<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR933878.7	1	GGCCAAAGTGCCTAGCATGGTGACAGGAGGAGCCGGGCCATTCGAATCAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	35305	GGCCAAAGTGCCTAGCATGGTGACAGGAGGAGCCGGGCCATTCGAATCAC	35354

CR933878.7	51	CTCTCCTTCCAAAGCTAAATGGCTACTGAATGCTGCCCTCGGAGCCTTGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	35355	CTCTCCTTCCAAAGCTAAATGGCTACTGAATGCTGCCCTCGGAGCCTTGC	35404

CR933878.7	101	CCCACGCGGAGAGGGCAGCCGGAGAGGGGCGCGGTGCGGGAGGCGGGGGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	35405	CCCACGCGGAGAGGGCAGCCGGAGAGGGGCGCGGTGCGGGAGGCGGGGGT	35454

CR933878.7	151	AGGGGGCGGAACAACTGGGAAAGATACTGACAACTAACCCTGGAGCCCGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	35455	AGGGGGCGGAACAACTGGGAAAGATACTGACAACTAACCCTGGAGCCCGC	35504

CR933878.7	201	GAGACTCCGAATCTAGTCAAATTCCTGGCAGCCAATCGGGAGAAGGGAGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	35505	GAGACTCCGAATCTAGTCAAATTCCTGGCAGCCAATCGGGAGAAGGGAGG	35554

CR933878.7	251	AATCTGGTTAGCCCGCCTATTGAACGTGACATCATTTCCTCCGCAACCAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	35555	AATCTGGTTAGCCCGCCTATTGAACGTGACATCATTTCCTCCGCAACCAT	35604

CR933878.7	301	GAAGCTCCAGGCCTTAGCAACTGAACTAGGCCAGAGCAACCGAACTAGGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	35605	GAAGCTCCAGGCCTTAGCAACTGAACTAGGCCAGAGCAACCGAACTAGGC	35654

CR933878.7	351	AGAATCGAACAGAATTTGGCGCGGTCGGGCTGGCCAGGCTGCTCAAGAGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	35655	AGAATCGAACAGAATTTGGCGCGGTCGGGCTGGCCAGGCTGCTCAAGAGT	35704

CR933878.7	401	CAAAGTGGGCCAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	35705	CAAAGTGGGCCAACATGGTGAGACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAT	35754

CR933878.7	451	TAGTAGGTCATGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAACTACTCGGAAGGCTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	35755	TAGTAGGTCATGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAACTACTCGGAAGGCTG	35804

CR933878.7	501	AAACAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGACAGACGTTGCAGTGAGCCGAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	35805	AAACAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGACAGACGTTGCAGTGAGCCGAG	35854

CR933878.7	551	ATCACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTAGAGACTCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	35855	ATCACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTAGAGACTCC	35904

CR933878.7	601	GTCTCAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTGGGCCGGGCGCG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	35905	GTCTCAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTGGGCCGGGCGCG	35954

CR933878.7	651	GTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTTGAGGTCAGGAGTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	35955	GTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTTGAGGTCAGGAGTT	36004

CR933878.7	701	CAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATGCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36005	CAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATGCA	36054

CR933878.7	751	AAAATAGCTCGGCGTGATGGCGGGCGCCTATATCCCAGCTACCCAGGAGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36055	AAAATAGCTCGGCGTGATGGCGGGCGCCTATATCCCAGCTACCCAGGAGG	36104

CR933878.7	801	CTGAGGCAGGAGAATGGCTTACCTGGGAAGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36105	CTGAGGCAGGAGAATGGCTTACCTGGGAAGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGA	36154

CR933878.7	851	GATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTTGGCAACTGAGACTCTGGGAGGCTGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36155	GATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTTGGCAACTGAGACTCTGGGAGGCTGA	36204

CR933878.7	901	GGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGTGATCGAGACCATCCTGGCAACATGGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36205	GGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGTGATCGAGACCATCCTGGCAACATGGT	36254

CR933878.7	951	GAAATCTCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAGTTAGCTGGGCATGGTGGCG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36255	GAAATCTCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAGTTAGCTGGGCATGGTGGCG	36304

CR933878.7	1001	TGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCGCTTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36305	TGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATCGCTTG	36354

CR933878.7	1051	AACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGTGCCACTGCAATCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36355	AACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGTGCCACTGCAATCC	36404

