<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 5350 bps / non-identical: 50 bps

Full alignment

  BX664718.7	162297	GAATTCAATGAAACACAAAGCACAGCAGTGTAAGAAACTAAATTAATCAT	162346
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149891	GAATTCAATGAAACACAAAGCACAGCAGTGTAAGAAACTAAATTAATCAT	149842

  BX664718.7	162347	GGGATGTTTGCTTGATTTTATGCTTTGAAGTAACACTGAGCTTTAGATGA	162396
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149841	GGGATGTTTGCTTGATTTTATGCTTTGAAGTAACACTGAGCTTTAGATGA	149792

  BX664718.7	162397	AAGTGAGTGATAATAGGTCCCATCAATATTATTGAAACTCTAACTCATTT	162446
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149791	AAGTGAGTGATAATAGGTCCCATCAATATTATTGAAACTCTAACTCATTT	149742

  BX664718.7	162447	TCTCATTAAATATTTACAATCCTTGGTAACATAACACATCCTCAACTCTT	162496
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149741	TCTCATTAAATATTTACAATCCTTGGTAACATAACACATCCTCAACTCTT	149692

  BX664718.7	162497	AAAGAGTATCTACCTGTCATCCTTTCATCATATAAACTATGATAAATTTC	162546
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149691	AAAGAGTATCTACCTGTCATCCTTTCATCATATAAACTATGATAAATTTC	149642

  BX664718.7	162547	AACCAGAAAAGTGAACCCCTCAAAACTGTGATTTGTAGAGTTCCCAGGCA	162596
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149641	AACCAGAAAAGTGAACCCCTCAAAACTGTGATTTGTAGAGTTCCCAGGCA	149592

  BX664718.7	162597	GCCCAGAGTGCCTTGGATATAGGGGATTTGGGCACCTGTTCTTACAAGTG	162646
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149591	GCCCAGAGTGCCTTGGATATAGGGGATTTGGGCACCTGTTCTTACAAGTG	149542

  BX664718.7	162647	ACCTCTAAAGAAGGTTTCTCCTTCAAGAGCAGCAGATATATAAAAAATAA	162696
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149541	ACCTCTAAAGAAGGTTTCTCCTTCAAGAGCAGCAGATATATAAAAAATAA	149492

  BX664718.7	162697	TTCCTTTCTCTGGACTCATTTCAACTGATAAATGCCAAGGTAGGCAGTTG	162746
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149491	TTCCTTTCTCTGGACTCATTTCAACTGATAAATGCCAAGGTAGGCAGTTG	149442

  BX664718.7	162747	GATGCTAGGATAATCTGGCCATAAATCATGATTCAGGGTTATAAACAAAG	162796
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149441	GATGCTAGGATAATCTGGCCATAAATCATGATTCAGGGTTATAAACAAAG	149392

  BX664718.7	162797	TATATGCTTTATTTTGTTGTGGTGGTGGTTCCTTCATAACTAGGAAAAGG	162846
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149391	TATATGCTTTATTTTGTTGTGGTGGTGGTTCCTTCATAACTAGGAAAAGG	149342

  BX664718.7	162847	GAGACAAGCTTTCTTACTTTTCAACAAAAAGTTTCTCTATCTATACTCAT	162896
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149341	GAGACAAGCTTTCTTACTTTTCAACAAAAAGTTTCTCTATCTATACTCAT	149292

  BX664718.7	162897	TTACATGCTGACCTTCTTATATAAATACACAAAGTGACTCTTAGGAACAT	162946
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149291	TTACATGCTGACCTTCTTATATAAATACACAAAGTGACTCTTAGGAACAT	149242

  BX664718.7	162947	GTAAGTGATTATAGGAAGTTAACATATACCAATGACTTATTTGCCACCAA	162996
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149241	GTAAGTGATTATAGGAAGTTAACATATACCAATGACTTATTTGCCACCAA	149192

  BX664718.7	162997	CTTTATAAGTAGGCTTCTAGTTACTGCAGCATATTAAATAATGGTATCAT	163046
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149191	CTTTATAAGTAGGCTTCTAGTTACTGCAGCATATTAAATAATGGTATCAT	149142

  BX664718.7	163047	TTGTTTTTCTGAAACATGCAAAACACTGGGTCAATTTTTTTTTTTTTAAG	163096
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149141	TTGTTTTTCTGAAACATGCAAAACACTGGGTCAATTTTTTTTTTTTTAAG	149092

