<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX572632.7	1	GAATTCAGGATTCTGCCTGGTGTTAAAGCCTTCTTTAAAGGGTTATTTTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	50770	GAATTCAGGATTCTGCCTGGTGTTAAAGCCTTCTTTAAAGGGTTATTTTC	50819

BX572632.7	51	ACAATTTAATATGGCATAGCAGTCAAAATAGGATAAATGAGCTCATGTAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	50820	ACAATTTAATATGGCATAGCAGTCAAAATAGGATAAATGAGCTCATGTAC	50869

BX572632.7	101	GAGACAAATTCTGGACCTTTATCAGTGAGGGGTGAGTCTTTCGAACCACT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	50870	GAGACAAATTCTGGACCTTTATCAGTGAGGGGTGAGTCTTTCGAACCACT	50919

BX572632.7	151	CCTGGCTACGGGCCTGCAAAGACTAAATACGTTTGGAAGTGTTTGGACGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	50920	CCTGGCTACGGGCCTGCAAAGACTAAATACGTTTGGAAGTGTTTGGACGT	50969

BX572632.7	201	GAGAGTCCTGCGAGTCCAGCGAGTCCTGGGTCTTCCCCGAGTGGGACATG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	50970	GAGAGTCCTGCGAGTCCAGCGAGTCCTGGGTCTTCCCCGAGTGGGACATG	51019

BX572632.7	251	CCAGGAACATCTCCCTAGGTAAGCGTCCAGGAAGCATCCGAAACAGATGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51020	CCAGGAACATCTCCCTAGGTAAGCGTCCAGGAAGCATCCGAAACAGATGC	51069

BX572632.7	301	TTGAGCCACCTCAGCTGACTTCTCTCAATGTGGAGGAGAAGCGTCCTACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51070	TTGAGCCACCTCAGCTGACTTCTCTCAATGTGGAGGAGAAGCGTCCTACT	51119

BX572632.7	351	CCGACCTCCTCCCGGGTGACAGAGCTCCTCACCCCATCTATAAGCGTGCG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51120	CCGACCTCCTCCCGGGTGACAGAGCTCCTCACCCCATCTATAAGCGTGCG	51169

BX572632.7	401	CCCTGCCACCCTGTGAAGGAAACTCATTTCAGCCGCTTGTACCCAAGATC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51170	CCCTGCCACCCTGTGAAGGAAACTCATTTCAGCCGCTTGTACCCAAGATC	51219

BX572632.7	451	TTTTCCTTTCAGTCATGACCCAAAGCTCATGACCATAGGTGAGAGTAGGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51220	TTTTCCTTTCAGTCATGACCCAAAGCTCATGACCATAGGTGAGAGTAGGA	51269

BX572632.7	501	ATGTAGATTGATTGGTAAATTGAGAGCTTATTACCACAACGGACCAGTAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51270	ATGTAGATTGATTGGTAAATTGAGAGCTTATTACCACAACGGACCAGTAC	51319

BX572632.7	551	CTCGACACATTACTGCTGCTGCTGCACTGATCTGTCAATTTCAAGTTCCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51320	CTCGACACATTACTGCTGCTGCTGCACTGATCTGTCAATTTCAAGTTCCA	51369

BX572632.7	601	TCCTTCCCTCACTCATAAACAAAACCCTAAGATGCTTGAACTCCTCCACC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51370	TCCTTCCCTCACTCATAAACAAAACCCTAAGATGCTTGAACTCCTCCACC	51419

BX572632.7	651	TGGAGTAAGGACTTTCCTCCAACCTGAAGATGGCCAACCACCTTTTTCCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51420	TGGAGTAAGGACTTTCCTCCAACCTGAAGATGGCCAACCACCTTTTTCCA	51469

BX572632.7	701	GGGGAGCAGCCTGGCCTCGAACTTGTAGGTGCTGATTCTCATCCCAGCCG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51470	GGGGAGCAGCCTGGCCTCGAACTTGTAGGTGCTGATTCTCATCCCAGCCG	51519

