<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR450728.8	1	AAGCTTTAGTGCCTGTGGGAATTCCCAGCACACTCTTCTTCGGGTGTGTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	145400	AAGCTTTAGTGCCTGTGGGAATTCCCAGCACACTCTTCTTCGGGTGTGTG	145449

CR450728.8	51	TTTTTACCTCTTTGTCAAAGTTAAGCGTGTGTAGCAGTTGTATTCCCAGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	145450	TTTTTACCTCTTTGTCAAAGTTAAGCGTGTGTAGCAGTTGTATTCCCAGC	145499

CR450728.8	101	AGGAGGCTGTTCTGGTGGGCTTTTTTAGATACGTGCAGATGTTTCTCCAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	145500	AGGAGGCTGTTCTGGTGGGCTTTTTTAGATACGTGCAGATGTTTCTCCAA	145549

CR450728.8	151	GTCAGCACGTGTGAGGGTACTCAGGAGACGTCCGTCCACAAGGTGAGTGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	145550	GTCAGCACGTGTGAGGGTACTCAGGAGACGTCCGTCCACAAGGTGAGTGT	145599

CR450728.8	201	GAAAGAACTGGGAATATTGAGGGAGACCCACATCAGTCAGCCATGCCTGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	145600	GAAAGAACTGGGAATATTGAGGGAGACCCACATCAGTCAGCCATGCCTGA	145649

CR450728.8	251	GCCACCCAGTGATGATCCAGTTCAGCTGCTTTAGAAAGACTGAGACACAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	145650	GCCACCCAGTGATGATCCAGTTCAGCTGCTTTAGAAAGACTGAGACACAA	145699

CR450728.8	301	AATACATTTATTCATTCATTCTTCTTCCGCTTAGTCCCTTTATTAATCAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	145700	AATACATTTATTCATTCATTCTTCTTCCGCTTAGTCCCTTTATTAATCAG	145749

CR450728.8	351	ATGGTCACAACGGAATGAACCGCCAACTTATCCAGCATATGTTTTATGCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	145750	ATGGTCACAACGGAATGAACCGCCAACTTATCCAGCATATGTTTTATGCA	145799

CR450728.8	401	GCGGATGCCCTTCCAGCTGCAATCCAGTACTAGGTAACTATAATATGTCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	145800	GCGGATGCCCTTCCAGCTGCAATCCAGTACTAGGTAACTATAATATGTCC	145849

CR450728.8	451	ACTGAGAGTATGAATAAAATCTGTTTTGTATGTGTAAAAAAATTAATACA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	145850	ACTGAGAGTATGAATAAAATCTGTTTTGTATGTGTAAAAAAATTAATACA	145899

CR450728.8	501	ATTTATAAATACCATTGTTCAATAATCAAGCTTTAATTTTGTGTTACTGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	145900	ATTTATAAATACCATTGTTCAATAATCAAGCTTTAATTTTGTGTTACTGT	145949

CR450728.8	551	GTGTTTAAATTACCTTAAATATGGTTAACAAATATATAAAATACAATCTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	145950	GTGTTTAAATTACCTTAAATATGGTTAACAAATATATAAAATACAATCTT	145999

CR450728.8	601	AGGACATTTTAATGGTTTAAGTAAATACTAAAAGTTCAAAACCAAACAGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146000	AGGACATTTTAATGGTTTAAGTAAATACTAAAAGTTCAAAACCAAACAGT	146049

CR450728.8	651	TATTTCATGACTGTTCAGTGGTGTTCAATGCTGTTTTCATTTCAAAATTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146050	TATTTCATGACTGTTCAGTGGTGTTCAATGCTGTTTTCATTTCAAAATTG	146099

CR450728.8	701	AACATTTTGTCATCATTTACTCACCCTCAAACCAATCCATTATATACAGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146100	AACATTTTGTCATCATTTACTCACCCTCAAACCAATCCATTATATACAGT	146149

CR450728.8	751	AAAGTGACTGTATCTATTCACAGGACCTAGATTAAACAGCTTGTTTCATT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146150	AAAGTGACTGTATCTATTCACAGGACCTAGATTAAACAGCTTGTTTCATT	146199

CR450728.8	801	CATGTTCTTTTTTTTTTATAAAGAATTCCTCTGTGATATTTTGGAAGCTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146200	CATGTTCTTTTTTTTTTATAAAGAATTCCTCTGTGATATTTTGGAAGCTT	146249

CR450728.8	851	CTATCATTTGGTTGCCTGAACCTTAAAGGGGTGGTCTAGAGTGTATTGTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146250	CTATCATTTGGTTGCCTGAACCTTAAAGGGGTGGTCTAGAGTGTATTGTT	146299

CR450728.8	901	AAGGCTTGGTTGTGTTTATAAGATGCAAAGCAATGTGTGCTCATGCTTCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146300	AAGGCTTGGTTGTGTTTATAAGATGCAAAGCAATGTGTGCTCATGCTTCA	146349

CR450728.8	951	TTTGTGAAAAAATATCCTACTTTAATTATTTACTGCTACTCAGCTAACAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146350	TTTGTGAAAAAATATCCTACTTTAATTATTTACTGCTACTCAGCTAACAT	146399

CR450728.8	1001	GAAAACGACTGTCATTTTTCCTAGTTCTTCCGAAGGTCCGACCTCAAGAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146400	GAAAACGACTGTCATTTTTCCTAGTTCTTCCGAAGGTCCGACCTCAAGAG	146449

CR450728.8	1051	GCTCTGATTGGTCATCTAACATATTGTGCTGTGATTCGCAGATCGGCTCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146450	GCTCTGATTGGTCATCTAACATATTGTGCTGTGATTCGCAGATCGGCTCC	146499

