<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759778.8	1	GGCCAAGCTGGTCTCAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCCACCTTGGCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20045	GGCCAAGCTGGTCTCAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCCACCTTGGCCT	20094

CR759778.8	51	CCCAATGTGCTGAGATTACAGGCCTGAGCCGCCGCACCCGACCAATTTTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20095	CCCAATGTGCTGAGATTACAGGCCTGAGCCGCCGCACCCGACCAATTTTT	20144

CR759778.8	101	TTTTTTTTAATATTAAATACTGAAATGCTTAAGGGTAGAATTAGATAGCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20145	TTTTTTTTAATATTAAATACTGAAATGCTTAAGGGTAGAATTAGATAGCA	20194

CR759778.8	151	GTGAATGGAAGGGATGTTTTGGAAGAGAAGATAATAAATAGGCCTAAGCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20195	GTGAATGGAAGGGATGTTTTGGAAGAGAAGATAATAAATAGGCCTAAGCC	20244

CR759778.8	201	TGAAGGGAAATCATGAGGCTGCCTCCAGTAGGGGAGGGAGTTGGACATGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20245	TGAAGGGAAATCATGAGGCTGCCTCCAGTAGGGGAGGGAGTTGGACATGG	20294

CR759778.8	251	TCCTCTACCTTCAGGGAAACAAGGATGGAGAGGGGGAGAGCTAGAATCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20295	TCCTCTACCTTCAGGGAAACAAGGATGGAGAGGGGGAGAGCTAGAATCTG	20344

CR759778.8	301	TTGAATCTGTTTTGGCTTTACTGGGAACACAGGCTAAACAGTCTCTCAGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20345	TTGAATCTGTTTTGGCTTTACTGGGAACACAGGCTAAACAGTCTCTCAGG	20394

CR759778.8	351	TTACTCTCTAGAATGAAAGCACACAGACAGGTAAATATGACACAATGTGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20395	TTACTCTCTAGAATGAAAGCACACAGACAGGTAAATATGACACAATGTGA	20444

CR759778.8	401	TTTGTGCTATAATATTCAAGCAGAACAAGTAAGGCATAGACTGAGGTGTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20445	TTTGTGCTATAATATTCAAGCAGAACAAGTAAGGCATAGACTGAGGTGTT	20494

CR759778.8	451	CATTTGCTTACCAGATAACTCTATTTACATGGCCTATAGGTTTTACAAAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20495	CATTTGCTTACCAGATAACTCTATTTACATGGCCTATAGGTTTTACAAAC	20544

CR759778.8	501	AACGTGTCCCCCTGGCCAGGCACAGTGGCTCAGGCCTATAATTCCAACAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20545	AACGTGTCCCCCTGGCCAGGCACAGTGGCTCAGGCCTATAATTCCAACAG	20594

CR759778.8	551	TTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAGGCCAGAGGTTCAGGATTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20595	TTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAGGCCAGAGGTTCAGGATTA	20644

CR759778.8	601	GCCTGAGCAACATAGTGAGACCTCCTCTCTAAAAATTATTATTTTTTTAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20645	GCCTGAGCAACATAGTGAGACCTCCTCTCTAAAAATTATTATTTTTTTAA	20694

CR759778.8	651	TTAGGCAGGCATGGTGGCGCTTGCCTGTAGTCCTAGCTACTCAGGAGGCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20695	TTAGGCAGGCATGGTGGCGCTTGCCTGTAGTCCTAGCTACTCAGGAGGCT	20744

CR759778.8	701	AAAGTGGGAGGATCACCTAAGCCTAGGAATTTAAGGTTACAGTGAGTTAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20745	AAAGTGGGAGGATCACCTAAGCCTAGGAATTTAAGGTTACAGTGAGTTAT	20794

CR759778.8	751	GATCATGCCACTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20795	GATCATGCCACTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCT	20844

CR759778.8	801	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGGGTGTGTGTGTGTTGTATACATGTGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20845	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGGGTGTGTGTGTGTTGTATACATGTGT	20894

CR759778.8	851	GTGTATCTACACATATCTCCCAAATTGAATTTATAATATCTTCTTCCTTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20895	GTGTATCTACACATATCTCCCAAATTGAATTTATAATATCTTCTTCCTTC	20944

CR759778.8	901	CTATAAGACCTTCTCTTCCACTGCCTCCTTAATTAATAAATGGTACCACT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20945	CTATAAGACCTTCTCTTCCACTGCCTCCTTAATTAATAAATGGTACCACT	20994

CR759778.8	951	TAGCCCAGCTAATTTTGCCAGCTAAAAACACAGGAGTCATCTCTGAGTGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	20995	TAGCCCAGCTAATTTTGCCAGCTAAAAACACAGGAGTCATCTCTGAGTGC	21044

