<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927194.9	1	GGCCAACATAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATCAGCTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	14749	GGCCAACATAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATCAGCTG	14798

BX927194.9	51	GACATGATGGCCTGTGCCTGTAGTTCCAGGTACTCAGGAACTCGAGAGGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	14799	GACATGATGGCCTGTGCCTGTAGTTCCAGGTACTCAGGAACTCGAGAGGC	14848

BX927194.9	101	TGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATGTGGGAGGTGGAGTTTGCAGTGAGCCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	14849	TGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATGTGGGAGGTGGAGTTTGCAGTGAGCCA	14898

BX927194.9	151	AGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTTTGTCTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	14899	AGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTTTGTCTC	14948

BX927194.9	201	AAAAGAAAAAAAAAAAAATTTAAAAACTTTTTGTAGTTAAATCTATGCAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	14949	AAAAGAAAAAAAAAAAAATTTAAAAACTTTTTGTAGTTAAATCTATGCAT	14998

BX927194.9	251	ATATTCCTTTCTTTTGTTGGCCTATTGTTTCAGTTAATTTGTTTTTTTAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	14999	ATATTCCTTTCTTTTGTTGGCCTATTGTTTCAGTTAATTTGTTTTTTTAC	15048

BX927194.9	301	TTTTTTCCCATGTTTTACTTATTACTTTCATATTTCTTGTATGATATTTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15049	TTTTTTCCCATGTTTTACTTATTACTTTCATATTTCTTGTATGATATTTA	15098

BX927194.9	351	TCTTAAAATCTAGTTTTATTTTTCTTTAAGAGACTGGGAGTCTTGCTATG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15099	TCTTAAAATCTAGTTTTATTTTTCTTTAAGAGACTGGGAGTCTTGCTATG	15148

BX927194.9	401	TTTCTCAGGCGGGTCTCGAATTTCTGGGCATAAGCGATCTTCCTGCCTCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15149	TTTCTCAGGCGGGTCTCGAATTTCTGGGCATAAGCGATCTTCCTGCCTCA	15198

BX927194.9	451	GCCTCTCAAGTAGCTGGGAATTACGCCACCAACACACCTGGCTTCTTTCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15199	GCCTCTCAAGTAGCTGGGAATTACGCCACCAACACACCTGGCTTCTTTCA	15248

BX927194.9	501	GCTAATTTAGAACATCCTACCCTTTTCAGAGATTAAAAAATATTTAGATT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15249	GCTAATTTAGAACATCCTACCCTTTTCAGAGATTAAAAAATATTTAGATT	15298

BX927194.9	551	TGCTCAGGATATGTTAGATGAAGTGAGGATTTACATCTACTATATGTATT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15299	TGCTCAGGATATGTTAGATGAAGTGAGGATTTACATCTACTATATGTATT	15348

BX927194.9	601	TTCCCAAATATTAATAATTATTTCTCCTGAACCATTTATTGCATAATATT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15349	TTCCCAAATATTAATAATTATTTCTCCTGAACCATTTATTGCATAATATT	15398

BX927194.9	651	TTTCTGTTCCATTGTTATATGACAGCACGTTTCTGCCTGGTTGTAATCTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15399	TTTCTGTTCCATTGTTATATGACAGCACGTTTCTGCCTGGTTGTAATCTC	15448

BX927194.9	701	ATAGTGGCTTGATTTTTAAGTGAACATTATATGTTTAACTGCCTCCTTGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15449	ATAGTGGCTTGATTTTTAAGTGAACATTATATGTTTAACTGCCTCCTTGA	15498

BX927194.9	751	GGATACTGAAGACTCTTTCCAATGATTATATTCTTTTCACTTCACCTGTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15499	GGATACTGAAGACTCTTTCCAATGATTATATTCTTTTCACTTCACCTGTC	15548

BX927194.9	801	ATGCATCAAGTGTTGATGTTGCTGGCTGCCTTTCTCAGTGTTAGTTTTTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15549	ATGCATCAAGTGTTGATGTTGCTGGCTGCCTTTCTCAGTGTTAGTTTTTA	15598

BX927194.9	851	TGTGTTTTGGAATTTCAGCTTCCAGGTTCATTTCCAGGCTTTCTCTGTCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15599	TGTGTTTTGGAATTTCAGCTTCCAGGTTCATTTCCAGGCTTTCTCTGTCT	15648

BX927194.9	901	CCCTTCTCTTGTTCCTCACTCCTCCCTGCCTAGTGGCTGTGCAGTTGCCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15649	CCCTTCTCTTGTTCCTCACTCCTCCCTGCCTAGTGGCTGTGCAGTTGCCC	15698

BX927194.9	951	TTCCCAGGGGCCAGTGTTCAGGACTAGGTCTTATATGGCAGTCGGGGCTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15699	TTCCCAGGGGCCAGTGTTCAGGACTAGGTCTTATATGGCAGTCGGGGCTC	15748

BX927194.9	1001	CTGCCCTGGGATAACCCTGGGAATGACTCACATCCAGCCCCATGGCTGTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15749	CTGCCCTGGGATAACCCTGGGAATGACTCACATCCAGCCCCATGGCTGTG	15798

