<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR774188.4	1	CAAAAGTTTCAAACTACCTTCCCACGTATCCTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	87425	CAAAAGTTTCAAACTACCTTCCCACGTATCCTAAAAAAAAAAAAAAAAAA	87474

CR774188.4	51	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTTCATTTTTAATATATAAAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	87475	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTTCATTTTTAATATATAAAG	87524

CR774188.4	101	ACACTGAAAATTCAACAGTTTAAAAAAATCAATAAAATAGGAAAGTGGAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	87525	ACACTGAAAATTCAACAGTTTAAAAAAATCAATAAAATAGGAAAGTGGAC	87574

CR774188.4	151	AAAACACATGACAAATATTTCTTTTAAAATGATATGTAGATGGGAAGTGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	87575	AAAACACATGACAAATATTTCTTTTAAAATGATATGTAGATGGGAAGTGA	87624

CR774188.4	201	GGACACAAAAATGTGGTCCATATGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	87625	GGACACAAAAATGTGGTCCATATGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGC	87674

CR774188.4	251	GCCACTGCACTCCAGCCGGGGCCACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	87675	GCCACTGCACTCCAGCCGGGGCCACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAA	87724

CR774188.4	301	AAAAGAAAAAAAAAAAATGTGGTCCATATGATTCATCATTGGGGAAATGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	87725	AAAAGAAAAAAAAAAAATGTGGTCCATATGATTCATCATTGGGGAAATGT	87774

CR774188.4	351	AATTAAAACCATTATGAGATATTACTACACCCCTATCAGAATGAATAAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	87775	AATTAAAACCATTATGAGATATTACTACACCCCTATCAGAATGAATAAAA	87824

CR774188.4	401	TAAGAAATAGAAATAACACCACATGCTGGATGTGGAGAAAATGGCTGAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	87825	TAAGAAATAGAAATAACACCACATGCTGGATGTGGAGAAAATGGCTGAAT	87874

CR774188.4	451	CACTCATTGCTGGTGGGAATGTAAAATGGTACAGCCACTCTAGAAACTAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	87875	CACTCATTGCTGGTGGGAATGTAAAATGGTACAGCCACTCTAGAAACTAG	87924

CR774188.4	501	AGTATGGCGAAAAAAAAAAAAAACTAAACATGCCATTGCACTCTAGGGCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	87925	AGTATGGCGAAAAAAAAAAAAAACTAAACATGCCATTGCACTCTAGGGCA	87974

CR774188.4	551	TTTATCCCAGAGAAATGAACACTTAAGTTCACACCGAAATCAGCATACAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	87975	TTTATCCCAGAGAAATGAACACTTAAGTTCACACCGAAATCAGCATACAG	88024

CR774188.4	601	CATATAAAGGTTCGTAGCAGAGCAGAGACCTGAGCAGGAAAAAAAAAAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88025	CATATAAAGGTTCGTAGCAGAGCAGAGACCTGAGCAGGAAAAAAAAAAAA	88074

CR774188.4	651	AAAAAAAAAACCCACTGTCACAGCCAGACAGAATCAGTTCTGGAAACTCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88075	AAAAAAAAAACCCACTGTCACAGCCAGACAGAATCAGTTCTGGAAACTCC	88124

CR774188.4	701	CAAAAGAACTAGAAGCCACCAAGACCGGCAGCCCACCTTGGGCAGTGACA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88125	CAAAAGAACTAGAAGCCACCAAGACCGGCAGCCCACCTTGGGCAGTGACA	88174

CR774188.4	751	GTTTCTGCTCAAGGGAGACACAACCTGAAGAAGGAAAACAAGACCAAAAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88175	GTTTCTGCTCAAGGGAGACACAACCTGAAGAAGGAAAACAAGACCAAAAT	88224

CR774188.4	801	TGAGAAGCAATCTTTTAATCACAGTGTTTGCAAACACATAGCCAGGAAAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88225	TGAGAAGCAATCTTTTAATCACAGTGTTTGCAAACACATAGCCAGGAAAG	88274

CR774188.4	851	AATGTTAGCACAGAGGTCAGAAAGGCAGTCACTCATGGAGCTAGGAAAGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88275	AATGTTAGCACAGAGGTCAGAAAGGCAGTCACTCATGGAGCTAGGAAAGG	88324

CR774188.4	901	GAAGAGGTGTGATGGGAGGGGGCAAGCAAGGCATTTGTGGGACACTGGAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88325	GAAGAGGTGTGATGGGAGGGGGCAAGCAAGGCATTTGTGGGACACTGGAC	88374

CR774188.4	951	AACTGTGCTTCTTGACCTAGGTGGTGCTTGTGTGGTCATAGTCGCTAGTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88375	AACTGTGCTTCTTGACCTAGGTGGTGCTTGTGTGGTCATAGTCGCTAGTT	88424

CR774188.4	1001	AAATATTGTGTACATTTGTAAGTAACTTTTCTGCATATATTTTATATCTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88425	AAATATTGTGTACATTTGTAAGTAACTTTTCTGCATATATTTTATATCTC	88474

