<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759817.3	1	GGCCAACATGATGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	22496	GGCCAACATGATGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG	22545

CR759817.3	51	GCATGATGGTGGATGCCTATAATCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	22546	GCATGATGGTGGATGCCTATAATCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAAG	22595

CR759817.3	101	AGAATCACTTGAACTTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	22596	AGAATCACTTGAACTTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCATGC	22645

CR759817.3	151	CACTGCACTCCAGCCTGGATGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	22646	CACTGCACTCCAGCCTGGATGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAA	22695

CR759817.3	201	AAAAAAAAAAAAGGATGTAAAAATGACCAATTAGTAAGAACTATGAGGAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	22696	AAAAAAAAAAAAGGATGTAAAAATGACCAATTAGTAAGAACTATGAGGAA	22745

CR759817.3	251	TGAACAGACTTGAAAAAAGGAAATTTTTTTAGATATGAAAAGCCAGTTTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	22746	TGAACAGACTTGAAAAAAGGAAATTTTTTTAGATATGAAAAGCCAGTTTT	22795

CR759817.3	301	AGAAAGTCAACAGATTAACAAGAATTATACAATGAATTAGAATTTATAAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	22796	AGAAAGTCAACAGATTAACAAGAATTATACAATGAATTAGAATTTATAAC	22845

CR759817.3	351	TGAAGAAAGGACTCAGAATGTAGCACAGACAGAAGATGGAAAATTTTGAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	22846	TGAAGAAAGGACTCAGAATGTAGCACAGACAGAAGATGGAAAATTTTGAG	22895

CR759817.3	401	ATAGTAGGAGATACAGAAATCTAATTAATGTATCTAGGCACTGAAATTGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	22896	ATAGTAGGAGATACAGAAATCTAATTAATGTATCTAGGCACTGAAATTGA	22945

CR759817.3	451	TGGCTACTAACATCACAAAGAGAGCCAAGAAGACATTATGTGCTTCCTGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	22946	TGGCTACTAACATCACAAAGAGAGCCAAGAAGACATTATGTGCTTCCTGA	22995

CR759817.3	501	TGGAAATACATACCACTACCTCTCAAATATCCCTGTAGAAAAAAAAAAAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	22996	TGGAAATACATACCACTACCTCTCAAATATCCCTGTAGAAAAAAAAAAAC	23045

CR759817.3	551	TAATTTAAATCTGACCAAGCCTTTCCATCTAATTACACACTTATGAGAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23046	TAATTTAAATCTGACCAAGCCTTTCCATCTAATTACACACTTATGAGAAA	23095

CR759817.3	601	TACACCAGACAGAGGAAGTTTGGCCACACCATGGAATGCAGTCAGCAAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23096	TACACCAGACAGAGGAAGTTTGGCCACACCATGGAATGCAGTCAGCAAAA	23145

CR759817.3	651	TCTAAACTGTACATCATTCTAGATGACAAATGACTCAATAACTCAGTTTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23146	TCTAAACTGTACATCATTCTAGATGACAAATGACTCAATAACTCAGTTTC	23195

CR759817.3	701	TTCCAAAAATAAATTGCAGAGGAGATGGAAGGGAAATCTATAGACTAAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23196	TTCCAAAAATAAATTGCAGAGGAGATGGAAGGGAAATCTATAGACTAAAA	23245

CR759817.3	751	AAAGACACATATATGGACTTTATATGGATCCTGATTTGAACCATAAAAAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23246	AAAGACACATATATGGACTTTATATGGATCCTGATTTGAACCATAAAAAT	23295

CR759817.3	801	CATTTATGAAGGCCAGGCACAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23296	CATTTATGAAGGCCAGGCACAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATTTT	23345

CR759817.3	851	GGGAGGCTGAGGCGGGTAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23346	GGGAGGCTGAGGCGGGTAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC	23395

CR759817.3	901	TGGCCAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23396	TGGCCAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTG	23445

CR759817.3	951	GGCGTGGTGGTGGGTGTCTATAATCCCAGCTACTCAGGAGACTGAGGCAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23446	GGCGTGGTGGTGGGTGTCTATAATCCCAGCTACTCAGGAGACTGAGGCAG	23495

CR759817.3	1001	GAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGATGTTGGAGTGTGCCAAGATCGGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23496	GAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGATGTTGGAGTGTGCCAAGATCGGG	23545

