<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759870.6	1	ACAGTCAACCCTCAGTATCCCCAGGGAATTAGTTCCAGGACACCCCTCAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	50551	ACAGTCAACCCTCAGTATCCCCAGGGAATTAGTTCCAGGACACCCCTCAG	50600

CR759870.6	51	ATACCAAAATCTGCAGATGCTGAAGTCCCAAAGTTGACCTTGCAGAACTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	50601	ATACCAAAATCTGCAGATGCTGAAGTCCCAAAGTTGACCTTGCAGAACTC	50650

CR759870.6	101	ACAAATACAAAAAGTCGGTTCTCACATCCATGAGTTTAGCATCCTGAGAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	50651	ACAAATACAAAAAGTCGGTTCTCACATCCATGAGTTTAGCATCCTGAGAA	50700

CR759870.6	151	TATTGTATTTTCAATTCATGTTTGCTTGTGGATGCAGAACCTGTGGGAAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	50701	TATTGTATTTTCAATTCATGTTTGCTTGTGGATGCAGAACCTGTGGGAAT	50750

CR759870.6	201	GGAGGATAGACTATATTTACAGAAAGAAATCCTAGGGCCTGCGTCCTCAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	50751	GGAGGATAGACTATATTTACAGAAAGAAATCCTAGGGCCTGCGTCCTCAC	50800

CR759870.6	251	GAAAGCATTGGCCTCCAGCGTGGGCTAACAGCAGAGCAGGGCGGAGCTGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	50801	GAAAGCATTGGCCTCCAGCGTGGGCTAACAGCAGAGCAGGGCGGAGCTGG	50850

CR759870.6	301	CCCATGGTTGCAGACCTCTGTGCCAGCCTCCCCTAGACAAGAGCGCCGTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	50851	CCCATGGTTGCAGACCTCTGTGCCAGCCTCCCCTAGACAAGAGCGCCGTG	50900

CR759870.6	351	TCGAGGAGAAGAAATCGGCTCAAGCTCTGGGCCCATGATGCCTGCTCCTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	50901	TCGAGGAGAAGAAATCGGCTCAAGCTCTGGGCCCATGATGCCTGCTCCTT	50950

CR759870.6	401	CCAAAGACTGTGGCAGATTACGCCAACTGGGATCCGGCGGTCGCAAGGTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	50951	CCAAAGACTGTGGCAGATTACGCCAACTGGGATCCGGCGGTCGCAAGGTC	51000

CR759870.6	451	TAGAGGAGTCAAGAAAGCCATCACCAACGTCGTTCAGCAGGAAGTAAAAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51001	TAGAGGAGTCAAGAAAGCCATCACCAACGTCGTTCAGCAGGAAGTAAAAT	51050

CR759870.6	501	CCCTTTGTGTCTTGGAAGCCTCCCAGGTTCCTGCAGAAGAAGCTGTTTCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51051	CCCTTTGTGTCTTGGAAGCCTCCCAGGTTCCTGCAGAAGAAGCTGTTTCT	51100

CR759870.6	551	GGAGCTAGTGAGCCCTATGACATCATCGACAGCAGTAACTTGAAGAAGAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51101	GGAGCTAGTGAGCCCTATGACATCATCGACAGCAGTAACTTGAAGAAGAG	51150

CR759870.6	601	CAGACATGGAAGAGAAATCTGCTTTTCACTTTATATTTTTGCCTGTCTTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51151	CAGACATGGAAGAGAAATCTGCTTTTCACTTTATATTTTTGCCTGTCTTT	51200

CR759870.6	651	TAAATGTTACAGCTGTGTGTGCTTTACATATTCAAAATAAATTGTGTGTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51201	TAAATGTTACAGCTGTGTGTGCTTTACATATTCAAAATAAATTGTGTGTA	51250

CR759870.6	701	TGTGTGTGTGTGTGTGTAAATTTTAAGCAGTTAATAGGTTCAAGGCAGAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51251	TGTGTGTGTGTGTGTGTAAATTTTAAGCAGTTAATAGGTTCAAGGCAGAA	51300

CR759870.6	751	GTGGCTACAAGTTTATGCCCCAGTAAGAATCAGTTCCAGTGCTCTTCATT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51301	GTGGCTACAAGTTTATGCCCCAGTAAGAATCAGTTCCAGTGCTCTTCATT	51350

CR759870.6	801	AATTGCCAGGCAAAATAGCCATAGTAATGTAGTAACTAGAATAAAATTTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51351	AATTGCCAGGCAAAATAGCCATAGTAATGTAGTAACTAGAATAAAATTTA	51400

CR759870.6	851	AATTAGGTTAGTTATAAACACCCTATCCATTATCGACTCCCAAAGCTGCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51401	AATTAGGTTAGTTATAAACACCCTATCCATTATCGACTCCCAAAGCTGCT	51450

CR759870.6	901	TCATCCATGAATATTTAATATGCCACAAAACTATCAGAGATTGCTAATAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51451	TCATCCATGAATATTTAATATGCCACAAAACTATCAGAGATTGCTAATAT	51500

CR759870.6	951	ATCCCATAATATAATATGAAACCAAAAGATTTTTCAAAAAGCTAAACTTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51501	ATCCCATAATATAATATGAAACCAAAAGATTTTTCAAAAAGCTAAACTTG	51550

