<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX511144.13	183994	CTTCCTGATGATCTGGCACCGAATATCTAAAGTAAAAATGGAATTTGCTG	184043
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1	CTTCCTGATGATCTGGCACCGAATATCTAAAGTAAAAATGGAATTTGCTG	50

BX511144.13	184044	CAGTAGGAGAAGCTGCATCAATCTTTTCTTAATTTAATAAATCACTTGCA	184093
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	51	CAGTAGGAGAAGCTGCATCAATCTTTTCTTAATTTAATAAATCACTTGCA	100

BX511144.13	184094	CCTCAGACAAATGCCAACATGCAATGAACGCGTGGTGGTGTTTAAAGGAA	184143
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	101	CCTCAGACAAATGCCAACATGCAATGAACGCGTGGTGGTGTTTAAAGGAA	150

BX511144.13	184144	CAAAGAGGCTCTTGACAGATCTGGTAAACAATATTATAATAACACTGATA	184193
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	151	CAAAGAGGCTCTTGACAGATCTGGTAAACAATATTATAATAACACTGATA	200

BX511144.13	184194	CTGAAAATCGGCTTTACTGTGGCGCAGTGGGTTGCTCGATTGCCTCACAG	184243
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	201	CTGAAAATCGGCTTTACTGTGGCGCAGTGGGTTGCTCGATTGCCTCACAG	250

BX511144.13	184244	TAAGAAGGTTGCTGGTTCGAGCCTCAGCTGGGTTAGTTGGTGTTTCTGTG	184293
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	251	TAAGAAGGTTGCTGGTTCGAGCCTCAGCTGGGTTAGTTGGTGTTTCTGTG	300

BX511144.13	184294	TGGAGGTTGTATCTTCACCCAGTGTTCCCGTGGGTTTCCTCTTGGTGCTC	184343
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	301	TGGAGGTTGTATCTTCACCCAGTGTTCCCGTGGGTTTCCTCTTGGTGCTC	350

BX511144.13	184344	CAGTTTCCCCCACAGTCCAAAGACATGCACTATAGGTGAATTGAGTAAGC	184393
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	351	CAGTTTCCCCCACAGTCCAAAGACATGCACTATAGGTGAATTGAGTAAGC	400

BX511144.13	184394	TAAATTGTCTATAGTGTATGTGTGTGAACGAGTGTGTGTGGATGTTCCAG	184443
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	401	TAAATTGTCTATAGTGTATGTGTGTGAACGAGTGTGTGTGGATGTTCCAG	450

BX511144.13	184444	GTGATGGGTTGCAGCTGAAAGGGCTTCCGCTGCGTAAAACATGCTGTATA	184493
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	451	GTGATGGGTTGCAGCTGAAAGGGCTTCCGCTGCGTAAAACATGCTGTATA	500

BX511144.13	184494	AGTTGGCGGTTCATTCCGCTGTGATGACCCTAGATTAATACAGTAAATGG	184543
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	501	AGTTGGCGGTTCATTCCGCTGTGATGACCCTAGATTAATACAGTAAATGG	550

BX511144.13	184544	ACTAAGCGGGGAATGAATGAATGAATGAATAATACTGAAATGGTTATGGC	184593
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	551	ACTAAGCGGGGAATGAATGAATGAATGAATAATACTGAAATGGTTATGGC	600

BX511144.13	184594	ATTTTAGAATGATCAAAACAACATTTCAGATGTTTTACAATCTGAGCCTG	184643
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	601	ATTTTAGAATGATCAAAACAACATTTCAGATGTTTTACAATCTGAGCCTG	650

BX511144.13	184644	CCGGTTTCATTCCCACACGTTTTTATCACCACATGATCTTTTATAACAAA	184693
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	651	CCGGTTTCATTCCCACACGTTTTTATCACCACATGATCTTTTATAACAAA	700

