<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR936913.7	1	TCAAGGTGAAACTTCCAGATCAATGTGGCAGGAGTGTTGAGGAAGGAAGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	93555	TCAAGGTGAAACTTCCAGATCAATGTGGCAGGAGTGTTGAGGAAGGAAGT	93604

CR936913.7	51	GAACTCGGTTCTAACCAAGTAGGACAGCCAAATCATCACTGAAGTGTGGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	93605	GAACTCGGTTCTAACCAAGTAGGACAGCCAAATCATCACTGAAGTGTGGC	93654

CR936913.7	101	ACTGGCCTTTCGCCAAGGTAACATGTGGCAAGGTTTTAGGTTAGGATAGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	93655	ACTGGCCTTTCGCCAAGGTAACATGTGGCAAGGTTTTAGGTTAGGATAGG	93704

CR936913.7	151	TACCAGGCAAAAGCTGGGTGACTCGATGGAGGCTTTTGTGCCAACCTTCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	93705	TACCAGGCAAAAGCTGGGTGACTCGATGGAGGCTTTTGTGCCAACCTTCA	93754

CR936913.7	201	GAGACTGGCTGCGTCAGACTGCCCTCAAGAGCATACAAAGGAAAAAAGAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	93755	GAGACTGGCTGCGTCAGACTGCCCTCAAGAGCATACAAAGGAAAAAAGAC	93804

CR936913.7	251	AAATTAAAAGCCTTTAATCCAAACTCAAGACATGAATGAAAAACTGTAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	93805	AAATTAAAAGCCTTTAATCCAAACTCAAGACATGAATGAAAAACTGTAAA	93854

CR936913.7	301	TGCCTCTATAGCAGTTTTAAAGGCTATCTTTTCTCCTGCAACCCAGCACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	93855	TGCCTCTATAGCAGTTTTAAAGGCTATCTTTTCTCCTGCAACCCAGCACA	93904

CR936913.7	351	GATATGGCTGAGGGTCAAGCCCGGGGGCTTATGATAAAGGTTATGAAGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	93905	GATATGGCTGAGGGTCAAGCCCGGGGGCTTATGATAAAGGTTATGAAGTT	93954

CR936913.7	401	GTAGAAATGTTTGTTGCATCATCCAACAGCAGCTGTTGTGATAAGGCAAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	93955	GTAGAAATGTTTGTTGCATCATCCAACAGCAGCTGTTGTGATAAGGCAAG	94004

CR936913.7	451	ACCCCTGGTTGGGATAGACCGGACCCTGAGATATGAAATAGGGACATATG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94005	ACCCCTGGTTGGGATAGACCGGACCCTGAGATATGAAATAGGGACATATG	94054

CR936913.7	501	AGCAGACACAGAGAAGTCTGAGTGAGAACTATGAATCACCGCACCCCCTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94055	AGCAGACACAGAGAAGTCTGAGTGAGAACTATGAATCACCGCACCCCCTG	94104

CR936913.7	551	AGGGTCCTTGCTGGAAGAAGCAGACTCACCGTATTAGTTACCTATTGCCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94105	AGGGTCCTTGCTGGAAGAAGCAGACTCACCGTATTAGTTACCTATTGCCA	94154

CR936913.7	601	TGTAATGAATGACACCCGCTTAAAATAACAGACATTTACTATAAGGTGTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94155	TGTAATGAATGACACCCGCTTAAAATAACAGACATTTACTATAAGGTGTT	94204

CR936913.7	651	ACTGGGACAATGGGGGATTTTTTAATATGGATTGTGTGTTTGATAATATG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94205	ACTGGGACAATGGGGGATTTTTTAATATGGATTGTGTGTTTGATAATATG	94254

CR936913.7	701	GTATCAATTTTAAGTATCTTGGGGGTGATGACAGTATTAGGGTTTTGCAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94255	GTATCAATTTTAAGTATCTTGGGGGTGATGACAGTATTAGGGTTTTGCAG	94304

CR936913.7	751	GAGAAATGTCCTTATTCTTAAATTATACATGACAAAATATTTAGGGGTCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94305	GAGAAATGTCCTTATTCTTAAATTATACATGACAAAATATTTAGGGGTCA	94354

CR936913.7	801	AGTGGCATAATTTCCACAGATTACTCTCAAATTGTTTAACAAAATGGTTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94355	AGTGGCATAATTTCCACAGATTACTCTCAAATTGTTTAACAAAATGGTTC	94404

CR936913.7	851	TTCAACAGTAAATGGATAAACAAAACGTAGTCTATTCGTGCAACACAGTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94405	TTCAACAGTAAATGGATAAACAAAACGTAGTCTATTCGTGCAACACAGTA	94454

CR936913.7	901	CTATGTAAACAATGAAACTTCATCAACTACTGAAAATGTAACAACATGGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94455	CTATGTAAACAATGAAACTTCATCAACTACTGAAAATGTAACAACATGGA	94504

CR936913.7	951	CGAATCTCATAGAAACAATATTAAGTGAAGAAGCCAGACTTGCAGAAATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94505	CGAATCTCATAGAAACAATATTAAGTGAAGAAGCCAGACTTGCAGAAATA	94554

CR936913.7	1001	CATACTGTATGTTTCCATTATCTATTGCTGGGCAGCACACCAACTCCAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94555	CATACTGTATGTTTCCATTATCTATTGCTGGGCAGCACACCAACTCCAAA	94604

