<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX950214.7	195500	GTCATTAAACTATGAAGAAGTACCACGTTGTTGCAAATTTAATGACGTAC	195549
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1	GTCATTAAACTATGAAGAAGTACCACGTTGTTGCAAATTTAATGACGTAC	50

BX950214.7	195550	TACACGGAATGCCTCAAAAAATCTGCTGTTTACATGACAGTCACATTGTC	195599
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	51	TACACGGAATGCCTCAAAAAATCTGCTGTTTACATGACAGTCACATTGTC	100

BX950214.7	195600	ACATATCTGATTTATTTCCACATATGAAGGAGGCCTAAAATCGATTTCTG	195649
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	101	ACATATCTGATTTATTTCCACATATGAAGGAGGCCTAAAATCGATTTCTG	150

BX950214.7	195650	AATATCTGAATGTATGCGTTTTTTTCGTGTTTACATGCTCATTGAACATC	195699
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	151	AATATCTGAATGTATGCGTTTTTTTCGTGTTTACATGCTCATTGAACATC	200

BX950214.7	195700	AGAATTGGGTCACATTTAACTGGCAGTGTAAACGGGGCCTCCGACTTTCT	195749
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	201	AGAATTGGGTCACATTTAACTGGCAGTGTAAACGGGGCCTCCGACTTTCT	250

BX950214.7	195750	TATTAAACATCCAATCGTTTTGTCTAGTTCTACATTCATTTCATTTAGCC	195799
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	251	TATTAAACATCCAATCGTTTTGTCTAGTTCTACATTCATTTCATTTAGCC	300

BX950214.7	195800	TGTCTATTAATATGTGCTCATAAAAATGGCATACACAATTATAATAGTTT	195849
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	301	TGTCTATTAATATGTGCTCATAAAAATGGCATACACAATTATAATAGTTT	350

BX950214.7	195850	GAAAGTGCTGAGAAGAGTAGTTTTGTGTCATACTGCAAGGCATTTTCGGA	195899
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	351	GAAAGTGCTGAGAAGAGTAGTTTTGTGTCATACTGCAAGGCATTTTCGGA	400

BX950214.7	195900	TATGCAGCTGTTTTGGCACATTGTTTACAACAGTTAAGGTTCCTTTTGCA	195949
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	401	TATGCAGCTGTTTTGGCACATTGTTTACAACAGTTAAGGTTCCTTTTGCA	450

BX950214.7	195950	GCTTTTGTCACAAAAAAATAAGCACAGTTTAGCTTATTTTAAGCTGATTA	195999
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	451	GCTTTTGTCACAAAAAAATAAGCACAGTTTAGCTTATTTTAAGCTGATTA	500

BX950214.7	196000	GTGCTGAAAATCTCATTTCCTGTCATGCTGACTGCAGGAAAAGAGAACAT	196049
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	501	GTGCTGAAAATCTCATTTCCTGTCATGCTGACTGCAGGAAAAGAGAACAT	550

BX950214.7	196050	TAAAACTTCTATATTAATGCAACTAAAAAAATCTTCCTTTTCCTGATGTA	196099
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	551	TAAAACTTCTATATTAATGCAACTAAAAAAATCTTCCTTTTCCTGATGTA	600

BX950214.7	196100	AATGCTTTTTAAAAAGCCTGTCTTGACTTCATTTGGGGAAATGTTAATTA	196149
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	601	AATGCTTTTTAAAAAGCCTGTCTTGACTTCATTTGGGGAAATGTTAATTA	650

BX950214.7	196150	GAAAGAGATGTCCATAAAAAGTCAATTTAAAAAGTATTTTCCATTTCCCA	196199
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	651	GAAAGAGATGTCCATAAAAAGTCAATTTAAAAAGTATTTTCCATTTCCCA	700

BX950214.7	196200	TATTCTACCACAGGGCTTGGTGACAGAATATTATCATATTTAAGATCAAT	196249
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	701	TATTCTACCACAGGGCTTGGTGACAGAATATTATCATATTTAAGATCAAT	750

BX950214.7	196250	TTGAAAACAAATGGGTTTTTTTTTAAAGAGATGCCAATTAGATATATTAG	196299
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	751	TTGAAAACAAATGGGTTTTTTTTTAAAGAGATGCCAATTAGATATATTAG	800

BX950214.7	196300	GCTTTTATTTTGATATATATTAGTGATTTTGGTCTATACTGTATGACTAT	196349
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	801	GCTTTTATTTTGATATATATTAGTGATTTTGGTCTATACTGTATGACTAT	850

BX950214.7	196350	TTCAGTTTATAACGAGAATAGGGACAACACTAAACAAATTGCTAAAAACT	196399
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	851	TTCAGTTTATAACGAGAATAGGGACAACACTAAACAAATTGCTAAAAACT	900

BX950214.7	196400	TTCTATGTATCAATTTCTGCTCCTAATTAGAACATAGCAAGCATATAAAG	196449
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	901	TTCTATGTATCAATTTCTGCTCCTAATTAGAACATAGCAAGCATATAAAG	950

BX950214.7	196450	CAAGCTTTGAGCCGTGCTGCTAATATTTATCAAGCAATAAAAATCCCCTT	196499
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	951	CAAGCTTTGAGCCGTGCTGCTAATATTTATCAAGCAATAAAAATCCCCTT	1000

BX950214.7	196500	TCCTTAGGCCAAAGCAACGAGTCTGTGAAGGACTGCTGAGAAGAATTTTA	196549
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1001	TCCTTAGGCCAAAGCAACGAGTCTGTGAAGGACTGCTGAGAAGAATTTTA	1050