CR450728.8	1101	ATGTCACCAGGAAAAGCGTGAACAATGTCTCCACAAGCACACGCTTTCTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146500	ATGTCACCAGGAAAAGCGTGAACAATGTCTCCACAAGCACACGCTTTCTT	146549

CR450728.8	1151	TGCTGTTAACCATATCAGTTTAAGCCTGAACCGGACAGAAAATGAGGAGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146550	TGCTGTTAACCATATCAGTTTAAGCCTGAACCGGACAGAAAATGAGGAGC	146599

CR450728.8	1201	TGAATACAGCTGAACCTCACAGCTGATTTCTAAAATAAAATCTGACAAGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146600	TGAATACAGCTGAACCTCACAGCTGATTTCTAAAATAAAATCTGACAAGT	146649

CR450728.8	1251	TTCTTCCACTTTGATGAAATGTCACATACCTTTTGCTAGTTTGTTATTTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146650	TTCTTCCACTTTGATGAAATGTCACATACCTTTTGCTAGTTTGTTATTTG	146699

CR450728.8	1301	AGATGTAGAATGCAGGGAAGGTGGCTGCTGATGATTGTGGCTGTTCACAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146700	AGATGTAGAATGCAGGGAAGGTGGCTGCTGATGATTGTGGCTGTTCACAG	146749

CR450728.8	1351	TGGTTTGACGCATAAATATGAATTTGTGGCTAAATTGTTAACAGTGCCAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146750	TGGTTTGACGCATAAATATGAATTTGTGGCTAAATTGTTAACAGTGCCAA	146799

CR450728.8	1401	ACAGCATTTTCCGTTGTCTTTGTCGTGGAACTGCTCCTTCTTTGAGGATT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146800	ACAGCATTTTCCGTTGTCTTTGTCGTGGAACTGCTCCTTCTTTGAGGATT	146849

CR450728.8	1451	TTTTTAGCCGAATGCAGCACTGAACTGAGAGATTTTGGAAGCTGTCCTTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146850	TTTTTAGCCGAATGCAGCACTGAACTGAGAGATTTTGGAAGCTGTCCTTT	146899

CR450728.8	1501	GTCATTTGCTAGCTTTATATTTTTTTTATTCTCTGGAACGTAATTGAAAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146900	GTCATTTGCTAGCTTTATATTTTTTTTATTCTCTGGAACGTAATTGAAAT	146949

CR450728.8	1551	TAAATTGTAAGCACTTCTCTCTTTGTGTTGTGTCCTTTGAAAGCCCAAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	146950	TAAATTGTAAGCACTTCTCTCTTTGTGTTGTGTCCTTTGAAAGCCCAAAT	146999

CR450728.8	1601	ACAGAAACAGAAGAAGCTTGGTGGAAATAGCAGCATTTGGACGGCATTTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	147000	ACAGAAACAGAAGAAGCTTGGTGGAAATAGCAGCATTTGGACGGCATTTT	147049

CR450728.8	1651	AGCTTTCTCTGCAATAACATTACAGCGCATCTGGGGCCACACCCTAAGGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	147050	AGCTTTCTCTGCAATAACATTACAGCGCATCTGGGGCCACACCCTAAGGG	147099

CR450728.8	1701	TGTATGCGCATGGTGAATGCACATGACCTGAAGCGTTTGTGATTTCACTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	147100	TGTATGCGCATGGTGAATGCACATGACCTGAAGCGTTTGTGATTTCACTA	147149

CR450728.8	1751	ACCCGGATGTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTGTAGTCCCCAAACTTTGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	147150	ACCCGGATGTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTGTAGTCCCCAAACTTTGT	147199

CR450728.8	1801	TTGCTGTTGGCATTGCTAAGGTAACCCTGTAAAAGCCAATGTCTCCCTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	147200	TTGCTGTTGGCATTGCTAAGGTAACCCTGTAAAAGCCAATGTCTCCCTTT	147249

CR450728.8	1851	CATATATTATCCCTTATGTGGTTTAAAACCTTTATGAGTTTCTTTCTTCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	147250	CATATATTATCCCTTATGTGGTTTAAAACCTTTATGAGTTTCTTTCTTCA	147299

CR450728.8	1901	GTTGAAATCAAAAGAAGATATCTTGAAGAATTCTGATTGCTGAGACCCAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	147300	GTTGAAATCAAAAGAAGATATCTTGAAGAATTCTGATTGCTGAGACCCAT	147349

CR450728.8	1951	CGACTTCCATAATAAGAAAAAAAACTGAAAACATTTAGACGGGTCGCAGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847868.9	147350	CGACTTCCATAATAAGAAAAAAAACTGAAAACATTTAGACGGGTCGCAGC	147399

Overview

Query
CR450728.8 - 193025 bps
Hit
CR847868.9 - 147399 bps
Total alignments
24
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100195420001200011454001473991
290.84146235189347189581-1815383921
386.67160314124157124470121294216081
484.16142359189125189483121304216631
586.85119211117666117876-125892261041
681.041042667912279387157744580121
788.4621734880428389-160323606601
891.1898136118205118340162238623731
981.781253014802948329180370806601
1082.751172728141981690-180430807131
1181.8199247190502190748181965822171
1283.341473044801448317186439867441
1386.15101188117681117868-186456866501
1490.58251362170850171211-11004851008451
1590183271727657303511004861007551
1686.191162162535625571-11005461007551
1786.61184320480104832911124801128001
1884.77101203117675117877-11124921127011
1981.8299245135461135705-11125571128091
2087.07240489189150189638-11195131199991
2186.29221447124225124671-11287551291991
2284.34147372179046179417-11295211299031
2384.3914234612419912454411295581299031
2492.53129173119725119897-11447591449321
Short-link