BX572632.7	751	TCTCACACCCGGCAGCAAATGGCCCTAGATGAAGCCAACAGAACGACATC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51520	TCTCACACCCGGCAGCAAATGGCCCTAGATGAAGCCAACAGAACGACATC	51569

BX572632.7	801	GTCTGGGAATAACAGAGATGAGATCCTGTGGTCCCCAAAATGGACCCCTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51570	GTCTGGGAATAACAGAGATGAGATCCTGTGGTCCCCAAAATGGACCCCTT	51619

BX572632.7	851	TGAAATTCTGTCCATAAAATTGTGTGTGTTTAAAGTTTGATAAAAGAAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51620	TGAAATTCTGTCCATAAAATTGTGTGTGTTTAAAGTTTGATAAAAGAAAA	51669

BX572632.7	901	AGAAAAAAAAGTTTAGTCCTAAATAATTGGACTTCTAAGAATATTTAGTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51670	AGAAAAAAAAGTTTAGTCCTAAATAATTGGACTTCTAAGAATATTTAGTG	51719

BX572632.7	951	AATCCGGCCCCTGATGACCGATCAGAATAAACCTGCTGGGATGCAGACAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51720	AATCCGGCCCCTGATGACCGATCAGAATAAACCTGCTGGGATGCAGACAC	51769

BX572632.7	1001	ATCAAGCAACTCCAGCTCAGCAAGCAGTTACTGTTGCTCATATCATAGCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51770	ATCAAGCAACTCCAGCTCAGCAAGCAGTTACTGTTGCTCATATCATAGCC	51819

BX572632.7	1051	TTCAGCCGCTTTCCCTTCATTTTCCACATGCTTCTTTAAAGCCAGACTCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51820	TTCAGCCGCTTTCCCTTCATTTTCCACATGCTTCTTTAAAGCCAGACTCC	51869

BX572632.7	1101	TCCTCGCTGACCCGCTGATGAGAGCTTTAAATGAAATTGATTTCCCCATC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51870	TCCTCGCTGACCCGCTGATGAGAGCTTTAAATGAAATTGATTTCCCCATC	51919

BX572632.7	1151	AGCGAATGACTTTTCTCTGATCGGCTTCAGAATTTATGGAAGAACTTCTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51920	AGCGAATGACTTTTCTCTGATCGGCTTCAGAATTTATGGAAGAACTTCTC	51969

BX572632.7	1201	CACAGGGAGTCAGATTTATGGCGCGCTGTTTATATCTGTCTCCAACACGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	51970	CACAGGGAGTCAGATTTATGGCGCGCTGTTTATATCTGTCTCCAACACGC	52019

BX572632.7	1251	GCAAACACACGCGCGCACTCGCAGCGGTTTGGGCTTGCTAACTTTCAAAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	52020	GCAAACACACGCGCGCACTCGCAGCGGTTTGGGCTTGCTAACTTTCAAAG	52069

BX572632.7	1301	CCGTCTTTGAGTGCTTGTAATCCATTACTCTGGAAAGTACAGACCATTTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	52070	CCGTCTTTGAGTGCTTGTAATCCATTACTCTGGAAAGTACAGACCATTTG	52119

BX572632.7	1351	AAGGGTCTAAATGGAACTATTCAAAGTTCACAGCAGGAAAAAAGCTTTCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	52120	AAGGGTCTAAATGGAACTATTCAAAGTTCACAGCAGGAAAAAAGCTTTCT	52169

BX572632.7	1401	AGCAAATAATAAGCTGCAGAACATGTAGACGGCGTTTATGGACTGGAGAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	52170	AGCAAATAATAAGCTGCAGAACATGTAGACGGCGTTTATGGACTGGAGAC	52219

