<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX510997.9	1	GAATTCATACGCTGATTTAATATCGGTACATAACAGTTACCAAGGTATCG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	122426	GAATTCATACGCTGATTTAATATCGGTACATAACAGTTACCAAGGTATCG	122475

BX510997.9	51	GTGCTATAATGGCACCGCTGGGTTTCGGCACCCAACCCTATTCAGTATGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	122476	GTGCTATAATGGCACCGCTGGGTTTCGGCACCCAACCCTATTCAGTATGG	122525

BX510997.9	101	GGGCGTGCGAGAGAGATCTGCAGAGTGGATGGCAACATCAACAGCCTGAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	122526	GGGCGTGCGAGAGAGATCTGCAGAGTGGATGGCAACATCAACAGCCTGAG	122575

BX510997.9	151	GTATCAAGACATTTGTGCTGCCCATTACATTACAAACTACAGGAGAGGGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	122576	GTATCAAGACATTTGTGCTGCCCATTACATTACAAACTACAGGAGAGGGC	122625

BX510997.9	201	AAATTCTTCAGCAAGATAGTGCTCCTCATACTTCAGCCTCCACATCAAAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	122626	AAATTCTTCAGCAAGATAGTGCTCCTCATACTTCAGCCTCCACATCAAAG	122675

BX510997.9	251	GTTCTGAAAGCAAAGAAGGTGAAGGCGCTCCAGGATTGGCCAGCCCAGTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	122676	GTTCTGAAAGCAAAGAAGGTGAAGGCGCTCCAGGATTGGCCAGCCCAGTC	122725

BX510997.9	301	ACCAGATATGAACATCAATGAGCATGTCTGAGGTAAGATGAAGGAGGAGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	122726	ACCAGATATGAACATCAATGAGCATGTCTGAGGTAAGATGAAGGAGGAGG	122775

BX510997.9	351	CATTGAAGATGAATCCAAAGAATCTTAATGAACTCTGGGAGTCCTGCAAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	122776	CATTGAAGATGAATCCAAAGAATCTTAATGAACTCTGGGAGTCCTGCAAG	122825

BX510997.9	401	AATGCTTTCTTTGCCATTCCAGATGACTTTGTTAATGAGTTATTTGATTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	122826	AATGCTTTCTTTGCCATTCCAGATGACTTTGTTAATGAGTTATTTGATTC	122875

BX510997.9	451	ATTGCAGAGATGTATGGATGCAGTCCTCTAAGGTCATGGGAGTCAGACAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	122876	ATTGCAGAGATGTATGGATGCAGTCCTCTAAGGTCATGGGAGTCAGACAC	122925

BX510997.9	501	AATAATAATTCTTTTTCCACTGCACTATGACTTTATATTCTATACTGTAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	122926	AATAATAATTCTTTTTCCACTGCACTATGACTTTATATTCTATACTGTAT	122975

BX510997.9	551	AATATTTCTGTTAAGTGACCAGATGTTTGTCTAAGCAAAGTCAGACCTTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	122976	AATATTTCTGTTAAGTGACCAGATGTTTGTCTAAGCAAAGTCAGACCTTA	123025

BX510997.9	601	CTGTCCTTATTAAATAATTCAAATTCAAGGCATGATTATATTTTATTTAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123026	CTGTCCTTATTAAATAATTCAAATTCAAGGCATGATTATATTTTATTTAG	123075

BX510997.9	651	GTAAAGTAAGCATTATCTAAAGGCCGTTGCTTTTCATTTAAGCCACTTCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123076	GTAAAGTAAGCATTATCTAAAGGCCGTTGCTTTTCATTTAAGCCACTTCT	123125

BX510997.9	701	GATACCAAGTGATCATCTAGAAGTCAAGTTATTATTTGTTGTTTCTAAAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123126	GATACCAAGTGATCATCTAGAAGTCAAGTTATTATTTGTTGTTTCTAAAC	123175

BX510997.9	751	CTTGGATTGGCGACAATAATTTTCTCAGTTAGTGTAGGCTTAATTGTACC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123176	CTTGGATTGGCGACAATAATTTTCTCAGTTAGTGTAGGCTTAATTGTACC	123225

BX510997.9	801	ATCATTTACTCACTCTTCACTTTTTTAAAACCTGTGACTGTCTTTCTACT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123226	ATCATTTACTCACTCTTCACTTTTTTAAAACCTGTGACTGTCTTTCTACT	123275

BX510997.9	851	GTTGACCTTTAAAGAAGTCATTTTGAAAGAATACTGGAAACCAGAAACCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123276	GTTGACCTTTAAAGAAGTCATTTTGAAAGAATACTGGAAACCAGAAACCC	123325

BX510997.9	901	TTGACTTTCATAGTATTTGTTTTTCCTACTATGGAATTCGTTGGTTCCAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123326	TTGACTTTCATAGTATTTGTTTTTCCTACTATGGAATTCGTTGGTTCCAG	123375

BX510997.9	951	GTTTTCAGCTTTCTTCAAAATATCTTCATTTGAGCTAAACAGAAGAAAGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123376	GTTTTCAGCTTTCTTCAAAATATCTTCATTTGAGCTAAACAGAAGAAAGA	123425

BX510997.9	1001	ATCTCATAAAGGTTTGGAATCAGTTGAGGTTGACAAAATAGTTAGCAAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123426	ATCTCATAAAGGTTTGGAATCAGTTGAGGTTGACAAAATAGTTAGCAAAT	123475

