<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX640592.10	1	GAATTCATTATTGTAATGGATAGAGACCAGCTGAGGCAAACATCTCTGAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	22182	GAATTCATTATTGTAATGGATAGAGACCAGCTGAGGCAAACATCTCTGAT	22231

BX640592.10	51	TTAATTATGCTGAAATGAAGTGACATCTGGCAGTTATGAGGAGGTAACGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	22232	TTAATTATGCTGAAATGAAGTGACATCTGGCAGTTATGAGGAGGTAACGG	22281

BX640592.10	101	TGCCATTCCGAACAGAATCCTCTAATGGCCCGTCATGTTCGATCCAGTGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	22282	TGCCATTCCGAACAGAATCCTCTAATGGCCCGTCATGTTCGATCCAGTGA	22331

BX640592.10	151	CTCAGCACATAAATAACACTCTTCAGAAAATACACGGCAGACATCCGTCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	22332	CTCAGCACATAAATAACACTCTTCAGAAAATACACGGCAGACATCCGTCC	22381

BX640592.10	201	TTGAAGTATTTTAAGTCAAACCCTCTTCTGCCTCTCAAATATCATCGAGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	22382	TTGAAGTATTTTAAGTCAAACCCTCTTCTGCCTCTCAAATATCATCGAGT	22431

BX640592.10	251	TTGGTTTTAGGTGAAAAATCATTTGCCGCAATATTTTAGTCAGAATTTGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	22432	TTGGTTTTAGGTGAAAAATCATTTGCCGCAATATTTTAGTCAGAATTTGA	22481

BX640592.10	301	GCTGTACACGACTGTGTGGACACACAAACAGCTAATCTGTGGATCTGATA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	22482	GCTGTACACGACTGTGTGGACACACAAACAGCTAATCTGTGGATCTGATA	22531

BX640592.10	351	CATCCTGCGCACGATAACAATAGGTGGACAATTTTTTTCTGATGATGTTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	22532	CATCCTGCGCACGATAACAATAGGTGGACAATTTTTTTCTGATGATGTTG	22581

BX640592.10	401	ATGAGATGCAGGCCCCTTCGCTTCACTTTGCAGGGCTCCTAAATTGCCAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	22582	ATGAGATGCAGGCCCCTTCGCTTCACTTTGCAGGGCTCCTAAATTGCCAG	22631

BX640592.10	451	GGCCCTAAGCACCCTGTCCCCCTTTTCCTTCAGTAGCGATGCCCCTGATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	22632	GGCCCTAAGCACCCTGTCCCCCTTTTCCTTCAGTAGCGATGCCCCTGATT	22681

BX640592.10	501	ATAGATATAGTATAAAACTGTATTACTATATACAATATTGTATGTACAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	22682	ATAGATATAGTATAAAACTGTATTACTATATACAATATTGTATGTACAAA	22731

BX640592.10	551	TTAAAGTGTTAACTATGTGTGTGTTTTAAATAAATAGGTGTAAGTGTATA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	22732	TTAAAGTGTTAACTATGTGTGTGTTTTAAATAAATAGGTGTAAGTGTATA	22781

BX640592.10	601	TAAATAGTGTTTGTTTTTCAATACAAGTGTCACACACATGATAATGATAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	22782	TAAATAGTGTTTGTTTTTCAATACAAGTGTCACACACATGATAATGATAA	22831

BX640592.10	651	TACAAATGTCGAGGGACAGTTCACTTAAAAATGAAAATTCTATTATAACC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	22832	TACAAATGTCGAGGGACAGTTCACTTAAAAATGAAAATTCTATTATAACC	22881

BX640592.10	701	TTTTCAGTATCTTTGAGTTTCTTCTATTGAACATAAGAGAAAATATTTTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	22882	TTTTCAGTATCTTTGAGTTTCTTCTATTGAACATAAGAGAAAATATTTTA	22931

BX640592.10	751	AAGAATGTTGGTTGCTGGGACCCATTGACTTTCATCATAGGGAAAAATTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	22932	AAGAATGTTGGTTGCTGGGACCCATTGACTTTCATCATAGGGAAAAATTA	22981

BX640592.10	801	CTATTTTACCAAATTAATTACTCGATTACTTTTCAGTAGGCCAGAATTAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	22982	CTATTTTACCAAATTAATTACTCGATTACTTTTCAGTAGGCCAGAATTAA	23031

BX640592.10	851	CGTAAGAATATTCTTATGGAACTCCCAAAACTTAAGAGAGGAGGAAAAGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23032	CGTAAGAATATTCTTATGGAACTCCCAAAACTTAAGAGAGGAGGAAAAGC	23081

BX640592.10	901	CGGCAGGCAGCACATTGCTTTTTAGTATGGACCTGAGGTATCAAGACATT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23082	CGGCAGGCAGCACATTGCTTTTTAGTATGGACCTGAGGTATCAAGACATT	23131

BX640592.10	951	TGTGTTGCTCGTTACATTACAAACCACAGGGGCAAATTCTGCAGCATAGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23132	TGTGTTGCTCGTTACATTACAAACCACAGGGGCAAATTCTGCAGCATAGC	23181

BX640592.10	1001	GCTCATTCTCATACTTCAAGCTCCACATCAACATTTCTGGAAGCAAAGAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23182	GCTCATTCTCATACTTCAAGCTCCACATCAACATTTCTGGAAGCAAAGAA	23231

