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Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CR388202.9 1 GGCCGACTTGCGGCTGGGGAGCGCAAGCTGGGTAGAGTAGAGGGGAGGAG 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 55998 GGCCGACTTGCGGCTGGGGAGCGCAAGCTGGGTAGAGTAGAGGGGAGGAG 56047 CR388202.9 51 GAAGCCGGGAAAGGGGCGGGGTTTCCTTCATTCCGACTTCCTCCCTGGCC 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56048 GAAGCCGGGAAAGGGGCGGGGTTTCCTTCATTCCGACTTCCTCCCTGGCC 56097 CR388202.9 101 GGCCGGCTCCCATTGCGCAGGCGCGGACCCTAGCCTGGGCTGCCAGACGG 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56098 GGCCGGCTCCCATTGCGCAGGCGCGGACCCTAGCCTGGGCTGCCAGACGG 56147 CR388202.9 151 GTGGCGGGACTCAGCGCCTGAGCTCAAAGGATTTTGTTCTTTTCCAGAAT 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56148 GTGGCGGGACTCAGCGCCTGAGCTCAAAGGATTTTGTTCTTTTCCAGAAT 56197 CR388202.9 201 CCTGCCATCTACAGCGTGATGTGTTTGTGCCCTACACACACTTCCTATCG 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56198 CCTGCCATCTACAGCGTGATGTGTTTGTGCCCTACACACACTTCCTATCG 56247 CR388202.9 251 AGAATTGTGGGGAGTTTGTTAAGATTATGAAGTGTGCACTTTTCTATATT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56248 AGAATTGTGGGGAGTTTGTTAAGATTATGAAGTGTGCACTTTTCTATATT 56297 CR388202.9 301 TGTTAAAGTAAAAACATAAAATTTAAAAAATAAAATTAAAAAATGTTTTG 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56298 TGTTAAAGTAAAAACATAAAATTTAAAAAATAAAATTAAAAAATGTTTTG 56347 CR388202.9 351 AATCTTAAATTCAGCTGATAAAAAGAAAAAAAGGCCGAGGGCCGTGGCTC 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56348 AATCTTAAATTCAGCTGATAAAAAGAAAAAAAGGCCGAGGGCCGTGGCTC 56397 CR388202.9 401 AAGCCTTTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCTAGGTGGGTGGATTGTGTGA 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56398 AAGCCTTTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCTAGGTGGGTGGATTGTGTGA 56447 CR388202.9 451 GGTCAGGAGTTCGAGACCAGTCTAGCCAACATGGTGAAACCCCATCTTCA 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56448 GGTCAGGAGTTCGAGACCAGTCTAGCCAACATGGTGAAACCCCATCTTCA 56497 CR388202.9 501 CTAAAAATACAAAAAAAATTAGGCGTGGTCGCAGGCTCCTGTAATACCAG 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56498 CTAAAAATACAAAAAAAATTAGGCGTGGTCGCAGGCTCCTGTAATACCAG 56547 CR388202.9 551 CTACTCGGGAGGCTGAGGGAAGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56548 CTACTCGGGAGGCTGAGGGAAGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGG 56597 CR388202.9 601 TTGCAGTGAACCGAGATCGCGCCACTGCACTGCAGCCTGGGCGACAGAGC 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56598 TTGCAGTGAACCGAGATCGCGCCACTGCACTGCAGCCTGGGCGACAGAGC 56647 CR388202.9 651 AAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGACCGGGAGCAGTGGC 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56648 AAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGACCGGGAGCAGTGGC 56697 CR388202.9 701 TCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGCGGCCAAGGCAAGTGGATCGCCT 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56698 TCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGCGGCCAAGGCAAGTGGATCGCCT 56747 CR388202.9 751 GAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGCGAAATTCTGTCTC 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56748 GAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGCGAAATTCTGTCTC 56797 CR388202.9 801 TACTAAAAACCCAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCACGCGCCTGTAAATC 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56798 TACTAAAAACCCAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCACGCGCCTGTAAATC 56847 CR388202.9 851 CAGGAGGCATAGGTTGCAGTGAGTGGAGATCTTGCCATTGCACTCCAGCC 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56848 CAGGAGGCATAGGTTGCAGTGAGTGGAGATCTTGCCATTGCACTCCAGCC 56897 CR388202.9 901 TGGGCAACAAGAGCAAAACTCCATCCCAAAAAACAAAAAATGTTGAGGCC 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56898 TGGGCAACAAGAGCAAAACTCCATCCCAAAAAACAAAAAATGTTGAGGCC 56947 CR388202.9 951 TGTAAATCCCAGCATTTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCATTTGAACCC 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56948 TGTAAATCCCAGCATTTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCATTTGAACCC 56997 CR388202.9 1001 