<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1996 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR936483.10	1	ATCTAGCATTGATTCTTCCTAGTCCTCTATATCTGGGCTGCTGTGGTCAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	76913	ATCTAGCATTGATTCTTCCTAGTCCTCTATATCTGGGCTGCTGTGGTCAG	76962

CR936483.10	51	CCTACAGGGTCAATGCCATGGGGTCAGTGCTCACTGCCACATTGTAGATA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	76963	CCTACAGGGTCAATGCCATGGGGTCAGTGCTCACTGCCACATTGTAGATA	77012

CR936483.10	101	GCCATGCCCACAGCCCGGTGATCATTGATCTTCTCAGTGGACACACTCTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77013	GCCATGCCCACAGCCCGGTGATCATTGATCTTCTCAGTGGACACACTCTT	77062

CR936483.10	151	GGTCTCATAAGCAAGGAAGATTCCCAGCAGCAGCAGCAGCCCCTTGTAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77063	GGTCTCATAAGCAAGGAAGATTCCCAGCAGCAGCAGCAGCCCCTTGTAAC	77112

CR936483.10	201	CATAGAAAATGCCTAGGATGGCAGGAGAGAGTCACTTGAGCAACAAGGAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77113	CATAGAAAATGCCTAGGATGGCAGGAGAGAGTCACTTGAGCAACAAGGAC	77162

CR936483.10	251	CACAATGCTCCTCACTCAATCCCCATCCCCTCTCTGCCCTTCACCTACTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77163	CACAATGCTCCTCACTCAATCCCCATCCCCTCTCTGCCCTTCACCTACTC	77212

CR936483.10	301	TGAAATGGAAAGGGGGCCCTCCTCTCCAATCCAACCCCTCTGACCTAGCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77213	TGAAATGGAAAGGGGGCCCTCCTCTCCAATCCAACCCCTCTGACCTAGCA	77262

CR936483.10	351	AACCTCACCCTGTGTCCCCTATCCCTTATGTCCACCCAACTTGCCCAGAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77263	AACCTCACCCTGTGTCCCCTATCCCTTATGTCCACCCAACTTGCCCAGAC	77312

CR936483.10	401	CACATCACTTTTTCCTGGGATTCACACAGGAAAGCAATGGTGGCAAGCTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77313	CACATCACTTTTTCCTGGGATTCACACAGGAAAGCAATGGTGGCAAGCTG	77362

CR936483.10	451	CTGTCAGTCAGGCAAGGGCTTGTTGAATATCTAGAAATAGGCCAGTCTGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77363	CTGTCAGTCAGGCAAGGGCTTGTTGAATATCTAGAAATAGGCCAGTCTGG	77412

CR936483.10	501	GCCACACATGCCTCACCCTTACCCTACAGGTGGGAAGGTGGCTTTCCAGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77413	GCCACACATGCCTCACCCTTACCCTACAGGTGGGAAGGTGGCTTTCCAGG	77462

CR936483.10	551	CAGAGGGTAGGTTTGCAATTTGTGACCATGAATCGAACAATGCTAATAAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77463	CAGAGGGTAGGTTTGCAATTTGTGACCATGAATCGAACAATGCTAATAAG	77512

CR936483.10	601	GCCAAGGGGGATCTAAAAGATAATGTCAAGTCTGGAGGTGGGGTTACCCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77513	GCCAAGGGGGATCTAAAAGATAATGTCAAGTCTGGAGGTGGGGTTACCCC	77562

CR936483.10	651	CACTTGTTCCTCTGCTGAACACAAGTTCTTCATCTGTGCTTTCTGTGCTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77563	CACTTGTTCCTCTGCTGAACACAAGTTCTTCATCTGTGCTTTCTGTGCTT	77612

CR936483.10	701	TGGGCCCTAAGCTCCTCATAGCAAAAGAGCAACTCTCCCCTATTCTCAGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77613	TGGGCCCTAAGCTCCTCATAGCAAAAGAGCAACTCTCCCCTATTCTCAGA	77662

CR936483.10	751	AAAGATTAGTGCAATAACAAAGAGTAGGGTGTTCAAACTGGGTTGACAAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77663	AAAGATTAGTGCAATAACAAAGAGTAGGGTGTTCAAACTGGGTTGACAAG	77712

CR936483.10	801	CTCTCTACCTCCTCTTCCAAAGACCCCTCTCCCTCCAAGCCCTCTACCCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77713	CTCTCTACCTCCTCTTCCAAAGACCCCTCTCCCTCCAAGCCCTCTACCCC	77762

CR936483.10	851	TGCCTTCCCTCCTGCCTTTGTGCATCCCTGCCCTCCTTTGCCCACATCCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77763	TGCCTTCCCTCCTGCCTTTGTGCATCCCTGCCCTCCTTTGCCCACATCCC	77812

CR936483.10	901	ACACACCAAGCCATGTATTCATCTTCCTGGAGCTGCAATGCTCCAGCTGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77813	ACACACCAAGCCATGTATTCATCTTCCTGGAGCTGCAATGCTCCAGCTGG	77862

CR936483.10	951	GGCAGAATAGAGACGTCAATATCTTCCTTAGGTTCCTCCTTGGCAAATGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77863	GGCAGAATAGAGACGTCAATATCTTCCTTAGGTTCCTCCTTGGCAAATGT	77912

