<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CR774188.4 1 CAAAAGTTTCAAACTACCTTCCCACGTATCCTAAAAAAAAAAAAAAAAAA 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 87425 CAAAAGTTTCAAACTACCTTCCCACGTATCCTAAAAAAAAAAAAAAAAAA 87474 CR774188.4 51 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTTCATTTTTAATATATAAAG 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 87475 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTTCATTTTTAATATATAAAG 87524 CR774188.4 101 ACACTGAAAATTCAACAGTTTAAAAAAATCAATAAAATAGGAAAGTGGAC 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 87525 ACACTGAAAATTCAACAGTTTAAAAAAATCAATAAAATAGGAAAGTGGAC 87574 CR774188.4 151 AAAACACATGACAAATATTTCTTTTAAAATGATATGTAGATGGGAAGTGA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 87575 AAAACACATGACAAATATTTCTTTTAAAATGATATGTAGATGGGAAGTGA 87624 CR774188.4 201 GGACACAAAAATGTGGTCCATATGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGC 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 87625 GGACACAAAAATGTGGTCCATATGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGC 87674 CR774188.4 251 GCCACTGCACTCCAGCCGGGGCCACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 87675 GCCACTGCACTCCAGCCGGGGCCACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAA 87724 CR774188.4 301 AAAAGAAAAAAAAAAAATGTGGTCCATATGATTCATCATTGGGGAAATGT 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 87725 AAAAGAAAAAAAAAAAATGTGGTCCATATGATTCATCATTGGGGAAATGT 87774 CR774188.4 351 AATTAAAACCATTATGAGATATTACTACACCCCTATCAGAATGAATAAAA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 87775 AATTAAAACCATTATGAGATATTACTACACCCCTATCAGAATGAATAAAA 87824 CR774188.4 401 TAAGAAATAGAAATAACACCACATGCTGGATGTGGAGAAAATGGCTGAAT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 87825 TAAGAAATAGAAATAACACCACATGCTGGATGTGGAGAAAATGGCTGAAT 87874 CR774188.4 451 CACTCATTGCTGGTGGGAATGTAAAATGGTACAGCCACTCTAGAAACTAG 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 87875 CACTCATTGCTGGTGGGAATGTAAAATGGTACAGCCACTCTAGAAACTAG 87924 CR774188.4 501 AGTATGGCGAAAAAAAAAAAAAACTAAACATGCCATTGCACTCTAGGGCA 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 87925 AGTATGGCGAAAAAAAAAAAAAACTAAACATGCCATTGCACTCTAGGGCA 87974 CR774188.4 551 TTTATCCCAGAGAAATGAACACTTAAGTTCACACCGAAATCAGCATACAG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 87975 TTTATCCCAGAGAAATGAACACTTAAGTTCACACCGAAATCAGCATACAG 88024 CR774188.4 601 CATATAAAGGTTCGTAGCAGAGCAGAGACCTGAGCAGGAAAAAAAAAAAA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88025 CATATAAAGGTTCGTAGCAGAGCAGAGACCTGAGCAGGAAAAAAAAAAAA 88074 CR774188.4 651 AAAAAAAAAACCCACTGTCACAGCCAGACAGAATCAGTTCTGGAAACTCC 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88075 AAAAAAAAAACCCACTGTCACAGCCAGACAGAATCAGTTCTGGAAACTCC 88124 CR774188.4 701 CAAAAGAACTAGAAGCCACCAAGACCGGCAGCCCACCTTGGGCAGTGACA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88125 CAAAAGAACTAGAAGCCACCAAGACCGGCAGCCCACCTTGGGCAGTGACA 88174 CR774188.4 751 GTTTCTGCTCAAGGGAGACACAACCTGAAGAAGGAAAACAAGACCAAAAT 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88175 GTTTCTGCTCAAGGGAGACACAACCTGAAGAAGGAAAACAAGACCAAAAT 88224 CR774188.4 801 TGAGAAGCAATCTTTTAATCACAGTGTTTGCAAACACATAGCCAGGAAAG 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88225 TGAGAAGCAATCTTTTAATCACAGTGTTTGCAAACACATAGCCAGGAAAG 88274 CR774188.4 851 AATGTTAGCACAGAGGTCAGAAAGGCAGTCACTCATGGAGCTAGGAAAGG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88275 AATGTTAGCACAGAGGTCAGAAAGGCAGTCACTCATGGAGCTAGGAAAGG 88324 CR774188.4 901 GAAGAGGTGTGATGGGAGGGGGCAAGCAAGGCATTTGTGGGACACTGGAC 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88325 GAAGAGGTGTGATGGGAGGGGGCAAGCAAGGCATTTGTGGGACACTGGAC 88374 CR774188.4 951 AACTGTGCTTCTTGACCTAGGTGGTGCTTGTGTGGTCATAGTCGCTAGTT 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88375 