<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 1996 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CR936483.10 1 ATCTAGCATTGATTCTTCCTAGTCCTCTATATCTGGGCTGCTGTGGTCAG 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 76913 ATCTAGCATTGATTCTTCCTAGTCCTCTATATCTGGGCTGCTGTGGTCAG 76962 CR936483.10 51 CCTACAGGGTCAATGCCATGGGGTCAGTGCTCACTGCCACATTGTAGATA 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 76963 CCTACAGGGTCAATGCCATGGGGTCAGTGCTCACTGCCACATTGTAGATA 77012 CR936483.10 101 GCCATGCCCACAGCCCGGTGATCATTGATCTTCTCAGTGGACACACTCTT 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77013 GCCATGCCCACAGCCCGGTGATCATTGATCTTCTCAGTGGACACACTCTT 77062 CR936483.10 151 GGTCTCATAAGCAAGGAAGATTCCCAGCAGCAGCAGCAGCCCCTTGTAAC 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77063 GGTCTCATAAGCAAGGAAGATTCCCAGCAGCAGCAGCAGCCCCTTGTAAC 77112 CR936483.10 201 CATAGAAAATGCCTAGGATGGCAGGAGAGAGTCACTTGAGCAACAAGGAC 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77113 CATAGAAAATGCCTAGGATGGCAGGAGAGAGTCACTTGAGCAACAAGGAC 77162 CR936483.10 251 CACAATGCTCCTCACTCAATCCCCATCCCCTCTCTGCCCTTCACCTACTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77163 CACAATGCTCCTCACTCAATCCCCATCCCCTCTCTGCCCTTCACCTACTC 77212 CR936483.10 301 TGAAATGGAAAGGGGGCCCTCCTCTCCAATCCAACCCCTCTGACCTAGCA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77213 TGAAATGGAAAGGGGGCCCTCCTCTCCAATCCAACCCCTCTGACCTAGCA 77262 CR936483.10 351 AACCTCACCCTGTGTCCCCTATCCCTTATGTCCACCCAACTTGCCCAGAC 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77263 AACCTCACCCTGTGTCCCCTATCCCTTATGTCCACCCAACTTGCCCAGAC 77312 CR936483.10 401 CACATCACTTTTTCCTGGGATTCACACAGGAAAGCAATGGTGGCAAGCTG 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77313 CACATCACTTTTTCCTGGGATTCACACAGGAAAGCAATGGTGGCAAGCTG 77362 CR936483.10 451 CTGTCAGTCAGGCAAGGGCTTGTTGAATATCTAGAAATAGGCCAGTCTGG 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77363 CTGTCAGTCAGGCAAGGGCTTGTTGAATATCTAGAAATAGGCCAGTCTGG 77412 CR936483.10 501 GCCACACATGCCTCACCCTTACCCTACAGGTGGGAAGGTGGCTTTCCAGG 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77413 GCCACACATGCCTCACCCTTACCCTACAGGTGGGAAGGTGGCTTTCCAGG 77462 CR936483.10 551 CAGAGGGTAGGTTTGCAATTTGTGACCATGAATCGAACAATGCTAATAAG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77463 CAGAGGGTAGGTTTGCAATTTGTGACCATGAATCGAACAATGCTAATAAG 77512 CR936483.10 601 GCCAAGGGGGATCTAAAAGATAATGTCAAGTCTGGAGGTGGGGTTACCCC 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77513 GCCAAGGGGGATCTAAAAGATAATGTCAAGTCTGGAGGTGGGGTTACCCC 77562 CR936483.10 651 CACTTGTTCCTCTGCTGAACACAAGTTCTTCATCTGTGCTTTCTGTGCTT 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77563 CACTTGTTCCTCTGCTGAACACAAGTTCTTCATCTGTGCTTTCTGTGCTT 77612 CR936483.10 701 TGGGCCCTAAGCTCCTCATAGCAAAAGAGCAACTCTCCCCTATTCTCAGA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77613 TGGGCCCTAAGCTCCTCATAGCAAAAGAGCAACTCTCCCCTATTCTCAGA 77662 CR936483.10 751 AAAGATTAGTGCAATAACAAAGAGTAGGGTGTTCAAACTGGGTTGACAAG 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77663 AAAGATTAGTGCAATAACAAAGAGTAGGGTGTTCAAACTGGGTTGACAAG 77712 CR936483.10 801 CTCTCTACCTCCTCTTCCAAAGACCCCTCTCCCTCCAAGCCCTCTACCCC 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77713 CTCTCTACCTCCTCTTCCAAAGACCCCTCTCCCTCCAAGCCCTCTACCCC 77762 CR936483.10 851 TGCCTTCCCTCCTGCCTTTGTGCATCCCTGCCCTCCTTTGCCCACATCCC 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77763 TGCCTTCCCTCCTGCCTTTGTGCATCCCTGCCCTCCTTTGCCCACATCCC 77812 CR936483.10 901 ACACACCAAGCCATGTATTCATCTTCCTGGAGCTGCAATGCTCCAGCTGG 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77813 ACACACCAAGCCATGTATTCATCTTCCTGGAGCTGCAATGCTCCAGCTGG 77862 CR936483.10 951 GGCAGAATAGAGACGTCAATATCTTCCTTAGGTTCCTCCTTGGCAAATGT 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77863 