CR759870.6	1001	GGAGAGACTCATAGCAAAATGACATGTAATTCTGAGGTCATCACTGAGTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51551	GGAGAGACTCATAGCAAAATGACATGTAATTCTGAGGTCATCACTGAGTA	51600

CR759870.6	1051	TGGTACTTGAGTCTATCGCCACATGTGAAAAGCATCTGAATATAATCCAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51601	TGGTACTTGAGTCTATCGCCACATGTGAAAAGCATCTGAATATAATCCAA	51650

CR759870.6	1101	AAAGCTATTGCAGTCATGGGCTGCAGAATAATGCGGTGGCCAAGAGGCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51651	AAAGCTATTGCAGTCATGGGCTGCAGAATAATGCGGTGGCCAAGAGGCTG	51700

CR759870.6	1151	TAATATTGTGATATAATAAGATATACATATTTGGCCTTTGATCCCAGTTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51701	TAATATTGTGATATAATAAGATATACATATTTGGCCTTTGATCCCAGTTC	51750

CR759870.6	1201	CTGGCACAGAGTTCCTAAGGCCCTTGTAATTCCCTGAGCAATAGGGGTGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51751	CTGGCACAGAGTTCCTAAGGCCCTTGTAATTCCCTGAGCAATAGGGGTGC	51800

CR759870.6	1251	TAGGAGAGTCTTTTGTTCTAATATTTGGTCTTTGACCAAATATGTCAGTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51801	TAGGAGAGTCTTTTGTTCTAATATTTGGTCTTTGACCAAATATGTCAGTT	51850

CR759870.6	1301	CCTAACATTGAGCTCTAATCCCTTGGAATTTCCTGGGTAACAGGAGCATC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51851	CCTAACATTGAGCTCTAATCCCTTGGAATTTCCTGGGTAACAGGAGCATC	51900

CR759870.6	1351	TTTTGTTCTAATGAGGTGACCCCTTGGGGGACCCCTGAATGGGGACTCTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51901	TTTTGTTCTAATGAGGTGACCCCTTGGGGGACCCCTGAATGGGGACTCTG	51950

CR759870.6	1401	ACTAGAAGGACCAAGCCATGATTAGAAGTTTGAAACTTTCAGCTCTACCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	51951	ACTAGAAGGACCAAGCCATGATTAGAAGTTTGAAACTTTCAGCTCTACCC	52000

CR759870.6	1451	TCATCTTCCAGAAAATCGAGAGTGGCTAGACATTGAGTTAATAATCAACT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	52001	TCATCTTCCAGAAAATCGAGAGTGGCTAGACATTGAGTTAATAATCAACT	52050

CR759870.6	1501	ATATCTATTTGATGAAGCCTCCACAAAAATCCCTGAACTACAGAGCTCCG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	52051	ATATCTATTTGATGAAGCCTCCACAAAAATCCCTGAACTACAGAGCTCCG	52100

CR759870.6	1551	AGAACTTCCAGGCTGGTGCACACACAGAAATGCTGAGAGGGCAGCATGCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	52101	AGAACTTCCAGGCTGGTGCACACACAGAAATGCTGAGAGGGCAGCATGCC	52150

CR759870.6	1601	CCAGAAGCTCTGTAACCCTTCCCACACACCTTTTCCTGTACATCTCTTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	52151	CCAGAAGCTCTGTAACCCTTCCCACACACCTTTTCCTGTACATCTCTTCT	52200

CR759870.6	1651	ATTTTGTTGTTCATTTGTATCCTTTGGAATATCCTCTATAATAAACTGGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	52201	ATTTTGTTGTTCATTTGTATCCTTTGGAATATCCTCTATAATAAACTGGT	52250

CR759870.6	1701	AAATTGAACTAAAGAGCTTTCATGTATTCTGTGAACTGCTCTAATAAATC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	52251	AAATTGAACTAAAGAGCTTTCATGTATTCTGTGAACTGCTCTAATAAATC	52300

CR759870.6	1751	ATCAAACCCAAGGAGGGGATTGTGGGAACCCCCAGTAGGGTTCCCAGTAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	52301	ATCAAACCCAAGGAGGGGATTGTGGGAACCCCCAGTAGGGTTCCCAGTAG	52350

CR759870.6	1801	GTCAGAAGTTCCAGAAGCTTGGACTTGTGATTGGCATCTGAAGTGGGGAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	52351	GTCAGAAGTTCCAGAAGCTTGGACTTGTGATTGGCATCTGAAGTGGGGAG	52400

CR759870.6	1851	CAGCCTTATGGGATCCTTTAACCTGTGGGATCTCACTGTATCTCCAGGTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	52401	CAGCCTTATGGGATCCTTTAACCTGTGGGATCTCACTGTATCTCCAGGTG	52450

CR759870.6	1901	AATAATGTCAGAAGTGAATTGAATTGAATTATAGGACACCAAGTTGGTGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	52451	AATAATGTCAGAAGTGAATTGAATTGAATTATAGGACACCAAGTTGGTGT	52500

CR759870.6	1951	CCACTGAAGAATGTATTGGTCAGTCTGGAAGAAAAACCAACATGTTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CR759770.3	52501	CCACTGAAGAATGTATTGGTCAGTCTGGAAGAAAAACCAACATGTTGGCC	52550

Overview

Query
CR759870.6 - 57743 bps
Hit
CR759770.3 - 52550 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link