<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR788250.6	1	CTTTAGATCCAGCTGGCTCCCTGATCCCAGAGCATAGTCTTTCCCTGAGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	36591	CTTTAGATCCAGCTGGCTCCCTGATCCCAGAGCATAGTCTTTCCCTGAGG	36640

CR788250.6	51	CTCGCTACTCAAAAGAGTCAAACTTCATCCAGCCCTCACTTCTTCCACCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	36641	CTCGCTACTCAAAAGAGTCAAACTTCATCCAGCCCTCACTTCTTCCACCC	36690

CR788250.6	101	GCTCTTCAAATGGTCCAATCCACTTTCCATCCTGGATACTCCACTGACTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	36691	GCTCTTCAAATGGTCCAATCCACTTTCCATCCTGGATACTCCACTGACTG	36740

CR788250.6	151	CAAATATCAACTCCTCCAAACCCAGTACTTGCGTCTCTGTCACGTTCTTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	36741	CAAATATCAACTCCTCCAAACCCAGTACTTGCGTCTCTGTCACGTTCTTA	36790

CR788250.6	201	CTTCACTCACCTGTCAGTGGTTCTCACCACAACTGGCCACTCCCTCGCCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	36791	CTTCACTCACCTGTCAGTGGTTCTCACCACAACTGGCCACTCCCTCGCCT	36840

CR788250.6	251	CGAAAAAATCATTTTTCTTTGATTCCCATGCATCACATTCCTTGGGTTTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	36841	CGAAAAAATCATTTTTCTTTGATTCCCATGCATCACATTCCTTGGGTTTT	36890

CR788250.6	301	TTTTCTCCAGCATCTCTGGGGAATCTTCTCAGTCCCTTATGCTGTCCTGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	36891	TTTTCTCCAGCATCTCTGGGGAATCTTCTCAGTCCCTTATGCTGTCCTGT	36940

CR788250.6	351	GGCCCTCTGATATTTTTTCTACACAAAAATCTATCTCCCTCTGCAACCTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	36941	GGCCCTCTGATATTTTTTCTACACAAAAATCTATCTCCCTCTGCAACCTC	36990

CR788250.6	401	TTCCACTTCCCTGGAATTTAACACAGAACCTGCATTGACCCCAACATAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	36991	TTCCACTTCCCTGGAATTTAACACAGAACCTGCATTGACCCCAACATAAA	37040

CR788250.6	451	TACCTCCAGCCCTGGCCTCACCCTGAACTCCTCTCTTATATTCAGTTGAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37041	TACCTCCAGCCCTGGCCTCACCCTGAACTCCTCTCTTATATTCAGTTGAC	37090

CR788250.6	501	TTCCTGATTGCTTCATGTGAGTTCAAAAATCATCTCAATTTTAATAAACA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37091	TTCCTGATTGCTTCATGTGAGTTCAAAAATCATCTCAATTTTAATAAACA	37140

CR788250.6	551	CAATTGTCATTTCTAATCACCCACTTCAAATCATTTCCTCCCATTATTCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37141	CAATTGTCATTTCTAATCACCCACTTCAAATCATTTCCTCCCATTATTCT	37190

CR788250.6	601	TCCCTATTTCAATAAGCAGCACCACCATCCACCTATTTATCAAGGCAAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37191	TCCCTATTTCAATAAGCAGCACCACCATCCACCTATTTATCAAGGCAAAA	37240

CR788250.6	651	TACTTAGAAATAAGTTACGTTTAATCCATTAACAAGTCATGCAAAAAGAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37241	TACTTAGAAATAAGTTACGTTTAATCCATTAACAAGTCATGCAAAAAGAC	37290

CR788250.6	701	ATCCCAAGTCTGTTCACTTTATCTGGATCTGTCTTTGTCACTACTACACT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37291	ATCCCAAGTCTGTTCACTTTATCTGGATCTGTCTTTGTCACTACTACACT	37340

CR788250.6	751	ACATGAAGCCAAAAATTTTTCTTCCCTGGAGAATTCTGCTGTTGTCCACT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37341	ACATGAAGCCAAAAATTTTTCTTCCCTGGAGAATTCTGCTGTTGTCCACT	37390

CR788250.6	801	TGTGAACCCCAACAATCCAATCTCCACATAGTAGCTAGAATTATTTTTAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37391	TGTGAACCCCAACAATCCAATCTCCACATAGTAGCTAGAATTATTTTTAA	37440

CR788250.6	851	AATTGAATATTATCGGGGGACCTGCCCCGATAATCACGTAGGTTCTTTTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37441	AATTGAATATTATCGGGGGACCTGCCCCGATAATCACGTAGGTTCTTTTC	37490

CR788250.6	901	TATTTTCCTAAGCATCGGCCGGCTTGAGAAATAAAGGGACAGAGTACAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37491	TATTTTCCTAAGCATCGGCCGGCTTGAGAAATAAAGGGACAGAGTACAAA	37540

CR788250.6	951	AGAGAGAAATTTTAAAGCTGGGGGAGACATCACACGTTGGTAGGATCCAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37541	AGAGAGAAATTTTAAAGCTGGGGGAGACATCACACGTTGGTAGGATCCAC	37590

