<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL772307.16	1	CATGTGGAACTGTATGTCCAATAAACCTTTTTCTTTTGTAAGTTGTCCAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	151631	CATGTGGAACTGTATGTCCAATAAACCTTTTTCTTTTGTAAGTTGTCCAG	151680

AL772307.16	51	TCGTGGGTATGTCTTTATCAGCAGTGTTAAAATGGACTAATACAATCACT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	151681	TCGTGGGTATGTCTTTATCAGCAGTGTTAAAATGGACTAATACAATCACT	151730

AL772307.16	101	CTATCAAATGAGATAATATTTATTCCTTTACCACTGACAACTCTCTCTCG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	151731	CTATCAAATGAGATAATATTTATTCCTTTACCACTGACAACTCTCTCTCG	151780

AL772307.16	151	GCTCTTCTATTCAATCATGTTACTGATAGACGCTTTGCTTTTTGTTTTTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	151781	GCTCTTCTATTCAATCATGTTACTGATAGACGCTTTGCTTTTTGTTTTTG	151830

AL772307.16	201	TTGTTTAACCTGATTGTTATAGCTTATTTTATGAATTTCTGTTCTTCTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	151831	TTGTTTAACCTGATTGTTATAGCTTATTTTATGAATTTCTGTTCTTCTTT	151880

AL772307.16	251	TAATTTTACAACAATTTTACTATTTCTCCTTACATGTTTATAAGTCATAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	151881	TAATTTTACAACAATTTTACTATTTCTCCTTACATGTTTATAAGTCATAT	151930

AL772307.16	301	GGAGACTCCTTCTCATCTACCCTGACCCCAGAATATTAAAACTTTTCAGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	151931	GGAGACTCCTTCTCATCTACCCTGACCCCAGAATATTAAAACTTTTCAGA	151980

AL772307.16	351	GTTTCAGGATTAATTCCATTATATGGACATGATTCCTTGAGATAGGAAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	151981	GTTTCAGGATTAATTCCATTATATGGACATGATTCCTTGAGATAGGAAAA	152030

AL772307.16	401	ACTGATTGGATTGTGACATTAGACTTATCAGAATCTAAGATCTTACAAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152031	ACTGATTGGATTGTGACATTAGACTTATCAGAATCTAAGATCTTACAAAA	152080

AL772307.16	451	TATAAAGCTTTACTAGTAATTTCACGAACTCAGGTAATCATTAGGCATAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152081	TATAAAGCTTTACTAGTAATTTCACGAACTCAGGTAATCATTAGGCATAG	152130

AL772307.16	501	GCAAATCAGAGAATTATTTAGATCTCTTAATCTGATTCTTTAGATCCTTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152131	GCAAATCAGAGAATTATTTAGATCTCTTAATCTGATTCTTTAGATCCTTG	152180

AL772307.16	551	GTTCTGTCATTAGATACTCCCTTGCCCAGGCAGATAGATGAGACTTCTAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152181	GTTCTGTCATTAGATACTCCCTTGCCCAGGCAGATAGATGAGACTTCTAG	152230

AL772307.16	601	AGAGGTATGCAGACAATTTATTTACATGGAGATACCTGTCTCAATTATCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152231	AGAGGTATGCAGACAATTTATTTACATGGAGATACCTGTCTCAATTATCA	152280

AL772307.16	651	AATATCTTAATTTTTATGCAGATAGTTACATATGTGGTATATGTGACATT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152281	AATATCTTAATTTTTATGCAGATAGTTACATATGTGGTATATGTGACATT	152330

AL772307.16	701	TTCCAGGGAGCCCCATAAATCCACAACCTTCTACTTTGTTAACCATAAGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152331	TTCCAGGGAGCCCCATAAATCCACAACCTTCTACTTTGTTAACCATAAGC	152380

AL772307.16	751	AATTCTAAACGACCAAGTACATTCTGCTAAAAGCATTTCTGTGATAGATA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152381	AATTCTAAACGACCAAGTACATTCTGCTAAAAGCATTTCTGTGATAGATA	152430

AL772307.16	801	ATCACTCTCCTGCCAGCAAAAAAACAAATTGTTTGTCAGGAGCTGTCATT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152431	ATCACTCTCCTGCCAGCAAAAAAACAAATTGTTTGTCAGGAGCTGTCATT	152480

AL772307.16	851	AGTATGTTTATATAAGCAAAATGGGCTTCCTTCCTTCTGTGGATCCTGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152481	AGTATGTTTATATAAGCAAAATGGGCTTCCTTCCTTCTGTGGATCCTGGC	152530

AL772307.16	901	AGGGCATCTCAGTAATCAGAAAGAATCAAAGACCCTTTCCTTCCCAATCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152531	AGGGCATCTCAGTAATCAGAAAGAATCAAAGACCCTTTCCTTCCCAATCT	152580