GGCAGAATAGAGACGTCAATATCTTCCTTAGGTTCCTCCTTGGCAAATGT 77912 CR936483.10 1001 CTAGGGCAGAAACAAGGTCACAAGAAAGATGGTTGCCAGCCTCCCCTCCT 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77913 CTAGGGCAGAAACAAGGTCACAAGAAAGATGGTTGCCAGCCTCCCCTCCT 77962 CR936483.10 1051 CTCCTCAACGCTTCTCAGTCTCTGGCTTCCAACTGTTTTCCTATGAGACC 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 77963 CTCCTCAACGCTTCTCAGTCTCTGGCTTCCAACTGTTTTCCTATGAGACC 78012 CR936483.10 1101 CTCAATGCTGATGCCAAATCTCATTCTAGGCCTAAGAATGTTTTCCTGAA 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78013 CTCAATGCTGATGCCAAATCTCATTCTAGGCCTAAGAATGTTTTCCTGAA 78062 CR936483.10 1151 CCCTTGGAGGTGCTTGTTCCCCACTTTCCCTGATGCCTGGAAGTTCTACA 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78063 CCCTTGGAGGTGCTTGTTCCCCACTTTCCCTGATGCCTGGAAGTTCTACA 78112 CR936483.10 1201 CACCCTTCCCAGATCCCCACCCCTTCCTTTCTTCAGCTGAATCTGGAGGC 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78113 CACCCTTCCCAGATCCCCACCCCTTCCTTTCTTCAGCTGAATCTGGAGGC 78162 CR936483.10 1251 CTATGAGGGGCTCCTTCTAGGAAGGAAAGGAAGAGCTTCCAATACGAGGA 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78163 CTATGAGGGGCTCCTTCTAGGAAGGAAAGGAAGAGCTTCCAATACGAGGA 78212 CR936483.10 1301 AGGCACTCTCTCCAAGTAGCTTCATCCCTCAAGACCACACACAGCCCCAG 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78213 AGGCACTCTCTCCAAGTAGCTTCATCCCTCAAGACCACACACAGCCCCAG 78262 CR936483.10 1351 GGCCCTGATGGCCACTGAGCCCTGCTCATTCTCCTGACCATAGCACCTCC 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78263 GGCCCTGATGGCCACTGAGCCCTGCTCATTCTCCTGACCATAGCACCTCC 78312 CR936483.10 1401 TCTCCAGTGGTACCTCAATGGTCCGGTGCAGAGGGTCCACGATCTGCCAG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78313 TCTCCAGTGGTACCTCAATGGTCCGGTGCAGAGGGTCCACGATCTGCCAG 78362 CR936483.10 1451 ATGGCGAGAGTGAGGACATCCATGCCCACCAGCAGGCCCACTGTGGCATA 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78363 ATGGCGAGAGTGAGGACATCCATGCCCACCAGCAGGCCCACTGTGGCATA 78412 CR936483.10 1501 CAGCTTCCAGGGTTCCAGAGTCTGGATAAATATGTGGGGAGAACAGGCAC 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78413 CAGCTTCCAGGGTTCCAGAGTCTGGATAAATATGTGGGGAGAACAGGCAC 78462 CR936483.10 1551 GTCAGGGGAAAATGCTCTGTGCCCCAGGAGCCAAGGATCTGGGGGCTGAG 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78463 GTCAGGGGAAAATGCTCTGTGCCCCAGGAGCCAAGGATCTGGGGGCTGAG 78512 CR936483.10 1601 GATTGGGCAGCAGCTCACCTTCCTCCACTCCTTCTTTTCTTCCTTCTTTG 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78513 GATTGGGCAGCAGCTCACCTTCCTCCACTCCTTCTTTTCTTCCTTCTTTG 78562 CR936483.10 1651 TGAAGACCGTGTGGACCCACCAAATCTTGGTGAACATGGAACCGTAGCCC 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78563 TGAAGACCGTGTGGACCCACCAAATCTTGGTGAACATGGAACCGTAGCCC 78612 CR936483.10 1701 AGACTAAAGCCCAGGCCCAGGAGCCAGAGGCGGGCCTAGAAAAGAAGAGA 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78613 AGACTAAAGCCCAGGCCCAGGAGCCAGAGGCGGGCCTAGAAAAGAAGAGA 78662 CR936483.10 1751 GGGCACAGGCAGAACAGGGTAGAGTAGTAGCCGGGACTGCAGTAAGGATG 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78663 GGGCACAGGCAGAACAGGGTAGAGTAGTAGCCGGGACTGCAGTAAGGATG 78712 CR936483.10 1801 GGCAGAACCCTAAGGGAGAGTGGGCAGGGAGCACGGGCAGGGAGCTCATG 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78713 GGCAGAACCCTAAGGGAGAGTGGGCAGGGAGCACGGGCAGGGAGCTCATG 78762 CR936483.10 1851 GTGGCACAGGGAGGATGCGAAAATGTGAGCAGGACGGGGAGCGGCAGGAG 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78763 GTGGCACAGGGAGGATGCGAAAATGTGAGCAGGACGGGGAGCGGCAGGAG 78812 CR936483.10 1901 GAGAGCAGTCTCCCCACCTTGAACAATTCCTCCCATCCACCCTCTACTTC 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78813 GAGAGCAGTCTCCCCACCTTGAACAATTCCTCCCATCCACCCTCTACTTC 78862 CR936483.10 1951 CACACCACCAGGGTGATCTTGCTAAAACCTCCTGGCTTTAGTGGCC 1996 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR788300.6 78863 CACACCACCAGGGTGATCTTGCTAAAACCTCCTGGCTTTAGTGGCC 78908