  BX664718.7	163097	ATGGTGTCTTGCTCTGTCGCCAGGCTGCAGAGCAGTGATGCAATCTTGGC	163146
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149091	ATGGTGTCTTGCTCTGTCGCCAGGCTGCAGAGCAGTGATGCAATCTTGGC	149042

  BX664718.7	163147	TCACTGCAACCACATTGCTACCACTGTAGCCGAGCTGTGGTCTCTGATGT	163196
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	149041	TCACTGCAACCACATTGCTACCACTGTAGCCGAGCTGTGGTCTCTGATGT	148992

  BX664718.7	163197	CACCACCAACTGCAGCGAGGTAAGCCACGGAGGCGCAGGCTCTGGCTCCA	163246
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148991	CACCACCAACTGCAGCGAGGTAAGCCACGGAGGCGCAGGCTCTGGCTCCA	148942

  BX664718.7	163247	GCCTCCAGCATGCAGTGGTGTCTCTTCCTTCTCCTCGTCTTCCAGCCTGG	163296
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148941	GCCTCCAGCATGCAGTGGTGTCTCTTCCTTCTCCTCGTCTTCCAGCCTGG	148892

  BX664718.7	163297	CAGGAGAAGCTCCCGCTGCTAGCCTCCCTCCTACCGCTCCGTCACCAACA	163346
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148891	CAGGAGAAGCTCCCGCTGCTAGCCTCCCTCCTACCGCTCCGTCACCAACA	148842

  BX664718.7	163347	CCACCAACAGGGAGGCAGCGCCCCAGGCTCCAGGCTCCAGGCTCCAGGCT	163396
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148841	CCACCAACAGGGAGGCAGCGCCCCAGGCTCCAGGCTCCAGGCTCCAGGCT	148792

  BX664718.7	163397	CCAGCCGGTGAAAACTAATGGACCCTTCTAGTTCTCTAACCCAGGTACCT	163446
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148791	CCAGCCGGTGAAAACTAATGGACCCTTCTAGTTCTCTAACCCAGGTACCT	148742

  BX664718.7	163447	AGCAGCTGGACACACCGACACAGAAGACCCAAAAATGACGCACCACTTCC	163496
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148741	AGCAGCTGGACACACCGACACAGAAGACCCAAAAATGACGCACCACTTCC	148692

  BX664718.7	163497	TCAGCATGCTTTATATACTGAAGTTACGGATCCTGGACTACATGTTCTGA	163546
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148691	TCAGCATGCTTTATATACTGAAGTTACGGATCCTGGACTACATGTTCTGA	148642

  BX664718.7	163547	TTGGATGAGAGAAAAACCTCTAGGCCTACTCTGATTGGACTTTATTTTCA	163596
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148641	TTGGATGAGAGAAAAACCTCTAGGCCTACTCTGATTGGACTTTATTTTCA	148592

  BX664718.7	163597	TGCTGTGATTGGTTATCTTAAGACTTGCTCTCATGCAATCAGAACATGAA	163646
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148591	TGCTGTGATTGGTTATCTTAAGACTTGCTCTCATGCAATCAGAACATGAA	148542

  BX664718.7	163647	GTCTAGGAACCGGCATGCGCATAACCTCCGTATATAAATGATGCTGAAGA	163696
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148541	GTCTAGGAACCGGCATGCGCATAACCTCCGTATATAAATGATGCTGAAGA	148492

  BX664718.7	163697	GCCGTTACGGTTTTTTTTTTTTTTTTAGGGTTCGGTGTTTTACTGTTGAG	163746
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148491	GCCGTTACGGTTTTTTTTTTTTTTTTAGGGTTCGGTGTTTTACTGTTGAG	148442

  BX664718.7	163747	CTGCTCAGTGCCCAGCTTAGAGGACCAGGAAAAGGAGTCACCGGCCGTAT	163796
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148441	CTGCTCAGTGCCCAGCTTAGAGGACCAGGAAAAGGAGTCACCGGCCGTAT	148392

  BX664718.7	163797	GCTGGAGGCTTGAGACACGGCACAGAGGCGCAGCTCGCCTCGCTATGGTT	163846
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148391	GCTGGAGGCTTGAGACACGGCACAGAGGCGCAGCTCGCCTCGCTATGGTT	148342