CR774188.4	1051	ACAAAAAAAGAAAAGAGATCAGACTCCTCCCAGAAAAACAATGAAAGAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88475	ACAAAAAAAGAAAAGAGATCAGACTCCTCCCAGAAAAACAATGAAAGAAG	88524

CR774188.4	1101	GAGGTGTCACACCAAGATCAGTCAAACCTCCTTCCTACATTTGTAAATCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88525	GAGGTGTCACACCAAGATCAGTCAAACCTCCTTCCTACATTTGTAAATCC	88574

CR774188.4	1151	ATCCAAGCACTAGCTCTGTGACCCTCAGATTCCTCATCTCTATTGAGACT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88575	ATCCAAGCACTAGCTCTGTGACCCTCAGATTCCTCATCTCTATTGAGACT	88624

CR774188.4	1201	CAGCATCTGCAAGAGTTTAAGAACAAGACCATGGGTAGATCATACTGTCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88625	CAGCATCTGCAAGAGTTTAAGAACAAGACCATGGGTAGATCATACTGTCA	88674

CR774188.4	1251	TAAAATAGAATCTGTTTCTTGTGATACAACATGAGGGACCCCACCTCACC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88675	TAAAATAGAATCTGTTTCTTGTGATACAACATGAGGGACCCCACCTCACC	88724

CR774188.4	1301	CCCCAAAATAGGTACTGAACAAAGGTTCCTATTCCCAGAAACCCCCTCTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88725	CCCCAAAATAGGTACTGAACAAAGGTTCCTATTCCCAGAAACCCCCTCTT	88774

CR774188.4	1351	CCATCTTTGGATTCATCCCTGAGATTGCAGAATGCTTCTGGCTGAAGGCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88775	CCATCTTTGGATTCATCCCTGAGATTGCAGAATGCTTCTGGCTGAAGGCA	88824

CR774188.4	1401	AAGCCCCATCTTTATGATTCCCCTCCTCCTTCGTCCACCTCTCCAAGATG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88825	AAGCCCCATCTTTATGATTCCCCTCCTCCTTCGTCCACCTCTCCAAGATG	88874

CR774188.4	1451	TAGGCTTCTCCCTCATGCCTCAGACTCCAGGGCCTGTTCCAGGGTCAGGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88875	TAGGCTTCTCCCTCATGCCTCAGACTCCAGGGCCTGTTCCAGGGTCAGGA	88924

CR774188.4	1501	TCATAGTTCCCTTCTTCAGAGAGGAACTCTTAATGAAGCTGACCCAATTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88925	TCATAGTTCCCTTCTTCAGAGAGGAACTCTTAATGAAGCTGACCCAATTT	88974

CR774188.4	1551	GCTCTGGAGAGCACTGGAGGCACCTGCTAAGCCTCTCCCTTCAGTGGAGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	88975	GCTCTGGAGAGCACTGGAGGCACCTGCTAAGCCTCTCCCTTCAGTGGAGA	89024

CR774188.4	1601	GAAATTCCAGTGGAATCCCAGAGACCCTTGGCAAACCCACTGCAGACCAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	89025	GAAATTCCAGTGGAATCCCAGAGACCCTTGGCAAACCCACTGCAGACCAC	89074

CR774188.4	1651	CCTGCTGAACCCATCTCCACACTCACCACTGCAAGGAAACTTCAAACTGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	89075	CCTGCTGAACCCATCTCCACACTCACCACTGCAAGGAAACTTCAAACTGA	89124

CR774188.4	1701	GTTCTACTAAAAAGCAATTTCGGCTCTTACACTTCCTCTTTAGTGTTCTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	89125	GTTCTACTAAAAAGCAATTTCGGCTCTTACACTTCCTCTTTAGTGTTCTT	89174

CR774188.4	1751	CTAGCTTACTAGGCAAGTAACCACAGTGTGCCTCCATTAATTAATAAATC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	89175	CTAGCTTACTAGGCAAGTAACCACAGTGTGCCTCCATTAATTAATAAATC	89224

CR774188.4	1801	CCCAAAACACTGGTCTTATGAACAGTGTATTGATCAGGGCTCTCCACAGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	89225	CCCAAAACACTGGTCTTATGAACAGTGTATTGATCAGGGCTCTCCACAGA	89274

CR774188.4	1851	AGCAGAATGAATAGGCGACATATATCTCCAGTTGATCTGATGAGGCCCAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	89275	AGCAGAATGAATAGGCGACATATATCTCCAGTTGATCTGATGAGGCCCAC	89324

CR774188.4	1901	TCACATTATGGAGGGCAATGTACATTAGTCAATTCCACTGATTTAAATGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	89325	TCACATTATGGAGGGCAATGTACATTAGTCAATTCCACTGATTTAAATGT	89374

CR774188.4	1951	AAATCATTTTTCGAACACACTCATGGGAATACCTAGAATAATGTTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759890.6	89375	AAATCATTTTTCGAACACACTCATGGGAATACCTAGAATAATGTTTGGCC	89424

Overview

Query
CR774188.4 - 12420 bps
Hit
CR759890.6 - 89424 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link