CR936483.10	1001	CTAGGGCAGAAACAAGGTCACAAGAAAGATGGTTGCCAGCCTCCCCTCCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77913	CTAGGGCAGAAACAAGGTCACAAGAAAGATGGTTGCCAGCCTCCCCTCCT	77962

CR936483.10	1051	CTCCTCAACGCTTCTCAGTCTCTGGCTTCCAACTGTTTTCCTATGAGACC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	77963	CTCCTCAACGCTTCTCAGTCTCTGGCTTCCAACTGTTTTCCTATGAGACC	78012

CR936483.10	1101	CTCAATGCTGATGCCAAATCTCATTCTAGGCCTAAGAATGTTTTCCTGAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78013	CTCAATGCTGATGCCAAATCTCATTCTAGGCCTAAGAATGTTTTCCTGAA	78062

CR936483.10	1151	CCCTTGGAGGTGCTTGTTCCCCACTTTCCCTGATGCCTGGAAGTTCTACA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78063	CCCTTGGAGGTGCTTGTTCCCCACTTTCCCTGATGCCTGGAAGTTCTACA	78112

CR936483.10	1201	CACCCTTCCCAGATCCCCACCCCTTCCTTTCTTCAGCTGAATCTGGAGGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78113	CACCCTTCCCAGATCCCCACCCCTTCCTTTCTTCAGCTGAATCTGGAGGC	78162

CR936483.10	1251	CTATGAGGGGCTCCTTCTAGGAAGGAAAGGAAGAGCTTCCAATACGAGGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78163	CTATGAGGGGCTCCTTCTAGGAAGGAAAGGAAGAGCTTCCAATACGAGGA	78212

CR936483.10	1301	AGGCACTCTCTCCAAGTAGCTTCATCCCTCAAGACCACACACAGCCCCAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78213	AGGCACTCTCTCCAAGTAGCTTCATCCCTCAAGACCACACACAGCCCCAG	78262

CR936483.10	1351	GGCCCTGATGGCCACTGAGCCCTGCTCATTCTCCTGACCATAGCACCTCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78263	GGCCCTGATGGCCACTGAGCCCTGCTCATTCTCCTGACCATAGCACCTCC	78312

CR936483.10	1401	TCTCCAGTGGTACCTCAATGGTCCGGTGCAGAGGGTCCACGATCTGCCAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78313	TCTCCAGTGGTACCTCAATGGTCCGGTGCAGAGGGTCCACGATCTGCCAG	78362

CR936483.10	1451	ATGGCGAGAGTGAGGACATCCATGCCCACCAGCAGGCCCACTGTGGCATA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78363	ATGGCGAGAGTGAGGACATCCATGCCCACCAGCAGGCCCACTGTGGCATA	78412

CR936483.10	1501	CAGCTTCCAGGGTTCCAGAGTCTGGATAAATATGTGGGGAGAACAGGCAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78413	CAGCTTCCAGGGTTCCAGAGTCTGGATAAATATGTGGGGAGAACAGGCAC	78462

CR936483.10	1551	GTCAGGGGAAAATGCTCTGTGCCCCAGGAGCCAAGGATCTGGGGGCTGAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78463	GTCAGGGGAAAATGCTCTGTGCCCCAGGAGCCAAGGATCTGGGGGCTGAG	78512

CR936483.10	1601	GATTGGGCAGCAGCTCACCTTCCTCCACTCCTTCTTTTCTTCCTTCTTTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78513	GATTGGGCAGCAGCTCACCTTCCTCCACTCCTTCTTTTCTTCCTTCTTTG	78562

CR936483.10	1651	TGAAGACCGTGTGGACCCACCAAATCTTGGTGAACATGGAACCGTAGCCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78563	TGAAGACCGTGTGGACCCACCAAATCTTGGTGAACATGGAACCGTAGCCC	78612

CR936483.10	1701	AGACTAAAGCCCAGGCCCAGGAGCCAGAGGCGGGCCTAGAAAAGAAGAGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78613	AGACTAAAGCCCAGGCCCAGGAGCCAGAGGCGGGCCTAGAAAAGAAGAGA	78662

CR936483.10	1751	GGGCACAGGCAGAACAGGGTAGAGTAGTAGCCGGGACTGCAGTAAGGATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78663	GGGCACAGGCAGAACAGGGTAGAGTAGTAGCCGGGACTGCAGTAAGGATG	78712

CR936483.10	1801	GGCAGAACCCTAAGGGAGAGTGGGCAGGGAGCACGGGCAGGGAGCTCATG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78713	GGCAGAACCCTAAGGGAGAGTGGGCAGGGAGCACGGGCAGGGAGCTCATG	78762

CR936483.10	1851	GTGGCACAGGGAGGATGCGAAAATGTGAGCAGGACGGGGAGCGGCAGGAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78763	GTGGCACAGGGAGGATGCGAAAATGTGAGCAGGACGGGGAGCGGCAGGAG	78812

CR936483.10	1901	GAGAGCAGTCTCCCCACCTTGAACAATTCCTCCCATCCACCCTCTACTTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78813	GAGAGCAGTCTCCCCACCTTGAACAATTCCTCCCATCCACCCTCTACTTC	78862

CR936483.10	1951	CACACCACCAGGGTGATCTTGCTAAAACCTCCTGGCTTTAGTGGCC	1996
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR788300.6	78863	CACACCACCAGGGTGATCTTGCTAAAACCTCCTGGCTTTAGTGGCC	78908

Overview

Query
CR936483.10 - 67632 bps
Hit
CR788300.6 - 78908 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1996 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link