<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR394550.5	1	GAATTCCATTAGGCGTGGATTCCCTCAGACGCGCCAGCTGCAAACACGCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	106473	GAATTCCATTAGGCGTGGATTCCCTCAGACGCGCCAGCTGCAAACACGCA	106522

CR394550.5	51	GGGCATGTGCTTTTGTACAGAATCACCCAGCGTGGCTGCAGAGTATTGAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	106523	GGGCATGTGCTTTTGTACAGAATCACCCAGCGTGGCTGCAGAGTATTGAC	106572

CR394550.5	101	TCCCTGTTAGCTTGAATGATACCTGTATCCACAAAGACTAAATCTTCCTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	106573	TCCCTGTTAGCTTGAATGATACCTGTATCCACAAAGACTAAATCTTCCTC	106622

CR394550.5	151	ATGCCTGAAGAGAAAGGTTTAGGCTGTGTGAATGCGGGCACACACACATA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	106623	ATGCCTGAAGAGAAAGGTTTAGGCTGTGTGAATGCGGGCACACACACATA	106672

CR394550.5	201	TACACACACAGAAGTAGAACAGACAACAGACTTATTCTATATATACACAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	106673	TACACACACAGAAGTAGAACAGACAACAGACTTATTCTATATATACACAT	106722

CR394550.5	251	AAATAAATAACATCAGTTTTCTATGATATTTAGAATAAATATTGATATAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	106723	AAATAAATAACATCAGTTTTCTATGATATTTAGAATAAATATTGATATAC	106772

CR394550.5	301	TAAAGCTTCACCTATGATTGTAATGTGCTTGTGGTCTAAACAAACTTAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	106773	TAAAGCTTCACCTATGATTGTAATGTGCTTGTGGTCTAAACAAACTTAAA	106822

CR394550.5	351	GCGATAAAAGCAAAAACATGTGCATATAACCCAATCTAACATGCTAATTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	106823	GCGATAAAAGCAAAAACATGTGCATATAACCCAATCTAACATGCTAATTA	106872

CR394550.5	401	TAACAGTTTTGAACTGTTACATACACACACACACAAAATTACAAAAGCAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	106873	TAACAGTTTTGAACTGTTACATACACACACACACAAAATTACAAAAGCAG	106922

CR394550.5	451	CTTTTTTAAGCAATAAAAAGAGAGCTTGAGTGTGTTTGTATTTCTAAAGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	106923	CTTTTTTAAGCAATAAAAAGAGAGCTTGAGTGTGTTTGTATTTCTAAAGA	106972

CR394550.5	501	GCTCAATGATTTGTACGTAAGGAAGACGGTAATTAACATCAGTATTTTCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	106973	GCTCAATGATTTGTACGTAAGGAAGACGGTAATTAACATCAGTATTTTCC	107022

CR394550.5	551	TAAAGCCTCATTAAATAAAAGCGGAGGCACGTTTCTTTGCATGAAAAGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107023	TAAAGCCTCATTAAATAAAAGCGGAGGCACGTTTCTTTGCATGAAAAGCC	107072

CR394550.5	601	ACAGCAAGAGAGACAGAGAGGTAGTCTGAAGGTTTGACCTGCGGCTCGAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107073	ACAGCAAGAGAGACAGAGAGGTAGTCTGAAGGTTTGACCTGCGGCTCGAA	107122

CR394550.5	651	TAAATATATTATTAGTGATCCCTCATTATAAACAGCCCACACAGCCAGTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107123	TAAATATATTATTAGTGATCCCTCATTATAAACAGCCCACACAGCCAGTC	107172

CR394550.5	701	ATAACAAACCTAGAGCGAACCCGAATCCACTCCTAGACAAAAATTTCAAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107173	ATAACAAACCTAGAGCGAACCCGAATCCACTCCTAGACAAAAATTTCAAT	107222

CR394550.5	751	TTCAGAAGTTCTGCAAAAAAAAGTTGTTGATTGAGAATTCTGTGCCTATA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107223	TTCAGAAGTTCTGCAAAAAAAAGTTGTTGATTGAGAATTCTGTGCCTATA	107272

CR394550.5	801	GCGTGTTGAGCCTGATCTAGCAGCTAAGGGCCTCTGAGCACCAGCGCTAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107273	GCGTGTTGAGCCTGATCTAGCAGCTAAGGGCCTCTGAGCACCAGCGCTAA	107322

CR394550.5	851	TAAAACACAGTGTTTGCATTGGCAAGGTGCTTTCATCTCTTCTAATGCAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107323	TAAAACACAGTGTTTGCATTGGCAAGGTGCTTTCATCTCTTCTAATGCAA	107372

CR394550.5	901	GTCTGTTCATCTTCTAAATCAAATATTACTCACTGCCCAGAGCCATAAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107373	GTCTGTTCATCTTCTAAATCAAATATTACTCACTGCCCAGAGCCATAAAT	107422

CR394550.5	951	CCACACAAAGAGAACGCTGGTATAACCCACTGAAAAATCTGTGTTCTGTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107423	CCACACAAAGAGAACGCTGGTATAACCCACTGAAAAATCTGTGTTCTGTC	107472

CR394550.5	1001	TTCTTCTTCAAACAGGTAAACATCATCCACAGAAACCACATTCACGTGGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107473	TTCTTCTTCAAACAGGTAAACATCATCCACAGAAACCACATTCACGTGGT	107522

CR394550.5	1051	AACAGCAGGCCTTTTTTGATTGATTCCACACATCCCGCTATTTTATTTTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107523	AACAGCAGGCCTTTTTTGATTGATTCCACACATCCCGCTATTTTATTTTT	107572

