<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759838.4	1	GGCCAACATGGTAAAACCCGGTCTCTACTAAAAATATGAAAATTAGCCAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	19234	GGCCAACATGGTAAAACCCGGTCTCTACTAAAAATATGAAAATTAGCCAG	19283

CR759838.4	51	GCTTGGTGGCAAGCGCCTGTAGTCTCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	19284	GCTTGGTGGCAAGCGCCTGTAGTCTCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGG	19333

CR759838.4	101	AGAATCACTTGAACCTGGGAGACAAAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	19334	AGAATCACTTGAACCTGGGAGACAAAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCAC	19383

CR759838.4	151	CACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAAGAGCAAAGCTCCATCTCAAAAAAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	19384	CACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAAGAGCAAAGCTCCATCTCAAAAAAAA	19433

CR759838.4	201	AAAAAAAAAAAAAGAAGACCTGGCGGTTAAGGGATAGTGAGCTGGGAGTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	19434	AAAAAAAAAAAAAGAAGACCTGGCGGTTAAGGGATAGTGAGCTGGGAGTC	19483

CR759838.4	251	AGAAAGTCAGGGCTAGGGATATGGGGCAGGAGTGAGGTAGGGCATAGGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	19484	AGAAAGTCAGGGCTAGGGATATGGGGCAGGAGTGAGGTAGGGCATAGGGA	19533

CR759838.4	301	GATATGGAAATGAAGATGGGAGATGGAGACAGAGAGGAGGGAAAAAAACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	19534	GATATGGAAATGAAGATGGGAGATGGAGACAGAGAGGAGGGAAAAAAACA	19583

CR759838.4	351	GGGTCAGGGAGACAGAGTAGGGGACCCAGGAGCTATTCAGTTGAGCAAGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	19584	GGGTCAGGGAGACAGAGTAGGGGACCCAGGAGCTATTCAGTTGAGCAAGG	19633

CR759838.4	401	GGGCATTCAGGAAATAGTAGAATCTGTGCTGAAGAAGGAGGAAGGCTGAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	19634	GGGCATTCAGGAAATAGTAGAATCTGTGCTGAAGAAGGAGGAAGGCTGAG	19683

CR759838.4	451	AAAACAGCTGGTTTCTTTAACAACCAACCACTTGCTAATATGGTTGGCAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	19684	AAAACAGCTGGTTTCTTTAACAACCAACCACTTGCTAATATGGTTGGCAT	19733

CR759838.4	501	AGGCATTCCCCGGCTGCAGCCTAAATGTATGAATGCAGAGTTAGAGGTGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	19734	AGGCATTCCCCGGCTGCAGCCTAAATGTATGAATGCAGAGTTAGAGGTGG	19783

CR759838.4	551	GTGGGTATTTCTGAGAGAGGAATGTTGACTGCATTTGGATATACGCTGAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	19784	GTGGGTATTTCTGAGAGAGGAATGTTGACTGCATTTGGATATACGCTGAG	19833

CR759838.4	601	AATTGTGTGTGGATGAATCAGTAGGCAAAATACATTTGGGGTGGCCCATC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	19834	AATTGTGTGTGGATGAATCAGTAGGCAAAATACATTTGGGGTGGCCCATC	19883

CR759838.4	651	ATACCTGCACAAGACGACTTTGATATCCTAGAAGAGAAAGAGAAACAGCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	19884	ATACCTGCACAAGACGACTTTGATATCCTAGAAGAGAAAGAGAAACAGCA	19933

CR759838.4	701	CAGCCTCAGCACTTGGCTGATTCCCAGGAGCCAAGGAGGAGATACAGAGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	19934	CAGCCTCAGCACTTGGCTGATTCCCAGGAGCCAAGGAGGAGATACAGAGC	19983

CR759838.4	751	CTGCTGGGTGTGGGGCAGAGCAGGAGGAGTAAGAACCCCTCCAAGTCTCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	19984	CTGCTGGGTGTGGGGCAGAGCAGGAGGAGTAAGAACCCCTCCAAGTCTCT	20033

CR759838.4	801	CTTACCCCATCCTCCTCCCCTCTCCCCACCACGAAGGGCTTCTCCAAGAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20034	CTTACCCCATCCTCCTCCCCTCTCCCCACCACGAAGGGCTTCTCCAAGAA	20083

CR759838.4	851	GCACTGCTCTGCCAGTAAGCAGAAAAGTGTTTTGACCTCAAGAAGAACTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20084	GCACTGCTCTGCCAGTAAGCAGAAAAGTGTTTTGACCTCAAGAAGAACTG	20133

CR759838.4	901	AGTGAAGAAGAGAAGAGTGAGATTTAGAAGATGAATTTGGCTCTGAGACT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20134	AGTGAAGAAGAGAAGAGTGAGATTTAGAAGATGAATTTGGCTCTGAGACT	20183

