<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR753819.5	1	GGCCAGGCTCCTCCTTAGGAAACTGAATTCTAGCTCCGTGGGGCCATCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	18925	GGCCAGGCTCCTCCTTAGGAAACTGAATTCTAGCTCCGTGGGGCCATCCT	18974

CR753819.5	51	CCCAGATTCTCCCATTGAATAATACTGACCTCTTCCCTCAGTTCCCCAAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	18975	CCCAGATTCTCCCATTGAATAATACTGACCTCTTCCCTCAGTTCCCCAAG	19024

CR753819.5	101	ACTGAGGGAGAGGCAGTTGCCCCATTCCTGATTCCCACGCGTTCTACCTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19025	ACTGAGGGAGAGGCAGTTGCCCCATTCCTGATTCCCACGCGTTCTACCTC	19074

CR753819.5	151	TGCGGTATCTCAGTGCTCTTTTTGTCTTTTTAGATCTCAATATGTGGTTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19075	TGCGGTATCTCAGTGCTCTTTTTGTCTTTTTAGATCTCAATATGTGGTTA	19124

CR753819.5	201	ACAATCCTTTATATAAAATTACCTCTGTCTGGGCGCGGAGGCTCACGCTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19125	ACAATCCTTTATATAAAATTACCTCTGTCTGGGCGCGGAGGCTCACGCTT	19174

CR753819.5	251	GCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19175	GCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAG	19224

CR753819.5	301	GAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19225	GAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAA	19274

CR753819.5	351	ATACAAAACTTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCACTACTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19275	ATACAAAACTTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCACTACTT	19324

CR753819.5	401	GGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCATTTGAACCCGGGAGACCGAGGTTGCAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19325	GGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCATTTGAACCCGGGAGACCGAGGTTGCAG	19374

CR753819.5	451	TGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAAATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19375	TGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAAATT	19424

CR753819.5	501	CCTTTTCAAATAGAATAAAATAAAACAAAATTACCTCTGTTTAAATATTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19425	CCTTTTCAAATAGAATAAAATAAAACAAAATTACCTCTGTTTAAATATTT	19474

CR753819.5	551	GGATTTTTTTCTTTCACCTGACTAGACCCTAATACAAGGGTCTTCTGGAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19475	GGATTTTTTTCTTTCACCTGACTAGACCCTAATACAAGGGTCTTCTGGAG	19524

CR753819.5	601	AAACAGTTCAGCCCATTTGCACTATGGTGAAGCCCACTGAAACCTCCCCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19525	AAACAGTTCAGCCCATTTGCACTATGGTGAAGCCCACTGAAACCTCCCCC	19574

CR753819.5	651	CATCCCCAACACACACACCTGGAGTTTCCAAACAGCTTAAGATCTAACTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19575	CATCCCCAACACACACACCTGGAGTTTCCAAACAGCTTAAGATCTAACTA	19624

CR753819.5	701	AGCCAAGGATTACTGTATCATTCACAAAGCCCAAGCCCCAATTTGAGCAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19625	AGCCAAGGATTACTGTATCATTCACAAAGCCCAAGCCCCAATTTGAGCAG	19674

CR753819.5	751	AGAAAGTTTATTATTAGAAAGAATTATTGGCTGTAACAGGCTAAAAAGAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19675	AGAAAGTTTATTATTAGAAAGAATTATTGGCTGTAACAGGCTAAAAAGAC	19724

CR753819.5	801	GTGCAGAGAACTCCAAAGAATGCTGTAGGGCCGCGGGAGAGTACCCAAAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19725	GTGCAGAGAACTCCAAAGAATGCTGTAGGGCCGCGGGAGAGTACCCAAAG	19774

CR753819.5	851	AAGGACACACGTGGAAGCATCCCCACCCCAAAGCTGGATTCAGAACTCAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19775	AAGGACACACGTGGAAGCATCCCCACCCCAAAGCTGGATTCAGAACTCAA	19824

CR753819.5	901	GGCAGAAAGTGTGCATGTGCCCACCAGGTACCAGATTATTTCCCTGGGAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19825	GGCAGAAAGTGTGCATGTGCCCACCAGGTACCAGATTATTTCCCTGGGAT	19874

CR753819.5	951	GCCCAGGCCAAAGCCTGTGAACAGTCATGAGCAAGCAGGAAACTGGGGGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19875	GCCCAGGCCAAAGCCTGTGAACAGTCATGAGCAAGCAGGAAACTGGGGGG	19924

CR753819.5	1001	GTCGCGGCATCGGGAGCCCACTCACTGCATGCAAGGCCTGGGGCATGCAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19925	GTCGCGGCATCGGGAGCCCACTCACTGCATGCAAGGCCTGGGGCATGCAG	19974

