<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759782.7	1	GGCCGGGATTATTTGTCCGCCAGAGCGGAAATACGTTCCACACCCCCCTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61129	GGCCGGGATTATTTGTCCGCCAGAGCGGAAATACGTTCCACACCCCCCTC	61178

CR759782.7	51	TTTCTCGCTCCCCCTCCTCTGTACCTCCAAGCCCCGCGGCCAGTTTGCGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61179	TTTCTCGCTCCCCCTCCTCTGTACCTCCAAGCCCCGCGGCCAGTTTGCGC	61228

CR759782.7	101	GTGCGTGCCAAGTGCCGCGCGGAGGCCCGCTCACTCGGGCCCGCCCCCCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61229	GTGCGTGCCAAGTGCCGCGCGGAGGCCCGCTCACTCGGGCCCGCCCCCCA	61278

CR759782.7	151	ATCCCGGCTGCCCATGGCGCTACTCGCTCCGCGTCCCCGCGCCCCGCCCG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61279	ATCCCGGCTGCCCATGGCGCTACTCGCTCCGCGTCCCCGCGCCCCGCCCG	61328

CR759782.7	201	CGCCGCATCCCGCAGCGCGCGCGCGCACCCGTTCTCTCGGCTGCGGGCGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61329	CGCCGCATCCCGCAGCGCGCGCGCGCACCCGTTCTCTCGGCTGCGGGCGC	61378

CR759782.7	251	TGCCACCTGCTCCCAGGGGTGGTGCGTCTCCGGTCCAGCTGTGCCGAGCG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61379	TGCCACCTGCTCCCAGGGGTGGTGCGTCTCCGGTCCAGCTGTGCCGAGCG	61428

CR759782.7	301	CTGCCCTGGGTGCATCCGTGGCACCTCTCAGGGCCCCATCCGCCCCGTGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61429	CTGCCCTGGGTGCATCCGTGGCACCTCTCAGGGCCCCATCCGCCCCGTGG	61478

CR759782.7	351	CTAACAGAGCTGTTGGTAGCTATTACCCACGCCTGCCTCCTCTGCTGAGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61479	CTAACAGAGCTGTTGGTAGCTATTACCCACGCCTGCCTCCTCTGCTGAGT	61528

CR759782.7	401	GTGCTCACAGTTGCTCCAGACACATTCCCAGGCTTTTCCAACTCTTGTAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61529	GTGCTCACAGTTGCTCCAGACACATTCCCAGGCTTTTCCAACTCTTGTAA	61578

CR759782.7	451	AGCTAGTAACCGCCTCAGCCCTTCAGGCCTGAAATATGATTTCACTTTCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61579	AGCTAGTAACCGCCTCAGCCCTTCAGGCCTGAAATATGATTTCACTTTCC	61628

CR759782.7	501	ACAAAGCCAGACGATCCAGTGCCCTCAACTTTCCTCCACTCCATGTCAGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61629	ACAAAGCCAGACGATCCAGTGCCCTCAACTTTCCTCCACTCCATGTCAGT	61678

CR759782.7	551	CCTTTAAAATCACACCCGCCCTCCCCTCCATTCTCAGGATTGATCCCAAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61679	CCTTTAAAATCACACCCGCCCTCCCCTCCATTCTCAGGATTGATCCCAAC	61728

CR759782.7	601	TTCTTGCCAAGGCAGTCGCCCTCCGCTTGTGCTATCGATGACCTTGCCCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61729	TTCTTGCCAAGGCAGTCGCCCTCCGCTTGTGCTATCGATGACCTTGCCCA	61778

CR759782.7	651	TTTCACCTTTAGTATATAATTAACCCTAGGACTAATTTTAATGATGTGAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61779	TTTCACCTTTAGTATATAATTAACCCTAGGACTAATTTTAATGATGTGAT	61828

CR759782.7	701	TTATTATGTTAGTATGATTCTACTCTAATCTTCCACCGCTCCGTCCCCCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61829	TTATTATGTTAGTATGATTCTACTCTAATCTTCCACCGCTCCGTCCCCCT	61878

CR759782.7	751	TATTCCTCACCTCTCCTCCAGACTGACAAGGTCCAGCTCTAAACAAAACT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61879	TATTCCTCACCTCTCCTCCAGACTGACAAGGTCCAGCTCTAAACAAAACT	61928

CR759782.7	801	TCCCTTCAACACTGCGCCCGGGCCTTCTCTTTCTCTTGTCTCTCTCAGAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61929	TCCCTTCAACACTGCGCCCGGGCCTTCTCTTTCTCTTGTCTCTCTCAGAC	61978

CR759782.7	851	TAAGTTATAGTCTCCACAGCTTCAGCGACAGCACTTAGGAGCGTCTTGAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	61979	TAAGTTATAGTCTCCACAGCTTCAGCGACAGCACTTAGGAGCGTCTTGAA	62028

CR759782.7	901	GGCTGGTGCCTTCCCTTCCACTTCCTCGTACCTACACCCACTTCCCCACC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62029	GGCTGGTGCCTTCCCTTCCACTTCCTCGTACCTACACCCACTTCCCCACC	62078