CR933878.7	1101	AGCCTGGCGACAGAGCAAGATTCCCGCCTCAAAAATAAATAAATAAATAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36405	AGCCTGGCGACAGAGCAAGATTCCCGCCTCAAAAATAAATAAATAAATAA	36454

CR933878.7	1151	ATAAAAAGCCGGGCATCGCGCACGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGGAGGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36455	ATAAAAAGCCGGGCATCGCGCACGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGGAGGC	36504

CR933878.7	1201	CGAGGCGGCGGGGGGGGGCGGGGCGGGGGGGAGGGGGCGGGGCGGCGGGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36505	CGAGGCGGCGGGGGGGGGCGGGGCGGGGGGGAGGGGGCGGGGCGGCGGGG	36554

CR933878.7	1251	GGATCACTTGAGGTCAGGGGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTGAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36555	GGATCACTTGAGGTCAGGGGTTCGAGACCAGCCTGGACAACATGGTGAAA	36604

CR933878.7	1301	CCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGGGCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36605	CCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGGGCA	36654

CR933878.7	1351	CCTATAGTCCCAGCTACCCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36655	CCTATAGTCCCAGCTACCCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACC	36704

CR933878.7	1401	CGGAAGGCGGAGCTTGCGGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCGCTCCAGCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36705	CGGAAGGCGGAGCTTGCGGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCGCTCCAGCC	36754

CR933878.7	1451	TGGGCGACAGCGCAAGACTCCGTCTCAAACAAACAAACAAACAAACAAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36755	TGGGCGACAGCGCAAGACTCCGTCTCAAACAAACAAACAAACAAACAAAA	36804

CR933878.7	1501	AGTCAAAGTGTAGAGAAGTCCTGGAATGGAGACTGGGGGCGGATGACAAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36805	AGTCAAAGTGTAGAGAAGTCCTGGAATGGAGACTGGGGGCGGATGACAAT	36854

CR933878.7	1551	AGAGTGGAGAATGGCAGAGGTCGTGGTAAATGATAGTGGCAGCAGCCTTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36855	AGAGTGGAGAATGGCAGAGGTCGTGGTAAATGATAGTGGCAGCAGCCTTT	36904

CR933878.7	1601	TATCTGGAGACTTCAGGCCCTCCTATGCTAACTATCTTTATGTTCAGAGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36905	TATCTGGAGACTTCAGGCCCTCCTATGCTAACTATCTTTATGTTCAGAGC	36954

CR933878.7	1651	TCATTCAGTACAGGGTGTTCTCCAGGATAAAACCTCGGGACTCTCTCTCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	36955	TCATTCAGTACAGGGTGTTCTCCAGGATAAAACCTCGGGACTCTCTCTCC	37004

CR933878.7	1701	AACCGGCCCTGTCCCTTGGGTGACTACCTGAGGCTTCTCTTTACCTTTCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	37005	AACCGGCCCTGTCCCTTGGGTGACTACCTGAGGCTTCTCTTTACCTTTCC	37054

CR933878.7	1751	TTTCACATCCATCATTGCCTTTCAAGTCCTCCTTCATCAAGAAATCTTAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	37055	TTTCACATCCATCATTGCCTTTCAAGTCCTCCTTCATCAAGAAATCTTAG	37104

CR933878.7	1801	TGCTTTTCAAACATAAGTGTGCATACATATCACCTAGGGAACTTGTTAAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	37105	TGCTTTTCAAACATAAGTGTGCATACATATCACCTAGGGAACTTGTTAAG	37154

CR933878.7	1851	TTGCAGATTATGATTTAGGAAGTCTGTTGTGGGGCCTGTGATTCTGCATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	37155	TTGCAGATTATGATTTAGGAAGTCTGTTGTGGGGCCTGTGATTCTGCATT	37204

CR933878.7	1901	TCAATAAGCTGGTTAATGCAGATGCTGCTGGTTCATAAGCCGTATGTTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	37205	TCAATAAGCTGGTTAATGCAGATGCTGCTGGTTCATAAGCCGTATGTTTT	37254

CR933878.7	1951	TCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGAGAGATGGGGTCTGCTGTGTTTACCAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR925796.6	37255	TCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGAGAGATGGGGTCTGCTGTGTTTACCAG	37304

Overview

Query
CR933878.7 - 102907 bps
Hit
CR925796.6 - 37304 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link