<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR925796.6	1	ATGATAACAGCTAACAGTGATGACCAACAATGGACTGGACAGCCTCAGGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	43163	ATGATAACAGCTAACAGTGATGACCAACAATGGACTGGACAGCCTCAGGA	43212

CR925796.6	51	AGTACTGAGCTCTCTGTTACCAGGTGTTCCAACTGTGTGGGACCAATGCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	43213	AGTACTGAGCTCTCTGTTACCAGGTGTTCCAACTGTGTGGGACCAATGCT	43262

CR925796.6	101	TGCTGGAGATGCTGCAGAGACCTCAGTGCCCAGTGTCAAGCAGGCTAAGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	43263	TGCTGGAGATGCTGCAGAGACCTCAGTGCCCAGTGTCAAGCAGGCTAAGA	43312

CR925796.6	151	AAGCCTTTACAGCAGCTTCAGGTACCCAGCCATCTGGACTCAACCAATGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	43313	AAGCCTTTACAGCAGCTTCAGGTACCCAGCCATCTGGACTCAACCAATGA	43362

CR925796.6	201	TCACCTGGAACTTCCTCCAGGAGGTGAGCCCTGCCCCCCTGTCCTGCCCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	43363	TCACCTGGAACTTCCTCCAGGAGGTGAGCCCTGCCCCCCTGTCCTGCCCA	43412

CR925796.6	251	CTCAGTCCCCTCCTGGAGCCTGGCATCTCTCTCACCGTGGGGATGAACTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	43413	CTCAGTCCCCTCCTGGAGCCTGGCATCTCTCTCACCGTGGGGATGAACTG	43462

CR925796.6	301	AATTTCATAGGCATCCACGGGGCCAGGAGCCGGGGTCCACTCTGTCCGAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	43463	AATTTCATAGGCATCCACGGGGCCAGGAGCCGGGGTCCACTCTGTCCGAA	43512

CR925796.6	351	CTGTTGTCTCCTCCAAGAGATGCATCCTCATGCCCTCAATGGTTGGCACC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	43513	CTGTTGTCTCCTCCAAGAGATGCATCCTCATGCCCTCAATGGTTGGCACC	43562

CR925796.6	401	TCTGCCCAAGAGAATGGGTTAGGGAAAGCTGGTTAGCACAAGGCAACCAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	43563	TCTGCCCAAGAGAATGGGTTAGGGAAAGCTGGTTAGCACAAGGCAACCAC	43612

CR925796.6	451	CCCCACCCACAGCCCCTTTTACTCAGGGACATCGAAGAGGCCCATCCTAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	43613	CCCCACCCACAGCCCCTTTTACTCAGGGACATCGAAGAGGCCCATCCTAA	43662

CR925796.6	501	CTCCCACTCCTCTCTGCTAGTGGAGAATAGCTGACAGAGGGCTGAACGGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	43663	CTCCCACTCCTCTCTGCTAGTGGAGAATAGCTGACAGAGGGCTGAACGGG	43712

CR925796.6	551	GCTTGGATCGCCTTCACCTTCTCTCCATCTTCAGGAGCACAGAATCTCCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	43713	GCTTGGATCGCCTTCACCTTCTCTCCATCTTCAGGAGCACAGAATCTCCC	43762

CR925796.6	601	TAAATGCAACTAAATGGGCCCCAACCTGCTCCTCAGAGATCTGAAGGCCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	43763	TAAATGCAACTAAATGGGCCCCAACCTGCTCCTCAGAGATCTGAAGGCCA	43812

CR925796.6	651	GTCCTGCCCACTGGAAAGCCCCACCCCTGTGGTTCTGCTGCCCCTGGTGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	43813	GTCCTGCCCACTGGAAAGCCCCACCCCTGTGGTTCTGCTGCCCCTGGTGG	43862

CR925796.6	701	GCACTGGCTCCTTGGAATGACATGCTCTCCCTCCACTCTTCCTCAGGCTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	43863	GCACTGGCTCCTTGGAATGACATGCTCTCCCTCCACTCTTCCTCAGGCTC	43912

CR925796.6	751	AGGTCTTCCCCATGGCTCCTGTTCACAGAATCACAGTCCCAGAGTACACT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	43913	AGGTCTTCCCCATGGCTCCTGTTCACAGAATCACAGTCCCAGAGTACACT	43962

CR925796.6	801	GGGGAAGGCTGCCTGCTCACCTTCTCCGCAGTCTTCGCCAGCATACCCAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	43963	GGGGAAGGCTGCCTGCTCACCTTCTCCGCAGTCTTCGCCAGCATACCCAT	44012

CR925796.6	851	CTTTGCAGACACAGCTGCCATCGTGACACTCTCCTCGGCCACGGCAGTCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44013	CTTTGCAGACACAGCTGCCATCGTGACACTCTCCTCGGCCACGGCAGTCC	44062

CR925796.6	901	CCTGGGCATGTCTGGATGGCACAGTCAGGGCCTCGGAAGCCCTCTACACA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44063	CCTGGGCATGTCTGGATGGCACAGTCAGGGCCTCGGAAGCCCTCTACACA	44112

CR925796.6	951	CACACACTGGCCTGCCCGGCACAGTTCCCGGGGCCCGCAGCCTCCAGGGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44113	CACACACTGGCCTGCCCGGCACAGTTCCCGGGGCCCGCAGCCTCCAGGGC	44162