  BX664718.7	163847	GGTGGTGGCAGTGGAGATTGCGATTGCAGCGCGGCTGGAGGGGTAGGAAG	163896
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148341	GGTGGTGGCAGTGGAGATTGCGATTGCAGCGCGGCTGGAGGGGTAGGAAG	148292

  BX664718.7	163897	AGGAAAATAGTTTTGGGATAGATAGAGGGGTGGGTAAAGAGTTTGGTTAT	163946
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148291	AGGAAAATAGTTTTGGGATAGATAGAGGGGTGGGTAAAGAGTTTGGTTAT	148242

  BX664718.7	163947	TGCCAAAGGGAAAAAAGGATAGCGAGGAGGAGAAGGCATTGCAAAAAGAT	163996
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148241	TGCCAAAGGGAAAAAAGGATAGCGAGGAGGAGAAGGCATTGCAAAAAGAT	148192

  BX664718.7	163997	GATGGGGAAAAGATGGTGGGGAAAAAAGGTTTTGGGTAGATGGAGGTGGA	164046
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148191	GATGGGGAAAAGATGGTGGGGAAAAAAGGTTTTGGGTAGATGGAGGTGGA	148142

  BX664718.7	164047	AAGACAGGTTGTGGAGCGGGAGTGAGGGAAGGTTTTGCAGAAAGACGGTG	164096
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148141	AAGACAGGTTGTGGAGCGGGAGTGAGGGAAGGTTTTGCAGAAAGACGGTG	148092

  BX664718.7	164097	GATAGGAAGTTTATGGGTGGATGAAGGGGGAAAAGATGGTGGCAATTGGG	164146
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148091	GATAGGAAGTTTATGGGTGGATGAAGGGGGAAAAGATGGTGGCAATTGGG	148042

  BX664718.7	164147	GAGAGGAGAGAGTGGTGAGGTGGGGGAAATGGGCGAGCAGTAGGGAGAGA	164196
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	148041	GAGAGGAGAGAGTGGTGAGGTGGGGGAAATGGGCGAGCAGTAGGGAGAGA	147992

  BX664718.7	164197	GGGTTTTGTGAAAAGACAGTGGGGAGAGAAGTTTTTGGGTAGATAGAGGA	164246
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147991	GGGTTTTGTGAAAAGACAGTGGGGAGAGAAGTTTTTGGGTAGATAGAGGA	147942

  BX664718.7	164247	GCAGAAGAAGATAGCAAGTGGGAGAAGGAAAAAGAGGGTAACTAGCGGGA	164296
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147941	GCAGAAGAAGATAGCAAGTGGGAGAAGGAAAAAGAGGGTAACTAGCGGGA	147892

  BX664718.7	164297	GGAAGACAAGGTTTTGCGAAAAAACAGTGGCAGAAAAGAAAGATGGTGGA	164346
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147891	GGAAGACAAGGTTTTGCGAAAAAACAGTGGCAGAAAAGAAAGATGGTGGA	147842

  BX664718.7	164347	GAAAAGATGGTAGGTAAAAAGTGTTTGGGTAGATGGAGGAGGGAAAGAGG	164396
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147841	GAAAAGATGGTAGGTAAAAAGTGTTTGGGTAGATGGAGGAGGGAAAGAGG	147792

  BX664718.7	164397	GTGACAAGGAGGAGAAAGAGGGTGGCGAGAAGGGAGCAGGGAAAGAAGGT	164446
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147791	GTGACAAGGAGGAGAAAGAGGGTGGCGAGAAGGGAGCAGGGAAAGAAGGT	147742

  BX664718.7	164447	TGGGAAAAAGACGGGAAAATAGTTTGGGATAGATGCAGGGCAAAAAAAAG	164496
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147741	TGGGAAAAAGACGGGAAAATAGTTTGGGATAGATGCAGGGCAAAAAAAAG	147692

  BX664718.7	164497	GGTGGCAAGCAGGATAGGGGAGAGAAGAGGACGAGTGGGAAGAGGGGGCA	164546
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147691	GGTGGCAAGCAGGATAGGGGAGAGAAGAGGACGAGTGGGAAGAGGGGGCA	147642

  BX664718.7	164547	GACTTTGTGAAAAGATGGGGAAATTTTGGGGGGTAGATGGGGGGAAGAGG	164596
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147641	GACTTTGTGAAAAGATGGGGAAATTTTGGGGGGTAGATGGGGGGAAGAGG	147592