CR788250.6	1001	GGTGCCCCACAAGCCACAAAAACCAGCAAGTTTTTATTAGGGATTTTCAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37591	GGTGCCCCACAAGCCACAAAAACCAGCAAGTTTTTATTAGGGATTTTCAA	37640

CR788250.6	1051	AAGGGGAGGGAGTGTGCGAATAGGTGTGGGTGACAGACATCAAGTACTTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37641	AAGGGGAGGGAGTGTGCGAATAGGTGTGGGTGACAGACATCAAGTACTTA	37690

CR788250.6	1101	ACAGGGTAATAGAATATCACAAGGTAAGTGGAGGCAGGGCGAGATCACAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37691	ACAGGGTAATAGAATATCACAAGGTAAGTGGAGGCAGGGCGAGATCACAG	37740

CR788250.6	1151	GACCACAGGACCGAGGCGAAATTAAAATTGCTAATGAAGTTTCAGGCACC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37741	GACCACAGGACCGAGGCGAAATTAAAATTGCTAATGAAGTTTCAGGCACC	37790

CR788250.6	1201	ATTGTCATCAATAACATCTTATCAGGAGACATGGTTTTGAGATCAACCGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37791	ATTGTCATCAATAACATCTTATCAGGAGACATGGTTTTGAGATCAACCGA	37840

CR788250.6	1251	TCTGACCAAAATTTATTAGGTGGGAATTTCCTCTTCCTAATAAGCCTGGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37841	TCTGACCAAAATTTATTAGGTGGGAATTTCCTCTTCCTAATAAGCCTGGG	37890

CR788250.6	1301	AGCGCTATGGGAGACTGGAATCTATCTCACCTCTGCAATCTCAACCATAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37891	AGCGCTATGGGAGACTGGAATCTATCTCACCTCTGCAATCTCAACCATAA	37940

CR788250.6	1351	GAGATAGGTACGCCCCGGGGGGGCCAGTTCAGAGACCTACCCCTAGGTGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37941	GAGATAGGTACGCCCCGGGGGGGCCAGTTCAGAGACCTACCCCTAGGTGT	37990

CR788250.6	1401	GCATTCTCTTTCTCAGGGACATTCCATGCTGAGAAAAAGAATTCAGCAAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	37991	GCATTCTCTTTCTCAGGGACATTCCATGCTGAGAAAAAGAATTCAGCAAT	38040

CR788250.6	1451	ATTTCTCCCATTTGCTTTTGAAAGAAGAGAAATATGGCTCTGTTCTGCCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	38041	ATTTCTCCCATTTGCTTTTGAAAGAAGAGAAATATGGCTCTGTTCTGCCT	38090

CR788250.6	1501	GGCTCACCAGCAGTCAGAGTTTAAGGTTATCTCTCTTATTCCCTGAACAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	38091	GGCTCACCAGCAGTCAGAGTTTAAGGTTATCTCTCTTATTCCCTGAACAA	38140

CR788250.6	1551	TTGCTGTTATCCTGTTCTTTTTTCAAGGTGCCCACATTTCATATTGCTCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	38141	TTGCTGTTATCCTGTTCTTTTTTCAAGGTGCCCACATTTCATATTGCTCA	38190

CR788250.6	1601	AACACACATACTATACAATTTGTGCAGTTAATGCAATTATCACATAGTCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	38191	AACACACATACTATACAATTTGTGCAGTTAATGCAATTATCACATAGTCC	38240

CR788250.6	1651	TGAGGCGACGTACATCCTCCTCGGCTGATAGGATTAAGAGATTAAAGTAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	38241	TGAGGCGACGTACATCCTCCTCGGCTGATAGGATTAAGAGATTAAAGTAA	38290

CR788250.6	1701	AGGCAGGCATAGGAAATCACAAGGGTATTGACTGGGAAAGTGATAAGTGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	38291	AGGCAGGCATAGGAAATCACAAGGGTATTGACTGGGAAAGTGATAAGTGT	38340

CR788250.6	1751	TCATGAAATCTTTACAATTTATGTTTAGAGATTGCAGTAAAGACAGGCAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	38341	TCATGAAATCTTTACAATTTATGTTTAGAGATTGCAGTAAAGACAGGCAT	38390

CR788250.6	1801	AAGAAATTACAAAAGTATTAATTTGGGGAACTAATAAATGTACATAAAAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	38391	AAGAAATTACAAAAGTATTAATTTGGGGAACTAATAAATGTACATAAAAT	38440

CR788250.6	1851	CTTCACAATCCACATTCTTCTGTTCTGGCTTCAGCCGGTCCCTCTGTTTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	38441	CTTCACAATCCACATTCTTCTGTTCTGGCTTCAGCCGGTCCCTCTGTTTG	38490

CR788250.6	1901	GGGTCCCTGACTTCCCGCAACATAATATTAATGGACTCTCCTTGTAACCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	38491	GGGTCCCTGACTTCCCGCAACATAATATTAATGGACTCTCCTTGTAACCT	38540

CR788250.6	1951	TCCAGGAGCTTCAAATATGTTTAAATAAAACTTAATTCCTTACTATGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759779.6	38541	TCCAGGAGCTTCAAATATGTTTAAATAAAACTTAATTCCTTACTATGGCC	38590

Overview

Query
CR788250.6 - 88203 bps
Hit
CR759779.6 - 38590 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link