AAGAGTTACAGTGAGCTACAATCTCCCCACTGCATTCCAGCCTGGGTGAC 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 56998 AAGAGTTACAGTGAGCTACAATCTCCCCACTGCATTCCAGCCTGGGTGAC 57047 CR388202.9 1051 AGAGCGAGACTCTCTCTAGAAAAAAGAAAATTATAAACAAACAACGTTGA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57048 AGAGCGAGACTCTCTCTAGAAAAAAGAAAATTATAAACAAACAACGTTGA 57097 CR388202.9 1101 GCAGTCCCAGAGATAAGGAGGAGCTGGAGCACAAATTTTGATTTTATCAA 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57098 GCAGTCCCAGAGATAAGGAGGAGCTGGAGCACAAATTTTGATTTTATCAA 57147 CR388202.9 1151 AGGTTACCAATAAATACATTTCTCCAAAGGAGCCAACCTCAATCTCCGCA 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57148 AGGTTACCAATAAATACATTTCTCCAAAGGAGCCAACCTCAATCTCCGCA 57197 CR388202.9 1201 TTTCTTACACACTTTTGCCAAGACTGTCCTGTAAAGGACTGTGTAAAACT 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57198 TTTCTTACACACTTTTGCCAAGACTGTCCTGTAAAGGACTGTGTAAAACT 57247 CR388202.9 1251 AAAGAGACTGTGGCTCACAGATACAAATAACCCAGTCTAACATTTCACTG 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57248 AAAGAGACTGTGGCTCACAGATACAAATAACCCAGTCTAACATTTCACTG 57297 CR388202.9 1301 TTAAATGTTTCAAACACAAACAGACAGAAATGCAGTTACATATTATTCTA 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57298 TTAAATGTTTCAAACACAAACAGACAGAAATGCAGTTACATATTATTCTA 57347 CR388202.9 1351 ACTCATATCCCCCAGGTTTTTATAAATATGTATTAGGACACAGGTAAAAG 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57348 ACTCATATCCCCCAGGTTTTTATAAATATGTATTAGGACACAGGTAAAAG 57397 CR388202.9 1401 AAAAAAATGTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTATCACCAGGCTGGAGTGT 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57398 AAAAAAATGTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTATCACCAGGCTGGAGTGT 57447 CR388202.9 1451 GGTGCCACGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACGTCCCGGGTTCAAGCGA 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57448 GGTGCCACGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACGTCCCGGGTTCAAGCGA 57497 CR388202.9 1501 TTCCTCTGCCTCACCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGCATCACC 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57498 TTCCTCTGCCTCACCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGCATCACC 57547 CR388202.9 1551 GTCCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTT 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57548 GTCCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTT 57597 CR388202.9 1601 GGGCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTCATGATCCGCCCGCCTCGGCCT 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57598 GGGCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTCATGATCCGCCCGCCTCGGCCT 57647 CR388202.9 1651 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCTGGTAAAA 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57648 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCTGGTAAAA 57697 CR388202.9 1701 ATATTTTTTCATGGACTGAGACTTCATAAAACTTGTATTTGTCATCTTGC 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57698 ATATTTTTTCATGGACTGAGACTTCATAAAACTTGTATTTGTCATCTTGC 57747 CR388202.9 1751 ATAGACATACTTATTTGTCAAGAGTTTGTTATAGAAATATTTTCTGGGGC 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57748 ATAGACATACTTATTTGTCAAGAGTTTGTTATAGAAATATTTTCTGGGGC 57797 CR388202.9 1801 TGGGCACGGTGGCTCACGCCTATAATTCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGT 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57798 TGGGCACGGTGGCTCACGCCTATAATTCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGT 57847 CR388202.9 1851 GGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAGAACAGCCTGGTCAACATGGTG 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57848 GGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAGAACAGCCTGGTCAACATGGTG 57897 CR388202.9 1901 AAATCCCGTCTCTACTAAAAACACAAACATTAGCCGGGCATGGTGGTGAG 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57898 AAATCCCGTCTCTACTAAAAACACAAACATTAGCCGGGCATGGTGGTGAG 57947 CR388202.9 1951 CGCCTGTAATCCCAGCTACTCATGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAA 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR925765.2 57948 CGCCTGTAATCCCAGCTACTCATGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAA 57997