<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL929151.5	172647	AACTCAATGCTTCCCACACATAGACTTTACTTGGACGGGCTACCCAGGTA	172696
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1	AACTCAATGCTTCCCACACATAGACTTTACTTGGACGGGCTACCCAGGTA	50

AL929151.5	172697	TGTTAACGGCAGCCAAAGTAGTTTTAGTAAAACTTTTTTTTATATCATTA	172746
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	51	TGTTAACGGCAGCCAAAGTAGTTTTAGTAAAACTTTTTTTTATATCATTA	100

AL929151.5	172747	TCATCCTTTTACACTTTTTTTTCATCTGCTCACTATAACCAAACATCCAC	172796
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	101	TCATCCTTTTACACTTTTTTTTCATCTGCTCACTATAACCAAACATCCAC	150

AL929151.5	172797	GATCGATTACGTAGTGGAAAATCTTTTCTCGTTTACCCGTTTTAGACCCG	172846
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	151	GATCGATTACGTAGTGGAAAATCTTTTCTCGTTTACCCGTTTTAGACCCG	200

AL929151.5	172847	TTGCCAGCCTGCTGAAAGGGGTGTTTTTTTTTATGCCTGATTTTCTATTT	172896
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	201	TTGCCAGCCTGCTGAAAGGGGTGTTTTTTTTTATGCCTGATTTTCTATTT	250

AL929151.5	172897	AATAATGATTATTATGACTATTTTTAGCTGAATTATAGAGAGGAGTCTGG	172946
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	251	AATAATGATTATTATGACTATTTTTAGCTGAATTATAGAGAGGAGTCTGG	300

AL929151.5	172947	ATGCAGACCTGGTGCAGTGCAATCTGGGCTGCATCCAATGCTTTTTAATG	172996
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	301	ATGCAGACCTGGTGCAGTGCAATCTGGGCTGCATCCAATGCTTTTTAATG	350

AL929151.5	172997	GGTTCACCTAACCACACCCCTAACCCTACCCCTCACAGTGACATCACTCG	173046
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	351	GGTTCACCTAACCACACCCCTAACCCTACCCCTCACAGTGACATCACTCG	400

AL929151.5	173047	CTCCATTTGAGTGCATTGTGTCTGACAATGGCAATGGTAAGAGTTAGCTA	173096
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	401	CTCCATTTGAGTGCATTGTGTCTGACAATGGCAATGGTAAGAGTTAGCTA	450

AL929151.5	173097	GCATGAGCCATTAGCCAAGTGATGCTGAGTGATGCAATCTCAGCTTGCAT	173146
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	451	GCATGAGCCATTAGCCAAGTGATGCTGAGTGATGCAATCTCAGCTTGCAT	500

AL929151.5	173147	CATAAAGGCTGCATCCAGATACTATTGGAATTAGCTTGTCGGATGGTCAT	173196
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	501	CATAAAGGCTGCATCCAGATACTATTGGAATTAGCTTGTCGGATGGTCAT	550

AL929151.5	173197	CATAACTACGGCTTTTGATATACCAAATATATTTCCTAAAGATTTATAAT	173246
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	551	CATAACTACGGCTTTTGATATACCAAATATATTTCCTAAAGATTTATAAT	600

AL929151.5	173247	AAAGACATTTGAAATAATTCTTATTTTTATTTATTTTATTCATGGATAAC	173296
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	601	AAAGACATTTGAAATAATTCTTATTTTTATTTATTTTATTCATGGATAAC	650

AL929151.5	173297	AATAATAGGCAAAATAGTGTTCAAATAAATTTCAATATGAGCCGCTTTTG	173346
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	651	AATAATAGGCAAAATAGTGTTCAAATAAATTTCAATATGAGCCGCTTTTG	700

AL929151.5	173347	GTGCTTCACACCTTTTTATTGCACATTTTTTGTTTCAAGAACAAAGTCCA	173396
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	701	GTGCTTCACACCTTTTTATTGCACATTTTTTGTTTCAAGAACAAAGTCCA	750

AL929151.5	173397	AGATTTAGAATAAAAGTTAAAAATGTTTAAATGTTTTCTCTGTTTAAAAA	173446
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	751	AGATTTAGAATAAAAGTTAAAAATGTTTAAATGTTTTCTCTGTTTAAAAA	800

AL929151.5	173447	CAATAAAGTACTGAAACATGATGCCACTTATGGGAGATTGTAAAATTAAA	173496
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	801	CAATAAAGTACTGAAACATGATGCCACTTATGGGAGATTGTAAAATTAAA	850

AL929151.5	173497	ATATTTGTTAACATTGGCCAAAAACTGATTAGCTGAAGTCACACTGACGC	173546
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	851	ATATTTGTTAACATTGGCCAAAAACTGATTAGCTGAAGTCACACTGACGC	900

AL929151.5	173547	AACAGCCAACAGAGGATTCCACTTGGTCTTAAAGCATTTTTGATGGGTTA	173596
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	901	AACAGCCAACAGAGGATTCCACTTGGTCTTAAAGCATTTTTGATGGGTTA	950

AL929151.5	173597	TTTTTACTGTTTATGATGGCGTAGCAGTCAATATTGCTCAAATGAGCTCA	173646
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	951	TTTTTACTGTTTATGATGGCGTAGCAGTCAATATTGCTCAAATGAGCTCA	1000

AL929151.5	173647	TGTATGGGACAAATTCTGAACCTTTGTTGGTGAAGGGTGGGCCTTTCAAA	173696
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1001	TGTATGGGACAAATTCTGAACCTTTGTTGGTGAAGGGTGGGCCTTTCAAA	1050

