<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759964.5	1	GGCCATAGAGATGGTCATGATCAAAATCAAGAAAAGAACCAGAGAAAAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	3625	GGCCATAGAGATGGTCATGATCAAAATCAAGAAAAGAACCAGAGAAAAGA	3674

CR759964.5	51	GCACAGAGGGTTTGGCCAACGGGACAGTCAGAAAAATAGGGAGTGGTTCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	3675	GCACAGAGGGTTTGGCCAACGGGACAGTCAGAAAAATAGGGAGTGGTTCT	3724

CR759964.5	101	GGAGGAGACCTGCAGCCTCACCAGCTTTGGGTGTGAGCTCAAGTGAAAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	3725	GGAGGAGACCTGCAGCCTCACCAGCTTTGGGTGTGAGCTCAAGTGAAAAT	3774

CR759964.5	151	ATCCCCTGAGCATAACCATGGTTCCAACTCTTGTGGGGAGGAGGGGTCAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	3775	ATCCCCTGAGCATAACCATGGTTCCAACTCTTGTGGGGAGGAGGGGTCAC	3824

CR759964.5	201	GATGATCAAGCTCAGAACAATTTCTCTTTGATCTCTCAACACACAAGTCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	3825	GATGATCAAGCTCAGAACAATTTCTCTTTGATCTCTCAACACACAAGTCA	3874

CR759964.5	251	GAACTCTTTAGGCTTTGGCTTTCTATCGTTTCCTCAGGATGGAACCTGAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	3875	GAACTCTTTAGGCTTTGGCTTTCTATCGTTTCCTCAGGATGGAACCTGAC	3924

CR759964.5	301	CAGTAGGAGGAAGAATAAGATTATCACAGTTTATAATAATGGAGGGGGTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	3925	CAGTAGGAGGAAGAATAAGATTATCACAGTTTATAATAATGGAGGGGGTA	3974

CR759964.5	351	AAAAATTTCCCCTGAGAATTTGTAATTACACAACTTTCTTTATTTGGATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	3975	AAAAATTTCCCCTGAGAATTTGTAATTACACAACTTTCTTTATTTGGATT	4024

CR759964.5	401	TGTAACTTCAAACTCTACAAACTGAGTAGATCAGAAAATCCTGTTAGACT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4025	TGTAACTTCAAACTCTACAAACTGAGTAGATCAGAAAATCCTGTTAGACT	4074

CR759964.5	451	CACTCAGTGCCCTCCAGTTCTTCATCTTTGGGAAGAGTCTCCCTCCCTAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4075	CACTCAGTGCCCTCCAGTTCTTCATCTTTGGGAAGAGTCTCCCTCCCTAC	4124

CR759964.5	501	TTCTTTGCCTCTTTCAAATGCTATGTGATAAGTTAGAAGAAATTTACTGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4125	TTCTTTGCCTCTTTCAAATGCTATGTGATAAGTTAGAAGAAATTTACTGG	4174

CR759964.5	551	GACAGTGCTACAAATTAAAATCTCAAAATACACCTGGCATCTATGTATTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4175	GACAGTGCTACAAATTAAAATCTCAAAATACACCTGGCATCTATGTATTT	4224

CR759964.5	601	ATGTATTTATGTTTGTCTTTTTTATTTTCCCTTTGTCCTTTATTATTGCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4225	ATGTATTTATGTTTGTCTTTTTTATTTTCCCTTTGTCCTTTATTATTGCA	4274

CR759964.5	651	TGCTTATTAAGTGCCAAACACTATGCTAGTGCCTGTAAATACATCACCAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4275	TGCTTATTAAGTGCCAAACACTATGCTAGTGCCTGTAAATACATCACCAT	4324

CR759964.5	701	TTATTTCTCAAAACAATCCAATGACAACTTAAACTTCTTGCTATATAATG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4325	TTATTTCTCAAAACAATCCAATGACAACTTAAACTTCTTGCTATATAATG	4374

CR759964.5	751	GACTACGTGCCCTGACTGAAAATACACTGTAAAGCTAAGTTATGGACTTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4375	GACTACGTGCCCTGACTGAAAATACACTGTAAAGCTAAGTTATGGACTTC	4424

CR759964.5	801	AAAATCTTCTTAAAAGAGTCAGTGAATTGGCATGAAAGTATGGAATGCTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4425	AAAATCTTCTTAAAAGAGTCAGTGAATTGGCATGAAAGTATGGAATGCTA	4474

CR759964.5	851	AAATTAAAGACTAAATAGGACCCAGGAGGTAAGGGAAGTAATGAAGCCAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4475	AAATTAAAGACTAAATAGGACCCAGGAGGTAAGGGAAGTAATGAAGCCAA	4524

CR759964.5	901	CTTTTGCAAAACCCAAAGAACTTAAGCTTCGGGTATTACAGCTTCAGCTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4525	CTTTTGCAAAACCCAAAGAACTTAAGCTTCGGGTATTACAGCTTCAGCTG	4574

CR759964.5	951	GATCAGCCCAAGGTCATGGGTGGGGAGGAATCACATAAATCTGTAACTTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4575	GATCAGCCCAAGGTCATGGGTGGGGAGGAATCACATAAATCTGTAACTTT	4624