CR394550.5	1101	GCAGTTTACTTTGCAGTTTATTCAGGCTTGCTGATGTTTTGTTGTTGATT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107573	GCAGTTTACTTTGCAGTTTATTCAGGCTTGCTGATGTTTTGTTGTTGATT	107622

CR394550.5	1151	TCAATAGTTAAAACTTTTGTATGTGCTTTGCACGTCAGTTGTTTCATTTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107623	TCAATAGTTAAAACTTTTGTATGTGCTTTGCACGTCAGTTGTTTCATTTG	107672

CR394550.5	1201	TGATAACTGAAAGAAATCAAGAAATGGCTACTACAAGGGGAACCAATGAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107673	TGATAACTGAAAGAAATCAAGAAATGGCTACTACAAGGGGAACCAATGAT	107722

CR394550.5	1251	ATATTAATTATTATCAGGATTATCAGGGGTTCCATGTTTTTAAATGATTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107723	ATATTAATTATTATCAGGATTATCAGGGGTTCCATGTTTTTAAATGATTT	107772

CR394550.5	1301	ATATACAGTTGAAGTAGAAATTATTTGCTCCCCTGAATAATTAGCCCCCG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107773	ATATACAGTTGAAGTAGAAATTATTTGCTCCCCTGAATAATTAGCCCCCG	107822

CR394550.5	1351	TTTATTTTTTTCCCCAATTTATGTTTAACGGAGAGAAGACTTTTTCAACA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107823	TTTATTTTTTTCCCCAATTTATGTTTAACGGAGAGAAGACTTTTTCAACA	107872

CR394550.5	1401	CATTTCTAACCAGTGTTCTAATAGTATTAACTACTTATTTCTAATAACTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107873	CATTTCTAACCAGTGTTCTAATAGTATTAACTACTTATTTCTAATAACTG	107922

CR394550.5	1451	ATTTATTTTATCTTTGCCAAGGTGACAGTAGATAATATTTTACAAGATAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107923	ATTTATTTTATCTTTGCCAAGGTGACAGTAGATAATATTTTACAAGATAT	107972

CR394550.5	1501	TTTACTAAGACACTTCTATACAGCTTATCCAAAAAAATTTGCTTAAAGAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	107973	TTTACTAAGACACTTCTATACAGCTTATCCAAAAAAATTTGCTTAAAGAG	108022

CR394550.5	1551	GCTTAAAAATTTTAACCTTTAAATGGCTTTTAAAAAAATAAAAACTGCTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	108023	GCTTAAAAATTTTAACCTTTAAATGGCTTTTAAAAAAATAAAAACTGCTT	108072

CR394550.5	1601	TTATTTTAGCCGAAATAATACAAATAAGACTTTCTCCAGAAGAAAACATA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	108073	TTATTTTAGCCGAAATAATACAAATAAGACTTTCTCCAGAAGAAAACATA	108122

CR394550.5	1651	ATATCAGACTGTGCAAATTACCTTGCTCCTTATTTGGGAAATATTTAAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	108123	ATATCAGACTGTGCAAATTACCTTGCTCCTTATTTGGGAAATATTTAAAA	108172

CR394550.5	1701	AAGAAAAACTATTCAAAGGTGGGCTAATAATAATAATAAGACTTGGTAAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	108173	AAGAAAAACTATTCAAAGGTGGGCTAATAATAATAATAAGACTTGGTAAC	108222

CR394550.5	1751	ACTTTACAATAAGGTTCATTAGTTAATGCATTTACTAACATGAACTAATC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	108223	ACTTTACAATAAGGTTCATTAGTTAATGCATTTACTAACATGAACTAATC	108272

CR394550.5	1801	ATGAACAACACTTGTACAGCATTTATTGATCATAATTAAACATTTACTAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	108273	ATGAACAACACTTGTACAGCATTTATTGATCATAATTAAACATTTACTAA	108322

CR394550.5	1851	TGCATTATTAACATCCGAACTCATGCATGTTAATATTAGTTAATGCACCG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	108323	TGCATTATTAACATCCGAACTCATGCATGTTAATATTAGTTAATGCACCG	108372

CR394550.5	1901	TGAGTTAACATGAACTCACAATGAACAGCTGTATTTTCATTAACTTTAAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	108373	TGAGTTAACATGAACTCACAATGAACAGCTGTATTTTCATTAACTTTAAC	108422

CR394550.5	1951	ATGATAATTAACATTATCAACTAACATGAACAAGCATTGTAGTAAATGTA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762467.7	108423	ATGATAATTAACATTATCAACTAACATGAACAAGCATTGTAGTAAATGTA	108472

Overview

Query
CR394550.5 - 170825 bps
Hit
CR762467.7 - 108472 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100192120001200011064731084721
281.791213261421141424391790982431
384.741593291175501178781792382431
488.2473120117103117222124703248211
593.75113143142332142474-124710248531
690.6595140117769117908-124715248531
783.26207461134647135107126413268721
887.275125135361135485127116272401
990.85100143117764117906144079442201
1085.8821728062680797166784669591
1190.12166251114217114467-167860681121
1279.672989326955970490-176405773241
1382.9110257137617137873178458787261
1479.66862836163561917178460787491
1593.5514420217441945-182033822341
1680.75832353775737991-195706959441
1782.2399239117669117907-195706959471
1885.7172133117321117453-196175963071
1987.321682863121331498-197813980961
2081.981353384580446141-11036861040291
Short-link