<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 875 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU013522.1	1	ACCTAGGGCCCTCAAAGGGGGTCCTCACCCAGCTCTGGGTAATTAAGTTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	87941	ACCTAGGGCCCTCAAAGGGGGTCCTCACCCAGCTCTGGGTAATTAAGTTC	87990

CU013522.1	51	ATGACTCTGCTAGACTTGAGCTGGAAAAGAACAGATTAGCTGAGACAGAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	87991	ATGACTCTGCTAGACTTGAGCTGGAAAAGAACAGATTAGCTGAGACAGAG	88040

CU013522.1	101	CCAGCTAAGGTAAAAAAGCAGGAAGGCTGGGCACAGTGGCTCATGCCTGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	88041	CCAGCTAAGGTAAAAAAGCAGGAAGGCTGGGCACAGTGGCTCATGCCTGT	88090

CU013522.1	151	AATCCTAGTACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATGGCTTGAGCTCAGGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	88091	AATCCTAGTACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATGGCTTGAGCTCAGGA	88140

CU013522.1	201	GTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGTGACAAAAAAATTAAAAATTCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	88141	GTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGTGACAAAAAAATTAAAAATTCA	88190

CU013522.1	251	AAATTTTGACCAGGCACAGTGGCTCACACCTGCAATTCCAGCACTTTGGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	88191	AAATTTTGACCAGGCACAGTGGCTCACACCTGCAATTCCAGCACTTTGGG	88240

CU013522.1	301	AGGCCGAGGCAGACGGATCTCCTGAGGTTGGGAGTTCGAGACCAGCCTGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	88241	AGGCCGAGGCAGACGGATCTCCTGAGGTTGGGAGTTCGAGACCAGCCTGG	88290

CU013522.1	351	CCAAAATGGTGAAACCCCGTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGAGCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	88291	CCAAAATGGTGAAACCCCGTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGAGCA	88340

CU013522.1	401	TGGTGGTGCATGCCTGTATTTCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	88341	TGGTGGTGCATGCCTGTATTTCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGA	88390

CU013522.1	451	GTCGCTTGAACCTGGGAGACAGAGGTTGCAGTAAGCCAAGATCATGCCAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	88391	GTCGCTTGAACCTGGGAGACAGAGGTTGCAGTAAGCCAAGATCATGCCAC	88440

CU013522.1	501	CGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	88441	CGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAA	88490

CU013522.1	551	AAAAAAATTTCAGGCCAGGCACAGTGGCTAACACCTGTAACTCCAGCACT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	88491	AAAAAAATTTCAGGCCAGGCACAGTGGCTAACACCTGTAACTCCAGCACT	88540

CU013522.1	601	TTGGGAGGCTGAGGTGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	88541	TTGGGAGGCTGAGGTGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCC	88590

CU013522.1	651	TGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	88591	TGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTG	88640

CU013522.1	701	GGTGTGGTGGTACGCACCTGTAGTCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	88641	GGTGTGGTGGTACGCACCTGTAGTCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAG	88690

CU013522.1	751	GAGAATCACTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTCAAGATCGCG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	88691	GAGAATCACTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTCAAGATCGCG	88740

CU013522.1	801	CCACTGCACTCCAGCCTGGTGACAGAGCAAGACTCCACCTCAAAAAAAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	88741	CCACTGCACTCCAGCCTGGTGACAGAGCAAGACTCCACCTCAAAAAAAAA	88790

CU013522.1	851	CAAAAAATGTTTAATATGGGCATGG	875
			|||||||||||||||||||||||||
CR759778.8	88791	CAAAAAATGTTTAATATGGGCATGG	88815

Overview

Query
CU013522.1 - 3329 bps
Hit
CR759778.8 - 88815 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 875 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link