<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759805.5	1	AACCAGTCAGTAGCACTCTTTCTTCCTTAGTGGGGCATAAGTAATGCTGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	109151	AACCAGTCAGTAGCACTCTTTCTTCCTTAGTGGGGCATAAGTAATGCTGC	109200

CR759805.5	51	ATCTTGCATTCAACGTCATCTTAGATGGGATGAAATACACATTTTGGAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	109201	ATCTTGCATTCAACGTCATCTTAGATGGGATGAAATACACATTTTGGAAT	109250

CR759805.5	101	AAACGAATAAATGTATGCTTTCTTTTGGTGCTATTTCTTCTGTTTTGGTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	109251	AAACGAATAAATGTATGCTTTCTTTTGGTGCTATTTCTTCTGTTTTGGTC	109300

CR759805.5	151	TTATTTGTAAACACAAGGAAATTAGGATTCCTTTTTTTTTTTTTTTGAGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	109301	TTATTTGTAAACACAAGGAAATTAGGATTCCTTTTTTTTTTTTTTTGAGA	109350

CR759805.5	201	CAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGATTGCAATGGTGTGGTCTCAGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	109351	CAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGATTGCAATGGTGTGGTCTCAGC	109400

CR759805.5	251	TCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	109401	TCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCT	109450

CR759805.5	301	CCTGAGTAGCTGGGACTATAGGCGCGTGCCACCACACCCGGCTAATTTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	109451	CCTGAGTAGCTGGGACTATAGGCGCGTGCCACCACACCCGGCTAATTTTT	109500

CR759805.5	351	GTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGATGGCCAGGCTGATCTCGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	109501	GTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGATGGCCAGGCTGATCTCGA	109550

CR759805.5	401	ACTCCTGACCTTGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAGAGTGCTGGGATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	109551	ACTCCTGACCTTGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAGAGTGCTGGGATT	109600

CR759805.5	451	ACAGGTATGAGCCACTGCACCTGGCCTAGGATTCCTTTAGTAACTGTCTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	109601	ACAGGTATGAGCCACTGCACCTGGCCTAGGATTCCTTTAGTAACTGTCTA	109650

CR759805.5	501	GTATGGTGCTGGGAATTCTTTTGGGAACAGAGGCAGCCAACCAACAGAAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	109651	GTATGGTGCTGGGAATTCTTTTGGGAACAGAGGCAGCCAACCAACAGAAG	109700

CR759805.5	551	TGAATGACATAGTTCTTACCCTCAAGGACAAGAAAACCAGCAATTACAGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	109701	TGAATGACATAGTTCTTACCCTCAAGGACAAGAAAACCAGCAATTACAGT	109750

CR759805.5	601	GCAACATGCTAAGTGCTACAATAAAGGAATGCTTTCGGGCAGAGTCCAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	109751	GCAACATGCTAAGTGCTACAATAAAGGAATGCTTTCGGGCAGAGTCCAGA	109800

CR759805.5	651	GAAGGGATCTCATTCAGCCTGTGCAGATCCTGGAAAGCTTCCCAAGGGAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	109801	GAAGGGATCTCATTCAGCCTGTGCAGATCCTGGAAAGCTTCCCAAGGGAT	109850

CR759805.5	701	AGGGTAACTGACCGGAGACTTGTGACATATTTGTGGGGCACTTTGAGCTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	109851	AGGGTAACTGACCGGAGACTTGTGACATATTTGTGGGGCACTTTGAGCTG	109900

CR759805.5	751	CTGTCACATATGTGGATTCTTTTGATCTTCACATCACCTCTGTGAGGTAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	109901	CTGTCACATATGTGGATTCTTTTGATCTTCACATCACCTCTGTGAGGTAG	109950

CR759805.5	801	GAGAACCATCCTGTCTTAGAAATGCAAAGACTGAAGTTCAGAGAAGTTAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	109951	GAGAACCATCCTGTCTTAGAAATGCAAAGACTGAAGTTCAGAGAAGTTAA	110000

CR759805.5	851	ATAAATTGTCCCCAAACCTCCTTAACGGTAAGTGGCAGGGAGGGGTGGGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110001	ATAAATTGTCCCCAAACCTCCTTAACGGTAAGTGGCAGGGAGGGGTGGGG	110050

CR759805.5	901	GGTGAGGGAGTTAAACTCAGGTTTCCTGGCTCCAGGATTACTCACTTTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110051	GGTGAGGGAGTTAAACTCAGGTTTCCTGGCTCCAGGATTACTCACTTTTT	110100

CR759805.5	951	ATCTCATTTGGACTGAATCTCAAGTGATGAACTGTTCTGCACTGTCTCTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110101	ATCTCATTTGGACTGAATCTCAAGTGATGAACTGTTCTGCACTGTCTCTA	110150

CR759805.5	1001	CAAAAATCACTCACAGGTATGAACACTTTTATCCTTCAGTCTTCTCTTCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110151	CAAAAATCACTCACAGGTATGAACACTTTTATCCTTCAGTCTTCTCTTCT	110200