CR936913.7	1051	CTTAATGGCTTAAAACAAAAATAATCATTTTATTATCTCTCATGAAACTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94605	CTTAATGGCTTAAAACAAAAATAATCATTTTATTATCTCTCATGAAACTG	94654

CR936913.7	1101	TGAATTACTGGACTTTAAGAGCCACTGATGTAGTCCATGAACCAAAACAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94655	TGAATTACTGGACTTTAAGAGCCACTGATGTAGTCCATGAACCAAAACAC	94704

CR936913.7	1151	ATATTCACGGCAGCCACTCCACCCAGCACCTCACACCTGTGATGTTTACT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94705	ATATTCACGGCAGCCACTCCACCCAGCACCTCACACCTGTGATGTTTACT	94754

CR936913.7	1201	GGCTGCCCATGGGATTTGAACACCTTTAGAGTACTGTGAAATTTCCCCTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94755	GGCTGCCCATGGGATTTGAACACCTTTAGAGTACTGTGAAATTTCCCCTA	94804

CR936913.7	1251	CCTTTTGAGTCCTGCCTCCCTAAAGTGGAAACCAGAAAGCTCACTTCCCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94805	CCTTTTGAGTCCTGCCTCCCTAAAGTGGAAACCAGAAAGCTCACTTCCCC	94854

CR936913.7	1301	TAGCCTTCTTTGAAGCTAGAGCACCTAAGTTCCACCAATTAAATTCATCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94855	TAGCCTTCTTTGAAGCTAGAGCACCTAAGTTCCACCAATTAAATTCATCC	94904

CR936913.7	1351	ACCTAAGACTTCAGTTACAAAGGGGCCACAGGAGGAACCAGGGTGTGGGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94905	ACCTAAGACTTCAGTTACAAAGGGGCCACAGGAGGAACCAGGGTGTGGGG	94954

CR936913.7	1401	GTTGCAGAGCACCTTTTACTGTATTTATTTCTCTGGCAAAGGTGACAGAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	94955	GTTGCAGAGCACCTTTTACTGTATTTATTTCTCTGGCAAAGGTGACAGAA	95004

CR936913.7	1451	GAAGCAACTGTCTTTTGGGGAAGCGGTGGGTTTTTTCCTTTTTTTTTTTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	95005	GAAGCAACTGTCTTTTGGGGAAGCGGTGGGTTTTTTCCTTTTTTTTTTTT	95054

CR936913.7	1501	TTTTTTTAAGTGAAGTTCCTGAAACAGAAGTGGTTTAGGAGGTGTCTTCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	95055	TTTTTTTAAGTGAAGTTCCTGAAACAGAAGTGGTTTAGGAGGTGTCTTCA	95104

CR936913.7	1551	GTGGTGGCTGCAGCAACCTCCAGGTCCTAACAACAGAACCAACAGCAGCG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	95105	GTGGTGGCTGCAGCAACCTCCAGGTCCTAACAACAGAACCAACAGCAGCG	95154

CR936913.7	1601	TCTAGAAGCCATGGGGCAGCAGCAGTGGTGTGGCTCATCAGACCTGCTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	95155	TCTAGAAGCCATGGGGCAGCAGCAGTGGTGTGGCTCATCAGACCTGCTCT	95204

CR936913.7	1651	CTGCGTGGTCTGACCCTGTACATACATGTGCCTCTCATCCGTAGTTCCAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	95205	CTGCGTGGTCTGACCCTGTACATACATGTGCCTCTCATCCGTAGTTCCAG	95254

CR936913.7	1701	CATTTCCTCTCTAAAGTCTAGTTCTGAGAGAAATTTCTTTGGTAGACTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	95255	CATTTCCTCTCTAAAGTCTAGTTCTGAGAGAAATTTCTTTGGTAGACTTT	95304

CR936913.7	1751	TCAAAGTTTTATCAAACTCAAAGAGGGAACCAGCAAGAATACAAGAGCCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	95305	TCAAAGTTTTATCAAACTCAAAGAGGGAACCAGCAAGAATACAAGAGCCT	95354

CR936913.7	1801	TGATCCAAAGAGTATTTGAAAAACAGAGCTGTATCTCTCTGTGAGGAAAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	95355	TGATCCAAAGAGTATTTGAAAAACAGAGCTGTATCTCTCTGTGAGGAAAT	95404

CR936913.7	1851	AATTTCTAGGCTAGAGATTCAAAATGGCTAACGTGCTAGAGGGCAATAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	95405	AATTTCTAGGCTAGAGATTCAAAATGGCTAACGTGCTAGAGGGCAATAAA	95454

CR936913.7	1901	ATCATAACCTTGGTGTTATCTTCTTTACCGGAGAAAAAGAGAAAGCCAGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	95455	ATCATAACCTTGGTGTTATCTTCTTTACCGGAGAAAAAGAGAAAGCCAGC	95504

CR936913.7	1951	ATCCCTTATCAGCTCTCTGCTGATTAACCTCTAATCGCACAGGGCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762476.2	95505	ATCCCTTATCAGCTCTCTGCTGATTAACCTCTAATCGCACAGGGCTGGCC	95554

Overview

Query
CR936913.7 - 99908 bps
Hit
CR762476.2 - 95554 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link