CR925796.6	1001	AGGCGCTGGCTGGAGGCTCTTCCTGCCCGCAGTCCTCACCGCCATAGCCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44163	AGGCGCTGGCTGGAGGCTCTTCCTGCCCGCAGTCCTCACCGCCATAGCCC	44212

CR925796.6	1051	ACGTGGCACAGGCACACTCCTTGCACACACCGCCCACGTCCCCGGCAGTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44213	ACGTGGCACAGGCACACTCCTTGCACACACCGCCCACGTCCCCGGCAGTC	44262

CR925796.6	1101	AGCCGGGCACATGCGGGTGGCACAGGTAGGGCCGGTGTAGCCTGGGTCGC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44263	AGCCGGGCACATGCGGGTGGCACAGGTAGGGCCGGTGTAGCCTGGGTCGC	44312

CR925796.6	1151	ACAGGCAGCGCCCTTCCTCACAGCGGCCCCTCCCGTGGCAGTTGGAGGGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44313	ACAGGCAGCGCCCTTCCTCACAGCGGCCCCTCCCGTGGCAGTTGGAGGGG	44362

CR925796.6	1201	CAGGTGCGGATGCTGCAGTCCTCACTCACGTAGCCTTCCCAACAGATGCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44363	CAGGTGCGGATGCTGCAGTCCTCACTCACGTAGCCTTCCCAACAGATGCA	44412

CR925796.6	1251	CACACCGTCCTGGCACACGCCGTGCTGGCTGCAGTCATTCGGGCACTGCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44413	CACACCGTCCTGGCACACGCCGTGCTGGCTGCAGTCATTCGGGCACTGCC	44462

CR925796.6	1301	TCACACCGCAATCCTCGCCAGAGTAGCCGTCCTCGCACACACACCGCCCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44463	TCACACCGCAATCCTCGCCAGAGTAGCCGTCCTCGCACACACACCGCCCA	44512

CR925796.6	1351	TCTAGGCACTGGCCGCGGCCTCGGCAGCCCCCGGGGCAGCTGCGCGTGCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44513	TCTAGGCACTGGCCGCGGCCTCGGCAGCCCCCGGGGCAGCTGCGCGTGCT	44562

CR925796.6	1401	GCAGTCTTCCCCTGAGTAGCCTGCGTCACACACGCACACGCCATCCTCGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44563	GCAGTCTTCCCCTGAGTAGCCTGCGTCACACACGCACACGCCATCCTCGC	44612

CR925796.6	1451	AAAGGCCGTGCCCACGGCAGTCCCCGGGACAGCGACGGCTCCCACAGTCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44613	AAAGGCCGTGCCCACGGCAGTCCCCGGGACAGCGACGGCTCCCACAGTCC	44662

CR925796.6	1501	TCACCGGTGAAGCCCGGGTTGCACACGCAGCGGCCATCCACGCAGCGCCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44663	TCACCGGTGAAGCCCGGGTTGCACACGCAGCGGCCATCCACGCAGCGCCC	44712

CR925796.6	1551	GCGCCCGCGACAGTCGCCAGGACAGGCGCGCGTGCCGCAGTCCCGGCCTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44713	GCGCCCGCGACAGTCGCCAGGACAGGCGCGCGTGCCGCAGTCCCGGCCTG	44762

CR925796.6	1601	TGTACCCCGGCCAACACATGCAGCGGCCACTCTCACAGCGGCCCCGGCCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44763	TGTACCCCGGCCAACACATGCAGCGGCCACTCTCACAGCGGCCCCGGCCA	44812

CR925796.6	1651	CGACAGTCCCCAGGACAGCTGCGCACACCGCAGTCCTCGCCGCTGTAGCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44813	CGACAGTCCCCAGGACAGCTGCGCACACCGCAGTCCTCGCCGCTGTAGCC	44862

CR925796.6	1701	CGCATTGCAAACACACACGCCGTTCTCGCAGCGCCCGCGACCTCTACAGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44863	CGCATTGCAAACACACACGCCGTTCTCGCAGCGCCCGCGACCTCTACAGT	44912

CR925796.6	1751	CGCGTGGGCAGGCGCGCGAGCCGCAATCGGTTCCAGTGTACCCCGGCCAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44913	CGCGTGGGCAGGCGCGCGAGCCGCAATCGGTTCCAGTGTACCCCGGCCAG	44962

CR925796.6	1801	CACACGCAGCGGCCGTCCTCGCAGCGGCCCCTTTGGTTGCAGTCGCCAGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	44963	CACACGCAGCGGCCGTCCTCGCAGCGGCCCCTTTGGTTGCAGTCGCCAGG	45012

CR925796.6	1851	GCAGCTGCGCACGCCGCAGTCGTCCCCGCTGTAGCCCGTGTCGCAAATGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	45013	GCAGCTGCGCACGCCGCAGTCGTCCCCGCTGTAGCCCGTGTCGCAAATGC	45062

CR925796.6	1901	ATTCGCCGTCCTCGCAGCGCCCGCGGCCCCGGCAGTCCCTCGGACATGTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	45063	ATTCGCCGTCCTCGCAGCGCCCGCGGCCCCGGCAGTCCCTCGGACATGTC	45112

CR925796.6	1951	CGCGTGCTGCAGTCCTCGCCTGTGTACCCGGGCCAGCACACGCAGCGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759792.3	45113	CGCGTGCTGCAGTCCTCGCCTGTGTACCCGGGCCAGCACACGCAGCGGCC	45162

Overview

Query
CR925796.6 - 37304 bps
Hit
CR759792.3 - 45162 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link