CR759805.5	1051	TTAGGCTTGCAATGGCAGGCTCTCGGATCTTTCCTCCAATCTGTATTGGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110201	TTAGGCTTGCAATGGCAGGCTCTCGGATCTTTCCTCCAATCTGTATTGGG	110250

CR759805.5	1101	TTTTGAGCCAAGCAAGAAAAACCAGACACAGTCCCTATTCTTGAGGAGCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110251	TTTTGAGCCAAGCAAGAAAAACCAGACACAGTCCCTATTCTTGAGGAGCC	110300

CR759805.5	1151	CCCAGTCTGAAAACAAGTCGTGGATACACAGAAAAAACATTCTTGTGTGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110301	CCCAGTCTGAAAACAAGTCGTGGATACACAGAAAAAACATTCTTGTGTGT	110350

CR759805.5	1201	GTGATGGATGGTAGGGAACGTGTCATCAATTGTGACATTTATGGCATTTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110351	GTGATGGATGGTAGGGAACGTGTCATCAATTGTGACATTTATGGCATTTA	110400

CR759805.5	1251	TTTGCCTTTACTAGTGAGTTCTGCTTTTTAAGATGTTTGCGACTTCTCAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110401	TTTGCCTTTACTAGTGAGTTCTGCTTTTTAAGATGTTTGCGACTTCTCAG	110450

CR759805.5	1301	GCCTCACCCTCAAAAGAATTTGAAAATTGAACACAAGCAGAGATGTTTTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110451	GCCTCACCCTCAAAAGAATTTGAAAATTGAACACAAGCAGAGATGTTTTG	110500

CR759805.5	1351	TTTTCAACTCAGGACCTCACCCAGAGTTTTTTAGGCAGCAACCCTGAACC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110501	TTTTCAACTCAGGACCTCACCCAGAGTTTTTTAGGCAGCAACCCTGAACC	110550

CR759805.5	1401	AAGTTGGCCTCGAGGTATTCGTGAGTTTCCATACCCAGAAGACTTTTTCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110551	AAGTTGGCCTCGAGGTATTCGTGAGTTTCCATACCCAGAAGACTTTTTCA	110600

CR759805.5	1451	GCTTCTACCTTCTACCCATGAAAGGAGGTGGCATGGATGTTTCCTTTTTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110601	GCTTCTACCTTCTACCCATGAAAGGAGGTGGCATGGATGTTTCCTTTTTC	110650

CR759805.5	1501	TTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGTATTTATTGATCATTCTTGGGTGTTTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110651	TTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGTATTTATTGATCATTCTTGGGTGTTTC	110700

CR759805.5	1551	TCGGAGAGGGGGATTTGGCAGGGTCATAGGACAATAGTGGAGGGAAGGTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110701	TCGGAGAGGGGGATTTGGCAGGGTCATAGGACAATAGTGGAGGGAAGGTC	110750

CR759805.5	1601	AGCAGATAAACAAGTGAACAAGGGTCTCTGGTTTTCCTAGGCAGAGGACC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110751	AGCAGATAAACAAGTGAACAAGGGTCTCTGGTTTTCCTAGGCAGAGGACC	110800

CR759805.5	1651	CCGCGGCCTTCCGCAGTGTTTGTGTCCCTGGGTACTTGAGATTAGGGAGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110801	CCGCGGCCTTCCGCAGTGTTTGTGTCCCTGGGTACTTGAGATTAGGGAGT	110850

CR759805.5	1701	GGTGATGACTCTTAACGAGCATGCTGCCTTCAAGCATCTGTTTAACAAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110851	GGTGATGACTCTTAACGAGCATGCTGCCTTCAAGCATCTGTTTAACAAAG	110900

CR759805.5	1751	CACATGGTGCACCGCCCTTAATCCATTTAACCCTGAGTGGACACAGCACA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110901	CACATGGTGCACCGCCCTTAATCCATTTAACCCTGAGTGGACACAGCACA	110950

CR759805.5	1801	TGTTTCAGAGAGCACGGGGTTGGGGGTAAGGTTATAGATTAACAGCATCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	110951	TGTTTCAGAGAGCACGGGGTTGGGGGTAAGGTTATAGATTAACAGCATCC	111000

CR759805.5	1851	CAAGGCAGAAGAATTTTTCTTAGTACAGAACAAAATGGAGTCTCCCCTGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	111001	CAAGGCAGAAGAATTTTTCTTAGTACAGAACAAAATGGAGTCTCCCCTGT	111050

CR759805.5	1901	CTACTTCCCTCTACACAGACACAGCAACAATCTGATTTCTCTATCTTTTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	111051	CTACTTCCCTCTACACAGACACAGCAACAATCTGATTTCTCTATCTTTTC	111100

CR759805.5	1951	CCCACATTTCCCCCTTTCTATTCGACAAAACCGCCATCGTCATCATGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759772.4	111101	CCCACATTTCCCCCTTTCTATTCGACAAAACCGCCATCGTCATCATGGCC	111150

Overview

Query
CR759805.5 - 56809 bps
Hit
CR759772.4 - 111150 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link