<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759890.6	1	GGCCAACATGATGAAACCCCGTCTCTACTAAAAACACAAAAATCAGCCGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	37764	GGCCAACATGATGAAACCCCGTCTCTACTAAAAACACAAAAATCAGCCGG	37813

CR759890.6	51	GCGTGGTGGCGCATACCTGTAGTCCCAGTTACCTGAGAGGCTGAGGTGGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	37814	GCGTGGTGGCGCATACCTGTAGTCCCAGTTACCTGAGAGGCTGAGGTGGG	37863

CR759890.6	101	AGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATGGCGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	37864	AGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATGGCGC	37913

CR759890.6	151	CACTGCACCACAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACCCTTTCTCAAGAAAAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	37914	CACTGCACCACAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACCCTTTCTCAAGAAAAAA	37963

CR759890.6	201	GAGAAAAAGAAAGACCATGACAGACGCCTCTGCCTTCAAGGTGGCCAACT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	37964	GAGAAAAAGAAAGACCATGACAGACGCCTCTGCCTTCAAGGTGGCCAACT	38013

CR759890.6	251	GGGCACAAAATCTTTCCTCCTTGACTCTTAAGATATTGTTAAAACGTTAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38014	GGGCACAAAATCTTTCCTCCTTGACTCTTAAGATATTGTTAAAACGTTAT	38063

CR759890.6	301	TAGGGGAACTGAAATCCAAATTGTAAAGAAGGATGAGTCCAGTGGTGAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38064	TAGGGGAACTGAAATCCAAATTGTAAAGAAGGATGAGTCCAGTGGTGAAA	38113

CR759890.6	351	ATTTTCCACAAATATTAGAAATAGAAAAAAACCCTTACTGACCTATGAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38114	ATTTTCCACAAATATTAGAAATAGAAAAAAACCCTTACTGACCTATGAAA	38163

CR759890.6	401	GAAGGCAGAAGTCCTAGCGCATAAGAAACGCTAGAGGGGGCTGTAGCCCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38164	GAAGGCAGAAGTCCTAGCGCATAAGAAACGCTAGAGGGGGCTGTAGCCCA	38213

CR759890.6	451	GAGAAAACCAATCAACCTACCAAATAGAGCCCCAGAAAGAAACCTCCTCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38214	GAGAAAACCAATCAACCTACCAAATAGAGCCCCAGAAAGAAACCTCCTCC	38263

CR759890.6	501	TCGCCCCTCCGCCTTCCTCTGTGTTCCTGCCGCTCCTCCATTCCTTCTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38264	TCGCCCCTCCGCCTTCCTCTGTGTTCCTGCCGCTCCTCCATTCCTTCTTT	38313

CR759890.6	551	GGAAGACGCAGCTCCTGCATTCCTTCTTTGGAAGACTCCCCCCTTCACCG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38314	GGAAGACGCAGCTCCTGCATTCCTTCTTTGGAAGACTCCCCCCTTCACCG	38363

CR759890.6	601	AGGTTACCTACCAAATCCGCCATAGGGTGTGGTCCAGGGTCGAGTTATCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38364	AGGTTACCTACCAAATCCGCCATAGGGTGTGGTCCAGGGTCGAGTTATCA	38413

CR759890.6	651	CAGACCTGTCTCCCCAAGGTCCCCGCGTCGCGTTATCTAGGCAGAAGCGC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38414	CAGACCTGTCTCCCCAAGGTCCCCGCGTCGCGTTATCTAGGCAGAAGCGC	38463

CR759890.6	701	TGACCCCGCATCCCTCCCGTCGGGACCCCACGCGCTGCCCCAGTGAAATG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38464	TGACCCCGCATCCCTCCCGTCGGGACCCCACGCGCTGCCCCAGTGAAATG	38513

CR759890.6	751	AAATCCTGGTGCTTGTGGCGTGCGCTGCGCGGTTCCACTCCGCTGTGCCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38514	AAATCCTGGTGCTTGTGGCGTGCGCTGCGCGGTTCCACTCCGCTGTGCCT	38563

CR759890.6	801	TCCTTTCCGCCCGCCCCCGACGGCTGGACGCCCCTCTGTCGATTGGAGCG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38564	TCCTTTCCGCCCGCCCCCGACGGCTGGACGCCCCTCTGTCGATTGGAGCG	38613

CR759890.6	851	GTCCTTAGTGCTACGTGTCCTGGGATCCCCAAAGTTGACCGCCCCCACAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38614	GTCCTTAGTGCTACGTGTCCTGGGATCCCCAAAGTTGACCGCCCCCACAG	38663

CR759890.6	901	GGTGTGCCAAAGCTCATCAAGCGCCATTCCAGTCTCAACCTTTATCTTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38664	GGTGTGCCAAAGCTCATCAAGCGCCATTCCAGTCTCAACCTTTATCTTTT	38713

CR759890.6	951	ACAATTTAAAATTTATTTATTATCCATGTAAGGAGAATAACTGGTACACT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38714	ACAATTTAAAATTTATTTATTATCCATGTAAGGAGAATAACTGGTACACT	38763