AL929151.5	173697	CCACTCGAACCCCCCTGGCTACGGGCCTGTGTTTTGTACTGCACCAGAAC	173746
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1051	CCACTCGAACCCCCCTGGCTACGGGCCTGTGTTTTGTACTGCACCAGAAC	1100

AL929151.5	173747	TGTCAAAACTCCCACAGGGAGTCTCACGTGCTCTGCAGATGCACAGTGAC	173796
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1101	TGTCAAAACTCCCACAGGGAGTCTCACGTGCTCTGCAGATGCACAGTGAC	1150

AL929151.5	173797	GTGTCTTTTTGCAACCCGGCCGGGGTTTCTAAATAAACTAAATAGTCCAG	173846
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1151	GTGTCTTTTTGCAACCCGGCCGGGGTTTCTAAATAAACTAAATAGTCCAG	1200

AL929151.5	173847	GATTTATCTTTTTCTTTCTCTTTCTCGCTTGAAGCTGTCATTAATTGTAT	173896
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1201	GATTTATCTTTTTCTTTCTCTTTCTCGCTTGAAGCTGTCATTAATTGTAT	1250

AL929151.5	173897	ACACACATTCACGAGAGTGAGATAAACATTAAATGATAAATTCTTCAATC	173946
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1251	ACACACATTCACGAGAGTGAGATAAACATTAAATGATAAATTCTTCAATC	1300

AL929151.5	173947	CAAACGACTCAGAAAAAAACTACTGAATACTCGGAGAGGACGAAGGGAGG	173996
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1301	CAAACGACTCAGAAAAAAACTACTGAATACTCGGAGAGGACGAAGGGAGG	1350

AL929151.5	173997	ACAAAATCTAAATTGCCAATTCATTTGACTCTTTAAAATAATCTGCACAT	174046
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1351	ACAAAATCTAAATTGCCAATTCATTTGACTCTTTAAAATAATCTGCACAT	1400

AL929151.5	174047	TTTATTAGTGTAATTATTATAATTATTTGAGAAATTGTCTGTATTCCTTT	174096
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1401	TTTATTAGTGTAATTATTATAATTATTTGAGAAATTGTCTGTATTCCTTT	1450

AL929151.5	174097	TTTCTGTAATTTATTTTTCATTTGTTTCATATTTTATTAGTTTGATGATG	174146
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1451	TTTCTGTAATTTATTTTTCATTTGTTTCATATTTTATTAGTTTGATGATG	1500

AL929151.5	174147	TCAATATATTACATATTTTATGCATCTAAAATGCTTTGGCAACACTATAA	174196
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1501	TCAATATATTACATATTTTATGCATCTAAAATGCTTTGGCAACACTATAA	1550

AL929151.5	174197	AAAATGTCACGCTAATAAAGCAACCTGAACTTGATTGAGAGAAGCAGATT	174246
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1551	AAAATGTCACGCTAATAAAGCAACCTGAACTTGATTGAGAGAAGCAGATT	1600

AL929151.5	174247	TGACCTGTCAGTGAGTGTACATGGCTCCTGAATAACATAAAAATATGAGA	174296
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1601	TGACCTGTCAGTGAGTGTACATGGCTCCTGAATAACATAAAAATATGAGA	1650

AL929151.5	174297	AGTAGTGAATTTCTTTTTAATTCAGCAGTCTTTTTAACTTTAACCCATTG	174346
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1651	AGTAGTGAATTTCTTTTTAATTCAGCAGTCTTTTTAACTTTAACCCATTG	1700

AL929151.5	174347	AAAAGAAACAGTTTATAACAGTTGATTAAAAAAATAAAAATATTGTTAAA	174396
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1701	AAAAGAAACAGTTTATAACAGTTGATTAAAAAAATAAAAATATTGTTAAA	1750

AL929151.5	174397	AATCTAATTATGTTTTCTTTGTCGCATATAGTTATTATTAACTATTTATG	174446
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1751	AATCTAATTATGTTTTCTTTGTCGCATATAGTTATTATTAACTATTTATG	1800

AL929151.5	174447	TGATGTGGGTAGAAGGTATGTTTTAATTCGGCTACCACCACAGATATATT	174496
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1801	TGATGTGGGTAGAAGGTATGTTTTAATTCGGCTACCACCACAGATATATT	1850

AL929151.5	174497	TAAAACCTGTGGGAAGCACTGTGACTATTGGTTAACTTGTTCAGGTAACA	174546
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1851	TAAAACCTGTGGGAAGCACTGTGACTATTGGTTAACTTGTTCAGGTAACA	1900

AL929151.5	174547	TAAAAATATATTATAAATATACTGTAAAAAAATGTGTATAAACAGTTTTC	174596
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1901	TAAAAATATATTATAAATATACTGTAAAAAAATGTGTATAAACAGTTTTC	1950

AL929151.5	174597	ACTTAGATAATAAATCTAAGAAGAAACAGTATCAGTGATAAGTGGAATTC	174646
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR848722.7	1951	ACTTAGATAATAAATCTAAGAAGAAACAGTATCAGTGATAAGTGGAATTC	2000

Overview

Query
AL929151.5 - 174646 bps
Hit
CR848722.7 - 45585 bps
Total alignments
10
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100192320001726471746461120001
290.81121631709071710691267428361
383.641052231263921266141537355981
482.881835159797398487-120987215001
586.532635486569066237120989215301
695.431865050850593-133150332361
784.397200152092152291-135473356631
883.63106220140473140692-135967361921
980.2948144140336140479-136429365651
1096.0535765050850583-140451405261
Short-link