BX950214.7	196550	CCGTAGAATGACATGACAGTCATTTATGACATTATTGGTGCAACCCAATT	196599
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1051	CCGTAGAATGACATGACAGTCATTTATGACATTATTGGTGCAACCCAATT	1100

BX950214.7	196600	TATATACCAGTGTACTATTCAAGCCGCTTTCAACATGTCTGAATAGTGTT	196649
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1101	TATATACCAGTGTACTATTCAAGCCGCTTTCAACATGTCTGAATAGTGTT	1150

BX950214.7	196650	TACAGGACAATCTTGCAAGAAACCTACATTTTCACTTGTAAAAAATGTGA	196699
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1151	TACAGGACAATCTTGCAAGAAACCTACATTTTCACTTGTAAAAAATGTGA	1200

BX950214.7	196700	CAGGGCCTGAACTTTAAGCTTGTCTTCCTGAAAAAAATCATACAAAAACA	196749
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1201	CAGGGCCTGAACTTTAAGCTTGTCTTCCTGAAAAAAATCATACAAAAACA	1250

BX950214.7	196750	AGTATAAAATCATACAATTCATTGATAGAATGCATCCTTAATCACTGTCA	196799
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1251	AGTATAAAATCATACAATTCATTGATAGAATGCATCCTTAATCACTGTCA	1300

BX950214.7	196800	GCTTCTCCTCTGTCAAATGATGTCACTTGATGACACAAATGATGTCACTT	196849
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1301	GCTTCTCCTCTGTCAAATGATGTCACTTGATGACACAAATGATGTCACTT	1350

BX950214.7	196850	CCTCAGTCATAACCTTAAAAAATGAATGCAATTGTGACAGGACTGACAGA	196899
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1351	CCTCAGTCATAACCTTAAAAAATGAATGCAATTGTGACAGGACTGACAGA	1400

BX950214.7	196900	AACAGTAGTATTTTTTTGTAGAAATTATTTATGATTTCATGTTTTTAATC	196949
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1401	AACAGTAGTATTTTTTTGTAGAAATTATTTATGATTTCATGTTTTTAATC	1450

BX950214.7	196950	AATTACTGTGAATTATAACAACTTAAACTTAGTTGTTTCAGATTTTTTTT	196999
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1451	AATTACTGTGAATTATAACAACTTAAACTTAGTTGTTTCAGATTTTTTTT	1500

BX950214.7	197000	TTAAATAACAGTTTTTAGTATAAATAAATTATTAAAGCTGTAGCTTCAAT	197049
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1501	TTAAATAACAGTTTTTAGTATAAATAAATTATTAAAGCTGTAGCTTCAAT	1550

BX950214.7	197050	TGGGCTGAGGACAAGGACTTTGTAAACTGTGTTTTTAATAAAGAAAAACA	197099
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1551	TGGGCTGAGGACAAGGACTTTGTAAACTGTGTTTTTAATAAAGAAAAACA	1600

BX950214.7	197100	ATCTGAGAAGCAAACGAATTACATATTACTTTACAGAACAACTCACAGAA	197149
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1601	ATCTGAGAAGCAAACGAATTACATATTACTTTACAGAACAACTCACAGAA	1650

BX950214.7	197150	ATCAACCATCAGTCCATTTCAGCAATTGTTTTGGGATTAAATTTATTTTT	197199
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1651	ATCAACCATCAGTCCATTTCAGCAATTGTTTTGGGATTAAATTTATTTTT	1700

BX950214.7	197200	TAATTATTTATTTTAAAAATGTATTTATTTATTTATTAAACTTATTATGC	197249
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1701	TAATTATTTATTTTAAAAATGTATTTATTTATTTATTAAACTTATTATGC	1750

BX950214.7	197250	ACTGTATTTCTGTTTTTATTTCAAGAACAGATAATGCACATTTCTGGAAG	197299
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1751	ACTGTATTTCTGTTTTTATTTCAAGAACAGATAATGCACATTTCTGGAAG	1800

BX950214.7	197300	AATGTCCCTTACACTAAAAAGATCAAGATAAGATCTATGACTCGAACTTG	197349
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1801	AATGTCCCTTACACTAAAAAGATCAAGATAAGATCTATGACTCGAACTTG	1850

BX950214.7	197350	GGGTATACCCGAAGCGCAATGGTTGTTCATGTTGGCCTACTTTCCATGAG	197399
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1851	GGGTATACCCGAAGCGCAATGGTTGTTCATGTTGGCCTACTTTCCATGAG	1900

BX950214.7	197400	GCTATCAGCACCTACATTTATATGATATATTGAATACATGTACAGCATAA	197449
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1901	GCTATCAGCACCTACATTTATATGATATATTGAATACATGTACAGCATAA	1950

BX950214.7	197450	TAAAATGTGAAATATCAATATGAAAATTGCACACTTCTGCCAATGAATTC	197499
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932997.8	1951	TAAAATGTGAAATATCAATATGAAAATTGCACACTTCTGCCAATGAATTC	2000

Overview

Query
BX950214.7 - 197499 bps
Hit
CR932997.8 - 30310 bps
Total alignments
8
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100189920001955001974991120001
283.712054391899361903741904794881
385.97821716087061040-120900210631
483.7567166157837158002120900210591
592.865682174559174640-120988210711
681.82541387272772864-122118222491
793.96482167604167685-122126222071
892.08741013772937829122248223481
Short-link