  BX664718.7	164597	GAGGTGAGCAGGAGTGGGGAGAAGGCTTCGAGAAAAGATGGTGGGGAAAT	164646
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147591	GAGGTGAGCAGGAGTGGGGAGAAGGCTTCGAGAAAAGATGGTGGGGAAAT	147542

  BX664718.7	164647	GTTTTTGGGTAGATGGAGAAGGGAAAGAGTGGCAAGGAGGAGTAGGAGGA	164696
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147541	GTTTTTGGGTAGATGGAGAAGGGAAAGAGTGGCAAGGAGGAGTAGGAGGA	147492

  BX664718.7	164697	AAGACAATGAGGAAAACAGTTTTTGGGTAGATAAAGGGGGAAAAGAGGGT	164746
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147491	AAGACAATGAGGAAAACAGTTTTTGGGTAGATAAAGGGGGAAAAGAGGGT	147442

  BX664718.7	164747	GGTGAGCAGCAGGAGTGGGGAAAAGGCTTTGGGAAAAGACGGGGGGAAAA	164796
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147441	GGTGAGCAGCAGGAGTGGGGAAAAGGCTTTGGGAAAAGACGGGGGGAAAA	147392

  BX664718.7	164797	TGTTTTTGCTTAGATGAAGGAGGAAAAGGGCATGATGACAGCAGGAGGGG	164846
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147391	TGTTTTTGCTTAGATGAAGGAGGAAAAGGGCATGATGACAGCAGGAGGGG	147342

  BX664718.7	164847	GAAAAAAGAGGGTGGCCAGGGAGAAGGGGGAAAATACGGTGGGAAAAAAC	164896
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147341	GAAAAAAGAGGGTGGCCAGGGAGAAGGGGGAAAATACGGTGGGAAAAAAC	147292

  BX664718.7	164897	GGGAGAAAGTGTTTGGGTAGATGGTTGGGGAAAAGCGTGGTGAGCGGGAG	164946
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147291	GGGAGAAAGTGTTTGGGTAGATGGTTGGGGAAAAGCGTGGTGAGCGGGAG	147242

  BX664718.7	164947	AATAGAGAAGGCTTTGCGAAATGACGCGGGGTGGGGCGGGGAGAAAACGA	164996
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147241	AATAGAGAAGGCTTTGCGAAATGACGCGGGGTGGGGCGGGGAGAAAACGA	147192

  BX664718.7	164997	AATGATGGTGGGGAGATAACGGTGAAAAAGTTTGGGGTAGATGGAGGAAG	165046
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147191	AATGATGGTGGGGAGATAACGGTGAAAAAGTTTGGGGTAGATGGAGGAAG	147142

  BX664718.7	165047	AGAAAGGGTGGTGAGAGGGAGAGGGCGAAATGCGGTCGGGAAAAGAAGGT	165096
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147141	AGAAAGGGTGGTGAGAGGGAGAGGGCGAAATGCGGTCGGGAAAAGAAGGT	147092

  BX664718.7	165097	GGGGAAATGGTGGGGGATAGAAGTTTTGGGTGGATTTTTAAAAATAAGAT	165146
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147091	GGGGAAATGGTGGGGGATAGAAGTTTTGGGTGGATTTTTAAAAATAAGAT	147042

  BX664718.7	165147	TATTTGTATTTTCACTTTTGAGTAGTTTGAGTTCTTTAGATATTTTGTGT	165196
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	147041	TATTTGTATTTTCACTTTTGAGTAGTTTGAGTTCTTTAGATATTTTGTGT	146992

  BX664718.7	165197	ATTAACCTCTTGCCTGATGCATAGTTTGCAAAGACTTTCTTCCATTCTCG	165246
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146991	ATTAACCTCTTGCCTGATGCATAGTTTGCAAAGACTTTCTTCCATTCTCG	146942

  BX664718.7	165247	GGTTCTGTCTTCATTATACTGATTGCTTCCTCTGCTTTGGAAAAGGTTTT	165296
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146941	GGTTCTGTCTTCATTATACTGATTGCTTCCTCTGCTTTGGAAAAGGTTTT	146892

  BX664718.7	165297	AAGTTTAATGTAATTACATCTTTGCTTTTGTTGCTTGTGCTTTTGATGTC	165346
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146891	AAGTTTAATGTAATTACATCTTTGCTTTTGTTGCTTGTGCTTTTGATGTC	146842