CR753819.5	1051	GGTCCACGTCAGGGCCAGCTCGCTGGGGGAACGCATGCTGTCAGCACGCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	19975	GGTCCACGTCAGGGCCAGCTCGCTGGGGGAACGCATGCTGTCAGCACGCA	20024

CR753819.5	1101	GCTAGGACAGAGACCACCAGATGTTCCCACCTGGCCACTGATGGGCCCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20025	GCTAGGACAGAGACCACCAGATGTTCCCACCTGGCCACTGATGGGCCCTG	20074

CR753819.5	1151	CCGCAGGAGCAACAAGAATCACAAACCATAGCTCCCGGAACCAGAGATAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20075	CCGCAGGAGCAACAAGAATCACAAACCATAGCTCCCGGAACCAGAGATAA	20124

CR753819.5	1201	AAGAAATTCTTTCCTCTGGCAGTGTCCCTCCGGCGCCCTCTACTGAGAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20125	AAGAAATTCTTTCCTCTGGCAGTGTCCCTCCGGCGCCCTCTACTGAGAAA	20174

CR753819.5	1251	GCTTAATATTGTGCTGGCTGCGAAGGAGAACCGCTTAATTCAATACAGAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20175	GCTTAATATTGTGCTGGCTGCGAAGGAGAACCGCTTAATTCAATACAGAT	20224

CR753819.5	1301	CAGTTAAGAGGATGGATTTACGGTTGAGAGGCAATACATTGATAAGAAAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20225	CAGTTAAGAGGATGGATTTACGGTTGAGAGGCAATACATTGATAAGAAAC	20274

CR753819.5	1351	TAGTCATTATGGGATGAAAACCACTGACATGAAAGACAGGTATTGAAAAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20275	TAGTCATTATGGGATGAAAACCACTGACATGAAAGACAGGTATTGAAAAC	20324

CR753819.5	1401	ACAAGAATTAAGGAATATAAAGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20325	ACAAGAATTAAGGAATATAAAGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATC	20374

CR753819.5	1451	TCAGTGCCTTCGCAAGCCAAGCTGGGCGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20375	TCAGTGCCTTCGCAAGCCAAGCTGGGCGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTC	20424

CR753819.5	1501	AAGAACAGCCTGAGCAAAATGGCGAGATTCTGTGTCTACAAAAAGTACAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20425	AAGAACAGCCTGAGCAAAATGGCGAGATTCTGTGTCTACAAAAAGTACAA	20474

CR753819.5	1551	AAATTAGCCGGGCGCGGTGGCGTGCACCTGTAGTCTCAGCTGCTCAGGAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20475	AAATTAGCCGGGCGCGGTGGCGTGCACCTGTAGTCTCAGCTGCTCAGGAG	20524

CR753819.5	1601	GCTGAGATGGGAGGATCACTTGAGTCCGGGAGGTCGAGGCTTCATTGAGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20525	GCTGAGATGGGAGGATCACTTGAGTCCGGGAGGTCGAGGCTTCATTGAGC	20574

CR753819.5	1651	TGTGATTAAGCCATTGCCCTGGACCACAACAGAGAGACCCTGTCAAAAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20575	TGTGATTAAGCCATTGCCCTGGACCACAACAGAGAGACCCTGTCAAAAAA	20624

CR753819.5	1701	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAATTTAGAGAATGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20625	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAATTTAGAGAATGC	20674

CR753819.5	1751	AAAGAGCCAAATAATAAAATCCACTGCAATTAATATTTTCATAAACATAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20675	AAAGAGCCAAATAATAAAATCCACTGCAATTAATATTTTCATAAACATAA	20724

CR753819.5	1801	GAGACGATATTTTCTCCATGGTAAAAGAACACATTATTAAATAAAAAATT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20725	GAGACGATATTTTCTCCATGGTAAAAGAACACATTATTAAATAAAAAATT	20774

CR753819.5	1851	TAAAGTTGAAGAAATCTTCTAAAAAGAAGCAAAGGGTAAAGAAATGTAGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20775	TAAAGTTGAAGAAATCTTCTAAAAAGAAGCAAAGGGTAAAGAAATGTAGA	20824

CR753819.5	1901	TGGGACCGGGCACAGTAGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGTTGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20825	TGGGACCGGGCACAGTAGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGTTGC	20874

CR753819.5	1951	GGAAGTGGGTGGATCACTTGAGATTAGGAGTTCGAGACCAGCCTTACCAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847993.4	20875	GGAAGTGGGTGGATCACTTGAGATTAGGAGTTCGAGACCAGCCTTACCAA	20924

Overview

Query
CR753819.5 - 81418 bps
Hit
CR847993.4 - 20924 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link