CR759782.7	951	TATCCAAGTCCGCGTGAAGATGCCACTGTTTCCTGCCAATTGGATTTCTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62079	TATCCAAGTCCGCGTGAAGATGCCACTGTTTCCTGCCAATTGGATTTCTT	62128

CR759782.7	1001	TTTTACGTCCTTCAGGAGACTAGTGCGTTTTCCTTACATTTCAATTCTGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62129	TTTTACGTCCTTCAGGAGACTAGTGCGTTTTCCTTACATTTCAATTCTGA	62178

CR759782.7	1051	TGAAGTTTCTTATTATGTGTTCAATATCTGGTTTCCCCATTAGACTATAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62179	TGAAGTTTCTTATTATGTGTTCAATATCTGGTTTCCCCATTAGACTATAA	62228

CR759782.7	1101	ACTTCTTGGTTGCAGGAATTATGTTGTGGGTTTTGTTTTGCAAATAAAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62229	ACTTCTTGGTTGCAGGAATTATGTTGTGGGTTTTGTTTTGCAAATAAAAA	62278

CR759782.7	1151	TCATGCAATAGGGAGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62279	TCATGCAATAGGGAGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTGT	62328

CR759782.7	1201	GGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62329	GGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCC	62378

CR759782.7	1251	TGGCCAACATGGTGAAACCCTGACTCTACTAAATATACAAAAATTAGCTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62379	TGGCCAACATGGTGAAACCCTGACTCTACTAAATATACAAAAATTAGCTG	62428

CR759782.7	1301	GACGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62429	GACGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAG	62478

CR759782.7	1351	GAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGAAGGTTGCAGTGAGCCTAGATTGCG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62479	GAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGAAGGTTGCAGTGAGCCTAGATTGCG	62528

CR759782.7	1401	CCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCCTTCTCAAAACAAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62529	CCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCCTTCTCAAAACAAA	62578

CR759782.7	1451	ACACCAAAAAAGGTCATGCAACAAATGATTGTTGAAGTAATTCCTCTTTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62579	ACACCAAAAAAGGTCATGCAACAAATGATTGTTGAAGTAATTCCTCTTTG	62628

CR759782.7	1501	GCTCAGCCAGCATCCACCCATAAAAAGTTTGTTCTTGAGCTGAAACTGAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62629	GCTCAGCCAGCATCCACCCATAAAAAGTTTGTTCTTGAGCTGAAACTGAA	62678

CR759782.7	1551	TTCTTGAACTCAAGGGATGCTGTTTGGCAGGAGGGTGGAGGCAGCGTAGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62679	TTCTTGAACTCAAGGGATGCTGTTTGGCAGGAGGGTGGAGGCAGCGTAGA	62728

CR759782.7	1601	CAGTGTTTAGGTGGTACCTTGACTTTTTGCCTTTTTCTTTTAAATTCTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62729	CAGTGTTTAGGTGGTACCTTGACTTTTTGCCTTTTTCTTTTAAATTCTCT	62778

CR759782.7	1651	GATTTGTATGCCCGCACCCAGTTCCCTCTGTTGAATCTAAGAGTCTGTTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62779	GATTTGTATGCCCGCACCCAGTTCCCTCTGTTGAATCTAAGAGTCTGTTC	62828

CR759782.7	1701	TAAACTGCTCTCTTTGTATTTAGGCCTTGTAGATTTGAGGAAGAACACCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62829	TAAACTGCTCTCTTTGTATTTAGGCCTTGTAGATTTGAGGAAGAACACCT	62878

CR759782.7	1751	GATTTTGTGTCAGACGCACCTAGGCTTAAAGCCACATTCCTAGGAGTTTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62879	GATTTTGTGTCAGACGCACCTAGGCTTAAAGCCACATTCCTAGGAGTTTC	62928

CR759782.7	1801	TGAGCCTACTCTGGCTCAGAAGGCTGCCAGATTCGCAAATCATTAAAAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62929	TGAGCCTACTCTGGCTCAGAAGGCTGCCAGATTCGCAAATCATTAAAAAA	62978

CR759782.7	1851	ATAAAATAAAAGCCCTATTCCTGTACCAAATGAGGCCCACTGGGCAAGTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	62979	ATAAAATAAAAGCCCTATTCCTGTACCAAATGAGGCCCACTGGGCAAGTT	63028

CR759782.7	1901	ACTTAATTCTCTGAATCACAGTGTCCTTATCTTTGTCTCCCCCGCCCATC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	63029	ACTTAATTCTCTGAATCACAGTGTCCTTATCTTTGTCTCCCCCGCCCATC	63078

CR759782.7	1951	CTTAGCTCATCTGAAAGCATTTTTATCTTGAAGGCCCTGATCTCTCACAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759784.6	63079	CTTAGCTCATCTGAAAGCATTTTTATCTTGAAGGCCCTGATCTCTCACAG	63128

Overview

Query
CR759782.7 - 79825 bps
Hit
CR759784.6 - 63128 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link