BX511144.13	184694	ATCACATAACTTTTTATTTATTTGCTTACGGTAAAAGTGTTTTATCGAAT	184743
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	701	ATCACATAACTTTTTATTTATTTGCTTACGGTAAAAGTGTTTTATCGAAT	750

BX511144.13	184744	AAAGCGTTTATCTTACTCGTGTGCATACATTTTTAAGCCCAATTTCAAGA	184793
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	751	AAAGCGTTTATCTTACTCGTGTGCATACATTTTTAAGCCCAATTTCAAGA	800

BX511144.13	184794	CTTATGCTCATCTTGGCGTTTCCATCAACCTTTTTTATGCGCATAACCAA	184843
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	801	CTTATGCTCATCTTGGCGTTTCCATCAACCTTTTTTATGCGCATAACCAA	850

BX511144.13	184844	AATGCGCATAAAAATAGGTGGATGGAAACAGCTAGTGTTTTCTATAGGGG	184893
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	851	AATGCGCATAAAAATAGGTGGATGGAAACAGCTAGTGTTTTCTATAGGGG	900

BX511144.13	184894	GAAAATATTCCATAAGTCATCTGCTGCTGGTTTCCATTTTTCATGATATA	184943
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	901	GAAAATATTCCATAAGTCATCTGCTGCTGGTTTCCATTTTTCATGATATA	950

BX511144.13	184944	TTTTGTGCTTTCAGGAAAAAAAAAAAAACTTAGCAAGCAGTAAATTATGA	184993
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	951	TTTTGTGCTTTCAGGAAAAAAAAAAAAACTTAGCAAGCAGTAAATTATGA	1000

BX511144.13	184994	CAATTGTCATTCTTTTGGGTGAACTATTCTTTTCAGTTAGAGATAGGGTT	185043
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1001	CAATTGTCATTCTTTTGGGTGAACTATTCTTTTCAGTTAGAGATAGGGTT	1050

BX511144.13	185044	AGGGTGTCGGTGTGCGCGTGTATGAGAATGAGAAGGATAAGTATTGCAGT	185093
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1051	AGGGTGTCGGTGTGCGCGTGTATGAGAATGAGAAGGATAAGTATTGCAGT	1100

BX511144.13	185094	GGAAACATTGCAGTCAGGATAATGAGCTAGAAATAGTGCAGGGCAAATGA	185143
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1101	GGAAACATTGCAGTCAGGATAATGAGCTAGAAATAGTGCAGGGCAAATGA	1150

BX511144.13	185144	CATTCTGCATGTATGCAAGTGCTTAAATGCCCTGCAGCTACCATGGTTTA	185193
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1151	CATTCTGCATGTATGCAAGTGCTTAAATGCCCTGCAGCTACCATGGTTTA	1200

BX511144.13	185194	CTTCTAGGTTGCTGTCTAGTCTCTCTTCATTGCACAATAGCTTGTTTTTC	185243
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1201	CTTCTAGGTTGCTGTCTAGTCTCTCTTCATTGCACAATAGCTTGTTTTTC	1250

BX511144.13	185244	CTTCCCTAATGTCGCGTCATCTTTACAGTGCCTCCTTGTATCCTTTCTTC	185293
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1251	CTTCCCTAATGTCGCGTCATCTTTACAGTGCCTCCTTGTATCCTTTCTTC	1300

BX511144.13	185294	TATATGTGCAGTACATATTTTCCCTCGTCCATTTTATAATAATCGGCATT	185343
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1301	TATATGTGCAGTACATATTTTCCCTCGTCCATTTTATAATAATCGGCATT	1350

BX511144.13	185344	CAAGCAGGAGCAGAATATGGTCATCTGTTTAGAGGACGGAACACAGTTGT	185393
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1351	CAAGCAGGAGCAGAATATGGTCATCTGTTTAGAGGACGGAACACAGTTGT	1400

BX511144.13	185394	TTTTATATATTTAACTTCTTAATTGCTTGGTCATAACCTTCTGCTTTTCT	185443
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1401	TTTTATATATTTAACTTCTTAATTGCTTGGTCATAACCTTCTGCTTTTCT	1450

