<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR933862.6	1	GGGACAGATATTGTACAAGGATGAGGGAATGGCCTGAGCCAGAAATGCCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	100783	GGGACAGATATTGTACAAGGATGAGGGAATGGCCTGAGCCAGAAATGCCC	100832

CR933862.6	51	CGGTTTGGAATGGGGCCCCGGGATGGGCCCCTCATGGTGTTTCCTGAAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	100833	CGGTTTGGAATGGGGCCCCGGGATGGGCCCCTCATGGTGTTTCCTGAAAT	100882

CR933862.6	101	CAGGTTCCCATCTTTATCAAACTTAGAGTGACACTGATTAGCCCAATGTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	100883	CAGGTTCCCATCTTTATCAAACTTAGAGTGACACTGATTAGCCCAATGTT	100932

CR933862.6	151	TTCCTTTTTTGCATTTTGGACATATTTCAGGCTCAGTAGTTTTCTTTTTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	100933	TTCCTTTTTTGCATTTTGGACATATTTCAGGCTCAGTAGTTTTCTTTTTT	100982

CR933862.6	201	TCCCCTATATGGTGGCCTGACTTGCTGATTTTTTCTACATTGTTTTTTAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	100983	TCCCCTATATGGTGGCCTGACTTGCTGATTTTTTCTACATTGTTTTTTAG	101032

CR933862.6	251	TGTGATCATGCTTCAAACAGTTAAAACAAGCTCCAGGAAATGGAGTATTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101033	TGTGATCATGCTTCAAACAGTTAAAACAAGCTCCAGGAAATGGAGTATTT	101082

CR933862.6	301	CCTTTATCCACTCTCAGTCCTGCCATTGCCTGTGCCAACAAAGTAGCTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101083	CCTTTATCCACTCTCAGTCCTGCCATTGCCTGTGCCAACAAAGTAGCTTT	101132

CR933862.6	351	ATGCAGATTACCTCCGATACCGTCACAGGCCTTGATATAATCAACTAAAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101133	ATGCAGATTACCTCCGATACCGTCACAGGCCTTGATATAATCAACTAAAT	101182

CR933862.6	401	GTGCTTTCCCTCTAATAGGTCGCAAAGCAGCCTGGCAATCGAGATTAACA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101183	GTGCTTTCCCTCTAATAGGTCGCAAAGCAGCCTGGCAATCGAGATTAACA	101232

CR933862.6	451	TTGCCAAAAGCTAATAACTGCAACACTATATCCTGAGCAGCTGAATCTGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101233	TTGCCAAAAGCTAATAACTGCAACACTATATCCTGAGCAGCTGAATCTGA	101282

CR933862.6	501	AATCACCTTTTTAAGAGACTCCTGTCTTAAGAGATTCCAAGCTATAAAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101283	AATCACCTTTTTAAGAGACTCCTGTCTTAAGAGATTCCAAGCTATAAAAT	101332

CR933862.6	551	CTGCATACAGTTCTTTTGGTCCCTGTTTTACAGCACTAAAGGAAGGGTAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101333	CTGCATACAGTTCTTTTGGTCCCTGTTTTACAGCACTAAAGGAAGGGTAT	101382

CR933862.6	601	TGTTCTCCACCTGAAGTGATTTTTTCCCAAGCTCTAATGCACACTCCTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101383	TGTTCTCCACCTGAAGTGATTTTTTCCCAAGCTCTAATGCACACTCCTCT	101432

CR933862.6	651	AAGCTGCTCTATGGCATCATCCTGTATGACCACTTGTGCGTCTAAACCAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101433	AAGCTGCTCTATGGCATCATCCTGTATGACCACTTGTGCGTCTAAACCAG	101482

CR933862.6	701	CCCAGCAGCCGACCCCCAAAAGTTGGTCCATGTTATATTAATTTGAGTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101483	CCCAGCAGCCGACCCCCAAAAGTTGGTCCATGTTATATTAATTTGAGTTT	101532

CR933862.6	751	GGGCCTGGGCATTGCAAGCAGCCTGAATGGAAGCTTCATCTGCCCACCAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101533	GGGCCTGGGCATTGCAAGCAGCCTGAATGGAAGCTTCATCTGCCCACCAA	101582

CR933862.6	801	GTTTTAAATTGTAAGAATTGAGCAGGACTTAGACAAGCTCAAATAAGAGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101583	GTTTTAAATTGTAAGAATTGAGCAGGACTTAGACAAGCTCAAATAAGAGT	101632

CR933862.6	851	GTCCCCGTCAGTAGGAATCATCCGACTGGAAACAGCAACATTCTTTAACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101633	GTCCCCGTCAGTAGGAATCATCCGACTGGAAACAGCAACATTCTTTAACA	101682

CR933862.6	901	GTCCCATTACAAAAGGAGAACCTGGTCCATACTGATTAATAGCTTGTTTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101683	GTCCCATTACAAAAGGAGAACCTGGTCCATACTGATTAATAGCTTGTTTA	101732

CR933862.6	951	AATTATTTGAGTAATTTAAAAGGAAAAGGCTCAAATGTAGCTATAATATT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101733	AATTATTTGAGTAATTTAAAAGGAAAAGGCTCAAATGTAGCTATAATATT	101782