BX510997.9	1051	GTGAATTTTTTGGGCGAACTATCCCTTTAAACCTTGTTTCTAAAACTGAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123476	GTGAATTTTTTGGGCGAACTATCCCTTTAAACCTTGTTTCTAAAACTGAA	123525

BX510997.9	1101	AGTGTTATTTTATGTCATTCTTATGGAACATTATTATATCGCTTGCAGAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123526	AGTGTTATTTTATGTCATTCTTATGGAACATTATTATATCGCTTGCAGAA	123575

BX510997.9	1151	TGATAACATACAGAATGTTTCTATATTTTTGCGTACCCAAGAATGTTCTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123576	TGATAACATACAGAATGTTTCTATATTTTTGCGTACCCAAGAATGTTCTT	123625

BX510997.9	1201	GGGGCATGTTTTGTGTAGTGGTTTAACAATGATACATTTGCCATGCTTAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123626	GGGGCATGTTTTGTGTAGTGGTTTAACAATGATACATTTGCCATGCTTAT	123675

BX510997.9	1251	ATTCTCTGTATAATACCAGTAACTCTAACCTTGCTTTTCTGCATGTCCCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123676	ATTCTCTGTATAATACCAGTAACTCTAACCTTGCTTTTCTGCATGTCCCT	123725

BX510997.9	1301	TATTCTTTCTTGTCCTTTCTTAATCCCTGTAACAGTCCTAATCCTATGTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123726	TATTCTTTCTTGTCCTTTCTTAATCCCTGTAACAGTCCTAATCCTATGTC	123775

BX510997.9	1351	TGATCTTGATCCTGACAAAATCCTAAACCTATCCATCTCTAATCTTAGAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123776	TGATCTTGATCCTGACAAAATCCTAAACCTATCCATCTCTAATCTTAGAG	123825

BX510997.9	1401	ACCAATTAATGCTGTTCAGTTCAATATCACATGGCCAAAATCTGCAACAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123826	ACCAATTAATGCTGTTCAGTTCAATATCACATGGCCAAAATCTGCAACAT	123875

BX510997.9	1451	ATACATATTCCAGGACCACATACACAATCAGATAAGAGGTTTACTTATAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123876	ATACATATTCCAGGACCACATACACAATCAGATAAGAGGTTTACTTATAT	123925

BX510997.9	1501	GTATTAATATGTATATGTTTTGTTATTTTAGATATACAAAATTCTATTTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123926	GTATTAATATGTATATGTTTTGTTATTTTAGATATACAAAATTCTATTTT	123975

BX510997.9	1551	TAATCCCTCTCTTCACCAGCCCCAGCTTTGAGATGTTGATTGAACTAGTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	123976	TAATCCCTCTCTTCACCAGCCCCAGCTTTGAGATGTTGATTGAACTAGTG	124025

BX510997.9	1601	AATTACTGGTAGGCCAAGAGTGAGATTTATACATTTTAATGGTAACCGTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	124026	AATTACTGGTAGGCCAAGAGTGAGATTTATACATTTTAATGGTAACCGTT	124075

BX510997.9	1651	ATTTTATAAACCATTGTATTTTAATCTGAAATCATTTGATGAAATGTGGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	124076	ATTTTATAAACCATTGTATTTTAATCTGAAATCATTTGATGAAATGTGGA	124125

BX510997.9	1701	GAAAACAGTTAGATCTGTAATAGGCAAATCTCAGTTTTTAAAGGTTTTGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	124126	GAAAACAGTTAGATCTGTAATAGGCAAATCTCAGTTTTTAAAGGTTTTGG	124175

BX510997.9	1751	CTCCATCTTGTGGAAGTATGCATGCATAATCCAAAATATAAAGTAGTTCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	124176	CTCCATCTTGTGGAAGTATGCATGCATAATCCAAAATATAAAGTAGTTCT	124225

BX510997.9	1801	GGTCACACTTTACAATAACATTTCATTAGTTAATGTATTTACTAACAGGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	124226	GGTCACACTTTACAATAACATTTCATTAGTTAATGTATTTACTAACAGGA	124275

BX510997.9	1851	ACTTATTATGAGCAATAGTTGTACAGCATTTATTAATCATAATTCACCAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	124276	ACTTATTATGAGCAATAGTTGTACAGCATTTATTAATCATAATTCACCAT	124325

BX510997.9	1901	TTACTAATGCATTATTAACATCCAAATCCATATTTGTTGACGTTGAGTAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	124326	TTACTAATGCATTATTAACATCCAAATCCATATTTGTTGACGTTGAGTAA	124375

BX510997.9	1951	ACAGTGAACATTTATTTTCGGTAACTAACGTGAACAAATACTGTAATAAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR762381.8	124376	ACAGTGAACATTTATTTTCGGTAACTAACGTGAACAAATACTGTAATAAA	124425

Overview

Query
BX510997.9 - 104617 bps
Hit
CR762381.8 - 124425 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100193120001200011224261244251
283.951313034605546357-1291932421
382.741533809030290681-1292233091
486.3510820851247514541292331201
590.32851244604846171-111280114031
688.41871391851118649116452165891
790.951301915124751437-134066342531
888.721191994616246360134066342601
987.01901609052290681134101342541
1089.52841249803998162150687508101
1190.972133014605546355-155530558281
1284.681813799030390681-155531559021
1388.42233645124751610155532559021
1480.241424036825168653-180828812371
1586.99851469038090525-183714838591
1687.421833024605546356-187083873841
1783.691713799030390681-187085874581
1889.93921505849658645195280954281
1986.621392813485435134-195303955861
2092.961111424622446365-11202651204061
2193.08101131512475137711202771204061
Short-link