BX927194.9	1051	GGTGGCTCAGTTAAGCCCAGGTGTGGTGCCGTTTGGTAACCACGGGCCTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15799	GGTGGCTCAGTTAAGCCCAGGTGTGGTGCCGTTTGGTAACCACGGGCCTC	15848

BX927194.9	1101	CCTAGGCCACAGTCCCAGGCGAAGTTAGTAGCAAGCTATTTCAGTCTTCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15849	CCTAGGCCACAGTCCCAGGCGAAGTTAGTAGCAAGCTATTTCAGTCTTCT	15898

BX927194.9	1151	TGAAGAGGGTGGAAGTGTGGGCAAGAGGGGAATCTGAGTCCCTAATATTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15899	TGAAGAGGGTGGAAGTGTGGGCAAGAGGGGAATCTGAGTCCCTAATATTT	15948

BX927194.9	1201	TCACAGTGACCATGACACTGGTCCCCCACCTCAGTGGGCAATTTAATTCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15949	TCACAGTGACCATGACACTGGTCCCCCACCTCAGTGGGCAATTTAATTCT	15998

BX927194.9	1251	ATCTCACCACTCAGTACTCAACAGGACTTGACTTCCCAGCTGCCTTTAAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	15999	ATCTCACCACTCAGTACTCAACAGGACTTGACTTCCCAGCTGCCTTTAAC	16048

BX927194.9	1301	TGTACCCTGAGTCAGAACCCAACAGGCCACAGCTGTAGCCCTGTTCATCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	16049	TGTACCCTGAGTCAGAACCCAACAGGCCACAGCTGTAGCCCTGTTCATCT	16098

BX927194.9	1351	TTTGCATTTATATTCAGTTTCTGGGAATATCTTTGGGGATATTCTCCCTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	16099	TTTGCATTTATATTCAGTTTCTGGGAATATCTTTGGGGATATTCTCCCTT	16148

BX927194.9	1401	TGTGGAGCATTGCTTTTTAATTTTCTCTAATATTATATCTATCATTGCTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	16149	TGTGGAGCATTGCTTTTTAATTTTCTCTAATATTATATCTATCATTGCTC	16198

BX927194.9	1451	TGTATTGAAAGCCCCTGGGCTAGCCTGTTTCACTTGTGTCTATTTTTTAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	16199	TGTATTGAAAGCCCCTGGGCTAGCCTGTTTCACTTGTGTCTATTTTTTAG	16248

BX927194.9	1501	AAGCATTTACTGTAGCTTTATACTACATATTTGGGGATCACTAACAATTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	16249	AAGCATTTACTGTAGCTTTATACTACATATTTGGGGATCACTAACAATTT	16298

BX927194.9	1551	TTTCCGGTCACACTCTAATCACTTTCTCAAGGCTGGATCAGGTGCGAGAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	16299	TTTCCGGTCACACTCTAATCACTTTCTCAAGGCTGGATCAGGTGCGAGAC	16348

BX927194.9	1601	TCTGTAGCAGTAACCTGAAGTTGAGAATTGAGGAAGTAGTGCTGCTATGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	16349	TCTGTAGCAGTAACCTGAAGTTGAGAATTGAGGAAGTAGTGCTGCTATGA	16398

BX927194.9	1651	GAGGAGACCTGCGGTGGCATCCCTAGGATGGGGTGCTGGTGGGGGGTGGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	16399	GAGGAGACCTGCGGTGGCATCCCTAGGATGGGGTGCTGGTGGGGGGTGGG	16448

BX927194.9	1701	TGGCAAGGGGGAAAGGGGGTTTCTGCCTAAGGGAGTTTCTGCTCCATGCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	16449	TGGCAAGGGGGAAAGGGGGTTTCTGCCTAAGGGAGTTTCTGCTCCATGCC	16498

BX927194.9	1751	AGCACTTCATCAGAGGTCTTGAGCCAGGGTGGAATCCAGCTCCAGGGAGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	16499	AGCACTTCATCAGAGGTCTTGAGCCAGGGTGGAATCCAGCTCCAGGGAGC	16548

BX927194.9	1801	ATATGAGAGCAAACAATGGAAGCTTGACATGATCACTGGATGAACATCTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	16549	ATATGAGAGCAAACAATGGAAGCTTGACATGATCACTGGATGAACATCTG	16598

BX927194.9	1851	AAGTTTCATATGTGATGGGATCTCCCCAGAAAACAATAGTGCACATCACA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	16599	AAGTTTCATATGTGATGGGATCTCCCCAGAAAACAATAGTGCACATCACA	16648

BX927194.9	1901	GCCAGGAGGCACCCAGAGCATTGTGTTGCTGTGTTTTTTGAACCCAGTGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	16649	GCCAGGAGGCACCCAGAGCATTGTGTTGCTGTGTTTTTTGAACCCAGTGA	16698

BX927194.9	1951	GTTAACTGTCCAGTGTTCCACATCATTCTGACCTGGGTCAACAGATGGAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR847861.4	16699	GTTAACTGTCCAGTGTTCCACATCATTCTGACCTGGGTCAACAGATGGAG	16748

Overview

Query
BX927194.9 - 110208 bps
Hit
CR847861.4 - 16748 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link