<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
AL772307.16 1 CATGTGGAACTGTATGTCCAATAAACCTTTTTCTTTTGTAAGTTGTCCAG 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 151631 CATGTGGAACTGTATGTCCAATAAACCTTTTTCTTTTGTAAGTTGTCCAG 151680 AL772307.16 51 TCGTGGGTATGTCTTTATCAGCAGTGTTAAAATGGACTAATACAATCACT 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 151681 TCGTGGGTATGTCTTTATCAGCAGTGTTAAAATGGACTAATACAATCACT 151730 AL772307.16 101 CTATCAAATGAGATAATATTTATTCCTTTACCACTGACAACTCTCTCTCG 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 151731 CTATCAAATGAGATAATATTTATTCCTTTACCACTGACAACTCTCTCTCG 151780 AL772307.16 151 GCTCTTCTATTCAATCATGTTACTGATAGACGCTTTGCTTTTTGTTTTTG 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 151781 GCTCTTCTATTCAATCATGTTACTGATAGACGCTTTGCTTTTTGTTTTTG 151830 AL772307.16 201 TTGTTTAACCTGATTGTTATAGCTTATTTTATGAATTTCTGTTCTTCTTT 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 151831 TTGTTTAACCTGATTGTTATAGCTTATTTTATGAATTTCTGTTCTTCTTT 151880 AL772307.16 251 TAATTTTACAACAATTTTACTATTTCTCCTTACATGTTTATAAGTCATAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 151881 TAATTTTACAACAATTTTACTATTTCTCCTTACATGTTTATAAGTCATAT 151930 AL772307.16 301 GGAGACTCCTTCTCATCTACCCTGACCCCAGAATATTAAAACTTTTCAGA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 151931 GGAGACTCCTTCTCATCTACCCTGACCCCAGAATATTAAAACTTTTCAGA 151980 AL772307.16 351 GTTTCAGGATTAATTCCATTATATGGACATGATTCCTTGAGATAGGAAAA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 151981 GTTTCAGGATTAATTCCATTATATGGACATGATTCCTTGAGATAGGAAAA 152030 AL772307.16 401 ACTGATTGGATTGTGACATTAGACTTATCAGAATCTAAGATCTTACAAAA 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152031 ACTGATTGGATTGTGACATTAGACTTATCAGAATCTAAGATCTTACAAAA 152080 AL772307.16 451 TATAAAGCTTTACTAGTAATTTCACGAACTCAGGTAATCATTAGGCATAG 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152081 TATAAAGCTTTACTAGTAATTTCACGAACTCAGGTAATCATTAGGCATAG 152130 AL772307.16 501 GCAAATCAGAGAATTATTTAGATCTCTTAATCTGATTCTTTAGATCCTTG 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152131 GCAAATCAGAGAATTATTTAGATCTCTTAATCTGATTCTTTAGATCCTTG 152180 AL772307.16 551 GTTCTGTCATTAGATACTCCCTTGCCCAGGCAGATAGATGAGACTTCTAG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152181 GTTCTGTCATTAGATACTCCCTTGCCCAGGCAGATAGATGAGACTTCTAG 152230 AL772307.16 601 AGAGGTATGCAGACAATTTATTTACATGGAGATACCTGTCTCAATTATCA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152231 AGAGGTATGCAGACAATTTATTTACATGGAGATACCTGTCTCAATTATCA 152280 AL772307.16 651 AATATCTTAATTTTTATGCAGATAGTTACATATGTGGTATATGTGACATT 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152281 AATATCTTAATTTTTATGCAGATAGTTACATATGTGGTATATGTGACATT 152330 AL772307.16 701 TTCCAGGGAGCCCCATAAATCCACAACCTTCTACTTTGTTAACCATAAGC 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152331 TTCCAGGGAGCCCCATAAATCCACAACCTTCTACTTTGTTAACCATAAGC 152380 AL772307.16 751 AATTCTAAACGACCAAGTACATTCTGCTAAAAGCATTTCTGTGATAGATA 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152381 AATTCTAAACGACCAAGTACATTCTGCTAAAAGCATTTCTGTGATAGATA 152430 AL772307.16 801 ATCACTCTCCTGCCAGCAAAAAAACAAATTGTTTGTCAGGAGCTGTCATT 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152431 ATCACTCTCCTGCCAGCAAAAAAACAAATTGTTTGTCAGGAGCTGTCATT 152480 AL772307.16 851 AGTATGTTTATATAAGCAAAATGGGCTTCCTTCCTTCTGTGGATCCTGGC 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152481 AGTATGTTTATATAAGCAAAATGGGCTTCCTTCCTTCTGTGGATCCTGGC 152530 AL772307.16 901 AGGGCATCTCAGTAATCAGAAAGAATCAAAGACCCTTTCCTTCCCAATCT 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152531 AGGGCATCTCAGTAATCAGAAAGAATCAAAGACCCTTTCCTTCCCAATCT 152580 AL772307.16 951 GCTCTGGCCTTGGTCAACATCTTAGTGCCAAATATTGCTGGTGTATTATC 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152581 GCTCTGGCCTTGGTCAACATCTTAGTGCCAAATATTGCTGGTGTATTATC 152630 AL772307.16 1001 ATTATTGTCTTACACCATTTTCTGCAGTGTTTCACTTAAGCCAACTAATA 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152631 ATTATTGTCTTACACCATTTTCTGCAGTGTTTCACTTAAGCCAACTAATA 