  BX664718.7	165347	TATTTGAAAATTCCTTGTCCTAACCAATTTCATGAAGCATTTATCCTATG	165396
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146841	TATTTGAAAATTCCTTGTCCTAACCAATTTCATGAAGCATTTATCCTATG	146792

  BX664718.7	165397	TTTTCTTCTCTGGTAGTTTCATAGTTTCAGGTCCTGTATTTAAATCTTTA	165446
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146791	TTTTCTTCTCTGGTAGTTTCATAGTTTCAGGTCCTGTATTTAAATCTTTA	146742

  BX664718.7	165447	TTTTGAGTAGATTTTTGTATATGGTAAGGTAATGGCCTGGATGTATTCTT	165496
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146741	TTTTGAGTAGATTTTTGTATATGGTAAGGTAATGGCCTGGATGTATTCTT	146692

  BX664718.7	165497	GTACATGTGGGTGTTGGGTTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAGAGATTGTC	165546
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146691	GTACATGTGGGTGTTGGGTTTTCCTAGTACAGTTTATTGAAGAGATTGTC	146642

  BX664718.7	165547	TTTCCCGAAGGTGTGTTCTTGGGGCCTTTGTTAAAAATGAATTGACCGTA	165596
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146641	TTTCCCGAAGGTGTGTTCTTGGGGCCTTTGTTAAAAATGAATTGACCGTA	146592

  BX664718.7	165597	AACGCGTGAATTTATTTATGATTTCTCTATTCTGTTTCACTTGTCTATGT	165646
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146591	AACGCGTGAATTTATTTATGATTTCTCTATTCTGTTTCACTTGTCTATGT	146542

  BX664718.7	165647	CTGTCTGTCTCATTCGTTCATCTCTCTTGTCTCTCCCCCGCCCCTTTTAT	165696
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146541	CTGTCTGTCTCATTCGTTCATCTCTCTTGTCTCTCCCCCGCCCCTTTTAT	146492

  BX664718.7	165697	TGATAGTACCATGCTGTTTTGATAGTACCATCCTTACTATAAATTTGTAG	165746
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146491	TGATAGTACCATGCTGTTTTGATAGTACCATCCTTACTATAAATTTGTAG	146442

  BX664718.7	165747	TATATTTTGAAATCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTTCTTTTTATTCC	165796
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146441	TATATTTTGAAATCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTTCTTTTTATTCC	146392

  BX664718.7	165797	AGATTCTTTTGTCTATCTGAGGTATTTTGAACTTCCATGTGAATTTTAAG	165846
			| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146391	ACATTCTTTTGTCTATCTGAGGTATTTTGAACTTCCATGTGAATTTTAAG	146342

  BX664718.7	165847	ATTCTTTTTCCATTTCAGTGAAGAATGTCTTGTAATTGAACATGGATTGC	165896
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146341	ATTCTTTTTCCATTTCAGTGAAGAATGTCTTGTAATTGAACATGGATTGC	146292

  BX664718.7	165897	ATTGATTCTGTAGATCACATTGGGTGATACACATATTTTAACATTCTTCT	165946
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146291	ATTGATTCTGTAGATCACATTGGGTGATACACATATTTTAACATTCTTCT	146242

  BX664718.7	165947	AGTGCATAGAGATGGGATATCTTTCCATTTACTTGTGTCTGCTTTAGTAT	165996
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146241	AGTGCATAGAGATGGGATATCTTTCCATTTACTTGTGTCTGCTTTAGTAT	146192

  BX664718.7	165997	CTTTCATCTATGTTTTATGAAGTTTTCATTTTGGGATCTCTTGCCTTTTT	166046
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146191	CTTTCATCTATGTTTTATGAAGTTTTCATTTTGGGATCTCTTGCCTTTTT	146142

  BX664718.7	166047	GGTTAAGTTTATTCCTAGATATCATTTTTTTTTTTGGTAATGAAATAGCT	166096
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146141	GGTTAAGTTTATTCCTAGATATCATTTTTTTTTTTGGTAATGAAATAGCT	146092

  BX664718.7	166097	TTCTTGATTTCTTTCTTAGATATTTCACTATTGGTCCATGGGTGTAGTAT	166146
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146091	TTCTTGATTTCTTTCTTAGATATTTCACTATTGGTCCATGGGTGTAGTAT	146042

  BX664718.7	166147	TCATTTTTATATTTTGATACTGTATCTTGGAACTTGACTAATTTATTATT	166196
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146041	TCATTTTTATATTTTGATACTGTATCTTGGAACTTGACTAATTTATTATT	145992