BX640592.10	1051	GGTCAAGGTGCTCCAAAATTGGTCAGCCCACTCACCAGACATGGACATTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23232	GGTCAAGGTGCTCCAAAATTGGTCAGCCCACTCACCAGACATGGACATTA	23281

BX640592.10	1101	TTGAGCATGTCTGGTGTAAGATAAAGGGGGAGATATTGAAGATGAATCTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23282	TTGAGCATGTCTGGTGTAAGATAAAGGGGGAGATATTGAAGATGAATCTA	23331

BX640592.10	1151	AAGAATCTTGGTGAACTCTGGGAGTCCTGCAAGAACGCTTTCTTTGCCAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23332	AAGAATCTTGGTGAACTCTGGGAGTCCTGCAAGAACGCTTTCTTTGCCAT	23381

BX640592.10	1201	TCCAGATGACTTTAATAAGTTATTTGGGTCACTGCAGAGATGTATCGATG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23382	TCCAGATGACTTTAATAAGTTATTTGGGTCACTGCAGAGATGTATCGATG	23431

BX640592.10	1251	CAGTCATCCAAGCTGATGGGAGTCATACACAATATTAATTCTGTTTCCAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23432	CAGTCATCCAAGCTGATGGGAGTCATACACAATATTAATTCTGTTTCCAC	23481

BX640592.10	1301	CATGACTTTATATTCTATACTGTACATTATTTCTATTAAGTGACAAGACC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23482	CATGACTTTATATTCTATACTGTACATTATTTCTATTAAGTGACAAGACC	23531

BX640592.10	1351	TTTTGTCTGAGCAAAGACAGACATTACTGTGCCAATCAATAATTAAAAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23532	TTTTGTCTGAGCAAAGACAGACATTACTGTGCCAATCAATAATTAAAAAT	23581

BX640592.10	1401	CAAGGCATGGTCATATTTTATTTTGGTAAGCATAATCTAGAGCCCTTTAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23582	CAAGGCATGGTCATATTTTATTTTGGTAAGCATAATCTAGAGCCCTTTAC	23631

BX640592.10	1451	CTTTCTTATAAGCCACTTCTGATACCAAATGATTAGCTATAATAATAATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23632	CTTTCTTATAAGCCACTTCTGATACCAAATGATTAGCTATAATAATAATT	23681

BX640592.10	1501	AGCTAGTAGTCAATATTATTTGTTGTTTCCCAAATTTGAATAGGTGACAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23682	AGCTAGTAGTCAATATTATTTGTTGTTTCCCAAATTTGAATAGGTGACAA	23731

BX640592.10	1551	GACTTTTGCCAGGTAGAGTATGGTTTGGACCAGAGGTCATCAAACACCTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23732	GACTTTTGCCAGGTAGAGTATGGTTTGGACCAGAGGTCATCAAACACCTG	23781

BX640592.10	1601	CAGAGTTAAGCTCCAACCCTAATCAAACACCTGCATAATCTAATCAAGGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23782	CAGAGTTAAGCTCCAACCCTAATCAAACACCTGCATAATCTAATCAAGGT	23831

BX640592.10	1651	GTTTTTGGTATACTTGAAACTTCCAGGCAGGTGTGTTGAGGCAAGTTGGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23832	GTTTTTGGTATACTTGAAACTTCCAGGCAGGTGTGTTGAGGCAAGTTGGA	23881

BX640592.10	1701	GCTAAACTCTGCAGGGACACTGGCCCTTCAGAACCAAGATAGGTGACCCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23882	GCTAAACTCTGCAGGGACACTGGCCCTTCAGAACCAAGATAGGTGACCCC	23931

BX640592.10	1751	TGGTTTATACAGTTTGCATCACTTTAGACCAGGATTTCTAAAACTTTTTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23932	TGGTTTATACAGTTTGCATCACTTTAGACCAGGATTTCTAAAACTTTTTC	23981

BX640592.10	1801	TCTTCGGGGCCCACCTCCTTCTTTGATATTATTTTGAAGGCCACGTCTGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	23982	TCTTCGGGGCCCACCTCCTTCTTTGATATTATTTTGAAGGCCACGTCTGA	24031

BX640592.10	1851	TATTTTTTAAAGCTGATTGTCTAGAGAAAATGGTTGCTTTAAACCTTTAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	24032	TATTTTTTAAAGCTGATTGTCTAGAGAAAATGGTTGCTTTAAACCTTTAT	24081

BX640592.10	1901	TTATAAGCAAAATATTTATTTTGCTTAAACTATTATTATCCTAATTTTCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	24082	TTATAAGCAAAATATTTATTTTGCTTAAACTATTATTATCCTAATTTTCT	24131

BX640592.10	1951	ACAGCATTTTATAAAAACAAAATAACCTGAAACATTATATATATATATAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925859.4	24132	ACAGCATTTTATAAAAACAAAATAACCTGAAACATTATATATATATATAT	24181

Overview

Query
BX640592.10 - 186123 bps
Hit
CR925859.4 - 24181 bps
Total alignments
7
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001949200012000122182241811
287.58861685672756894-1944096081
387.9797183182447182629-112056122381
484.371884505644056889-112059125121
585.19194426183325183750112065125031
685.24147310114302114611-112247125511
787.591422648120181464112251125081
Short-link