CR759890.6	1001	CAGCGCAGTTCTGCATATATATAGGCCATAAAAGGAAATGAAGCTTGCGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38764	CAGCGCAGTTCTGCATATATATAGGCCATAAAAGGAAATGAAGCTTGCGT	38813

CR759890.6	1051	GACACTTTCCGTGAAAGCAATAGTACCGAACTACAAATCAAACTGCATCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38814	GACACTTTCCGTGAAAGCAATAGTACCGAACTACAAATCAAACTGCATCT	38863

CR759890.6	1101	TAGCCGATCTCCTGAAGAAGAGGAAAAGCCTTGCCAAATGCGTCTTCCCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38864	TAGCCGATCTCCTGAAGAAGAGGAAAAGCCTTGCCAAATGCGTCTTCCCA	38913

CR759890.6	1151	GCAGGATGCAAACCTCCTTCAGCAAACACTGAGTAAATCTGGGAGTGCTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38914	GCAGGATGCAAACCTCCTTCAGCAAACACTGAGTAAATCTGGGAGTGCTG	38963

CR759890.6	1201	AGACATAGTACAATGCGAGTTTTCAGTGTAATTGAAAAAATTGAAAAAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	38964	AGACATAGTACAATGCGAGTTTTCAGTGTAATTGAAAAAATTGAAAAAAT	39013

CR759890.6	1251	TGAAAAAAAAATAACTAAATTAAGATTTTCGACTGTTTTCAAGGACAGTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	39014	TGAAAAAAAAATAACTAAATTAAGATTTTCGACTGTTTTCAAGGACAGTA	39063

CR759890.6	1301	CTGAGGCAGCACGTTTGCAGAGTGATATTTTTCAAAAATGCTGTAAGAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	39064	CTGAGGCAGCACGTTTGCAGAGTGATATTTTTCAAAAATGCTGTAAGAAA	39113

CR759890.6	1351	CTATAAAATCAGCTGGAGATATTCTGTTGAAATGTGTTTTTCTACAAAGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	39114	CTATAAAATCAGCTGGAGATATTCTGTTGAAATGTGTTTTTCTACAAAGC	39163

CR759890.6	1401	AGAGTCAAAAATCACACGCTATGTAGTACACAAATAAAGTGGAAGCTGTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	39164	AGAGTCAAAAATCACACGCTATGTAGTACACAAATAAAGTGGAAGCTGTC	39213

CR759890.6	1451	GATACACGTATAAATATAAAGGATTTTTGCTTACACAAAAAATATTCCAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	39214	GATACACGTATAAATATAAAGGATTTTTGCTTACACAAAAAATATTCCAA	39263

CR759890.6	1501	TGTCCCAATATGCAACATTGCTGAACAAATATGGAGCTAAACAAGTGGCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	39264	TGTCCCAATATGCAACATTGCTGAACAAATATGGAGCTAAACAAGTGGCT	39313

CR759890.6	1551	TCTAATGAATTATTCTAATAAATTTTACTCCGATAAATTACATACTTAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	39314	TCTAATGAATTATTCTAATAAATTTTACTCCGATAAATTACATACTTAAA	39363

CR759890.6	1601	ATATTATATTTAAAAACAAACTGGAGAGCTGTAGAAGAAACCCTATTTAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	39364	ATATTATATTTAAAAACAAACTGGAGAGCTGTAGAAGAAACCCTATTTAT	39413

CR759890.6	1651	CCTCATGTGAAGTTTGAGATTTGTTTGTAATTTTTTTTAAATTAATGCAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	39414	CCTCATGTGAAGTTTGAGATTTGTTTGTAATTTTTTTTAAATTAATGCAG	39463

CR759890.6	1701	GAGAGAAGTGCGTCGTTGAAACAACCACCTCGAGTAAAACAGCATTTCTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	39464	GAGAGAAGTGCGTCGTTGAAACAACCACCTCGAGTAAAACAGCATTTCTT	39513

CR759890.6	1751	CTCACCACACAACAAAACAAAAACCCCACTTGCTGCATTTCAGTTTAGAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	39514	CTCACCACACAACAAAACAAAAACCCCACTTGCTGCATTTCAGTTTAGAA	39563

CR759890.6	1801	TTTATTGTGTTCACTTTAAGCAGGGAATGTATCAAAACTCAAAATTTAGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	39564	TTTATTGTGTTCACTTTAAGCAGGGAATGTATCAAAACTCAAAATTTAGC	39613

CR759890.6	1851	AGACGTTTTAATGATTTAAGAACTATTATAGAAAATACTTTTTTTCCAGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	39614	AGACGTTTTAATGATTTAAGAACTATTATAGAAAATACTTTTTTTCCAGG	39663

CR759890.6	1901	AATAAGTTGCTATATCTTAATTACTAAGTAACCCCAATTCCTATTGCTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	39664	AATAAGTTGCTATATCTTAATTACTAAGTAACCCCAATTCCTATTGCTTT	39713

CR759890.6	1951	TAGAACTTCCCAGTTTGCTTCAGAGTTCAACGGCCCAGTGTGCAAAACTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759928.10	39714	TAGAACTTCCCAGTTTGCTTCAGAGTTCAACGGCCCAGTGTGCAAAACTG	39763

Overview

Query
CR759890.6 - 89424 bps
Hit
CR759928.10 - 39763 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link