTGACCCACCCACGGCTGAATCAGACTACTCACACCCAGATCTC	193830

CR933735.5	1601	ATGCCTAATACCTTAAGTGCAATCCAGGTCAGCTTGTGGAAAGAGAGGGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193831	ATGCCTAATACCTTAAGTGCAATCCAGGTCAGCTTGTGGAAAGAGAGGGG	193880

CR933735.5	1651	ACGTTAGGGCTCTCATAGCACAGAGATAGATAGGTTAGGTGGACGCGTGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193881	ACGTTAGGGCTCTCATAGCACAGAGATAGATAGGTTAGGTGGACGCGTGT	193930

CR933735.5	1701	TGGTATACTTTTGAGAAAATGCTCTAACCTGCTTGTACTTCCGATAACAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193931	TGGTATACTTTTGAGAAAATGCTCTAACCTGCTTGTACTTCCGATAACAA	193980

CR933735.5	1751	CGTTGGATCACCGCTGCGGCTACCTCCTGCTGCTCCTTCAGCCTCCGACC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	193981	CGTTGGATCACCGCTGCGGCTACCTCCTGCTGCTCCTTCAGCCTCCGACC	194030

CR933735.5	1801	CTAAAGGAAGAGAATGAGGCCCCGTCTGAGCCTCTCAAGGCCCACCTAGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	194031	CTAAAGGAAGAGAATGAGGCCCCGTCTGAGCCTCTCAAGGCCCACCTAGT	194080

CR933735.5	1851	AGACTCTGGACCACCTCTTCCTCCCAGAGTCTCCTCCTTAAAACTTTTTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	194081	AGACTCTGGACCACCTCTTCCTCCCAGAGTCTCCTCCTTAAAACTTTTTA	194130

CR933735.5	1901	AAAACCATTTACTTATTTTGTGTGTGTGTATATAGGCTGCCTGTGTGTGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	194131	AAAACCATTTACTTATTTTGTGTGTGTGTATATAGGCTGCCTGTGTGTGG	194180

CR933735.5	1951	ACACGAGAAGACAATTTGAAGCAGTCAGTTTCTTCTTCCACCATGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR933736.12	194181	ACACGAGAAGACAATTTGAAGCAGTCAGTTTCTTCTTCCACCATGAATTC	194230

Overview

Query
CR933735.5 - 188880 bps
Hit
CR933736.12 - 194230 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link