BX511144.13	185444	GACTGAATAAGATTGCTGCTTTTTATAGGAAACTAAAACCTTACTACAGC	185493
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1451	GACTGAATAAGATTGCTGCTTTTTATAGGAAACTAAAACCTTACTACAGC	1500

BX511144.13	185494	TAAATTAAAATTGATGAATTTCACAAAGAAACTGAACTGACCCTGAATTT	185543
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1501	TAAATTAAAATTGATGAATTTCACAAAGAAACTGAACTGACCCTGAATTT	1550

BX511144.13	185544	CTAACTTAAGCGGAATAAATGCATCCTAGATGCATACTTTTTCAGGATTG	185593
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1551	CTAACTTAAGCGGAATAAATGCATCCTAGATGCATACTTTTTCAGGATTG	1600

BX511144.13	185594	CATGTGTTATGTGCAGTTTGCAAAATTAATGCCATTTTATTAAGCAAAAT	185643
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1601	CATGTGTTATGTGCAGTTTGCAAAATTAATGCCATTTTATTAAGCAAAAT	1650

BX511144.13	185644	ATTAAGCATTAAACAGTTGTTATCAATATAAATTCATACATTCATTTTCC	185693
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1651	ATTAAGCATTAAACAGTTGTTATCAATATAAATTCATACATTCATTTTCC	1700

BX511144.13	185694	TTCGGCTTAGTCCCTTTATTCATCAGGGGTTGCCACAGTGGAATGAACCG	185743
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1701	TTCGGCTTAGTCCCTTTATTCATCAGGGGTTGCCACAGTGGAATGAACCG	1750

BX511144.13	185744	CCAACATGTCCAGCCTATGTTTTACACAGCAGATGCCCTTCCAGCTGCAA	185793
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1751	CCAACATGTCCAGCCTATGTTTTACACAGCAGATGCCCTTCCAGCTGCAA	1800

BX511144.13	185794	CCCAGGTCTCGGGATAAATGCCAACTGACCAAACTGGCACTCGAAACGGT	185843
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1801	CCCAGGTCTCGGGATAAATGCCAACTGACCAAACTGGCACTCGAAACGGT	1850

BX511144.13	185844	GAACTTCTTGCTGTAAGGCAGCAGTGCTAACCACTGAGCCATCTTGTCGC	185893
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1851	GAACTTCTTGCTGTAAGGCAGCAGTGCTAACCACTGAGCCATCTTGTCGC	1900

BX511144.13	185894	CCAACATAAATGTCAACATAAATTACTTAATTTTTTTCAGTTGAGTAAAA	185943
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1901	CCAACATAAATGTCAACATAAATTACTTAATTTTTTTCAGTTGAGTAAAA	1950

BX511144.13	185944	TGTAATTTTAAAGATCTTGTGACTTTGAAGATTTGAGTAATGCTGAATTC	185993
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR932365.10	1951	TGTAATTTTAAAGATCTTGTGACTTTGAAGATTTGAGTAATGCTGAATTC	2000

Overview

Query
BX511144.13 - 185993 bps
Hit
CR932365.10 - 119693 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100195920001839941859931120001
279.94105315835728388612195371
384.41141284689666924912425231
494.23861049818998292-1170118041
597.5664821361751362561615762381
688.731172103096231171-138042382541
780.8210937085908959138044384341
883.742105397282273360-138049385771
987.9149927016870259141953420431
1081.471865347282873361147608481251
1184.84932206991970138-147827480371
1292.715396122021122116157076571711
1392.3918628224892770-161026613011
1498.1451056179961903165748658521
1593.8192113170146170258180609807211
1683.62861805935559534-181932821081
1787.151262122861428825-182106823151
1896.4950579854298598182259823151
1983.282876012795428554-182319829101
2085.41713179890899224182596829101
2187.85282170167170248186222863031
2294.9365138618236196011067091068461
Short-link