<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759942.12	1	GGCCATTCCATCACAGGGCGGGCTCATACACACACACACACACTCACACA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92062	GGCCATTCCATCACAGGGCGGGCTCATACACACACACACACACTCACACA	92111

CR759942.12	51	TATGCTCGCGTGCTCTTTCACTCAGACTGATGACGCTAGACTCAGACTAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92112	TATGCTCGCGTGCTCTTTCACTCAGACTGATGACGCTAGACTCAGACTAG	92161

CR759942.12	101	ATATGCTAATGAACCTAATGTGCACATTTTTGGGATGTGGGAGGAAACTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92162	ATATGCTAATGAACCTAATGTGCACATTTTTGGGATGTGGGAGGAAACTC	92211

CR759942.12	151	AGACAGTGGCTTCCAGGAGAAATAGACTTTTTTCTCATCAACATTATAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92212	AGACAGTGGCTTCCAGGAGAAATAGACTTTTTTCTCATCAACATTATAAC	92261

CR759942.12	201	AAAATGATGTTGAATGAAACAACGTTATTCAAGGGTCTGCTGTACGCAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92262	AAAATGATGTTGAATGAAACAACGTTATTCAAGGGTCTGCTGTACGCAGA	92311

CR759942.12	251	TTTTCCTATTTCTTTAGGTCTTCATTTTTGAAGGCTCTTGTGTCAATAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92312	TTTTCCTATTTCTTTAGGTCTTCATTTTTGAAGGCTCTTGTGTCAATAAA	92361

CR759942.12	301	ATTTGTTTGATTTGTATGCTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92362	ATTTGTTTGATTTGTATGCTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTG	92411

CR759942.12	351	TTGAGACAGAATTTCACTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGTAATGGCGCGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92412	TTGAGACAGAATTTCACTTTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGTAATGGCGCGA	92461

CR759942.12	401	TCTTGGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92462	TCTTGGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCT	92511

CR759942.12	451	TCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACTATGCCCAGCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92512	TCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACTATGCCCAGCT	92561

CR759942.12	501	AATTTCGTATTTTTAGTGGAAATGGGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGCTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92562	AATTTCGTATTTTTAGTGGAAATGGGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGCTG	92611

CR759942.12	551	GTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCAGCTTCAGCCCCCCAAAGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92612	GTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCAGCTTCAGCCCCCCAAAGT	92661

CR759942.12	601	GCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCCCACCCGGCCTGCTTTTCCCTTGTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92662	GCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCCCACCCGGCCTGCTTTTCCCTTGTT	92711

CR759942.12	651	AATCTATCTTTTATTATGAAGTGTCAGCCATGAACCTGGCACTGGGTGGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92712	AATCTATCTTTTATTATGAAGTGTCAGCCATGAACCTGGCACTGGGTGGG	92761

CR759942.12	701	AAAAGATGTTTTTCTGCCCTAGACCTTCCTATAAGTGCTTTTGGGACAAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92762	AAAAGATGTTTTTCTGCCCTAGACCTTCCTATAAGTGCTTTTGGGACAAC	92811

CR759942.12	751	ACTGCAGGAGTCCCCAAAGGTGAAAATTTACCTGCGGGAGTTAATAAAAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92812	ACTGCAGGAGTCCCCAAAGGTGAAAATTTACCTGCGGGAGTTAATAAAAA	92861

CR759942.12	801	CAGGAATCCCCAGGCCTTACCCCAGAGACTGAGATGCTGAGTGCTTTCAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92862	CAGGAATCCCCAGGCCTTACCCCAGAGACTGAGATGCTGAGTGCTTTCAG	92911

CR759942.12	851	AGTCTCCAGAAAAGGGCCCAGGAATTATTATGGGGTGACAGATGTCACAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92912	AGTCTCCAGAAAAGGGCCCAGGAATTATTATGGGGTGACAGATGTCACAG	92961

CR759942.12	901	CTAGATCGTCCTCACATCTATGGAATATTGTGTTATTTAATATTTCCCAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	92962	CTAGATCGTCCTCACATCTATGGAATATTGTGTTATTTAATATTTCCCAG	93011

CR759942.12	951	TTGAATTTGATATTCAGGCAAGTTTGAAAACCACTGGGCCTGAAAATCTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93012	TTGAATTTGATATTCAGGCAAGTTTGAAAACCACTGGGCCTGAAAATCTA	93061

CR759942.12	1001	GCCACAACAGAAACTGAAACTAGGATCTGGGGAAAGTTAACAAGGGGAGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93062	GCCACAACAGAAACTGAAACTAGGATCTGGGGAAAGTTAACAAGGGGAGG	93111

CR759942.12	1051	AGAAAGATTGGAAAGTATTACAAGAAAAACTTGGGATTGTAACGTTCCCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93112	AGAAAGATTGGAAAGTATTACAAGAAAAACTTGGGATTGTAACGTTCCCC	93161