AL772307.16	951	GCTCTGGCCTTGGTCAACATCTTAGTGCCAAATATTGCTGGTGTATTATC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152581	GCTCTGGCCTTGGTCAACATCTTAGTGCCAAATATTGCTGGTGTATTATC	152630

AL772307.16	1001	ATTATTGTCTTACACCATTTTCTGCAGTGTTTCACTTAAGCCAACTAATA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152631	ATTATTGTCTTACACCATTTTCTGCAGTGTTTCACTTAAGCCAACTAATA	152680

AL772307.16	1051	CTCTGACCTTGATTTGAACCATCCAACAGAGAGTAGGAATTCCCTCCACA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152681	CTCTGACCTTGATTTGAACCATCCAACAGAGAGTAGGAATTCCCTCCACA	152730

AL772307.16	1101	AAGCATGTTACTCATTAACATCTTCCTTTACAAGTCTCTTGATGTTCATT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152731	AAGCATGTTACTCATTAACATCTTCCTTTACAAGTCTCTTGATGTTCATT	152780

AL772307.16	1151	CACAAACTCAATTACCTTTTTCCTCCATCAACCTCAATTATTTGCATCAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152781	CACAAACTCAATTACCTTTTTCCTCCATCAACCTCAATTATTTGCATCAT	152830

AL772307.16	1201	TTTCCATGGGCCTATGGGAGTATTTAATTGAATACATATTTTTTCTTCTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152831	TTTCCATGGGCCTATGGGAGTATTTAATTGAATACATATTTTTTCTTCTC	152880

AL772307.16	1251	AAATCAAATTTTCTGAAAAAAATTTGTTTCTATGAACTGTATTTTAGGTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152881	AAATCAAATTTTCTGAAAAAAATTTGTTTCTATGAACTGTATTTTAGGTA	152930

AL772307.16	1301	TATTCCAGGTTGGTACAAACACTAATTTTCAGGGGTCATTATGTCAAAGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152931	TATTCCAGGTTGGTACAAACACTAATTTTCAGGGGTCATTATGTCAAAGA	152980

AL772307.16	1351	GCCCATCCACACCCCATGGCCTACATATGTCAAAGGATTGTTCTTTATTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	152981	GCCCATCCACACCCCATGGCCTACATATGTCAAAGGATTGTTCTTTATTC	153030

AL772307.16	1401	ATCCACTTTCTATGAATTCCACACACGGGAGATAAACTTCTTTTTCATCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	153031	ATCCACTTTCTATGAATTCCACACACGGGAGATAAACTTCTTTTTCATCC	153080

AL772307.16	1451	ATATTACCAGGGTTGTCAGGGAGCAACACTGAAGGTCACAGTGTTCAGTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	153081	ATATTACCAGGGTTGTCAGGGAGCAACACTGAAGGTCACAGTGTTCAGTG	153130

AL772307.16	1501	AAACCTTGCCATAACTTAGACTAAACACGTTTTTCCCATAATTTTACTTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	153131	AAACCTTGCCATAACTTAGACTAAACACGTTTTTCCCATAATTTTACTTC	153180

AL772307.16	1551	TTCAAATTCTTTCTTTTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	153181	TTCAAATTCTTTCTTTTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCT	153230

AL772307.16	1601	TTTTCTTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTCTCTTTCTCCTTTTCTTTCTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	153231	TTTTCTTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTCTCTTTCTCCTTTTCTTTCTCT	153280

AL772307.16	1651	CTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTGACAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	153281	CTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTGACAG	153330

AL772307.16	1701	GGTTTCACTCTTGTCACCTGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	153331	GGTTTCACTCTTGTCACCTGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCA	153380

AL772307.16	1751	CTGCAACCTTCACCTCACAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	153381	CTGCAACCTTCACCTCACAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCC	153430

AL772307.16	1801	GAGTAGCTGGGATTACAAGCACCTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	153431	GAGTAGCTGGGATTACAAGCACCTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTAT	153480

AL772307.16	1851	TTTTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATATTGACCAGGCTTGTCTTGAACTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	153481	TTTTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATATTGACCAGGCTTGTCTTGAACTC	153530

AL772307.16	1901	CTGACCTCAGGTGATCCACACTCCTCAGCCTACCTAAGTGCTGGGATTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	153531	CTGACCTCAGGTGATCCACACTCCTCAGCCTACCTAAGTGCTGGGATTTT	153580

AL772307.16	1951	ACAAGTGTGAGCCACTGCGCCCGACGTTGAGCTTGTTTCTTTATGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR769767.5	153581	ACAAGTGTGAGCCACTGCGCCCGACGTTGAGCTTGTTTCTTTATGAATTC	153630

Overview

Query
AL772307.16 - 105782 bps
Hit
CR769767.5 - 153630 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link