<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX908772.11	1	AAGCTTATGACAGTTCTAGGTACAGTATTTCCAATAGTGATTGCAACCGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	17524	AAGCTTATGACAGTTCTAGGTACAGTATTTCCAATAGTGATTGCAACCGA	17573

BX908772.11	51	TTGCTTAACAGAAAGATCATGAGGGGATTTCCATCTCTGTACTCTGTATC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	17574	TTGCTTAACAGAAAGATCATGAGGGGATTTCCATCTCTGTACTCTGTATC	17623

BX908772.11	101	TTTGTAGCAGTCAAAGCAGCTAATCAACATTTAAAGACCTTTGCATCTAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	17624	TTTGTAGCAGTCAAAGCAGCTAATCAACATTTAAAGACCTTTGCATCTAA	17673

BX908772.11	151	GGGAAATTGGGAGTTCTCTCAACAATAGCTTTTTTTTGTAAATTGAAATA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	17674	GGGAAATTGGGAGTTCTCTCAACAATAGCTTTTTTTTGTAAATTGAAATA	17723

BX908772.11	201	AAATTTCCAGCACAGAATCCCAAATTTTTTCCACCTCTGGACATTCCCAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	17724	AAATTTCCAGCACAGAATCCCAAATTTTTTCCACCTCTGGACATTCCCAC	17773

BX908772.11	251	ATCATATGTAAAGTGCTATTTGGACGCTCTGGTTTGCAGAACTTACAATA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	17774	ATCATATGTAAAGTGCTATTTGGACGCTCTGGTTTGCAGAACTTACAATA	17823

BX908772.11	301	AGGATGTGAAGATAAACCTTTGAAATATATATCCTATATGTGTAGTTAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	17824	AGGATGTGAAGATAAACCTTTGAAATATATATCCTATATGTGTAGTTAAA	17873

BX908772.11	351	TATGCCCTTTAAATAGTTTTAAAGTGAATAAATTGGTGATTAGGGTTTGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	17874	TATGCCCTTTAAATAGTTTTAAAGTGAATAAATTGGTGATTAGGGTTTGT	17923

BX908772.11	401	GGAAGCGTTTCCCAACCAATAGTTTTATTGGGCGGAGACAGATCAAATAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	17924	GGAAGCGTTTCCCAACCAATAGTTTTATTGGGCGGAGACAGATCAAATAG	17973

BX908772.11	451	CCATAATCTTTCTTTTGAGAAAGTATGTATATTAATATTTGAAAACAGCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	17974	CCATAATCTTTCTTTTGAGAAAGTATGTATATTAATATTTGAAAACAGCC	18023

BX908772.11	501	ATAAATATATAAGACAGTTCCTTTTCTTGGAGCATTATATATCCATTTCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18024	ATAAATATATAAGACAGTTCCTTTTCTTGGAGCATTATATATCCATTTCA	18073

BX908772.11	551	CAATCGAATGGATATGAAGATCCTTATTTCAATATATATAAATAGAGTTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18074	CAATCGAATGGATATGAAGATCCTTATTTCAATATATATAAATAGAGTTT	18123

BX908772.11	601	TGGGGATATATTACATTTTTTAACAAACCCCTGAAAATCTAGAATTGATT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18124	TGGGGATATATTACATTTTTTAACAAACCCCTGAAAATCTAGAATTGATT	18173

BX908772.11	651	TTTCTTCATTTATGTCTTTTAATGTTAGAATACGTCCTGTATTGGCCCAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18174	TTTCTTCATTTATGTCTTTTAATGTTAGAATACGTCCTGTATTGGCCCAT	18223

BX908772.11	701	GATAGCTGATTAAAGGGTTGTCCACCAGAAAGTAGGTTCATATTGTGCCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18224	GATAGCTGATTAAAGGGTTGTCCACCAGAAAGTAGGTTCATATTGTGCCA	18273

BX908772.11	751	CAGAGGACTGCGAGTATGCTAATATTTAATTGTTTTTATGCTCATATGCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18274	CAGAGGACTGCGAGTATGCTAATATTTAATTGTTTTTATGCTCATATGCA	18323

BX908772.11	801	TTCATTTTCATCTAGAACATTCACTCATAACATGGTGGCTTTTGGGTTAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18324	TTCATTTTCATCTAGAACATTCACTCATAACATGGTGGCTTTTGGGTTAA	18373

BX908772.11	851	GCAAGAAACTCTGCAACGACTTCCTGAAGAAGCAGGCAGTCATTGGAAAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18374	GCAAGAAACTCTGCAACGACTTCCTGAAGAAGCAGGCAGTCATTGGAAAT	18423

BX908772.11	901	CTGAATGAAGGTAACTCACTGTTTATTTACACGTTGAATGCATCACTGCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18424	CTGAATGAAGGTAACTCACTGTTTATTTACACGTTGAATGCATCACTGCT	18473

BX908772.11	951	GAATACAAAATATTCACTTTTTTAAACACCTGTTATACTGTAATGTATGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18474	GAATACAAAATATTCACTTTTTTAAACACCTGTTATACTGTAATGTATGT	18523

BX908772.11	1001	ATAATTAGAATTCTCACTTTATATCATCCTTTTTTCAGAGCAATACAAGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18524	ATAATTAGAATTCTCACTTTATATCATCCTTTTTTCAGAGCAATACAAGC	18573

