<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759960.3	1	GGCCAATTGTAGCTCGAGGACTCCTCTATGGCCTTGCTCAGTGAAGTCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	12317	GGCCAATTGTAGCTCGAGGACTCCTCTATGGCCTTGCTCAGTGAAGTCCT	12366

CR759960.3	51	CAGATGATGCAGGCCTAGGCTGACAACTGGACTGCAACCTTGTGAGAGGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	12367	CAGATGATGCAGGCCTAGGCTGACAACTGGACTGCAACCTTGTGAGAGGC	12416

CR759960.3	101	CCTGAGCCAGAAGCACTCAGGGAAACCTCTCCTGGATTTCTGATCATTGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	12417	CCTGAGCCAGAAGCACTCAGGGAAACCTCTCCTGGATTTCTGATCATTGG	12466

CR759960.3	151	AAACTGTGGGAGATGAGGAATATTTGTTGTTCTGAGCTGCTAAGTTTTAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	12467	AAACTGTGGGAGATGAGGAATATTTGTTGTTCTGAGCTGCTAAGTTTTAC	12516

CR759960.3	201	ATAATTTGTTATGCATAGTAAATAACTAATACATTTTCACAAGACAGGAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	12517	ATAATTTGTTATGCATAGTAAATAACTAATACATTTTCACAAGACAGGAT	12566

CR759960.3	251	GCATTATTACATGTTAATTTGCATTTGCTCTAAATTTATCATCATCATTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	12567	GCATTATTACATGTTAATTTGCATTTGCTCTAAATTTATCATCATCATTA	12616

CR759960.3	301	TTATTATTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	12617	TTATTATTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAG	12666

CR759960.3	351	TGGCATGATCACCATGCACTGCAGTGTCGACCTCCTGGGCTCAAGGGATC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	12667	TGGCATGATCACCATGCACTGCAGTGTCGACCTCCTGGGCTCAAGGGATC	12716

CR759960.3	401	CTCTGACCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTATAGTCATGAACCACCAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	12717	CTCTGACCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTATAGTCATGAACCACCAT	12766

CR759960.3	451	GCCAGGCTAATTTTCTAGTTTTTTTGTAGAGATGAGAGTTTCACCATGTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	12767	GCCAGGCTAATTTTCTAGTTTTTTTGTAGAGATGAGAGTTTCACCATGTT	12816

CR759960.3	501	GCCCAGGCTGATCTTGAACTTCTGGAGTCAACAAGTCTGCCTTCCTCTGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	12817	GCCCAGGCTGATCTTGAACTTCTGGAGTCAACAAGTCTGCCTTCCTCTGC	12866

CR759960.3	551	CTTCCATAGTGCTAGGATGGCAGGCGTGAGCCACCACCCCTGCCTAACTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	12867	CTTCCATAGTGCTAGGATGGCAGGCGTGAGCCACCACCCCTGCCTAACTT	12916

CR759960.3	601	AATTATAAGACATTAAACATGTAACTTAGTTTTAAAAGGAAAGGAGAAGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	12917	AATTATAAGACATTAAACATGTAACTTAGTTTTAAAAGGAAAGGAGAAGT	12966

CR759960.3	651	TCCATGGCTGAAGAGGATGTATTTTATTATCGTTCACAATGATCACTTTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	12967	TCCATGGCTGAAGAGGATGTATTTTATTATCGTTCACAATGATCACTTTA	13016

CR759960.3	701	CTTGAACTTCAATTTCCAACTGTGTCCCAATTAAACACAAAAGGAAGATT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13017	CTTGAACTTCAATTTCCAACTGTGTCCCAATTAAACACAAAAGGAAGATT	13066

CR759960.3	751	CATCCCTTGCTAGAGTGATTCTATGATGGCCCCAACAACCACCTCCTGGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13067	CATCCCTTGCTAGAGTGATTCTATGATGGCCCCAACAACCACCTCCTGGT	13116

CR759960.3	801	CATTCACCTTCCCCCAGTTATTCAACCAACTCTAATGTAGGTGCTGCTGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13117	CATTCACCTTCCCCCAGTTATTCAACCAACTCTAATGTAGGTGCTGCTGT	13166

CR759960.3	851	GAAGGAATTTAGCAGACATAATAAAGGGGCTCAATTAGTTGACTTCAGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13167	GAAGGAATTTAGCAGACATAATAAAGGGGCTCAATTAGTTGACTTCAGGC	13216

CR759960.3	901	TGGGTTTATGCTGCTTGGACTGTCCTAATCAGGAGAGTCCTTGAAAGGAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13217	TGGGTTTATGCTGCTTGGACTGTCCTAATCAGGAGAGTCCTTGAAAGGAC	13266

CR759960.3	951	TGGGTTCTTCCTGAGCATAGAGATTCACAGTGTGAGAGGGATTCAGCATG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13267	TGGGTTCTTCCTGAGCATAGAGATTCACAGTGTGAGAGGGATTCAGCATG	13316

