<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR926460.7	1	AAGCTTAATGTTTAGAGGTGAAATTAGAACAGCGTTGCCAGATCATTTGT	50
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CR855315.5	3965	AAGCTTAATGTTTAGAGGTGAAATTAGAACAGCGTTGCCAGATCATTTGT	4014

CR926460.7	51	CTCTGGAAATACAGAAAAATAGACAATTCCACTACAGCACGACATTACCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	4015	CTCTGGAAATACAGAAAAATAGACAATTCCACTACAGCACGACATTACCA	4064

CR926460.7	101	AACCTTCTCCACAATTCCCGCTCATCGCAGATTTCCACCACAATCATGAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	4065	AACCTTCTCCACAATTCCCGCTCATCGCAGATTTCCACCACAATCATGAT	4114

CR926460.7	151	CAGCGACCATCAAGCCGATCTGAGAAGCCGGAGAAGTGTGAAATTTTCAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	4115	CAGCGACCATCAAGCCGATCTGAGAAGCCGGAGAAGTGTGAAATTTTCAT	4164

CR926460.7	201	TTTAGCACTGGCCCGGGCAGGTTGTGAGAGGAAGGTGAGTAACTGAGGTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	4165	TTTAGCACTGGCCCGGGCAGGTTGTGAGAGGAAGGTGAGTAACTGAGGTT	4214

CR926460.7	251	GTTGCAGGTCAGTGATGATGTATCTCCCATAAGGTGTTGTCTGCGCCTGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	4215	GTTGCAGGTCAGTGATGATGTATCTCCCATAAGGTGTTGTCTGCGCCTGA	4264

CR926460.7	301	CAGGTGATGTAGCGGGTCATGAATTGCCTGTCTTAACATTTCAGGCCCTG	350
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CR855315.5	4265	CAGGTGATGTAGCGGGTCATGAATTGCCTGTCTTAACATTTCAGGCCCTG	4314

CR926460.7	351	CACGGACCGATGTTTCAGATGCTGTTGCGGAGGCATTATGAGGAAGAGCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	4315	CACGGACCGATGTTTCAGATGCTGTTGCGGAGGCATTATGAGGAAGAGCC	4364

CR926460.7	401	ACCTGCTCGTGGATAAGGTGATCAATGAACAGGGAGCTTTCAGTGGGCGC	450
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CR855315.5	4365	ACCTGCTCGTGGATAAGGTGATCAATGAACAGGGAGCTTTCAGTGGGCGC	4414

CR926460.7	451	CATACCAGACTCTTATTGATGTTTCAGGACTGAGGTCTAAATCGATGGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	4415	CATACCAGACTCTTATTGATGTTTCAGGACTGAGGTCTAAATCGATGGCA	4464

CR926460.7	501	GCTGTTTGAGTCTGACTGAGCTAACTGTGCTTAACGCCAGCTCTGAAGGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	4465	GCTGTTTGAGTCTGACTGAGCTAACTGTGCTTAACGCCAGCTCTGAAGGT	4514

CR926460.7	551	GAAATTAATTGATTGAAGGGATGACATATATTGGAGATGGGTGTCAATCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	4515	GAAATTAATTGATTGAAGGGATGACATATATTGGAGATGGGTGTCAATCT	4564

CR926460.7	601	GTGTTTATTTATGCTCCCATGAGCGGTTTGAAGAGGAGGGCGGGGGCGTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	4565	GTGTTTATTTATGCTCCCATGAGCGGTTTGAAGAGGAGGGCGGGGGCGTC	4614

CR926460.7	651	TAGGACAAGAAGAGCTCGGGACAAGAAGAACTCTTTCTTTTTCCATCTTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	4615	TAGGACAAGAAGAGCTCGGGACAAGAAGAACTCTTTCTTTTTCCATCTTT	4664

CR926460.7	701	TTCCATCTTTTTGAAATGGCTGGAAAGAGGTGCTCGACTAAAAAGAGAAA	750
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CR855315.5	4665	TTCCATCTTTTTGAAATGGCTGGAAAGAGGTGCTCGACTAAAAAGAGAAA	4714

CR926460.7	751	AGTATAATAATAATGTCAATTAGAAAAAGTGAAACACTCACTCTTGAAGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	4715	AGTATAATAATAATGTCAATTAGAAAAAGTGAAACACTCACTCTTGAAGA	4764

CR926460.7	801	AATCCAACTTTATATGTAAGTTTTCAGGCATTATGCAGATGTTCATCAAG	850
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CR855315.5	4765	AATCCAACTTTATATGTAAGTTTTCAGGCATTATGCAGATGTTCATCAAG	4814

CR926460.7	851	CCCACTTTATCTCAATGTCTTTGGTTCCTCAGTGGTAGTTTGATGCAATT	900
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CR855315.5	4815	CCCACTTTATCTCAATGTCTTTGGTTCCTCAGTGGTAGTTTGATGCAATT	4864

CR926460.7	901	AGTGGCATTGAAAGTCGTTGAATGGCATCAAGTTTTAATGCGTTTTTGCC	950
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CR855315.5	4865	AGTGGCATTGAAAGTCGTTGAATGGCATCAAGTTTTAATGCGTTTTTGCC	4914