CR933862.6	1001	TCCCTGTTGATCAGGTGGTGTATTCTAACAGGGAACTGCCAAGCCTCTAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101783	TCCCTGTTGATCAGGTGGTGTATTCTAACAGGGAACTGCCAAGCCTCTAT	101832

CR933862.6	1051	ATCACCCTCTCGTCTAGCCTGCTGAACTCCTGCCTGAATAGAACTGACAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101833	ATCACCCTCTCGTCTAGCCTGCTGAACTCCTGCCTGAATAGAACTGACAG	101882

CR933862.6	1101	CAGTCGCTCGAGGTGCTGCTCAGTCACTGGGGCAACTACTTTTCGCCCAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101883	CAGTCGCTCGAGGTGCTGCTCAGTCACTGGGGCAACTACTTTTCGCCCAG	101932

CR933862.6	1151	TGTCCTCCAGAAAAGAAAGATCTGGAGGGTCTGGCCACTCTTTTTCTTCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101933	TGTCCTCCAGAAAAGAAAGATCTGGAGGGTCTGGCCACTCTTTTTCTTCA	101982

CR933862.6	1201	AAATAATAATGAGGGGGTGCAGAAGGGTAGGGATGAACCTCTTCCTCCTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	101983	AAATAATAATGAGGGGGTGCAGAAGGGTAGGGATGAACCTCTTCCTCCTG	102032

CR933862.6	1251	TGCCGCTTTAGCTTTAGCTGGCAAATAAACCTGCTCTGTAACCTCTTCTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	102033	TGCCGCTTTAGCTTTAGCTGGCAAATAAACCTGCTCTGTAACCTCTTCTG	102082

CR933862.6	1301	TTACTTCGTCATACTCTCCTTCCTCCTCATCATCAGTGTGAAAAAGTTCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	102083	TTACTTCGTCATACTCTCCTTCCTCCTCATCATCAGTGTGAAAAAGTTCC	102132

CR933862.6	1351	AAGGTGGAACGAACCAGAGCCCACACTTGTCCCATTGTTACCCGATGCTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	102133	AAGGTGGAACGAACCAGAGCCCACACTTGTCCCATTGTTACCCGATGCTT	102182

CR933862.6	1401	CCAAGCTCCCCATCTTACTCACTACGAGGATTGCTTAAGAGTACTTGGGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	102183	CCAAGCTCCCCATCTTACTCACTACGAGGATTGCTTAAGAGTACTTGGGT	102232

CR933862.6	1451	GTCCTCCAGCTTAGTTCCCCATTCTCCAACTGTTGCTCTGGCGACCCTTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	102233	GTCCTCCAGCTTAGTTCCCCATTCTCCAACTGTTGCTCTGGCGACCCTTC	102282

CR933862.6	1501	AACCTGGATTCGAGCCCCCACGTATGGGTGCTGCTTACTGAGACCAGCTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	102283	AACCTGGATTCGAGCCCCCACGTATGGGTGCTGCTTACTGAGACCAGCTT	102332

CR933862.6	1551	GGTGGGGGAGACCCTAACCCAGCAGAGCTAGAGGAATTAAAGATACACAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	102333	GGTGGGGGAGACCCTAACCCAGCAGAGCTAGAGGAATTAAAGATACACAC	102382

CR933862.6	1601	ACAGAAATATAGAGGTGTGGAGTGGGAAATCAGGGGTTTCACAGCCTTCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	102383	ACAGAAATATAGAGGTGTGGAGTGGGAAATCAGGGGTTTCACAGCCTTCA	102432

CR933862.6	1651	GAGCCAAGAGCCTTGAACAGAGATTTACCCATGTATTTATTGACAGCAAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	102433	GAGCCAAGAGCCTTGAACAGAGATTTACCCATGTATTTATTGACAGCAAG	102482

CR933862.6	1701	CCAGTGATAAGCATTGTTTCTATAGATTATAGATTAACTAAAAGTATTCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	102483	CCAGTGATAAGCATTGTTTCTATAGATTATAGATTAACTAAAAGTATTCC	102532

CR933862.6	1751	TTACAGGAAACAAAGGGATGGGCTGAAATGAAGGGATGGGCTCTGGCTAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	102533	TTACAGGAAACAAAGGGATGGGCTGAAATGAAGGGATGGGCTCTGGCTAG	102582

CR933862.6	1801	TTATCTGCAGCAGGAGCATGTCCTTAAGGCACAGATTGCTCACGCTACTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	102583	TTATCTGCAGCAGGAGCATGTCCTTAAGGCACAGATTGCTCACGCTACTG	102632

CR933862.6	1851	TTTGTGGTTTAAGAACACCTTTAAGTGGTTTTCCACTCTGGGTGGGCCAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	102633	TTTGTGGTTTAAGAACACCTTTAAGTGGTTTTCCACTCTGGGTGGGCCAG	102682

CR933862.6	1901	GTGTTCCTTGCCCCCATTCCGGTAAACCCACAACCTTCCAGTGTGGGCAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	102683	GTGTTCCTTGCCCCCATTCCGGTAAACCCACAACCTTCCAGTGTGGGCAT	102732

CR933862.6	1951	CATGGCCATCACGAACATGTCACAGTGCTGCAGAGATTTTGTTTATGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759815.3	102733	CATGGCCATCACGAACATGTCACAGTGCTGCAGAGATTTTGTTTATGGCC	102782

Overview

Query
CR933862.6 - 27769 bps
Hit
CR759815.3 - 102782 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link