CR759960.3	1001	AGGGGTTTCCTCCACTGTGGGCTTTGAAAATGAAGGGGCTGTGTAGGAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13317	AGGGGTTTCCTCCACTGTGGGCTTTGAAAATGAAGGGGCTGTGTAGGAAA	13366

CR759960.3	1051	CAACACTGGTGGGCACCAGGAATTGAGTACAGCCCTCCCTGTTCTCTACA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13367	CAACACTGGTGGGCACCAGGAATTGAGTACAGCCCTCCCTGTTCTCTACA	13416

CR759960.3	1101	TTGACAGCCAGCAAGGAACAGGGACCTCAGTCTTAAAACTGCAAGAAAGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13417	TTGACAGCCAGCAAGGAACAGGGACCTCAGTCTTAAAACTGCAAGAAAGC	13466

CR759960.3	1151	ACATTCTGCCACCTCTGTATAAGCCTAAAGGAGGATTCAAAATGAAGACT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13467	ACATTCTGCCACCTCTGTATAAGCCTAAAGGAGGATTCAAAATGAAGACT	13516

CR759960.3	1201	CAGATTTGGGAAGCCTGGAACAGAGATTCCATCTACATCATGCCCAGATT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13517	CAGATTTGGGAAGCCTGGAACAGAGATTCCATCTACATCATGCCCAGATT	13566

CR759960.3	1251	TCTGACTAAGGTACTATAAACAGATAAATGGGTGTTTTTTGGCCAGGCGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13567	TCTGACTAAGGTACTATAAACAGATAAATGGGTGTTTTTTGGCCAGGCGT	13616

CR759960.3	1301	GGTGGTGCACTCCTGTAATCCTAACATTTGAGGAGCTGACACAGGAGGAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13617	GGTGGTGCACTCCTGTAATCCTAACATTTGAGGAGCTGACACAGGAGGAT	13666

CR759960.3	1351	CACTTGCAGCCAGGAGTGTGAGACCAGCCCAGGTAATACAGTGAGACACT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13667	CACTTGCAGCCAGGAGTGTGAGACCAGCCCAGGTAATACAGTGAGACACT	13716

CR759960.3	1401	CGTCTCTACACTTTTTTTTTTAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACTTGTCTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13717	CGTCTCTACACTTTTTTTTTTAATTAGCTGGGTGTGGTGGCACTTGTCTG	13766

CR759960.3	1451	CAGTCCTGTCTACTCTGAAGACTGAGGCAGGAGGATTCCTTGAGCCCAGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13767	CAGTCCTGTCTACTCTGAAGACTGAGGCAGGAGGATTCCTTGAGCCCAGG	13816

CR759960.3	1501	AGTTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATCATGTGACTGCACTTCACGCTGGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13817	AGTTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATCATGTGACTGCACTTCACGCTGGA	13866

CR759960.3	1551	TGACAGTTTTTAGAGACTCTGTCTCTAAAAACAAATAAATGAATACAATA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13867	TGACAGTTTTTAGAGACTCTGTCTCTAAAAACAAATAAATGAATACAATA	13916

CR759960.3	1601	AATAAAAACAAATAAATAAATACAATAAATGGGTGTTGTTTAAAGCCAAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13917	AATAAAAACAAATAAATAAATACAATAAATGGGTGTTGTTTAAAGCCAAT	13966

CR759960.3	1651	GTTTGTGATAATTTTTTACACAGTCTTATAAAATTCATACACAGGCTCAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	13967	GTTTGTGATAATTTTTTACACAGTCTTATAAAATTCATACACAGGCTCAA	14016

CR759960.3	1701	CAGACTAATGGAATGAACTGATGAATTGATATATACACTAGTTACATAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	14017	CAGACTAATGGAATGAACTGATGAATTGATATATACACTAGTTACATAAA	14066

CR759960.3	1751	ATAAAATCTGAACTTTTTCAGTGTTTTGCATTTTATAATTATCTGTGATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	14067	ATAAAATCTGAACTTTTTCAGTGTTTTGCATTTTATAATTATCTGTGATG	14116

CR759960.3	1801	CAATTTAATATACTCATATTTCATTCATTCAGTCAACAAAAATTAATTTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	14117	CAATTTAATATACTCATATTTCATTCATTCAGTCAACAAAAATTAATTTA	14166

CR759960.3	1851	GTCCCTACAATGAACCAGGTATCCCCTCATATGCTCACGTGCCTGACATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	14167	GTCCCTACAATGAACCAGGTATCCCCTCATATGCTCACGTGCCTGACATT	14216

CR759960.3	1901	CTAGAAGCTTCACAAGACCAAGGTGGAGCCACTGGAGTGTTTTAGGTGGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	14217	CTAGAAGCTTCACAAGACCAAGGTGGAGCCACTGGAGTGTTTTAGGTGGA	14266

CR759960.3	1951	GAAATGACACACTTTGACTCACATTAGCAGGACCACTATGGAGAGAACAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759943.6	14267	GAAATGACACACTTTGACTCACATTAGCAGGACCACTATGGAGAGAACAG	14316

Overview

Query
CR759960.3 - 97107 bps
Hit
CR759943.6 - 14316 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link