CR759964.5	1001	CAGTGAGAATGTAAACTAAAAATAAACCTGCCCCTCCTCTAAGGAAATGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4625	CAGTGAGAATGTAAACTAAAAATAAACCTGCCCCTCCTCTAAGGAAATGT	4674

CR759964.5	1051	AAGCAAAATTGCCTGTCTCTAAATTTGGTGCAGAGGAGGGTAGAGGGAGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4675	AAGCAAAATTGCCTGTCTCTAAATTTGGTGCAGAGGAGGGTAGAGGGAGT	4724

CR759964.5	1101	ATCCCTTGAGAAATAAATTGTAACCACAACAACCAACAATACCTTACTTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4725	ATCCCTTGAGAAATAAATTGTAACCACAACAACCAACAATACCTTACTTA	4774

CR759964.5	1151	CATGGTTTGTAGCCACAAATCATGCAGTCTAGGTAATTCAAAAGACCGCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4775	CATGGTTTGTAGCCACAAATCATGCAGTCTAGGTAATTCAAAAGACCGCA	4824

CR759964.5	1201	ATCCTATAGTTTAGCTTAAAATAATCCTCAAATTATACAGCATATATATG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4825	ATCCTATAGTTTAGCTTAAAATAATCCTCAAATTATACAGCATATATATG	4874

CR759964.5	1251	TATTAAAACATTAAATTGTACCCCATAAGTATATACAGTAACAATGTTAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4875	TATTAAAACATTAAATTGTACCCCATAAGTATATACAGTAACAATGTTAA	4924

CR759964.5	1301	TAAAATATTTTAATTAAAAATATAATAATAAAATAATCCTCAAATGGTAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4925	TAAAATATTTTAATTAAAAATATAATAATAAAATAATCCTCAAATGGTAA	4974

CR759964.5	1351	TGTCTCCATATGCTTGGAAAAAACATGCAAATTCTCTGTGAAAGATCGTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	4975	TGTCTCCATATGCTTGGAAAAAACATGCAAATTCTCTGTGAAAGATCGTA	5024

CR759964.5	1401	GCTTAATCTGTAATTCCAGAAATTTGGGAGGCCGAGGCAGTAGGATTGCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	5025	GCTTAATCTGTAATTCCAGAAATTTGGGAGGCCGAGGCAGTAGGATTGCC	5074

CR759964.5	1451	TGAGCCCAGAAGGTCAAGGCTGCAGTGAGTTATGCTAGTGCCACTGCAGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	5075	TGAGCCCAGAAGGTCAAGGCTGCAGTGAGTTATGCTAGTGCCACTGCAGC	5124

CR759964.5	1501	CTTGATCTCGACAGATAACATTCCAAGAAAAATAAATTTATAGTCATGAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	5125	CTTGATCTCGACAGATAACATTCCAAGAAAAATAAATTTATAGTCATGAT	5174

CR759964.5	1551	TCTCAAATCATAAGTGAAAACAGACACCCTGAGTGAAAACCAGCAAGGAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	5175	TCTCAAATCATAAGTGAAAACAGACACCCTGAGTGAAAACCAGCAAGGAA	5224

CR759964.5	1601	GAAAACAAAACCAAAAAGCTAGACAGCAGTATCAGATCCTCAAAGACTTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	5225	GAAAACAAAACCAAAAAGCTAGACAGCAGTATCAGATCCTCAAAGACTTT	5274

CR759964.5	1651	AGGTATTGAAATTATTAAATACAGAATATAAGGTAAGTAGGTTTAAATGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	5275	AGGTATTGAAATTATTAAATACAGAATATAAGGTAAGTAGGTTTAAATGT	5324

CR759964.5	1701	ACGTCCTGGCTTTATTTTTAATTTTTTTTATTTTTACTTTTTGTGGTACA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	5325	ACGTCCTGGCTTTATTTTTAATTTTTTTTATTTTTACTTTTTGTGGTACA	5374

CR759964.5	1751	TAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTACATGAGATGTTTTGATACAGGTAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	5375	TAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTACATGAGATGTTTTGATACAGGTAT	5424

CR759964.5	1801	GCAATGTGAAATCAGCACATCGTGGAGAATGGGGTATCTATCCCCTCAAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	5425	GCAATGTGAAATCAGCACATCGTGGAGAATGGGGTATCTATCCCCTCAAG	5474

CR759964.5	1851	CATTTATCCTTTGAGTTACAAAAAATCCAATTACACTCTTTATGTTATTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	5475	CATTTATCCTTTGAGTTACAAAAAATCCAATTACACTCTTTATGTTATTT	5524

CR759964.5	1901	TAATATATACAATTAAGTTATTATTCACTATAGTTACCCTGTTGTGCTAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	5525	TAATATATACAATTAAGTTATTATTCACTATAGTTACCCTGTTGTGCTAT	5574

CR759964.5	1951	CAAAGAGTAGGTCTTATTCATTCTTTTTAATTCATTTGTTTTTTTAAATT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759911.5	5575	CAAAGAGTAGGTCTTATTCATTCTTTTTAATTCATTTGTTTTTTTAAATT	5624

Overview

Query
CR759964.5 - 82838 bps
Hit
CR759911.5 - 5624 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link