AACTGTGCTTCTTGACCTAGGTGGTGCTTGTGTGGTCATAGTCGCTAGTT 88424 CR774188.4 1001 AAATATTGTGTACATTTGTAAGTAACTTTTCTGCATATATTTTATATCTC 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88425 AAATATTGTGTACATTTGTAAGTAACTTTTCTGCATATATTTTATATCTC 88474 CR774188.4 1051 ACAAAAAAAGAAAAGAGATCAGACTCCTCCCAGAAAAACAATGAAAGAAG 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88475 ACAAAAAAAGAAAAGAGATCAGACTCCTCCCAGAAAAACAATGAAAGAAG 88524 CR774188.4 1101 GAGGTGTCACACCAAGATCAGTCAAACCTCCTTCCTACATTTGTAAATCC 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88525 GAGGTGTCACACCAAGATCAGTCAAACCTCCTTCCTACATTTGTAAATCC 88574 CR774188.4 1151 ATCCAAGCACTAGCTCTGTGACCCTCAGATTCCTCATCTCTATTGAGACT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88575 ATCCAAGCACTAGCTCTGTGACCCTCAGATTCCTCATCTCTATTGAGACT 88624 CR774188.4 1201 CAGCATCTGCAAGAGTTTAAGAACAAGACCATGGGTAGATCATACTGTCA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88625 CAGCATCTGCAAGAGTTTAAGAACAAGACCATGGGTAGATCATACTGTCA 88674 CR774188.4 1251 TAAAATAGAATCTGTTTCTTGTGATACAACATGAGGGACCCCACCTCACC 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88675 TAAAATAGAATCTGTTTCTTGTGATACAACATGAGGGACCCCACCTCACC 88724 CR774188.4 1301 CCCCAAAATAGGTACTGAACAAAGGTTCCTATTCCCAGAAACCCCCTCTT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88725 CCCCAAAATAGGTACTGAACAAAGGTTCCTATTCCCAGAAACCCCCTCTT 88774 CR774188.4 1351 CCATCTTTGGATTCATCCCTGAGATTGCAGAATGCTTCTGGCTGAAGGCA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88775 CCATCTTTGGATTCATCCCTGAGATTGCAGAATGCTTCTGGCTGAAGGCA 88824 CR774188.4 1401 AAGCCCCATCTTTATGATTCCCCTCCTCCTTCGTCCACCTCTCCAAGATG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88825 AAGCCCCATCTTTATGATTCCCCTCCTCCTTCGTCCACCTCTCCAAGATG 88874 CR774188.4 1451 TAGGCTTCTCCCTCATGCCTCAGACTCCAGGGCCTGTTCCAGGGTCAGGA 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88875 TAGGCTTCTCCCTCATGCCTCAGACTCCAGGGCCTGTTCCAGGGTCAGGA 88924 CR774188.4 1501 TCATAGTTCCCTTCTTCAGAGAGGAACTCTTAATGAAGCTGACCCAATTT 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88925 TCATAGTTCCCTTCTTCAGAGAGGAACTCTTAATGAAGCTGACCCAATTT 88974 CR774188.4 1551 GCTCTGGAGAGCACTGGAGGCACCTGCTAAGCCTCTCCCTTCAGTGGAGA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 88975 GCTCTGGAGAGCACTGGAGGCACCTGCTAAGCCTCTCCCTTCAGTGGAGA 89024 CR774188.4 1601 GAAATTCCAGTGGAATCCCAGAGACCCTTGGCAAACCCACTGCAGACCAC 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 89025 GAAATTCCAGTGGAATCCCAGAGACCCTTGGCAAACCCACTGCAGACCAC 89074 CR774188.4 1651 CCTGCTGAACCCATCTCCACACTCACCACTGCAAGGAAACTTCAAACTGA 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 89075 CCTGCTGAACCCATCTCCACACTCACCACTGCAAGGAAACTTCAAACTGA 89124 CR774188.4 1701 GTTCTACTAAAAAGCAATTTCGGCTCTTACACTTCCTCTTTAGTGTTCTT 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 89125 GTTCTACTAAAAAGCAATTTCGGCTCTTACACTTCCTCTTTAGTGTTCTT 89174 CR774188.4 1751 CTAGCTTACTAGGCAAGTAACCACAGTGTGCCTCCATTAATTAATAAATC 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 89175 CTAGCTTACTAGGCAAGTAACCACAGTGTGCCTCCATTAATTAATAAATC 89224 CR774188.4 1801 CCCAAAACACTGGTCTTATGAACAGTGTATTGATCAGGGCTCTCCACAGA 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 89225 CCCAAAACACTGGTCTTATGAACAGTGTATTGATCAGGGCTCTCCACAGA 89274 CR774188.4 1851 AGCAGAATGAATAGGCGACATATATCTCCAGTTGATCTGATGAGGCCCAC 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 89275 AGCAGAATGAATAGGCGACATATATCTCCAGTTGATCTGATGAGGCCCAC 89324 CR774188.4 1901 TCACATTATGGAGGGCAATGTACATTAGTCAATTCCACTGATTTAAATGT 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 89325 TCACATTATGGAGGGCAATGTACATTAGTCAATTCCACTGATTTAAATGT 89374 CR774188.4 1951 AAATCATTTTTCGAACACACTCATGGGAATACCTAGAATAATGTTTGGCC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CR759890.6 89375 AAATCATTTTTCGAACACACTCATGGGAATACCTAGAATAATGTTTGGCC 89424