  BX664718.7	166197	TCTAGTAGGTTTTTTGTGGAATCTTTAGGGTTCTCTCTATATATGTTCAT	166246
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145991	TCTAGTAGGTTTTTTGTGGAATCTTTAGGGTTCTCTCTATATATGTTCAT	145942

  BX664718.7	166247	GTCACCTGGAAACAGACAATTTGACTCCTTTTTTCCAATTTGGATGCCTT	166296
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145941	GTCACCTGGAAACAGACAATTTGACTCCTTTTTTCCAATTTGGATGCCTT	145892

  BX664718.7	166297	TTATTGCATTCTCCTAATTGCTCTAGCTAGGACTTCCAGTATTATGATGA	166346
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145891	TTATTGCATTCTCCTAATTGCTCTAGCTAGGACTTCCAGTATTATGATGA	145842

  BX664718.7	166347	ACAAAAGTGGTGTAAAAGTAGCCACACTTGTTCCAGATCTTAGAGGAGAA	166396
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145841	ACAAAAGTGGTGTAAAAGTAGCCACACTTGTTCCAGATCTTAGAGGAGAA	145792

  BX664718.7	166397	GAGCTTTTAACTTTTCCTTATTGATTATGTTAGCTGTGGGTTTGTCATAT	166446
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145791	GAGCTTTTAACTTTTCCTTATTGATTATGTTAGCTGTGGGTTTGTCATAT	145742

  BX664718.7	166447	ATGGCCTTTATTGCACTGAGATATGTTCCTTCTGTACTCATGTTGTTGAG	166496
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145741	ATGGCCTTTATTGCACTGAGATATGTTCCTTCTGTACTCATGTTGTTGAG	145692

  BX664718.7	166497	TTTTTATCATGAAGGAATGTTGACTTTTAATTTTTTCAGCGTCTACTGAA	166546
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145691	TTTTTATCATGAAGGAATGTTGACTTTTAATTTTTTCAGCGTCTACTGAA	145642

  BX664718.7	166547	ATGATTATATGGTTTTTGTTCTTGATTTGCTGAATGTGATGTTGCATATT	166596
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145641	ATGATTATATGGTTTTTGTTCTTGATTTGCTGAATGTGATGTTGCATATT	145592

  BX664718.7	166597	TATTTATTTGTGTTTATTGAATCATCCTCATATTCCTGGGATGAATGAAA	166646
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145591	TATTTATTTGTGTTTATTGAATCATCCTCATATTCCTGGGATGAATGAAA	145542

  BX664718.7	166647	TCCACTTGATCATGGCAGATGATCTTTTTATTGCGTTGTCAAATGCAATT	166696
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145541	TCCACTTGATCATGGCAGATGATCTTTTTATTGCGTTGTCAAATGCAATT	145492

  BX664718.7	166697	TTCAAGTATTTTGCTGAGGATTTCTTACACCTCTGTTCATCAGGGATATT	166746
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145491	TTCAAGTATTTTGCTGAGGATTTCTTACACCTCTGTTCATCAGGGATATT	145442

  BX664718.7	166747	TGCCTGTGGTTTCCTTTTTGTGTTGTGTTCTGGTCTGGTTTTTGTACCAG	166796
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145441	TGCCTGTGGTTTCCTTTTTGTGTTGTGTTCTGGTCTGGTTTTTGTACCAG	145392

  BX664718.7	166797	GGTCATGCTGTCCTCATAGAACAAGTTTCGAAGCCTTTCTTCGTCTTCAT	166846
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145391	GGTCATGCTGTCCTCATAGAACAAGTTTCGAAGCCTTTCTTCGTCTTCAT	145342

  BX664718.7	166847	TTTATGGGGAATATTTTGAGTAAAATACATATTAGCTCTTTTAAAAATGT	166896
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145341	TTTATGGGGAATATTTTGAGTAAAATACATATTAGCTCTTTTAAAAATGT	145292

  BX664718.7	166897	TTGGTAATTCAGCAGGAAAACCATGATTCTTGTGTTTTTCTTTGCCAGGA	166946
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145291	TTGGTAATTCAGCAGGAAAACCATGATTCTTGTGTTTTTCTTTGCCAGGA	145242