CR759778.8	1001	TCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGAGTCTTGCTCTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21045	TCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGAGTCTTGCTCTG	21094

CR759778.8	1051	TCACCCAGGCTGCAGTACAATAGCGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21095	TCACCCAGGCTGCAGTACAATAGCGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCG	21144

CR759778.8	1101	CCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGTCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGGGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21145	CCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGTCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGGGA	21194

CR759778.8	1151	TTACAGGCGCCCGCCACTATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21195	TTACAGGCGCCCGCCACTATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGA	21244

CR759778.8	1201	GACTGGGTTTCACCATGTTCACCAGACTAGTCTTGAACTCCTGACCTCAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21245	GACTGGGTTTCACCATGTTCACCAGACTAGTCTTGAACTCCTGACCTCAA	21294

CR759778.8	1251	GTGATCCGCCTGCCTCTGCCTCACAAAGTGCCGGGATTACAGGCATGAGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21295	GTGATCCGCCTGCCTCTGCCTCACAAAGTGCCGGGATTACAGGCATGAGC	21344

CR759778.8	1301	CACCGCGCCCGGCCGGGTGCTCTTTATTCCCCACCTCTAGCCCCATCCTA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21345	CACCGCGCCCGGCCGGGTGCTCTTTATTCCCCACCTCTAGCCCCATCCTA	21394

CR759778.8	1351	TGAATTCTTCTTTATGTCCGCTTGTCACCACCACCCAGACTACTCTGACA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21395	TGAATTCTTCTTTATGTCCGCTTGTCACCACCACCCAGACTACTCTGACA	21444

CR759778.8	1401	GCCTCCCCAGTGGATTTCCCACTATGCTTATTCCCTCCGATTCTTGCTGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21445	GCCTCCCCAGTGGATTTCCCACTATGCTTATTCCCTCCGATTCTTGCTGT	21494

CR759778.8	1451	ACTCTGAAGCCAGAGTGAAACTTTAAAGTGTGAAAGTGATCATACCAATA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21495	ACTCTGAAGCCAGAGTGAAACTTTAAAGTGTGAAAGTGATCATACCAATA	21544

CR759778.8	1501	AAGTCCCCATTCCTTAACCTTGCTACAAGGCCCTCACTCCAGCCTTACCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21545	AAGTCCCCATTCCTTAACCTTGCTACAAGGCCCTCACTCCAGCCTTACCT	21594

CR759778.8	1551	TGCACCATTCTCCCCTCAGTCTGTAAGCTTAGCCATACCAAACCTTTCCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21595	TGCACCATTCTCCCCTCAGTCTGTAAGCTTAGCCATACCAAACCTTTCCC	21644

CR759778.8	1601	TGTCTCTCAGTGTGTGTGCTTTCTCACAGCTGGGCCTGTGCACAGCACTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21645	TGTCTCTCAGTGTGTGTGCTTTCTCACAGCTGGGCCTGTGCACAGCACTG	21694

CR759778.8	1651	GAATTACACCATGTGTCTGACTAACTTCTCATACTCCTCATTACTTCAGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21695	GAATTACACCATGTGTCTGACTAACTTCTCATACTCCTCATTACTTCAGT	21744

CR759778.8	1701	TATTTGCTTAAATGCCATCTTCTTAGAGAGGCCGCCACCAGAGATGAAGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21745	TATTTGCTTAAATGCCATCTTCTTAGAGAGGCCGCCACCAGAGATGAAGC	21794

CR759778.8	1751	CAGCCTCTCCCCCACCACCAAGTAGGCTTTACCTTTTCTTTTGGAACCTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21795	CAGCCTCTCCCCCACCACCAAGTAGGCTTTACCTTTTCTTTTGGAACCTT	21844

CR759778.8	1801	CAGTACACCTGGAATTACCTATTTAAAAATCTCTCTTCCTATAGCCTGCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21845	CAGTACACCTGGAATTACCTATTTAAAAATCTCTCTTCCTATAGCCTGCA	21894

CR759778.8	1851	AGCTCCAGAGGAGACCACATTTGTCTTGTTCATTGCTATGATCCCCTACG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21895	AGCTCCAGAGGAGACCACATTTGTCTTGTTCATTGCTATGATCCCCTACG	21944

CR759778.8	1901	CTAGCACAATATCTGACACATGGTAGCTGTTTAGTAGATACTTAGTGGAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21945	CTAGCACAATATCTGACACATGGTAGCTGTTTAGTAGATACTTAGTGGAT	21994

CR759778.8	1951	GAATGAATAGAGATGGGAATGATTATTTCTGCAGGAGTTGTGAGACAGTA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847863.2	21995	GAATGAATAGAGATGGGAATGATTATTTCTGCAGGAGTTGTGAGACAGTA	22044

Overview

Query
CR759778.8 - 88815 bps
Hit
CR847863.2 - 22044 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link