CR759838.4	951	GAACAAGGGAGCCTGCTAGCCAGGGCAGGAGAAAGGCTAGAATGGCTTTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20184	GAACAAGGGAGCCTGCTAGCCAGGGCAGGAGAAAGGCTAGAATGGCTTTG	20233

CR759838.4	1001	CATGATCTTTCTTAAAATAAATAAATAGGTTTTTGAACCTGTGGGAGAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20234	CATGATCTTTCTTAAAATAAATAAATAGGTTTTTGAACCTGTGGGAGAAT	20283

CR759838.4	1051	AGATGACTTGAGGAGGAATCATCTCAGCTTGTTTTAAGCACCAGCTAGAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20284	AGATGACTTGAGGAGGAATCATCTCAGCTTGTTTTAAGCACCAGCTAGAC	20333

CR759838.4	1101	TTGCACTGTCCAATATGGTAGCCACCAACCACATGTGGCTACTGAACATT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20334	TTGCACTGTCCAATATGGTAGCCACCAACCACATGTGGCTACTGAACATT	20383

CR759838.4	1151	GGAAATTGTGGCTAGTGTGACAAAGAACTGAATTTTTAATTTCATTTTTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20384	GGAAATTGTGGCTAGTGTGACAAAGAACTGAATTTTTAATTTCATTTTTA	20433

CR759838.4	1201	CTAATTCAAATTTAAATTAAAAATAGAGGCCAGGCACGGTGGTTCACGCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20434	CTAATTCAAATTTAAATTAAAAATAGAGGCCAGGCACGGTGGTTCACGCC	20483

CR759838.4	1251	TGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCAGATCACTTGAGGTCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20484	TGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCAGATCACTTGAGGTCA	20533

CR759838.4	1301	GGAGTTCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTAAAACCCCGTGTCTGCTAAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20534	GGAGTTCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTAAAACCCCGTGTCTGCTAAG	20583

CR759838.4	1351	AATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGGGGACCTGTAATCCCAGCTAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20584	AATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGGGGACCTGTAATCCCAGCTAC	20633

CR759838.4	1401	TTGGGACTTGGGCCTAGGAGGCGGAAGTTGTAGTGTGCCAAAATCGCGCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20634	TTGGGACTTGGGCCTAGGAGGCGGAAGTTGTAGTGTGCCAAAATCGCGCC	20683

CR759838.4	1451	ACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGATTCCATCTCAAAAAATAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20684	ACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGATTCCATCTCAAAAAATAAA	20733

CR759838.4	1501	ATAAAATAAATAGAAGAAGGGTAAAGTACTTTTTCCATTAAACACAACTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20734	ATAAAATAAATAGAAGAAGGGTAAAGTACTTTTTCCATTAAACACAACTT	20783

CR759838.4	1551	TATTGATTTGGTAAGACTATATTTTACTTTAACAATTGACAATTTAGCAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20784	TATTGATTTGGTAAGACTATATTTTACTTTAACAATTGACAATTTAGCAT	20833

CR759838.4	1601	CTGAATTGAGATGTGCCAAAGTGAAAAATATACACACAATTTCAAAGACT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20834	CTGAATTGAGATGTGCCAAAGTGAAAAATATACACACAATTTCAAAGACT	20883

CR759838.4	1651	CAGTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCACCAAAAACCCAGAATGTGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20884	CAGTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCACCAAAAACCCAGAATGTGA	20933

CR759838.4	1701	AATATCTCATTAATACTTTTAAAATATTCATTACAGGCTGAAAGGATAAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20934	AATATCTCATTAATACTTTTAAAATATTCATTACAGGCTGAAAGGATAAT	20983

CR759838.4	1751	ATTTCAGATATATTGAGTTAAAATATTTTATTAAAATTAATTTCACTTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	20984	ATTTCAGATATATTGAGTTAAAATATTTTATTAAAATTAATTTCACTTTT	21033

CR759838.4	1801	ATCATTTTAATGTGACTAACCAGAAAAATTTGTAATTCCATATGTGGCTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	21034	ATCATTTTAATGTGACTAACCAGAAAAATTTGTAATTCCATATGTGGCTG	21083

CR759838.4	1851	AAACTACATTTCTAAATCACACATGTGGCCAGAATTATATTTATGAATTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	21084	AAACTACATTTCTAAATCACACATGTGGCCAGAATTATATTTATGAATTA	21133

CR759838.4	1901	CATATGTGGCTCACATTTTCATTCTAATACATGCGGCTCACATATTGCTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	21134	CATATGTGGCTCACATTTTCATTCTAATACATGCGGCTCACATATTGCTA	21183

CR759838.4	1951	TTGGACAGCACTGGGCTAGAGGTAGGATGGTTGGGGCAATCTCAGGTATT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759801.4	21184	TTGGACAGCACTGGGCTAGAGGTAGGATGGTTGGGGCAATCTCAGGTATT	21233

Overview

Query
CR759838.4 - 104924 bps
Hit
CR759801.4 - 21233 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link