  BX664718.7	166947	GACTTTTTATGACTGCTTTAATTGCATTACTCATTATTGGTCTGTTCAGG	166996
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145241	GACTTTTTATGACTGCTTTAATTGCATTACTCATTATTGGTCTGTTCAGG	145192

  BX664718.7	166997	TTTTTTATTTTTATTTTTTATCATTCTATCTTGGGAATTCGTTATGTGTC	167046
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145191	TTTTTTATTTTTATTTTTTATCATTCTATCTTGGGAATTCGTTATGTGTC	145142

  BX664718.7	167047	TAGAAATGTATTCACTTCCAGATTTTTCAATTTGTTTGTGATGTTTTTAG	167096
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145141	TAGAAATGTATTCACTTCCAGATTTTTCAATTTGTTTGTGATGTTTTTAG	145092

  BX664718.7	167097	TAATCTCTTAATGCTTCGTATTTCTGGGTTACCAGTTGTAATGCCTTCTT	167146
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145091	TAATCTCTTAATGCTTCGTATTTCTGGGTTACCAGTTGTAATGCCTTCTT	145042

  BX664718.7	167147	TATGACTTTGTTTTCTTTTTCTTATCTAACTTCATCTAGTTAAAACTCGT	167196
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	145041	TATGACTTTGTTTTCTTTTTCTTATCTAACTTCATCTAGTTAAAACTCGT	144992

  BX664718.7	167197	CAATTTTGATTTTTTTTTAAAAACACCCCAGCTTTTGTTTCATTGACTTT	167246
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	144991	CAATTTTGATTTTTTTTTAAAAACACCCCAGCTTTTGTTTCATTGACTTT	144942

  BX664718.7	167247	TTGTATTTTTTGTTTCTATTTTTAAAATTTCTTCTCTAATCTTTATGGTA	167296
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	144941	TTGTATTTTTTGTTTCTATTTTTAAAATTTCTTCTCTAATCTTTATGGTA	144892

  BX664718.7	167297	TTTTTTCTGCGAATTCTAGCATTTGATTGTTCCTGTTTTTCTCATTACTG	167346
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	144891	TTTTTTCTGCGAATTCTAGCATTTGATTGTTCCTGTTTTTCTCATTACTG	144842

  BX664718.7	167347	GAGGTGTACCGTCAGGCTATTTGAGATCTTCCTACTTTTCTGATGCAGGC	167396
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	144841	GAGGTGTACCGTCAGGCTATTTGAGATCTTCCTACTTTTCTGATGCAGGC	144792

  BX664718.7	167397	ATTTATAGCTATACACTTTTCCTCTTAGAATTGCCTTTGGTGCATCCCAC	167446
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	144791	ATTTATAGCTATACACTTTTCCTCTTAGAATTGCCTTTGGTGCATCCCAC	144742

  BX664718.7	167447	AGGATTTGTTATGTTGTGTTTCTATTCTTACTTGTTTCAATAAATATTTA	167496
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	144741	AGGATTTGTTATGTTGTGTTTCTATTCTTACTTGTTTCAATAAATATTTA	144692

  BX664718.7	167497	ATTTCCCTTGTGTTTTCTTCATTTCTTTTATTGGTTGCTCATGGGTGTGT	167546
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	144691	ATTTCCCTTGTGTTTTCTTCATTTCTTTTATTGGTTGCTCATGGGTGTGT	144642

  BX664718.7	167547	ATTTTAATTTCCATGTATTTGTACAGTTTTTAAAGTTCTATCTGTTATTG	167596
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	144641	ATTTTAATTTCCATGTATTTGTACAGTTTTTAAAGTTCTATCTGTTATTG	144592

  BX664718.7	167597	ATTTCTAATACTATTCGACTGTGGTCACAAAAGATACTTGATATGAATTC	167646
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	144591	ATTTCTAATACTATTCGACTGTGGTCACAAAAGATACTTGATATGAATTC	144542

Compact alignment

skip 3500 bps 100% identity alignment

  BX664718.7	165797	AGATTCTTTTGTCTATCTGAGGTATTTTGAACTTCCATGTGAATTTTAAG	165846
			| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
C  CR848007.6	146391	ACATTCTTTTGTCTATCTGAGGTATTTTGAACTTCCATGTGAATTTTAAG	146342

skip 1800 bps 100% identity alignment

Overview

Query
BX664718.7 - 167646 bps
Hit
CR848007.6 - 149891 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 5350 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.9813053501622971676461144542149891-1
Short-link