CR926460.7	951	ACTGAGAATGTGCCCATGATGGCGGAGGCTCCTATTAAAACAAAGACAGG	1000
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CR855315.5	4915	ACTGAGAATGTGCCCATGATGGCGGAGGCTCCTATTAAAACAAAGACAGG	4964

CR926460.7	1001	TGGTGATGATGGTGCGTTCACCCCTGTCAGAGCTGTGTCATGAGCAGAAT	1050
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CR855315.5	4965	TGGTGATGATGGTGCGTTCACCCCTGTCAGAGCTGTGTCATGAGCAGAAT	5014

CR926460.7	1051	GATAGTAATTAGTGTGATGCAAGGAGTGATAAAAATATATGCAGCTAGTG	1100
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CR855315.5	5015	GATAGTAATTAGTGTGATGCAAGGAGTGATAAAAATATATGCAGCTAGTG	5064

CR926460.7	1101	TAATGACGTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTGAAAGTTTTAGAAAGGAGCCAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	5065	TAATGACGTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTGAAAGTTTTAGAAAGGAGCCAA	5114

CR926460.7	1151	CTTTAACAGCTGATGTTTGAAGAACTTCAGACACCATGTCATTTTTTTGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	5115	CTTTAACAGCTGATGTTTGAAGAACTTCAGACACCATGTCATTTTTTTGC	5164

CR926460.7	1201	ACTTAGATACAGTAAAATAGTATTGTGATGTTAATAATAGCTTTACTTGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	5165	ACTTAGATACAGTAAAATAGTATTGTGATGTTAATAATAGCTTTACTTGG	5214

CR926460.7	1251	CATTAATTGTAAAATATCAACAGGCTCATCCAGCAATTAACCAGAAATAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	5215	CATTAATTGTAAAATATCAACAGGCTCATCCAGCAATTAACCAGAAATAT	5264

CR926460.7	1301	TGACTGCATTTTTATTCATTCGTTTATTTTCTTTTCGGCTTAGTCCCTTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	5265	TGACTGCATTTTTATTCATTCGTTTATTTTCTTTTCGGCTTAGTCCCTTT	5314

CR926460.7	1351	ATTAATCTAGGGTCGCCACAGCGGAACCGCCGACTTATCCAGCATATGTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	5315	ATTAATCTAGGGTCGCCACAGCGGAACCGCCGACTTATCCAGCATATGTT	5364

CR926460.7	1401	TTATTACATACTTATCCAGCGGATGCCTTTCCAGATGCAACCCATCACTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	5365	TTATTACATACTTATCCAGCGGATGCCTTTCCAGATGCAACCCATCACTG	5414

CR926460.7	1451	GGAAATGGCTACATTTTAATGCATTTCAGGCAAGTAGTTATAGATATGTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	5415	GGAAATGGCTACATTTTAATGCATTTCAGGCAAGTAGTTATAGATATGTT	5464

CR926460.7	1501	ACTACAAAGAACTTACAATATAATAAATTTTAACATTTTAATAAACAGAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	5465	ACTACAAAGAACTTACAATATAATAAATTTTAACATTTTAATAAACAGAA	5514

CR926460.7	1551	AAAGAGTTTCCATATTTTATAATCTGCGTTCACACTGACTTTTTTTCCTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CR926460.7	1601	TCTATTAAACTATAAATCTTCTATAAGACTATAAATCCAATCTACTTTTA	1650
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CR926460.7	1701	ATTTTCTTTTCGGCTTAGCCCCTTTATTGATCAGGGTTCGCCACCATCTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	5665	ATTTTCTTTTCGGCTTAGCCCCTTTATTGATCAGGGTTCGCCACCATCTT	5714

CR926460.7	1751	ATCCAGCACATGTTTTACACAGCGGATGCCCTTCCAGCCGCAACCCAACA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	5715	ATCCAGCACATGTTTTACACAGCGGATGCCCTTCCAGCCGCAACCCAACA	5764

CR926460.7	1801	CTGGGAAACACCAACACACACTTATACACTACGGCCAATTTAGCTTATAC	1850
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CR855315.5	5765	CTGGGAAACACCAACACACACTTATACACTACGGCCAATTTAGCTTATAC	5814

CR926460.7	1851	AATTCACCTGTAGCCTATGTCTTTGAACTGTGGGGGAAACCGGAGCACCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	5815	AATTCACCTGTAGCCTATGTCTTTGAACTGTGGGGGAAACCGGAGCACCT	5864

CR926460.7	1901	GGAGGAAATCCTGGGAGGAACACGGGGGGGTCATGCAAGCTCCACACATA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR855315.5	5865	GGAGGAAATCCTGGGAGGAACACGGGGGGGTCATGCAAGCTCCACACATA	5914

CR926460.7	1951	AATGCCAACTGACCTAGCCGGGGCTTGAACCAGCAAGCTTCTTGCTGTGA	2000
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CR855315.5	5915	AATGCCAACTGACCTAGCCGGGGCTTGAACCAGCAAGCTTCTTGCTGTGA	5964

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CR926460.7 - 26686 bps
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CR855315.5 - 5964 bps
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