CR759942.12	1101	CCAAACTGGGAAGGTCCCGGAAGACCAAAGACAGTCCAGCTTAATAAGCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93162	CCAAACTGGGAAGGTCCCGGAAGACCAAAGACAGTCCAGCTTAATAAGCA	93211

CR759942.12	1151	GGTGAGTTTAGTAGGACTTAGATACAGGGTACTCCTGGGTGCAGCAGGAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93212	GGTGAGTTTAGTAGGACTTAGATACAGGGTACTCCTGGGTGCAGCAGGAT	93261

CR759942.12	1201	AGCTCTAGAGATCCATGCCGCCTCCTGTCTTTAAACTGTTTCTAAGTTAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93262	AGCTCTAGAGATCCATGCCGCCTCCTGTCTTTAAACTGTTTCTAAGTTAA	93311

CR759942.12	1251	TTTTCTGGCTTTTTGCCTACTGTGTTTGAGCAATGAGACTGTTTTTCTTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93312	TTTTCTGGCTTTTTGCCTACTGTGTTTGAGCAATGAGACTGTTTTTCTTG	93361

CR759942.12	1301	GTAGGTTCTCAGATACTCTCTGGGATGTTTGTGTTCTCAAGGACACCTGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93362	GTAGGTTCTCAGATACTCTCTGGGATGTTTGTGTTCTCAAGGACACCTGC	93411

CR759942.12	1351	TCCTCTGCTGGGCATCGTGGCCTTGGCTCACCACTGGGCCTTCAGGGTTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93412	TCCTCTGCTGGGCATCGTGGCCTTGGCTCACCACTGGGCCTTCAGGGTTC	93461

CR759942.12	1401	AGGCAGTAGACATACACTCTTAAGTGACATGGTGGGTGATCTGTCATGCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93462	AGGCAGTAGACATACACTCTTAAGTGACATGGTGGGTGATCTGTCATGCT	93511

CR759942.12	1451	GCAATCCACCCTGCCTCCCATTTCTTACATTCTTTCTGCCAATCTTGTGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93512	GCAATCCACCCTGCCTCCCATTTCTTACATTCTTTCTGCCAATCTTGTGT	93561

CR759942.12	1501	GAGACTCCTTGAGTAGGGTGGAAGGAAAGAACTATACAGGTCTATAACGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93562	GAGACTCCTTGAGTAGGGTGGAAGGAAAGAACTATACAGGTCTATAACGT	93611

CR759942.12	1551	CTAGCCATGGCTTGCGCATACAGGTCACATCTACAGTATACGTAGGAGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93612	CTAGCCATGGCTTGCGCATACAGGTCACATCTACAGTATACGTAGGAGCA	93661

CR759942.12	1601	CAAAAAGCAGAAGTTAACTACAATTATAATGTCTATTAGCAAAACCTAAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93662	CAAAAAGCAGAAGTTAACTACAATTATAATGTCTATTAGCAAAACCTAAT	93711

CR759942.12	1651	TCCCATGACTAGAGAAGCTGTGTAACCAATTTGAGAATGAGTAAAAGAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93712	TCCCATGACTAGAGAAGCTGTGTAACCAATTTGAGAATGAGTAAAAGAAA	93761

CR759942.12	1701	CCTAATTAGGTTATATCATGGATCTGAGTTGACAAATGGTTTAAAGTACC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93762	CCTAATTAGGTTATATCATGGATCTGAGTTGACAAATGGTTTAAAGTACC	93811

CR759942.12	1751	TCTGACATTACTCTCTTCATCAGGGAAATAGGTGCAACAGTTAGCACCTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93812	TCTGACATTACTCTCTTCATCAGGGAAATAGGTGCAACAGTTAGCACCTA	93861

CR759942.12	1801	GAAAGGCACATTTTGGGTCTTTGTCACGTTGGTGATTGAGCCTCTAGGTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93862	GAAAGGCACATTTTGGGTCTTTGTCACGTTGGTGATTGAGCCTCTAGGTG	93911

CR759942.12	1851	GAGGCAATCCTTAGTGAGCCCGGGTTGCATTATCAGTGCTATTGTACAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93912	GAGGCAATCCTTAGTGAGCCCGGGTTGCATTATCAGTGCTATTGTACAAG	93961

CR759942.12	1901	TCACTCCAGTTCTGTCAGGAGAAAGGCAGAGTATTTTAAGGCATATCATT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	93962	TCACTCCAGTTCTGTCAGGAGAAAGGCAGAGTATTTTAAGGCATATCATT	94011

CR759942.12	1951	ATTATTTTATAGGGAGAGGTATCTGACTGGTTGTTGACTGCTTCTGGAGT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759954.9	94012	ATTATTTTATAGGGAGAGGTATCTGACTGGTTGTTGACTGCTTCTGGAGT	94061

Overview

Query
CR759942.12 - 69422 bps
Hit
CR759954.9 - 94061 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link