CR759817.3	1051	CCATTGCACTCCAGCCTGGAGGCAACAAGAGTGAAACTGTGTCTCAAAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23546	CCATTGCACTCCAGCCTGGAGGCAACAAGAGTGAAACTGTGTCTCAAAAA	23595

CR759817.3	1101	AAAAAAAAAAAAAATCACTTATGAAATAACTGGGAAAATCTGAATAGTTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23596	AAAAAAAAAAAAAATCACTTATGAAATAACTGGGAAAATCTGAATAGTTA	23645

CR759817.3	1151	TTTTAGATAAGATAATTTTTTTAAGTGTGATAATGTATTGTAGTTTTTAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23646	TTTTAGATAAGATAATTTTTTTAAGTGTGATAATGTATTGTAGTTTTTAA	23695

CR759817.3	1201	AACCATCTGTTACCAGGTGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGTTACTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23696	AACCATCTGTTACCAGGTGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGTTACTT	23745

CR759817.3	1251	AGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGGCTGCAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23746	AGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGGCTGCAG	23795

CR759817.3	1301	GGAGTTATATCATGCTACTACACTCCAGCCTGGGCACTACAGCAAGGCCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23796	GGAGTTATATCATGCTACTACACTCCAGCCTGGGCACTACAGCAAGGCCC	23845

CR759817.3	1351	TATCTCAAAAATAATTTTCTTAATAAAAATAACATTCTGATACAGATGAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23846	TATCTCAAAAATAATTTTCTTAATAAAAATAACATTCTGATACAGATGAA	23895

CR759817.3	1401	GTGATAATATTCATCTGTATATGTATAAGATTTAATTCAAAGTAACTGGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23896	GTGATAATATTCATCTGTATATGTATAAGATTTAATTCAAAGTAACTGGG	23945

CR759817.3	1451	GGACACAGAAGGAGGATAAGCAATAGGTGTTGGTATAGATGAAACAAAAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23946	GGACACAGAAGGAGGATAAGCAATAGGTGTTGGTATAGATGAAACAAAAC	23995

CR759817.3	1501	TGTCCGTGAACTGCTATACACCGAATATCACTGATGATGCCTGGGGGTTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	23996	TGTCCGTGAACTGCTATACACCGAATATCACTGATGATGCCTGGGGGTTC	24045

CR759817.3	1551	ACTATGCTTTTCTAATAGCATAGTGAAATTTCCCATAATAAAATGTTAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	24046	ACTATGCTTTTCTAATAGCATAGTGAAATTTCCCATAATAAAATGTTAAT	24095

CR759817.3	1601	TTTTGTTTAATGTAAAAGGGAGATTCAAACAAAAAAACTCATAAAAGCAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	24096	TTTTGTTTAATGTAAAAGGGAGATTCAAACAAAAAAACTCATAAAAGCAA	24145

CR759817.3	1651	ACAACCCAGACAGAAAGATCTGGTAAGAAGAAAGTGAAATTATTATTCCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	24146	ACAACCCAGACAGAAAGATCTGGTAAGAAGAAAGTGAAATTATTATTCCA	24195

CR759817.3	1701	TTTAAAAATAAATTATTAATACTAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	24196	TTTAAAAATAAATTATTAATACTAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATG	24245

CR759817.3	1751	CCTGTAACCCCAGCTACTCAGGGAGACTGAAGCAGAAGAATCACTTGAAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	24246	CCTGTAACCCCAGCTACTCAGGGAGACTGAAGCAGAAGAATCACTTGAAC	24295

CR759817.3	1801	CGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCAAGATCATGTCACTGCACTCCAGCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	24296	CGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCAAGATCATGTCACTGCACTCCAGCC	24345

CR759817.3	1851	TGGGCGACAGAGCAGCAACTTGTCTCAGTAAATAAATAAATAAATAAATA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	24346	TGGGCGACAGAGCAGCAACTTGTCTCAGTAAATAAATAAATAAATAAATA	24395

CR759817.3	1901	AATAAAAATTGTATCTTTTCTATTCTTCCCTCAAAATATTCACTTATATC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	24396	AATAAAAATTGTATCTTTTCTATTCTTCCCTCAAAATATTCACTTATATC	24445

CR759817.3	1951	CACTGAGGGTGTCAAATAACTAATATGCTGCAAGGAAGGATCTTTCTATA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762434.7	24446	CACTGAGGGTGTCAAATAACTAATATGCTGCAAGGAAGGATCTTTCTATA	24495

Overview

Query
CR759817.3 - 108902 bps
Hit
CR762434.7 - 24495 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link