BX572632.7	1451	TCTTATGGATTAGACTGATTACAAGAAGGACAAAAACTGTGATGGGGTTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	52220	TCTTATGGATTAGACTGATTACAAGAAGGACAAAAACTGTGATGGGGTTC	52269

BX572632.7	1501	ATGGATTTCATAATAAAAAAAAAAATCATAAATACACTCACAGGCCACTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	52270	ATGGATTTCATAATAAAAAAAAAAATCATAAATACACTCACAGGCCACTT	52319

BX572632.7	1551	TATTAGGTACACCTAACTTAGTACCGGGTTGGACCTCCTTTTTTCTTCAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	52320	TATTAGGTACACCTAACTTAGTACCGGGTTGGACCTCCTTTTTTCTTCAG	52369

BX572632.7	1601	AACTGCCTTAATTCTTTATGGTATAGATTCAACGAAGTACTGGACATATT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	52370	AACTGCCTTAATTCTTTATGGTATAGATTCAACGAAGTACTGGACATATT	52419

BX572632.7	1651	CCTCTGAGATTTTGGTCCATATCCACTGCTGTGTTATTGCATTGCGTTCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	52420	CCTCTGAGATTTTGGTCCATATCCACTGCTGTGTTATTGCATTGCGTTCA	52469

BX572632.7	1701	AAGAAAATCCTGTCTAACTGTGTATTCTGTTGTTTCTGTGTGTTCACGTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	52470	AAGAAAATCCTGTCTAACTGTGTATTCTGTTGTTTCTGTGTGTTCACGTT	52519

BX572632.7	1751	ATCCATCCGCCATTCATATCGTACCGTTCCACTTCTCAATTTTGTTCATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	52520	ATCCATCCGCCATTCATATCGTACCGTTCCACTTCTCAATTTTGTTCATT	52569

BX572632.7	1801	TACGTTGTTTACAAGTCTCGGACGAAGCAGACAGATAAGCATGTCATGTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	52570	TACGTTGTTTACAAGTCTCGGACGAAGCAGACAGATAAGCATGTCATGTG	52619

BX572632.7	1851	TAAGACTACTCTTGTGTATATTACACTAGGTTTGGGGCGAGCGGCACCCC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	52620	TAAGACTACTCTTGTGTATATTACACTAGGTTTGGGGCGAGCGGCACCCC	52669

BX572632.7	1901	TTGTAGTTCTAGATAGGTACCCTTGGACCCTTCAAACAATGTGAAGGAGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	52670	TTGTAGTTCTAGATAGGTACCCTTGGACCCTTCAAACAATGTGAAGGAGA	52719

BX572632.7	1951	AGGGCTTCTAAATGTACCCCTAAGAAATGGCACAGCTCTACAACCCCTGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759825.7	52720	AGGGCTTCTAAATGTACCCCTAAGAAATGGCACAGCTCTACAACCCCTGC	52769

Overview

Query
BX572632.7 - 162716 bps
Hit
CR759825.7 - 52769 bps
Total alignments
27
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001991200012000150770527691
289.06129192270128921834685371
397.1248104152895152998-1883289351
4100459342180422721883289241
597.12481041528951529981883289351
697.12521044216942272-1883589381
780.161475235187052392-111385119031
885.42084569130191756111387118381
989.071061835389054072111691118731
1078.32934933108731579-135271357591
1181.191515185041650933-135271357591
1286.78841785221552392-135271354441
1385.84461163738537500135271353901
1480.521475309130491833135276357731
1588.2921733761537787135512356891
1687.97651292462624754135545356771
1789.741121955389954093135565357591
1810046944217942272143849439421
1999.0146101152895152995143850439501
2010045934218042272-143879439711
2196.8556128152879153006-143944440701
2297.5659122152894153015143951440731
2310045934218042272-143973440651
2410046944218042273143974440671
2582.171664248217882601147703481171
2693.7550112152894153005-150444505551
2796.4655113152894153006-150495506071
Short-link