BX908772.11	1051	TGCTGTGTGACCACATTGAGCAGATGGCAGCAGAGTGAATATCCAAACTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18574	TGCTGTGTGACCACATTGAGCAGATGGCAGCAGAGTGAATATCCAAACTC	18623

BX908772.11	1101	TACTGTTCTCATCAGTCCAGTATTCCGCAAATGCCAACACAGATTTATCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18624	TACTGTTCTCATCAGTCCAGTATTCCGCAAATGCCAACACAGATTTATCC	18673

BX908772.11	1151	CTATTACAACCCCTGAGTCCTACTAACGTCAAGTTCAGAACTGATGCAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18674	CTATTACAACCCCTGAGTCCTACTAACGTCAAGTTCAGAACTGATGCAAA	18723

BX908772.11	1201	CAAAATGGCTGGCACAGATCAACCACATCCCCTTAATGCATCATTGTCTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18724	CAAAATGGCTGGCACAGATCAACCACATCCCCTTAATGCATCATTGTCTT	18773

BX908772.11	1251	CAGCAAAAATGGTTGGTTTTGTCCAGATTGGATCAATGTCAAACACTATG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18774	CAGCAAAAATGGTTGGTTTTGTCCAGATTGGATCAATGTCAAACACTATG	18823

BX908772.11	1301	CACATATTCGGCAACAGCAATACAACATACAGCCTTCAAGCAACATAAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18824	CACATATTCGGCAACAGCAATACAACATACAGCCTTCAAGCAACATAAAA	18873

BX908772.11	1351	CACTATTCCATTCATAATTTATATGGAGTTTATGTTGTGTGAGGTGAATA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18874	CACTATTCCATTCATAATTTATATGGAGTTTATGTTGTGTGAGGTGAATA	18923

BX908772.11	1401	TGATGCAAATCACACACTCGGACCAATCCATTAAAAAAATTCCCTTAATT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18924	TGATGCAAATCACACACTCGGACCAATCCATTAAAAAAATTCCCTTAATT	18973

BX908772.11	1451	TTGTCCAAAACTCTTCTTGCTACTTTTATGTACAGAATTCTAGTACTAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	18974	TTGTCCAAAACTCTTCTTGCTACTTTTATGTACAGAATTCTAGTACTAAA	19023

BX908772.11	1501	AGTGTCCTTTACGCAAACACGTTGACATATATAATGAACAAAAACAGTCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	19024	AGTGTCCTTTACGCAAACACGTTGACATATATAATGAACAAAAACAGTCT	19073

BX908772.11	1551	AAAAGTATCAGTATTTCAATATATAGCAATTTCAAGAAAATCCTCTGAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	19074	AAAAGTATCAGTATTTCAATATATAGCAATTTCAAGAAAATCCTCTGAAA	19123

BX908772.11	1601	TATATTAAGGTTTCATAATCTATCAGCTCTTCGAACGTCTCTACTGACCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	19124	TATATTAAGGTTTCATAATCTATCAGCTCTTCGAACGTCTCTACTGACCC	19173

BX908772.11	1651	ATTTCCATGTCGTAATTGTATTTCTGGATTTGTGTTTTTCCTGTATGAAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	19174	ATTTCCATGTCGTAATTGTATTTCTGGATTTGTGTTTTTCCTGTATGAAG	19223

BX908772.11	1701	TAATAATAGTGTTTGTGACATCCTCATACATTAAAACCAGAACTATGTCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	19224	TAATAATAGTGTTTGTGACATCCTCATACATTAAAACCAGAACTATGTCT	19273

BX908772.11	1751	ATTCCCCTGTTAAAAGTGCCTTTAGTCCTTTATTAAGAAGTGATCTTCCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	19274	ATTCCCCTGTTAAAAGTGCCTTTAGTCCTTTATTAAGAAGTGATCTTCCC	19323

BX908772.11	1801	ATTTTAATGTGTGAGAAAACCTTTGTCAGCATGCTGTCATCCTCCCATGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	19324	ATTTTAATGTGTGAGAAAACCTTTGTCAGCATGCTGTCATCCTCCCATGA	19373

BX908772.11	1851	CTCTCGGGGTTAGCGGTCAAAAGTTTGTGCCCCCCAGTAGATTTGTTGTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	19374	CTCTCGGGGTTAGCGGTCAAAAGTTTGTGCCCCCCAGTAGATTTGTTGTT	19423

BX908772.11	1901	TGGATGTCGCTTATGGTTCGTGTTCAGAAATTGATCATGCTGCAGCTGTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	19424	TGGATGTCGCTTATGGTTCGTGTTCAGAAATTGATCATGCTGCAGCTGTT	19473

BX908772.11	1951	TTGACGTTGTACAGTGTTGTGTCTTAAACGCATGGTGTGCATGCACATTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925806.6	19474	TTGACGTTGTACAGTGTTGTGTCTTAAACGCATGGTGTGCATGCACATTG	19523

Overview

Query
BX908772.11 - 173801 bps
Hit
CR925806.6 - 19523 bps
Total alignments
13
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001935200012000117524195231
296.5551589017890235-18318881
391.785071114123114193-18319031
490.415073332963336818319031
594.74475717348717354318318871
694.12405111907411912418378871
784.4671197112137112333-1268528771
897.6235421121771122181809581361
986.541813157060270916-112537128481
1081.821293228999590316112562128911
1187.6981137169872170008112754128911
1287.49781362684226977-112766129011
1385.374281129070129150112813128941
Short-link