152680 AL772307.16 1051 CTCTGACCTTGATTTGAACCATCCAACAGAGAGTAGGAATTCCCTCCACA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152681 CTCTGACCTTGATTTGAACCATCCAACAGAGAGTAGGAATTCCCTCCACA 152730 AL772307.16 1101 AAGCATGTTACTCATTAACATCTTCCTTTACAAGTCTCTTGATGTTCATT 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152731 AAGCATGTTACTCATTAACATCTTCCTTTACAAGTCTCTTGATGTTCATT 152780 AL772307.16 1151 CACAAACTCAATTACCTTTTTCCTCCATCAACCTCAATTATTTGCATCAT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152781 CACAAACTCAATTACCTTTTTCCTCCATCAACCTCAATTATTTGCATCAT 152830 AL772307.16 1201 TTTCCATGGGCCTATGGGAGTATTTAATTGAATACATATTTTTTCTTCTC 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152831 TTTCCATGGGCCTATGGGAGTATTTAATTGAATACATATTTTTTCTTCTC 152880 AL772307.16 1251 AAATCAAATTTTCTGAAAAAAATTTGTTTCTATGAACTGTATTTTAGGTA 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152881 AAATCAAATTTTCTGAAAAAAATTTGTTTCTATGAACTGTATTTTAGGTA 152930 AL772307.16 1301 TATTCCAGGTTGGTACAAACACTAATTTTCAGGGGTCATTATGTCAAAGA 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152931 TATTCCAGGTTGGTACAAACACTAATTTTCAGGGGTCATTATGTCAAAGA 152980 AL772307.16 1351 GCCCATCCACACCCCATGGCCTACATATGTCAAAGGATTGTTCTTTATTC 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 152981 GCCCATCCACACCCCATGGCCTACATATGTCAAAGGATTGTTCTTTATTC 153030 AL772307.16 1401 ATCCACTTTCTATGAATTCCACACACGGGAGATAAACTTCTTTTTCATCC 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 153031 ATCCACTTTCTATGAATTCCACACACGGGAGATAAACTTCTTTTTCATCC 153080 AL772307.16 1451 ATATTACCAGGGTTGTCAGGGAGCAACACTGAAGGTCACAGTGTTCAGTG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 153081 ATATTACCAGGGTTGTCAGGGAGCAACACTGAAGGTCACAGTGTTCAGTG 153130 AL772307.16 1501 AAACCTTGCCATAACTTAGACTAAACACGTTTTTCCCATAATTTTACTTC 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 153131 AAACCTTGCCATAACTTAGACTAAACACGTTTTTCCCATAATTTTACTTC 153180 AL772307.16 1551 TTCAAATTCTTTCTTTTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCT 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 153181 TTCAAATTCTTTCTTTTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCT 153230 AL772307.16 1601 TTTTCTTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTCTCTTTCTCCTTTTCTTTCTCT 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 153231 TTTTCTTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTCTCTTTCTCCTTTTCTTTCTCT 153280 AL772307.16 1651 CTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTGACAG 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 153281 CTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTGACAG 153330 AL772307.16 1701 GGTTTCACTCTTGTCACCTGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCA 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 153331 GGTTTCACTCTTGTCACCTGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCA 153380 AL772307.16 1751 CTGCAACCTTCACCTCACAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCC 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 153381 CTGCAACCTTCACCTCACAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCC 153430 AL772307.16 1801 GAGTAGCTGGGATTACAAGCACCTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTAT 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 153431 GAGTAGCTGGGATTACAAGCACCTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTAT 153480 AL772307.16 1851 TTTTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATATTGACCAGGCTTGTCTTGAACTC 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 153481 TTTTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATATTGACCAGGCTTGTCTTGAACTC 153530 AL772307.16 1901 CTGACCTCAGGTGATCCACACTCCTCAGCCTACCTAAGTGCTGGGATTTT 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 153531 CTGACCTCAGGTGATCCACACTCCTCAGCCTACCTAAGTGCTGGGATTTT 153580 AL772307.16 1951 ACAAGTGTGAGCCACTGCGCCCGACGTTGAGCTTGTTTCTTTATGAATTC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR769767.5 153581 ACAAGTGTGAGCCACTGCGCCCGACGTTGAGCTTGTTTCTTTATGAATTC 153630